MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016624	AGCG	2	8	9762	9769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016624	TCCC	2	8	9829	9836	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016624	GGCC	2	8	9926	9933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016624	AGGG	2	8	9948	9955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016624	GGTC	2	8	14561	14568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016624	GTCC	2	8	15384	15391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016624	CTCC	2	8	26488	26495	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016624	CCCG	2	8	26610	26617	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016624	CGAA	2	8	30079	30086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016624	CGGT	2	8	30120	30127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016624	AGCC	2	8	30374	30381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016624	TCCG	2	8	31219	31226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016624	CCCG	2	8	32738	32745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_016624	CCCT	2	8	36544	36551	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016624	AGGA	2	8	38698	38705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016624	CGGG	2	8	38725	38732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016624	AATA	2	8	42781	42788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016624	ATTT	2	8	42965	42972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016624	TCGA	2	8	42993	43000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016624	ACAA	2	8	43150	43157	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016624	GGCT	2	8	43310	43317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016624	TGTT	2	8	44531	44538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016624	CCCT	2	8	44658	44665	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016624	CCCT	2	8	52239	52246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016624	GACC	2	8	52316	52323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016624	TCGG	2	8	52325	52332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016624	GAGG	2	8	52345	52352	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016624	TTGG	2	8	53267	53274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016624	TCCG	2	8	57891	57898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016624	TCCG	2	8	62536	62543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016624	GCCG	2	8	75291	75298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016624	CCAC	2	8	75344	75351	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_016624	CGGC	2	8	81304	81311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016624	ATGG	2	8	91847	91854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016624	TGGT	2	8	91903	91910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016624	GCCG	2	8	95239	95246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016624	GGAA	2	8	99272	99279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016624	TCCT	2	8	103298	103305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016624	CGTC	2	8	107901	107908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016624	CGGG	2	8	108055	108062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016624	ATTG	2	8	109979	109986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016624	GATG	2	8	112891	112898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016624	CGAG	2	8	124722	124729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016624	GTGC	2	8	125770	125777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016624	TCAA	2	8	126165	126172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016624	TCCG	2	8	126567	126574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016624	GGTC	2	8	126769	126776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016624	CAAG	2	8	127051	127058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016624	GCCG	2	8	130424	130431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016624	CGGA	2	8	130436	130443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016624	AAAC	2	8	133894	133901	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016624	CATC	2	8	134989	134996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016624	AACA	2	8	135034	135041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016624	GGCT	2	8	136524	136531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016624	GAGG	2	8	137217	137224	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016624	ACGT	2	8	137479	137486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016624	CATC	2	8	137646	137653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016624	TGTA	2	8	138612	138619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016624	GTTA	2	8	138906	138913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016624	TCAA	2	8	139000	139007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016624	GGCC	2	8	142278	142285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016624	GCAG	2	8	145994	146001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016624	GCCG	2	8	149127	149134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016624	GCCG	2	8	149149	149156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016624	CGGC	2	8	150742	150749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016624	GAAA	2	8	150796	150803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016624	CGGG	2	8	160072	160079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016624	CCGC	2	8	167447	167454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_016624	CGCC	2	8	167735	167742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_016624	ACGC	2	8	167766	167773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016624	GCCG	2	8	171082	171089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016624	GACG	2	8	171187	171194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016624	CTTC	2	8	174207	174214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016624	TCCT	2	8	174223	174230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016624	CATT	2	8	177909	177916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016624	TGAT	2	8	177953	177960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016624	TTCA	2	8	177963	177970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016624	GCAA	2	8	178174	178181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016624	CTGC	2	8	178228	178235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016624	GAGG	2	8	182290	182297	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016624	GGGA	2	8	184024	184031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016624	CCCT	2	8	185935	185942	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016624	AGGG	2	8	186050	186057	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016624	TTCG	2	8	191996	192003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016624	TGTT	2	8	192020	192027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016624	CCGG	2	8	200668	200675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016624	CGCC	2	8	203228	203235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_016624	GCCC	2	8	205969	205976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_016624	CGGG	2	8	207531	207538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016624	CCGC	2	8	207572	207579	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_016624	GCCC	2	8	217580	217587	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_016624	GGAG	2	8	218925	218932	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016624	CCCT	2	8	221575	221582	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_016624	CCCG	2	8	229426	229433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_016624	AACC	2	8	230815	230822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016624	ACGG	2	8	232611	232618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016624	TCCC	2	8	236229	236236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_016624	AGGG	2	8	236580	236587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016624	CCGG	2	8	239964	239971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016624	CGGC	2	8	240408	240415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016624	CTGC	2	8	245785	245792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016624	AGGG	2	8	249899	249906	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016624	CCGC	2	8	252781	252788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_016624	GATG	2	8	254297	254304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016624	CTCC	2	8	257079	257086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_016624	CTCC	2	8	257106	257113	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_016624	GGCC	2	8	257178	257185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016624	AGGG	2	8	257203	257210	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016624	ATCG	2	8	259940	259947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016624	TTGC	2	8	260093	260100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016624	CGGC	2	8	266712	266719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016624	GCTC	2	8	269299	269306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016624	GCCC	2	8	269390	269397	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_016624	TACG	2	8	276000	276007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016624	TCCG	2	8	279702	279709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016624	AGGC	2	8	279837	279844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016624	CCCA	2	8	282035	282042	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_016624	GGAC	2	8	283030	283037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016624	GCCC	2	8	289002	289009	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_016624	ACCC	2	8	289071	289078	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_016624	CGGG	2	8	292044	292051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016624	CGGG	2	8	294749	294756	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016624	TCCC	2	8	295115	295122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_016624	TCCG	2	8	301925	301932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016624	CCGC	2	8	302460	302467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_016624	CAAT	2	8	303105	303112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016624	CCGT	2	8	305574	305581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016624	GTTT	2	8	309352	309359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016624	GCCC	2	8	309366	309373	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016624	AACG	2	8	312071	312078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016624	GTTG	2	8	312087	312094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016624	TTTC	2	8	313524	313531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016624	CACC	2	8	328244	328251	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_016624	CCGT	2	8	330154	330161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016624	GGCA	2	8	334756	334763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016624	GCCC	2	8	334895	334902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_016624	TTCA	2	8	334916	334923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016624	TGGC	2	8	340849	340856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016624	GCCG	2	8	344805	344812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016624	CCGG	2	8	345517	345524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016624	CCCG	2	8	350573	350580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_016624	TCCC	2	8	359014	359021	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_016624	CGGA	2	8	370954	370961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016624	TCCC	2	8	374900	374907	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_016624	AAAG	2	8	380651	380658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016624	GTGC	2	8	381164	381171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016624	GACG	2	8	385863	385870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016624	ACGG	2	8	390322	390329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016624	TGGA	2	8	390530	390537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016624	GCAT	2	8	392935	392942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016624	GTTT	2	8	400373	400380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016624	AGGG	2	8	402284	402291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016624	GGCG	2	8	406651	406658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_016624	GATC	2	8	413940	413947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_016624	ACGG	2	8	415913	415920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016624	GGAC	2	8	418068	418075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_016624	GGCC	2	8	422613	422620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_016624	TCAA	2	8	423446	423453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_016624	CAAG	2	8	423475	423482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_016624	GGCG	2	8	426710	426717	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
161	NC_016624	TGGA	2	8	426983	426990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016624	CCGA	2	8	433436	433443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_016624	CGGG	2	8	436319	436326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
164	NC_016624	GGAG	2	8	444543	444550	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016624	CCGA	2	8	444607	444614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_016624	TCCC	2	8	456450	456457	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
167	NC_016624	CCGT	2	8	458680	458687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_016624	CGTG	2	8	458748	458755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_016624	GTGC	2	8	463494	463501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_016624	TGCC	2	8	471696	471703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_016624	GCCA	2	8	471709	471716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_016624	CGGC	2	8	474161	474168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_016624	GAAC	2	8	474610	474617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_016624	GTGA	2	8	474953	474960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016624	GGAC	2	8	475265	475272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_016624	TGCA	2	8	475363	475370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_016624	ACGG	2	8	476174	476181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_016624	GGAA	2	8	476420	476427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_016624	GCGA	2	8	476912	476919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_016624	CAGA	2	8	477590	477597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_016624	GGTG	2	8	477599	477606	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016624	AAAG	2	8	477734	477741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.