MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016623	ATCCC	2	10	1011	1020	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016623	AGGGA	2	10	9157	9166	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016623	CATTG	2	10	15707	15716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016623	AGGCA	2	10	15803	15812	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016623	CGGGA	2	10	35121	35130	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016623	CGGTG	2	10	47223	47232	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016623	ACAGA	2	10	55362	55371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016623	TTCCC	2	10	76429	76438	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016623	CCGGA	2	10	77652	77661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016623	CGGGA	2	10	86979	86988	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016623	GGCCG	2	10	88380	88389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016623	CCCGC	2	10	90510	90519	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_016623	CAGTC	2	10	94231	94240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016623	AAGCC	2	10	102356	102365	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016623	CGCCC	2	10	113869	113878	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_016623	GAAGT	2	10	121613	121622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016623	GTGTC	2	10	125290	125299	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016623	CGAGC	2	10	127014	127023	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016623	CCAAG	2	10	130827	130836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016623	ATTTT	2	10	133719	133728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016623	CCTTC	2	10	139711	139720	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016623	GGGGC	2	10	139741	139750	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016623	GGGAG	2	10	143863	143872	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016623	TGGGG	2	10	145137	145146	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016623	CGCGG	2	10	152894	152903	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016623	GTCAT	2	10	169198	169207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016623	ACCTG	2	10	169600	169609	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016623	ACGAT	2	10	193353	193362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016623	CGGAC	2	10	199499	199508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016623	CGGCT	2	10	206747	206756	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016623	ACCGG	2	10	206803	206812	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016623	CCGGT	2	10	207748	207757	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016623	GACGG	2	10	212148	212157	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016623	ACCGG	2	10	216255	216264	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016623	AACAG	2	10	216351	216360	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016623	CCCGC	2	10	218219	218228	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_016623	GGCCC	2	10	226538	226547	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_016623	GGACC	2	10	227169	227178	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016623	GACAG	2	10	232151	232160	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016623	AGGAC	2	10	242816	242825	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016623	GTGGA	2	10	244491	244500	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016623	CCCGC	2	10	276202	276211	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_016623	GGACA	2	10	280385	280394	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016623	TGCCC	2	10	331882	331891	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_016623	GACCG	2	10	337791	337800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016623	ACAAA	2	10	346119	346128	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016623	ATTTT	2	10	355951	355960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016623	CGCGC	2	10	359785	359794	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_016623	TCCCC	2	10	364144	364153	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
50	NC_016623	AAGGT	2	10	381156	381165	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016623	ACCAA	2	10	381196	381205	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016623	CGGCC	2	10	381219	381228	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016623	CCCCT	2	10	388440	388449	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_016623	TCCCG	2	10	388481	388490	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_016623	TCCCG	2	10	402208	402217	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_016623	GGTGC	2	10	405937	405946	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016623	TCCCT	2	10	408191	408200	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016623	CGGGA	2	10	408327	408336	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016623	CCCGG	2	10	410628	410637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_016623	CGGGA	2	10	413707	413716	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016623	GTTTT	2	10	419704	419713	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016623	CGACA	2	10	427447	427456	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016623	AGCCG	2	10	450458	450467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016623	GGCAG	2	10	473378	473387	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016623	CGGGA	2	10	487143	487152	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016623	TGCGG	2	10	490625	490634	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016623	CCGTC	2	10	499972	499981	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_016623	GCGGG	2	10	508035	508044	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016623	CGCAT	2	10	509347	509356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016623	TGACC	2	10	512072	512081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016623	CTGCG	2	10	550873	550882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016623	CGTCG	2	10	550889	550898	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016623	CCTAT	2	10	553942	553951	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016623	GCGGG	2	10	558195	558204	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016623	CGGGA	2	10	569842	569851	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016623	CGTTG	2	10	570047	570056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016623	TCAAA	2	10	570067	570076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016623	TATTT	2	10	571834	571843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016623	TGCCG	2	10	576680	576689	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016623	CCCCT	2	10	602266	602275	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_016623	GGGCG	2	10	615801	615810	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016623	CGGCG	2	10	615814	615823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016623	GGGGA	2	10	621744	621753	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016623	CGACC	2	10	632567	632576	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016623	GACGG	2	10	638597	638606	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016623	TCGTG	2	10	645513	645522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016623	AATCA	2	10	647357	647366	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016623	AGAGG	2	10	648305	648314	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016623	TTGAA	2	10	648323	648332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.