MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016624	TCCGGG	2	12	708	719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294064
2	NC_016624	TGCCGA	2	12	4353	4364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294069
3	NC_016624	CCTGCA	2	12	4797	4808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294070
4	NC_016624	TCGGCC	2	12	7408	7419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294072
5	NC_016624	CAGCGT	2	12	8530	8541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294073
6	NC_016624	GTCAGC	2	12	8897	8908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294073
7	NC_016624	CGACCT	2	12	11059	11070	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294075
8	NC_016624	TGGCGA	2	12	11749	11760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294075
9	NC_016624	TCGCCG	2	12	12182	12193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294076
10	NC_016624	GTCGCC	2	12	12379	12390	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294076
11	NC_016624	TGCCGG	2	12	12453	12464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294076
12	NC_016624	GCCTCG	2	12	12479	12490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294076
13	NC_016624	CAGCGC	2	12	12691	12702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294076
14	NC_016624	CGAGGT	2	12	16467	16478	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294079
15	NC_016624	GTCCTT	2	12	18337	18348	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294082
16	NC_016624	TCCACC	2	12	18569	18580	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374294082
17	NC_016624	CCAGCT	2	12	21943	21954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294086
18	NC_016624	CTCCAC	2	12	22100	22111	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374294086
19	NC_016624	TCGCGG	2	12	23119	23130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294087
20	NC_016624	CGGTGA	2	12	24246	24257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294088
21	NC_016624	GCTGGA	2	12	26263	26274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294090
22	NC_016624	CACCCT	2	12	26635	26646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374294091
23	NC_016624	AAGCCG	2	12	27098	27109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294091
24	NC_016624	GGACGA	2	12	27816	27827	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294093
25	NC_016624	GCTGAC	2	12	32034	32045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294097
26	NC_016624	CGGCGA	2	12	36155	36166	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294103
27	NC_016624	TCTCCC	2	12	36412	36423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294103
28	NC_016624	CGCCGG	2	12	39232	39243	0 %	0 %	50 %	50 %	374294107
29	NC_016624	CACCGC	2	12	39304	39315	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294107
30	NC_016624	GTGCTG	2	12	44856	44867	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294114
31	NC_016624	GCTGAA	2	12	48591	48602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294116
32	NC_016624	CCCGCG	2	12	49053	49064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294117
33	NC_016624	CGGAGG	2	12	51842	51853	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374294119
34	NC_016624	GGCGCG	2	12	52116	52127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294119
35	NC_016624	TCAACG	2	12	54626	54637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294123
36	NC_016624	CTGCCG	2	12	55222	55233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294124
37	NC_016624	CACACC	2	12	56725	56736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294124
38	NC_016624	CTGGCA	2	12	58413	58424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294126
39	NC_016624	ATGGTC	2	12	59324	59335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374294128
40	NC_016624	GCGCCA	3	18	59988	60005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294128
41	NC_016624	CGTTGC	2	12	60147	60158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294128
42	NC_016624	GCCGTC	2	12	60436	60447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294128
43	NC_016624	GACCCA	2	12	60525	60536	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294128
44	NC_016624	GACGCC	2	12	61292	61303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294130
45	NC_016624	AGGGCA	2	12	62336	62347	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294131
46	NC_016624	CAGCAC	2	12	62585	62596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294132
47	NC_016624	GGCGCT	2	12	62735	62746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294132
48	NC_016624	GCCGTG	2	12	63119	63130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294132
49	NC_016624	CCGGCG	2	12	69519	69530	0 %	0 %	50 %	50 %	374294136
50	NC_016624	ACGGGC	2	12	69584	69595	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294136
51	NC_016624	TACGCC	2	12	70091	70102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294136
52	NC_016624	CGGCAT	2	12	71129	71140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294137
53	NC_016624	GCTGGG	2	12	71327	71338	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294137
54	NC_016624	TCCTGT	2	12	71506	71517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294137
55	NC_016624	GTCATC	2	12	72067	72078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294138
56	NC_016624	GGCCGC	2	12	72138	72149	0 %	0 %	50 %	50 %	374294138
57	NC_016624	GCTTCT	2	12	75418	75429	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294142
58	NC_016624	CCTGAC	3	18	75844	75861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294142
59	NC_016624	TTCCGT	2	12	78025	78036	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294144
60	NC_016624	CAAGGA	2	12	79599	79610	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374294145
61	NC_016624	TGCCCA	2	12	81589	81600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294147
62	NC_016624	TCGGCC	2	12	81633	81644	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294147
63	NC_016624	GTCACC	2	12	82007	82018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294148
64	NC_016624	CCCTGC	2	12	82623	82634	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374294148
65	NC_016624	CGACCC	2	12	85353	85364	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294150
66	NC_016624	GCTGCC	2	12	85549	85560	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294151
67	NC_016624	TCGAAG	2	12	86641	86652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294152
68	NC_016624	CCAGCC	2	12	88301	88312	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294152
69	NC_016624	ATGCCG	2	12	88393	88404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294152
70	NC_016624	ACCTCC	2	12	88414	88425	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374294152
71	NC_016624	CCCGGT	2	12	89123	89134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294152
72	NC_016624	TGGGCC	2	12	90232	90243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294152
73	NC_016624	GCCGAG	2	12	91132	91143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294153
74	NC_016624	CGACCG	2	12	91167	91178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294153
75	NC_016624	GCGAGC	2	12	92325	92336	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294154
76	NC_016624	CCAGCA	2	12	92770	92781	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294154
77	NC_016624	CGGCCC	2	12	94817	94828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294155
78	NC_016624	GTGGCG	2	12	94873	94884	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294155
79	NC_016624	CCATGT	2	12	95580	95591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294156
80	NC_016624	CGGTGC	2	12	98753	98764	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294158
81	NC_016624	CCATCG	2	12	98798	98809	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294158
82	NC_016624	TCGGCG	2	12	99411	99422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294159
83	NC_016624	TCGGCA	2	12	104366	104377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294163
84	NC_016624	TCCTGC	2	12	106985	106996	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294165
85	NC_016624	TGCCGG	2	12	107247	107258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294165
86	NC_016624	ACGGTG	2	12	109844	109855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294166
87	NC_016624	TGTCCA	2	12	113056	113067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294170
88	NC_016624	AGGCGC	2	12	114358	114369	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294171
89	NC_016624	TGCCAT	2	12	120630	120641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294174
90	NC_016624	CTGGAA	2	12	121640	121651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294175
91	NC_016624	CGGGTT	2	12	123167	123178	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294176
92	NC_016624	TCGCGA	2	12	123796	123807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294177
93	NC_016624	AGCGAT	2	12	125155	125166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294179
94	NC_016624	GCCGCG	2	12	129736	129747	0 %	0 %	50 %	50 %	374294182
95	NC_016624	CCGTCC	2	12	130255	130266	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374294182
96	NC_016624	CGGACC	2	12	131544	131555	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294183
97	NC_016624	CCGTCG	2	12	146812	146823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294198
98	NC_016624	GGCTGG	2	12	149068	149079	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294200
99	NC_016624	ACCGGC	2	12	151481	151492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294203
100	NC_016624	ACGCCA	2	12	151625	151636	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294203
101	NC_016624	GGCGAC	2	12	154906	154917	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294207
102	NC_016624	CAGCTT	2	12	154954	154965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294207
103	NC_016624	GCGATG	2	12	155430	155441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294208
104	NC_016624	CCCAGC	2	12	155547	155558	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294208
105	NC_016624	CCCGTC	2	12	155758	155769	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374294209
106	NC_016624	TCGATG	2	12	156343	156354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374294209
107	NC_016624	CCTCGT	2	12	156491	156502	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294210
108	NC_016624	CCAGCA	2	12	158464	158475	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294211
109	NC_016624	TCGGCA	2	12	158494	158505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294211
110	NC_016624	AGCCCG	2	12	158574	158585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294211
111	NC_016624	AGGACG	2	12	158867	158878	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294212
112	NC_016624	GATGGC	2	12	163754	163765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294216
113	NC_016624	CCTTGG	2	12	165857	165868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294219
114	NC_016624	CTGGAC	2	12	166407	166418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294219
115	NC_016624	CGCGGG	2	12	166652	166663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294219
116	NC_016624	TCCGGC	2	12	168323	168334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294220
117	NC_016624	CCGGCT	2	12	168408	168419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294220
118	NC_016624	CCCGAT	2	12	168695	168706	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294220
119	NC_016624	CAGCCG	2	12	169208	169219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294221
120	NC_016624	AGCCCG	2	12	169260	169271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294221
121	NC_016624	CGGCAG	2	12	170405	170416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294221
122	NC_016624	CCAGCG	2	12	170797	170808	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294221
123	NC_016624	TTTCGA	2	12	173650	173661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374294224
124	NC_016624	GAGGCG	2	12	173924	173935	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374294225
125	NC_016624	CCGCGC	2	12	174464	174475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294226
126	NC_016624	AGCGCG	2	12	175760	175771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294227
127	NC_016624	CGCCCC	2	12	176197	176208	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	374294228
128	NC_016624	GCCGAC	2	12	177613	177624	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294229
129	NC_016624	ACCGCG	2	12	180280	180291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294231
130	NC_016624	CTGATC	2	12	180297	180308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294231
131	NC_016624	GCGCTG	2	12	181643	181654	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294232
132	NC_016624	TGTCGC	2	12	184461	184472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294234
133	NC_016624	CGCCGG	2	12	184974	184985	0 %	0 %	50 %	50 %	374294234
134	NC_016624	TCCATG	2	12	186349	186360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294235
135	NC_016624	GCGGGT	2	12	191357	191368	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294240
136	NC_016624	GACGGC	2	12	193245	193256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294241
137	NC_016624	GCGCGA	2	12	195103	195114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294243
138	NC_016624	ACCTTC	2	12	195728	195739	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374294244
139	NC_016624	CGCCGA	2	12	195946	195957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294244
140	NC_016624	GGCGCC	2	12	196325	196336	0 %	0 %	50 %	50 %	374294244
141	NC_016624	TCGCCA	2	12	198372	198383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294245
142	NC_016624	GGCGCT	2	12	199565	199576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294246
143	NC_016624	GGCATC	2	12	200385	200396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294246
144	NC_016624	GGAGGT	2	12	201309	201320	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	374294247
145	NC_016624	TGTTCG	2	12	203087	203098	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374294249
146	NC_016624	GGCGAC	2	12	203661	203672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294250
147	NC_016624	TGCCGG	2	12	204865	204876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294251
148	NC_016624	CTTCAG	2	12	205772	205783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294251
149	NC_016624	GGATTC	2	12	207132	207143	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374294253
150	NC_016624	TGAACA	2	12	207344	207355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374294253
151	NC_016624	TCGGCT	2	12	208413	208424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294254
152	NC_016624	CGGCGA	2	12	208552	208563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294254
153	NC_016624	ACCGAC	2	12	209899	209910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294255
154	NC_016624	CGGCCG	2	12	211275	211286	0 %	0 %	50 %	50 %	374294255
155	NC_016624	GTCGCC	2	12	211981	211992	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294256
156	NC_016624	CGATGG	2	12	214100	214111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294258
157	NC_016624	CGGCCG	2	12	214196	214207	0 %	0 %	50 %	50 %	374294258
158	NC_016624	CCGGAG	2	12	214595	214606	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294259
159	NC_016624	CCGCCC	2	12	215753	215764	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	374294260
160	NC_016624	GAACAG	2	12	217916	217927	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374294263
161	NC_016624	CCGCGC	2	12	221170	221181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294265
162	NC_016624	CGCTGG	2	12	222834	222845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294267
163	NC_016624	CGAGGC	3	18	222856	222873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294267
164	NC_016624	TGCGGG	2	12	223925	223936	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294269
165	NC_016624	GCTCCG	2	12	224781	224792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294270
166	NC_016624	CCGCCC	2	12	225498	225509	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	374294270
167	NC_016624	CGGAAC	2	12	226997	227008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294271
168	NC_016624	GTCGAG	2	12	227151	227162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294271
169	NC_016624	GTCGAG	2	12	227244	227255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294271
170	NC_016624	CTCCGC	2	12	234531	234542	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374294274
171	NC_016624	GGTCGC	2	12	237761	237772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294276
172	NC_016624	CCAGCC	2	12	241855	241866	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294279
173	NC_016624	ATGCCG	2	12	241947	241958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294279
174	NC_016624	CGTCCT	2	12	244422	244433	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294280
175	NC_016624	GCGCCG	2	12	244451	244462	0 %	0 %	50 %	50 %	374294280
176	NC_016624	GTCGGC	2	12	246137	246148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294281
177	NC_016624	CAGCCG	2	12	247462	247473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294282
178	NC_016624	CGCCAC	2	12	249010	249021	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294282
179	NC_016624	ACGCCC	2	12	249585	249596	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294282
180	NC_016624	CACATC	2	12	252580	252591	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374294285
181	NC_016624	CGTTGG	2	12	253987	253998	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294286
182	NC_016624	CCCCCA	2	12	254647	254658	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	374294287
183	NC_016624	ACCGGC	2	12	255342	255353	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294287
184	NC_016624	GGCCGG	2	12	255986	255997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294287
185	NC_016624	GGGCGC	2	12	257967	257978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294289
186	NC_016624	GATGCC	2	12	258232	258243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294289
187	NC_016624	GCCCGC	2	12	259310	259321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294290
188	NC_016624	CGAGGA	2	12	259465	259476	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294290
189	NC_016624	AAGGAG	2	12	261329	261340	50 %	0 %	50 %	0 %	374294291
190	NC_016624	ACCGCC	2	12	262911	262922	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294292
191	NC_016624	GACGCC	2	12	263512	263523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294293
192	NC_016624	GCAGGC	2	12	267653	267664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294297
193	NC_016624	CGGCAG	2	12	269686	269697	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294298
194	NC_016624	CGCCCC	2	12	271394	271405	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	374294299
195	NC_016624	CAGCCC	2	12	272695	272706	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294300
196	NC_016624	ATGCCG	2	12	272786	272797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294300
197	NC_016624	GGGTCA	2	12	272964	272975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294300
198	NC_016624	GGCGAT	2	12	273583	273594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294300
199	NC_016624	TCGCGC	2	12	275393	275404	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294302
200	NC_016624	CCCATC	2	12	276714	276725	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374294303
201	NC_016624	CTGCAC	2	12	277444	277455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294304
202	NC_016624	CACCCG	2	12	277459	277470	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294304
203	NC_016624	TGCCGG	2	12	278379	278390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294305
204	NC_016624	GTCGAG	2	12	278428	278439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294305
205	NC_016624	CGATCA	2	12	278552	278563	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294306
206	NC_016624	AGCGCC	2	12	278845	278856	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294306
207	NC_016624	CGGAGC	2	12	278954	278965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294306
208	NC_016624	CAGGCG	2	12	279174	279185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294306
209	NC_016624	GGTGAC	2	12	279213	279224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294306
210	NC_016624	CCCGGC	2	12	281377	281388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294309
211	NC_016624	CGAGCC	2	12	281826	281837	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294309
212	NC_016624	CGATGG	2	12	282147	282158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294310
213	NC_016624	GTCGCC	2	12	282737	282748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294310
214	NC_016624	TCATTC	2	12	285342	285353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374294312
215	NC_016624	CCACCG	2	12	285677	285688	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294313
216	NC_016624	GGTCGA	2	12	286856	286867	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294313
217	NC_016624	GATGGC	2	12	288734	288745	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294314
218	NC_016624	CCTTCC	2	12	292634	292645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294319
219	NC_016624	CCCGCC	2	12	295799	295810	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	374294323
220	NC_016624	ATCGAC	2	12	296596	296607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294324
221	NC_016624	CGAAGG	2	12	298087	298098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294325
222	NC_016624	CCGGCC	2	12	300870	300881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294328
223	NC_016624	CTTGCG	2	12	302577	302588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294331
224	NC_016624	GCGGTC	2	12	304308	304319	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294335
225	NC_016624	GCGGCC	2	12	306319	306330	0 %	0 %	50 %	50 %	374294337
226	NC_016624	CATCTG	2	12	306331	306342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294337
227	NC_016624	CCGGTG	2	12	308894	308905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294340
228	NC_016624	CGTCGG	4	24	312547	312570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294342
229	NC_016624	TGGCGG	2	12	314918	314929	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294345
230	NC_016624	CAGCGC	2	12	317575	317586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294347
231	NC_016624	AGCGGA	2	12	320398	320409	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294348
232	NC_016624	CAGCGC	2	12	321626	321637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294350
233	NC_016624	CCCGCG	2	12	321902	321913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294350
234	NC_016624	GGCGCG	2	12	322885	322896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294351
235	NC_016624	GCCGAG	2	12	326408	326419	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294353
236	NC_016624	CCCGCG	2	12	327544	327555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294354
237	NC_016624	ATGGCG	2	12	327705	327716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294354
238	NC_016624	CCCCGT	2	12	331276	331287	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374294356
239	NC_016624	GCCATC	2	12	332047	332058	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294357
240	NC_016624	GGAAAA	2	12	333211	333222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294358
241	NC_016624	GAAGCC	2	12	333760	333771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294359
242	NC_016624	GCCAGC	2	12	334454	334465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294359
243	NC_016624	GTCGGC	2	12	340107	340118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294361
244	NC_016624	TCCGGC	2	12	340678	340689	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294361
245	NC_016624	AGGTCG	2	12	342205	342216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294363
246	NC_016624	CAGGAT	2	12	342796	342807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294364
247	NC_016624	CTGATC	2	12	343494	343505	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294365
248	NC_016624	GCCTTC	2	12	344475	344486	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294365
249	NC_016624	CGCCAC	2	12	346398	346409	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294367
250	NC_016624	GGATGG	2	12	346892	346903	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	374294368
251	NC_016624	TGCCGG	2	12	347168	347179	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294368
252	NC_016624	GGCGGA	2	12	347936	347947	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374294369
253	NC_016624	GCGCTG	2	12	349076	349087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294370
254	NC_016624	ATGAAG	2	12	351636	351647	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294372
255	NC_016624	GATCTG	2	12	354067	354078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374294374
256	NC_016624	ATCCTG	2	12	354098	354109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294374
257	NC_016624	ACCGGC	2	12	354995	355006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294374
258	NC_016624	CCGGCC	2	12	355635	355646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294375
259	NC_016624	GCTGGT	2	12	357517	357528	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294378
260	NC_016624	CCCATG	2	12	357582	357593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294378
261	NC_016624	CCGATC	2	12	357861	357872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294378
262	NC_016624	CGCCGG	2	12	360454	360465	0 %	0 %	50 %	50 %	374294381
263	NC_016624	GACGCC	2	12	361025	361036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294381
264	NC_016624	GCACCG	2	12	367720	367731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294387
265	NC_016624	CGCTGG	2	12	368898	368909	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294388
266	NC_016624	GCATCG	2	12	371086	371097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294391
267	NC_016624	CAAGGC	2	12	371594	371605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294391
268	NC_016624	CAGAAC	2	12	373100	373111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	374294392
269	NC_016624	GGCTGT	2	12	373693	373704	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294393
270	NC_016624	CGGTGT	2	12	376371	376382	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294395
271	NC_016624	AACGGC	2	12	381772	381783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294398
272	NC_016624	TCCGGC	2	12	384227	384238	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294401
273	NC_016624	CCGGCC	2	12	384318	384329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294401
274	NC_016624	TCGGCC	2	12	384474	384485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294401
275	NC_016624	ACGGCG	2	12	386039	386050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294402
276	NC_016624	TCGACG	2	12	386306	386317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294402
277	NC_016624	CTGACC	2	12	386635	386646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294402
278	NC_016624	TCGACG	2	12	388722	388733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294403
279	NC_016624	CCGCCA	2	12	391567	391578	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374294404
280	NC_016624	CGAAAC	2	12	393331	393342	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	374294405
281	NC_016624	TCCAGC	2	12	395353	395364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294407
282	NC_016624	ATCAGG	2	12	395710	395721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294407
283	NC_016624	GAAGCC	2	12	396644	396655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294408
284	NC_016624	GCCCGC	2	12	397284	397295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294408
285	NC_016624	GGCCTT	2	12	400137	400148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294410
286	NC_016624	CTCGCC	2	12	402087	402098	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374294411
287	NC_016624	CATCAC	2	12	402910	402921	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374294412
288	NC_016624	CGATGG	2	12	405089	405100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294414
289	NC_016624	AGCGAC	2	12	407198	407209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294416
290	NC_016624	GGCGGA	2	12	409870	409881	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374294418
291	NC_016624	CGATCC	2	12	414992	415003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294423
292	NC_016624	GCCGAG	2	12	417515	417526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294425
293	NC_016624	ATCGAC	2	12	417569	417580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294425
294	NC_016624	ACCTGG	2	12	420998	421009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294426
295	NC_016624	GCCGCG	2	12	422825	422836	0 %	0 %	50 %	50 %	374294428
296	NC_016624	GCCCTG	2	12	423002	423013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294428
297	NC_016624	GGCGAA	2	12	424327	424338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294429
298	NC_016624	CGACCA	2	12	426589	426600	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294431
299	NC_016624	GTTCCT	2	12	427783	427794	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294434
300	NC_016624	CAAGGG	2	12	428542	428553	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294435
301	NC_016624	GCGTCG	2	12	428877	428888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294435
302	NC_016624	GCCAGG	2	12	429114	429125	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294435
303	NC_016624	CGACCG	2	12	430180	430191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294437
304	NC_016624	GCCGCG	2	12	430338	430349	0 %	0 %	50 %	50 %	374294437
305	NC_016624	GCTGGG	2	12	430528	430539	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374294437
306	NC_016624	GCACCG	2	12	432749	432760	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294439
307	NC_016624	ACGCTG	2	12	432811	432822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294439
308	NC_016624	GCAGCC	2	12	432968	432979	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294440
309	NC_016624	GCCCGC	2	12	434300	434311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294441
310	NC_016624	ACCGGA	2	12	435359	435370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294442
311	NC_016624	GTCACC	2	12	437206	437217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294444
312	NC_016624	GACCGC	2	12	438435	438446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294445
313	NC_016624	TCGGCA	2	12	438533	438544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294445
314	NC_016624	GCCGAC	2	12	438679	438690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294445
315	NC_016624	CCAGCA	2	12	441134	441145	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294447
316	NC_016624	GGGGAT	2	12	441404	441415	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	374294448
317	NC_016624	CTGGGT	2	12	442097	442108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374294448
318	NC_016624	CAGGGC	2	12	442170	442181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374294448
319	NC_016624	CGAAGG	2	12	443665	443676	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374294448
320	NC_016624	CGACCT	2	12	446429	446440	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294450
321	NC_016624	CATCGG	2	12	447995	448006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294451
322	NC_016624	CTGCCG	2	12	448881	448892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294451
323	NC_016624	CTGCCA	2	12	449523	449534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294452
324	NC_016624	ACCGTG	2	12	451696	451707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294456
325	NC_016624	CATCGT	2	12	453016	453027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374294457
326	NC_016624	CCTTCG	2	12	454542	454553	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294457
327	NC_016624	GTGCCG	2	12	454896	454907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294457
328	NC_016624	GGCGCT	2	12	459232	459243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294460
329	NC_016624	GAAGCC	2	12	462907	462918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294463
330	NC_016624	GCGGGC	2	12	463015	463026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294463
331	NC_016624	CGCCAT	2	12	464691	464702	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294464
332	NC_016624	GCCAGC	2	12	466100	466111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294465
333	NC_016624	CGCCAG	2	12	466795	466806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294465
334	NC_016624	CGCCAG	2	12	467065	467076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294465
335	NC_016624	GCCCTG	2	12	467698	467709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294465
336	NC_016624	TGCCGG	2	12	469250	469261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294466
337	NC_016624	CGCGCT	2	12	469790	469801	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294466
338	NC_016624	TCGGCA	2	12	471900	471911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374294467
339	NC_016624	GCTGGC	2	12	472042	472053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294467
340	NC_016624	GTCGGC	2	12	472118	472129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294467
341	NC_016624	CTTCGC	2	12	473665	473676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.