MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 2

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016625	GATGAA	2	12	20356	20367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016625	ATGAAA	2	12	45454	45465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016625	CCTAGT	2	12	61775	61786	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016625	TGAAAG	2	12	78219	78230	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016625	GCGCCG	2	12	78353	78364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016625	CAAGGC	2	12	78394	78405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016625	GCGAAC	2	12	84389	84400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016625	GCGGCA	2	12	93388	93399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016625	ACGGCA	2	12	100043	100054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016625	ACGGCC	2	12	104666	104677	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016625	CGCGAT	2	12	125573	125584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016625	TGCGCG	2	12	132261	132272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016625	AGTTTG	2	12	147983	147994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016625	CGCTAT	2	12	170323	170334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016625	CGGATG	2	12	297932	297943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016625	CGCCCG	2	12	338991	339002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016625	ACGATT	2	12	350301	350312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016625	GATCGC	2	12	357895	357906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016625	GAAAAA	2	12	410893	410904	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016625	GAGAAC	2	12	419291	419302	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016625	CAGCCG	2	12	444474	444485	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016625	CAAAGC	2	12	461031	461042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016625	AACCGC	2	12	467604	467615	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016625	CAGTGG	2	12	503299	503310	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016625	TGACGC	2	12	553466	553477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016625	GCGTTC	2	12	603212	603223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016625	GCGCTT	2	12	622541	622552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016625	ATGAAA	2	12	702465	702476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016625	TCGGGT	2	12	760702	760713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016625	CAAAAA	2	12	782452	782463	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016625	CCGGAC	2	12	894262	894273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016625	TGATGT	2	12	950600	950611	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016625	ACGCGC	2	12	978232	978243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016625	GCTTGC	2	12	1034540	1034551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016625	TGTGCT	2	12	1034573	1034584	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016625	GCGCCG	2	12	1097525	1097536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016625	ACGCGC	2	12	1120537	1120548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016625	AATCCC	2	12	1165307	1165318	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016625	CGATCG	2	12	1231388	1231399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016625	ATCGGT	2	12	1254021	1254032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016625	TCCGCA	2	12	1255708	1255719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016625	GCGTTC	2	12	1273897	1273908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016625	TCACGC	2	12	1289333	1289344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016625	ACGCAC	2	12	1315789	1315800	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016625	GTTTTT	4	24	1337014	1337037	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016625	AAACGA	2	12	1337629	1337640	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016625	GATCGA	2	12	1340057	1340068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016625	TCGAGA	2	12	1360919	1360930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016625	AAATGC	2	12	1399183	1399194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016625	GCATGT	2	12	1415282	1415293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016625	AGCGCG	2	12	1419161	1419172	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016625	ATCGCG	2	12	1437291	1437302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016625	TTGTTT	2	12	1443174	1443185	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016625	GCGAAG	2	12	1558215	1558226	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016625	GTTGCG	2	12	1569320	1569331	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016625	GTGGGG	2	12	1574433	1574444	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016625	GTTTTT	2	12	1574473	1574484	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016625	AAAGAG	2	12	1576783	1576794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016625	TGTGTC	2	12	1608785	1608796	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016625	GCCCGT	2	12	1627852	1627863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016625	TTGGTT	2	12	1646264	1646275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016625	GTTTTT	2	12	1650603	1650614	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016625	CAAAAC	2	12	1652630	1652641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016625	TGGTTT	2	12	1675782	1675793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016625	AAACGC	2	12	1688724	1688735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016625	AAACCA	2	12	1742798	1742809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.