MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016623	ATCCC	2	10	1011	1020	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016623	GCACC	2	10	1692	1701	20 %	0 %	20 %	60 %	374293522
3	NC_016623	GGTCG	2	10	3271	3280	0 %	20 %	60 %	20 %	374293523
4	NC_016623	CGGCG	2	10	6340	6349	0 %	0 %	60 %	40 %	374293526
5	NC_016623	CGGCG	2	10	6616	6625	0 %	0 %	60 %	40 %	374293526
6	NC_016623	CGGAG	2	10	8366	8375	20 %	0 %	60 %	20 %	374293526
7	NC_016623	AGGGA	2	10	9157	9166	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016623	CAGCC	2	10	11430	11439	20 %	0 %	20 %	60 %	374293529
9	NC_016623	CGCGG	2	10	13103	13112	0 %	0 %	60 %	40 %	374293531
10	NC_016623	GCACC	2	10	14170	14179	20 %	0 %	20 %	60 %	374293531
11	NC_016623	CGGGT	2	10	15543	15552	0 %	20 %	60 %	20 %	374293532
12	NC_016623	CATTG	2	10	15707	15716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016623	AGGCA	2	10	15803	15812	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016623	CGACC	2	10	17598	17607	20 %	0 %	20 %	60 %	374293535
15	NC_016623	CCGCC	2	10	18509	18518	0 %	0 %	20 %	80 %	374293536
16	NC_016623	TCGGG	2	10	20236	20245	0 %	20 %	60 %	20 %	374293539
17	NC_016623	TCGCC	2	10	21069	21078	0 %	20 %	20 %	60 %	374293540
18	NC_016623	CAGGG	2	10	24400	24409	20 %	0 %	60 %	20 %	374293542
19	NC_016623	CACCG	2	10	24857	24866	20 %	0 %	20 %	60 %	374293543
20	NC_016623	AGCGC	2	10	26100	26109	20 %	0 %	40 %	40 %	374293544
21	NC_016623	GGCCC	2	10	27445	27454	0 %	0 %	40 %	60 %	374293545
22	NC_016623	GCGCC	2	10	27740	27749	0 %	0 %	40 %	60 %	374293546
23	NC_016623	CCCAG	2	10	28780	28789	20 %	0 %	20 %	60 %	374293546
24	NC_016623	CCGGC	2	10	28795	28804	0 %	0 %	40 %	60 %	374293546
25	NC_016623	GCGAG	2	10	29628	29637	20 %	0 %	60 %	20 %	374293547
26	NC_016623	CGCTA	2	10	30418	30427	20 %	20 %	20 %	40 %	374293548
27	NC_016623	CCGGC	2	10	31162	31171	0 %	0 %	40 %	60 %	374293549
28	NC_016623	ACGGC	2	10	31969	31978	20 %	0 %	40 %	40 %	374293550
29	NC_016623	CAACC	2	10	34222	34231	40 %	0 %	0 %	60 %	374293551
30	NC_016623	CGGGA	2	10	35121	35130	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016623	GACCG	2	10	35616	35625	20 %	0 %	40 %	40 %	374293552
32	NC_016623	TCCGC	2	10	36571	36580	0 %	20 %	20 %	60 %	374293554
33	NC_016623	CGCGG	2	10	44010	44019	0 %	0 %	60 %	40 %	374293557
34	NC_016623	CGGTG	2	10	47223	47232	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016623	TGCCC	2	10	49236	49245	0 %	20 %	20 %	60 %	374293562
36	NC_016623	CATGG	2	10	49300	49309	20 %	20 %	40 %	20 %	374293562
37	NC_016623	GGCCG	2	10	50022	50031	0 %	0 %	60 %	40 %	374293562
38	NC_016623	CGCGC	2	10	50154	50163	0 %	0 %	40 %	60 %	374293562
39	NC_016623	GCGCC	2	10	51053	51062	0 %	0 %	40 %	60 %	374293564
40	NC_016623	TGAAC	2	10	51170	51179	40 %	20 %	20 %	20 %	374293564
41	NC_016623	CATGC	2	10	51210	51219	20 %	20 %	20 %	40 %	374293564
42	NC_016623	GCCCG	2	10	53286	53295	0 %	0 %	40 %	60 %	374293566
43	NC_016623	CGCGG	2	10	53375	53384	0 %	0 %	60 %	40 %	374293566
44	NC_016623	CCGGC	2	10	53608	53617	0 %	0 %	40 %	60 %	374293566
45	NC_016623	ACAGA	2	10	55362	55371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016623	GAAGT	2	10	55785	55794	40 %	20 %	40 %	0 %	374293568
47	NC_016623	CGGCA	2	10	56463	56472	20 %	0 %	40 %	40 %	374293568
48	NC_016623	CGACG	2	10	58332	58341	20 %	0 %	40 %	40 %	374293572
49	NC_016623	GACGG	2	10	58654	58663	20 %	0 %	60 %	20 %	374293572
50	NC_016623	GCGCT	2	10	60094	60103	0 %	20 %	40 %	40 %	374293574
51	NC_016623	CCATG	2	10	62896	62905	20 %	20 %	20 %	40 %	374293577
52	NC_016623	TCCGC	2	10	62976	62985	0 %	20 %	20 %	60 %	374293577
53	NC_016623	ACCCG	2	10	63282	63291	20 %	0 %	20 %	60 %	374293577
54	NC_016623	CCATC	2	10	64842	64851	20 %	20 %	0 %	60 %	374293578
55	NC_016623	TGCCT	2	10	65590	65599	0 %	40 %	20 %	40 %	374293578
56	NC_016623	GCGAG	2	10	65882	65891	20 %	0 %	60 %	20 %	374293579
57	NC_016623	CGGAT	2	10	67598	67607	20 %	20 %	40 %	20 %	374293580
58	NC_016623	GACGT	2	10	68403	68412	20 %	20 %	40 %	20 %	374293580
59	NC_016623	CCCCA	2	10	69684	69693	20 %	0 %	0 %	80 %	374293581
60	NC_016623	ACGGA	2	10	71629	71638	40 %	0 %	40 %	20 %	374293582
61	NC_016623	CCGGC	2	10	72143	72152	0 %	0 %	40 %	60 %	374293583
62	NC_016623	GGGCT	2	10	73999	74008	0 %	20 %	60 %	20 %	374293584
63	NC_016623	GCCGC	2	10	75843	75852	0 %	0 %	40 %	60 %	374293586
64	NC_016623	TTCCC	2	10	76429	76438	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_016623	GTTCG	2	10	76588	76597	0 %	40 %	40 %	20 %	374293587
66	NC_016623	CCGGA	2	10	77652	77661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016623	CTGGT	2	10	77783	77792	0 %	40 %	40 %	20 %	374293588
68	NC_016623	ACCGG	2	10	78392	78401	20 %	0 %	40 %	40 %	374293589
69	NC_016623	CGCGC	2	10	80124	80133	0 %	0 %	40 %	60 %	374293590
70	NC_016623	GCCTT	2	10	80374	80383	0 %	40 %	20 %	40 %	374293591
71	NC_016623	CGGGC	2	10	81090	81099	0 %	0 %	60 %	40 %	374293591
72	NC_016623	CATCG	2	10	82211	82220	20 %	20 %	20 %	40 %	374293593
73	NC_016623	CGCCT	2	10	82251	82260	0 %	20 %	20 %	60 %	374293593
74	NC_016623	TCGGC	2	10	82737	82746	0 %	20 %	40 %	40 %	374293593
75	NC_016623	TGCGC	2	10	83588	83597	0 %	20 %	40 %	40 %	374293593
76	NC_016623	CGGGC	2	10	85140	85149	0 %	0 %	60 %	40 %	374293595
77	NC_016623	CGGGA	2	10	86979	86988	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016623	TGCCC	2	10	87251	87260	0 %	20 %	20 %	60 %	374293597
79	NC_016623	GATCG	2	10	87512	87521	20 %	20 %	40 %	20 %	374293597
80	NC_016623	CCGGA	2	10	87679	87688	20 %	0 %	40 %	40 %	374293597
81	NC_016623	TCTGG	2	10	87740	87749	0 %	40 %	40 %	20 %	374293597
82	NC_016623	GGCCG	2	10	88380	88389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016623	GGCTG	2	10	89916	89925	0 %	20 %	60 %	20 %	374293601
84	NC_016623	CACCG	2	10	90080	90089	20 %	0 %	20 %	60 %	374293601
85	NC_016623	CCCGC	2	10	90510	90519	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_016623	GGTCG	2	10	93682	93691	0 %	20 %	60 %	20 %	374293605
87	NC_016623	CCGGC	2	10	93759	93768	0 %	0 %	40 %	60 %	374293605
88	NC_016623	CAGAT	2	10	93851	93860	40 %	20 %	20 %	20 %	374293605
89	NC_016623	CAGTC	2	10	94231	94240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016623	CCGCG	2	10	94590	94599	0 %	0 %	40 %	60 %	374293606
91	NC_016623	GACGG	2	10	99193	99202	20 %	0 %	60 %	20 %	374293608
92	NC_016623	GCGAG	2	10	99608	99617	20 %	0 %	60 %	20 %	374293608
93	NC_016623	GCGGA	2	10	100570	100579	20 %	0 %	60 %	20 %	374293608
94	NC_016623	AAGCC	2	10	102356	102365	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016623	GCGTC	2	10	105301	105310	0 %	20 %	40 %	40 %	374293612
96	NC_016623	CCTGC	2	10	107046	107055	0 %	20 %	20 %	60 %	374293614
97	NC_016623	TCCCG	2	10	109718	109727	0 %	20 %	20 %	60 %	374293615
98	NC_016623	CGGGC	2	10	111668	111677	0 %	0 %	60 %	40 %	374293619
99	NC_016623	TGACG	2	10	113445	113454	20 %	20 %	40 %	20 %	374293621
100	NC_016623	CCGCA	2	10	113559	113568	20 %	0 %	20 %	60 %	374293621
101	NC_016623	CGCCC	2	10	113869	113878	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_016623	GCTCG	2	10	114521	114530	0 %	20 %	40 %	40 %	374293622
103	NC_016623	GACCA	2	10	116196	116205	40 %	0 %	20 %	40 %	374293622
104	NC_016623	TGGTC	2	10	116996	117005	0 %	40 %	40 %	20 %	374293623
105	NC_016623	CCGGC	2	10	119919	119928	0 %	0 %	40 %	60 %	374293625
106	NC_016623	GCGCG	2	10	120422	120431	0 %	0 %	60 %	40 %	374293626
107	NC_016623	CGGCG	2	10	120879	120888	0 %	0 %	60 %	40 %	374293626
108	NC_016623	CGTGA	2	10	121418	121427	20 %	20 %	40 %	20 %	374293627
109	NC_016623	GAAGT	2	10	121613	121622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016623	GTGTC	2	10	125290	125299	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016623	CGAGC	2	10	127014	127023	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016623	CCCAG	2	10	129919	129928	20 %	0 %	20 %	60 %	374293635
113	NC_016623	CCAAG	2	10	130827	130836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016623	GCCCC	2	10	132150	132159	0 %	0 %	20 %	80 %	374293637
115	NC_016623	TCCCC	2	10	132645	132654	0 %	20 %	0 %	80 %	374293638
116	NC_016623	GCGGT	2	10	133160	133169	0 %	20 %	60 %	20 %	374293638
117	NC_016623	GGTCA	2	10	133249	133258	20 %	20 %	40 %	20 %	374293638
118	NC_016623	ATTTT	2	10	133719	133728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016623	ACCCC	2	10	135740	135749	20 %	0 %	0 %	80 %	374293640
120	NC_016623	GCGCC	2	10	138026	138035	0 %	0 %	40 %	60 %	374293642
121	NC_016623	CCTTC	2	10	139711	139720	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016623	GGGGC	2	10	139741	139750	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016623	CCACC	2	10	141821	141830	20 %	0 %	0 %	80 %	374293645
124	NC_016623	CATGG	2	10	141906	141915	20 %	20 %	40 %	20 %	374293645
125	NC_016623	GGGAG	2	10	143863	143872	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016623	CCGGC	2	10	143906	143915	0 %	0 %	40 %	60 %	374293647
127	NC_016623	CCGGC	2	10	144168	144177	0 %	0 %	40 %	60 %	374293647
128	NC_016623	GCGTC	2	10	144761	144770	0 %	20 %	40 %	40 %	374293647
129	NC_016623	GGCTC	2	10	144845	144854	0 %	20 %	40 %	40 %	374293647
130	NC_016623	TGGGG	2	10	145137	145146	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016623	GTGCC	2	10	145654	145663	0 %	20 %	40 %	40 %	374293648
132	NC_016623	CTCCG	2	10	150720	150729	0 %	20 %	20 %	60 %	374293653
133	NC_016623	GGCGC	2	10	151079	151088	0 %	0 %	60 %	40 %	374293653
134	NC_016623	GGGCA	2	10	152518	152527	20 %	0 %	60 %	20 %	374293654
135	NC_016623	CGCGG	2	10	152894	152903	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016623	CGCTG	2	10	155523	155532	0 %	20 %	40 %	40 %	374293658
137	NC_016623	CGGCT	2	10	158314	158323	0 %	20 %	40 %	40 %	374293662
138	NC_016623	ACGCC	2	10	159743	159752	20 %	0 %	20 %	60 %	374293665
139	NC_016623	CCCTG	2	10	160320	160329	0 %	20 %	20 %	60 %	374293665
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260	NC_016623	CGACC	2	10	279015	279024	20 %	0 %	20 %	60 %	374293773
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263	NC_016623	GCGCA	2	10	280736	280745	20 %	0 %	40 %	40 %	374293774
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