MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016624	GCGGG	2	10	6302	6311	0 %	0 %	80 %	20 %	374294071
2	NC_016624	TGACC	2	10	8697	8706	20 %	20 %	20 %	40 %	374294073
3	NC_016624	GCCGA	2	10	10284	10293	20 %	0 %	40 %	40 %	374294074
4	NC_016624	GGCTG	2	10	11077	11086	0 %	20 %	60 %	20 %	374294075
5	NC_016624	TCGGC	2	10	12237	12246	0 %	20 %	40 %	40 %	374294076
6	NC_016624	GCCGC	2	10	12324	12333	0 %	0 %	40 %	60 %	374294076
7	NC_016624	GCGCC	2	10	13566	13575	0 %	0 %	40 %	60 %	374294076
8	NC_016624	GGGCT	3	15	13791	13805	0 %	20 %	60 %	20 %	374294076
9	NC_016624	AGCGG	2	10	19276	19285	20 %	0 %	60 %	20 %	374294083
10	NC_016624	GCGGA	2	10	19573	19582	20 %	0 %	60 %	20 %	374294083
11	NC_016624	GGGCG	2	10	20236	20245	0 %	0 %	80 %	20 %	374294083
12	NC_016624	GCCAG	2	10	21892	21901	20 %	0 %	40 %	40 %	374294086
13	NC_016624	TCGCC	2	10	22717	22726	0 %	20 %	20 %	60 %	374294086
14	NC_016624	GGCGG	2	10	22764	22773	0 %	0 %	80 %	20 %	374294086
15	NC_016624	TCCGC	2	10	24810	24819	0 %	20 %	20 %	60 %	374294088
16	NC_016624	CCGGC	2	10	25107	25116	0 %	0 %	40 %	60 %	374294088
17	NC_016624	GGGCC	2	10	25548	25557	0 %	0 %	60 %	40 %	374294089
18	NC_016624	CGCGG	2	10	26252	26261	0 %	0 %	60 %	40 %	374294090
19	NC_016624	ATCGA	2	10	28246	28255	40 %	20 %	20 %	20 %	374294093
20	NC_016624	GAGCG	2	10	28727	28736	20 %	0 %	60 %	20 %	374294093
21	NC_016624	GCGCC	2	10	33373	33382	0 %	0 %	40 %	60 %	374294099
22	NC_016624	AGCGC	2	10	33823	33832	20 %	0 %	40 %	40 %	374294100
23	NC_016624	GGCGC	2	10	35456	35465	0 %	0 %	60 %	40 %	374294102
24	NC_016624	TGACC	2	10	35690	35699	20 %	20 %	20 %	40 %	374294102
25	NC_016624	AGGGC	2	10	36884	36893	20 %	0 %	60 %	20 %	374294104
26	NC_016624	CCGGG	2	10	37753	37762	0 %	0 %	60 %	40 %	374294105
27	NC_016624	CGGCC	2	10	41187	41196	0 %	0 %	40 %	60 %	374294110
28	NC_016624	CGCGC	2	10	45668	45677	0 %	0 %	40 %	60 %	374294114
29	NC_016624	GGCGA	2	10	49181	49190	20 %	0 %	60 %	20 %	374294117
30	NC_016624	CGCCA	2	10	49340	49349	20 %	0 %	20 %	60 %	374294117
31	NC_016624	CGGTC	2	10	52836	52845	0 %	20 %	40 %	40 %	374294120
32	NC_016624	GCTCC	2	10	54115	54124	0 %	20 %	20 %	60 %	374294121
33	NC_016624	CGGCC	2	10	55266	55275	0 %	0 %	40 %	60 %	374294124
34	NC_016624	TCTGG	2	10	56433	56442	0 %	40 %	40 %	20 %	374294124
35	NC_016624	CGACG	2	10	56610	56619	20 %	0 %	40 %	40 %	374294124
36	NC_016624	TGCCG	2	10	56649	56658	0 %	20 %	40 %	40 %	374294124
37	NC_016624	TCGCC	2	10	56684	56693	0 %	20 %	20 %	60 %	374294124
38	NC_016624	AGCCC	2	10	58919	58928	20 %	0 %	20 %	60 %	374294127
39	NC_016624	CGGCC	2	10	59112	59121	0 %	0 %	40 %	60 %	374294127
40	NC_016624	CGGCC	2	10	61156	61165	0 %	0 %	40 %	60 %	374294129
41	NC_016624	TCAGG	2	10	62012	62021	20 %	20 %	40 %	20 %	374294130
42	NC_016624	AGGGC	2	10	63751	63760	20 %	0 %	60 %	20 %	374294132
43	NC_016624	CGGCC	2	10	64559	64568	0 %	0 %	40 %	60 %	374294133
44	NC_016624	GCACC	2	10	66288	66297	20 %	0 %	20 %	60 %	374294134
45	NC_016624	CAGCG	2	10	67052	67061	20 %	0 %	40 %	40 %	374294135
46	NC_016624	GCGCG	2	10	67240	67249	0 %	0 %	60 %	40 %	374294135
47	NC_016624	ATCGA	2	10	68951	68960	40 %	20 %	20 %	20 %	374294135
48	NC_016624	GCGCC	2	10	72971	72980	0 %	0 %	40 %	60 %	374294139
49	NC_016624	CCGGA	2	10	74200	74209	20 %	0 %	40 %	40 %	374294140
50	NC_016624	AGGTA	2	10	75054	75063	40 %	20 %	40 %	0 %	374294141
51	NC_016624	CCGGA	2	10	78412	78421	20 %	0 %	40 %	40 %	374294145
52	NC_016624	GGCTG	2	10	78476	78485	0 %	20 %	60 %	20 %	374294145
53	NC_016624	GACCG	2	10	78767	78776	20 %	0 %	40 %	40 %	374294145
54	NC_016624	TCGCC	2	10	79587	79596	0 %	20 %	20 %	60 %	374294145
55	NC_016624	GTCGG	2	10	80137	80146	0 %	20 %	60 %	20 %	374294145
56	NC_016624	TCCGG	2	10	82691	82700	0 %	20 %	40 %	40 %	374294148
57	NC_016624	GCCCG	2	10	83005	83014	0 %	0 %	40 %	60 %	374294148
58	NC_016624	CCGCG	2	10	87081	87090	0 %	0 %	40 %	60 %	374294152
59	NC_016624	ACCGA	2	10	89362	89371	40 %	0 %	20 %	40 %	374294152
60	NC_016624	GGCAA	2	10	94313	94322	40 %	0 %	40 %	20 %	374294154
61	NC_016624	GGCGC	2	10	96933	96942	0 %	0 %	60 %	40 %	374294156
62	NC_016624	TGCGG	2	10	97023	97032	0 %	20 %	60 %	20 %	374294156
63	NC_016624	ACCGG	2	10	100712	100721	20 %	0 %	40 %	40 %	374294159
64	NC_016624	GCCGG	2	10	100891	100900	0 %	0 %	60 %	40 %	374294160
65	NC_016624	GCCGC	2	10	103799	103808	0 %	0 %	40 %	60 %	374294162
66	NC_016624	TCGGG	2	10	104642	104651	0 %	20 %	60 %	20 %	374294163
67	NC_016624	CGATC	2	10	104880	104889	20 %	20 %	20 %	40 %	374294163
68	NC_016624	CTGGA	2	10	105480	105489	20 %	20 %	40 %	20 %	374294164
69	NC_016624	CCCGC	2	10	105866	105875	0 %	0 %	20 %	80 %	374294164
70	NC_016624	ACCCC	2	10	108717	108726	20 %	0 %	0 %	80 %	374294166
71	NC_016624	GACCT	2	10	111629	111638	20 %	20 %	20 %	40 %	374294168
72	NC_016624	TCCTC	2	10	113212	113221	0 %	40 %	0 %	60 %	374294170
73	NC_016624	CGCAG	2	10	114017	114026	20 %	0 %	40 %	40 %	374294171
74	NC_016624	GTCGC	2	10	116079	116088	0 %	20 %	40 %	40 %	374294171
75	NC_016624	GCCGC	2	10	116527	116536	0 %	0 %	40 %	60 %	374294171
76	NC_016624	TCGGT	2	10	117202	117211	0 %	40 %	40 %	20 %	374294172
77	NC_016624	GCGAG	2	10	117649	117658	20 %	0 %	60 %	20 %	374294172
78	NC_016624	ATCGT	2	10	120923	120932	20 %	40 %	20 %	20 %	374294175
79	NC_016624	GTCTT	2	10	121670	121679	0 %	60 %	20 %	20 %	374294175
80	NC_016624	ATGGC	2	10	122833	122842	20 %	20 %	40 %	20 %	374294176
81	NC_016624	CGTTC	2	10	124470	124479	0 %	40 %	20 %	40 %	374294178
82	NC_016624	ACCGA	2	10	128783	128792	40 %	0 %	20 %	40 %	374294181
83	NC_016624	GGTGC	2	10	129499	129508	0 %	20 %	60 %	20 %	374294182
84	NC_016624	CCCTG	2	10	129920	129929	0 %	20 %	20 %	60 %	374294182
85	NC_016624	TCCGC	2	10	131773	131782	0 %	20 %	20 %	60 %	374294184
86	NC_016624	GCAGC	2	10	134253	134262	20 %	0 %	40 %	40 %	374294186
87	NC_016624	AGCGA	2	10	134541	134550	40 %	0 %	40 %	20 %	374294186
88	NC_016624	TCCAT	2	10	134686	134695	20 %	40 %	0 %	40 %	374294186
89	NC_016624	CGGCG	2	10	135262	135271	0 %	0 %	60 %	40 %	374294187
90	NC_016624	CCGCG	2	10	138367	138376	0 %	0 %	40 %	60 %	374294190
91	NC_016624	CACCG	2	10	140076	140085	20 %	0 %	20 %	60 %	374294192
92	NC_016624	GCAGG	2	10	140784	140793	20 %	0 %	60 %	20 %	374294192
93	NC_016624	CCAAC	2	10	147892	147901	40 %	0 %	0 %	60 %	374294200
94	NC_016624	TCGCG	2	10	148363	148372	0 %	20 %	40 %	40 %	374294200
95	NC_016624	GTGCC	2	10	151864	151873	0 %	20 %	40 %	40 %	374294203
96	NC_016624	GGTCG	2	10	153870	153879	0 %	20 %	60 %	20 %	374294206
97	NC_016624	ACTTC	2	10	154059	154068	20 %	40 %	0 %	40 %	374294207
98	NC_016624	CCAGG	2	10	155528	155537	20 %	0 %	40 %	40 %	374294208
99	NC_016624	GCCGC	2	10	156180	156189	0 %	0 %	40 %	60 %	374294209
100	NC_016624	TCATG	2	10	156623	156632	20 %	40 %	20 %	20 %	374294210
101	NC_016624	CCGGT	2	10	156649	156658	0 %	20 %	40 %	40 %	374294210
102	NC_016624	GGTCG	2	10	157370	157379	0 %	20 %	60 %	20 %	374294211
103	NC_016624	CGGTA	2	10	161016	161025	20 %	20 %	40 %	20 %	374294213
104	NC_016624	GCCGG	2	10	162485	162494	0 %	0 %	60 %	40 %	374294215
105	NC_016624	GGCTC	2	10	163048	163057	0 %	20 %	40 %	40 %	374294216
106	NC_016624	GATCG	2	10	163298	163307	20 %	20 %	40 %	20 %	374294216
107	NC_016624	AGCCG	2	10	164139	164148	20 %	0 %	40 %	40 %	374294216
108	NC_016624	GCGCC	2	10	164704	164713	0 %	0 %	40 %	60 %	374294217
109	NC_016624	CACCG	2	10	166554	166563	20 %	0 %	20 %	60 %	374294219
110	NC_016624	GCCGC	2	10	168224	168233	0 %	0 %	40 %	60 %	374294220
111	NC_016624	CGCGG	2	10	169946	169955	0 %	0 %	60 %	40 %	374294221
112	NC_016624	CAGAC	2	10	170982	170991	40 %	0 %	20 %	40 %	374294221
113	NC_016624	TGCGC	2	10	173061	173070	0 %	20 %	40 %	40 %	374294223
114	NC_016624	TCGAA	2	10	175206	175215	40 %	20 %	20 %	20 %	374294227
115	NC_016624	CGCGG	2	10	175432	175441	0 %	0 %	60 %	40 %	374294227
116	NC_016624	GCGCC	2	10	177133	177142	0 %	0 %	40 %	60 %	374294229
117	NC_016624	GACCT	2	10	180944	180953	20 %	20 %	20 %	40 %	374294232
118	NC_016624	GGGCC	2	10	182761	182770	0 %	0 %	60 %	40 %	374294233
119	NC_016624	CGCGG	2	10	182795	182804	0 %	0 %	60 %	40 %	374294233
120	NC_016624	CGCGC	2	10	183781	183790	0 %	0 %	40 %	60 %	374294233
121	NC_016624	CGGGC	2	10	184388	184397	0 %	0 %	60 %	40 %	374294234
122	NC_016624	GATGG	2	10	189333	189342	20 %	20 %	60 %	0 %	374294239
123	NC_016624	CCCCG	2	10	191828	191837	0 %	0 %	20 %	80 %	374294240
124	NC_016624	CCGTC	2	10	194263	194272	0 %	20 %	20 %	60 %	374294241
125	NC_016624	GGCGA	2	10	195128	195137	20 %	0 %	60 %	20 %	374294243
126	NC_016624	AGCGG	2	10	196838	196847	20 %	0 %	60 %	20 %	374294245
127	NC_016624	CACCG	2	10	198500	198509	20 %	0 %	20 %	60 %	374294245
128	NC_016624	CCAGC	2	10	200931	200940	20 %	0 %	20 %	60 %	374294247
129	NC_016624	GGCAA	2	10	203044	203053	40 %	0 %	40 %	20 %	374294249
130	NC_016624	CGGCA	2	10	204036	204045	20 %	0 %	40 %	40 %	374294250
131	NC_016624	CGCGG	2	10	205019	205028	0 %	0 %	60 %	40 %	374294251
132	NC_016624	GCGCT	2	10	205332	205341	0 %	20 %	40 %	40 %	374294251
133	NC_016624	CGCCT	2	10	205592	205601	0 %	20 %	20 %	60 %	374294251
134	NC_016624	GCACA	2	10	206202	206211	40 %	0 %	20 %	40 %	374294252
135	NC_016624	CGGGC	2	10	206448	206457	0 %	0 %	60 %	40 %	374294252
136	NC_016624	CTTCG	2	10	207075	207084	0 %	40 %	20 %	40 %	374294253
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138	NC_016624	GCCCG	2	10	210235	210244	0 %	0 %	40 %	60 %	374294255
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148	NC_016624	CCGGC	2	10	218515	218524	0 %	0 %	40 %	60 %	374294263
149	NC_016624	GTCCT	2	10	219163	219172	0 %	40 %	20 %	40 %	374294264
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176	NC_016624	GCCGG	2	10	262007	262016	0 %	0 %	60 %	40 %	374294291
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234	NC_016624	GGCCA	2	10	330581	330590	20 %	0 %	40 %	40 %	374294356
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241	NC_016624	CATGC	2	10	339444	339453	20 %	20 %	20 %	40 %	374294361
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245	NC_016624	GCCAC	2	10	344880	344889	20 %	0 %	20 %	60 %	374294366
246	NC_016624	ACGCC	2	10	344890	344899	20 %	0 %	20 %	60 %	374294366
247	NC_016624	GGGCT	2	10	346825	346834	0 %	20 %	60 %	20 %	374294368
248	NC_016624	AGGAC	2	10	346904	346913	40 %	0 %	40 %	20 %	374294368
249	NC_016624	CGGAC	2	10	347501	347510	20 %	0 %	40 %	40 %	374294369
250	NC_016624	ACCCC	2	10	347998	348007	20 %	0 %	0 %	80 %	374294369
251	NC_016624	CGAAG	2	10	348809	348818	40 %	0 %	40 %	20 %	374294369
252	NC_016624	GGCGA	2	10	349043	349052	20 %	0 %	60 %	20 %	374294370
253	NC_016624	TGGGC	2	10	349745	349754	0 %	20 %	60 %	20 %	374294371
254	NC_016624	GATGC	2	10	351519	351528	20 %	20 %	40 %	20 %	374294372
255	NC_016624	ATGCC	2	10	352645	352654	20 %	20 %	20 %	40 %	374294373
256	NC_016624	GGCCG	2	10	353165	353174	0 %	0 %	60 %	40 %	374294373
257	NC_016624	GCGTC	2	10	361099	361108	0 %	20 %	40 %	40 %	374294381
258	NC_016624	GCCGC	2	10	364962	364971	0 %	0 %	40 %	60 %	374294385
259	NC_016624	CGCCA	2	10	365428	365437	20 %	0 %	20 %	60 %	374294385
260	NC_016624	GGTCG	2	10	367754	367763	0 %	20 %	60 %	20 %	374294387
261	NC_016624	TGCGC	2	10	368278	368287	0 %	20 %	40 %	40 %	374294387
262	NC_016624	GCGCC	2	10	368875	368884	0 %	0 %	40 %	60 %	374294388
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.