MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016623	GCCG	2	8	8489	8496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016623	CGTC	2	8	16604	16611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016623	AATA	2	8	16749	16756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016623	CGGC	2	8	16895	16902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016623	CGGG	2	8	30221	30228	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016623	CATG	2	8	33742	33749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016623	GTCG	2	8	33835	33842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016623	GGGC	2	8	35692	35699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016623	CCGC	3	12	35712	35723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_016623	CACG	2	8	37764	37771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016623	CGGG	2	8	38152	38159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016623	GACG	2	8	38641	38648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016623	GGCG	2	8	38670	38677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016623	GCGG	2	8	38739	38746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016623	GCCT	2	8	39517	39524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016623	CCCG	2	8	40841	40848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_016623	GCCG	2	8	40857	40864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016623	GTCC	2	8	42372	42379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016623	CCGG	2	8	45035	45042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016623	GGCG	2	8	50515	50522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016623	GCGA	2	8	54672	54679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016623	CCAG	2	8	56663	56670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016623	GGCT	2	8	56773	56780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016623	AGGA	2	8	60323	60330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016623	CCCT	2	8	61953	61960	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016623	CCGG	2	8	66496	66503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016623	GATC	2	8	66555	66562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016623	TTGG	2	8	68907	68914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016623	GCCG	2	8	71823	71830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016623	TCCT	2	8	76282	76289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016623	GCAC	2	8	76489	76496	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016623	TCTT	2	8	79623	79630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016623	CGGC	2	8	79793	79800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016623	TGCC	2	8	88405	88412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016623	GCTG	2	8	91786	91793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016623	CGGC	2	8	92064	92071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016623	CGAA	2	8	102381	102388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016623	GGCG	2	8	102397	102404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016623	GTAC	2	8	106013	106020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016623	CAGC	2	8	106221	106228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016623	CATT	2	8	110627	110634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016623	CGGG	2	8	113853	113860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016623	CCCG	2	8	113918	113925	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_016623	TCGC	2	8	114059	114066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016623	TTCG	2	8	120167	120174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016623	GTCT	2	8	127737	127744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016623	CAGA	2	8	127762	127769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016623	CGGC	2	8	130847	130854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016623	GTAT	2	8	134137	134144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016623	AGTA	2	8	134146	134153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016623	CATG	2	8	134226	134233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016623	GGCA	2	8	135815	135822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016623	CCCT	2	8	145048	145055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016623	CGGC	3	12	146159	146170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016623	CAGT	2	8	146240	146247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016623	TTCC	2	8	147429	147436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016623	TACA	2	8	152866	152873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016623	GGCC	2	8	153787	153794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016623	GAAG	2	8	158984	158991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016623	TCCG	2	8	163567	163574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016623	TTCT	2	8	164863	164870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016623	CATG	2	8	167890	167897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016623	GACC	2	8	178322	178329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016623	CGGC	2	8	181610	181617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016623	ATCC	2	8	186635	186642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016623	GTCC	2	8	199202	199209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016623	CTTC	2	8	199215	199222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016623	CCGG	2	8	199363	199370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016623	GTCG	2	8	199637	199644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016623	CCCG	2	8	200935	200942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_016623	CCGG	2	8	201835	201842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016623	ACCG	2	8	204152	204159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016623	CCGA	2	8	209542	209549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016623	CCCT	2	8	212704	212711	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_016623	GGGA	2	8	212800	212807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016623	CCTT	2	8	216165	216172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016623	GATC	2	8	216214	216221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016623	CGGC	2	8	216270	216277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016623	CCGC	2	8	216318	216325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_016623	CGGG	2	8	217219	217226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016623	GGCT	2	8	217250	217257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016623	AAAT	2	8	218649	218656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016623	CGAA	2	8	221292	221299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016623	CCGG	2	8	228595	228602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016623	GCCC	2	8	228681	228688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_016623	GCCG	2	8	231439	231446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016623	CGGA	2	8	238087	238094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016623	AAAG	2	8	241910	241917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016623	GACC	2	8	241973	241980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016623	AAGG	2	8	242042	242049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016623	GCCG	2	8	242650	242657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016623	CCCT	2	8	243474	243481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_016623	GGTC	2	8	244740	244747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016623	TCCC	2	8	246698	246705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_016623	CGGC	2	8	246713	246720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016623	AGGG	2	8	246822	246829	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016623	GACC	2	8	253093	253100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016623	ATCA	2	8	253317	253324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016623	CCAA	2	8	255906	255913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016623	TCCC	2	8	256758	256765	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_016623	GTCA	2	8	262187	262194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016623	TCTT	2	8	263069	263076	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016623	TTCC	2	8	264717	264724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016623	GCCG	2	8	264886	264893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016623	CAAA	2	8	269350	269357	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016623	AAGC	2	8	275072	275079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016623	GATG	2	8	275947	275954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016623	CGAT	2	8	275995	276002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016623	CCCG	2	8	276338	276345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_016623	ATCC	2	8	276349	276356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016623	GCGG	2	8	276602	276609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016623	GCGG	2	8	276666	276673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016623	ATCT	2	8	276865	276872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016623	ACCG	2	8	277644	277651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016623	GGCC	2	8	280280	280287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016623	AAAG	2	8	281147	281154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016623	GGTG	2	8	281586	281593	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016623	CCCG	2	8	286294	286301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_016623	TTCG	2	8	289715	289722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016623	TCCC	2	8	296285	296292	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_016623	CGGC	2	8	296300	296307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016623	AGGG	2	8	296411	296418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016623	GACG	2	8	303835	303842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016623	CGCC	2	8	319584	319591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_016623	TATT	2	8	325385	325392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016623	CGCC	2	8	327565	327572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_016623	CCTT	2	8	335611	335618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016623	CAAT	2	8	336520	336527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016623	CCGA	2	8	336533	336540	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016623	GAAC	2	8	337823	337830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016623	CGCC	2	8	344238	344245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_016623	ATAG	2	8	355268	355275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016623	TATT	2	8	355371	355378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016623	TTCC	2	8	355381	355388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016623	GCCG	2	8	355835	355842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016623	ATCC	2	8	355912	355919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016623	CCAT	2	8	359471	359478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016623	GCCG	2	8	360044	360051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016623	TCCC	2	8	364048	364055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016623	CGGC	2	8	364063	364070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016623	AGGG	2	8	367822	367829	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016623	CCAT	2	8	374221	374228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016623	TGCC	2	8	374967	374974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016623	CCTT	2	8	381136	381143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016623	GGGT	2	8	381424	381431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016623	GGGT	2	8	386519	386526	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016623	GCCC	2	8	391391	391398	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_016623	GGCA	2	8	391857	391864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016623	CCGT	2	8	392389	392396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016623	TCCT	2	8	393016	393023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016623	CCCT	2	8	395153	395160	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_016623	CGGC	2	8	395166	395173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_016623	CCCG	2	8	399197	399204	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_016623	ATCC	2	8	399228	399235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_016623	CCCT	2	8	405948	405955	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_016623	GAGG	2	8	406029	406036	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016623	GGGA	2	8	406049	406056	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016623	AGGG	2	8	410854	410861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016623	TAGC	2	8	412234	412241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_016623	GAGG	2	8	413584	413591	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_016623	TCCC	2	8	433825	433832	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
171	NC_016623	AGGG	2	8	433924	433931	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016623	CCCT	2	8	435247	435254	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
173	NC_016623	GAGG	2	8	435320	435327	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016623	GGGA	2	8	435340	435347	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_016623	TCCC	2	8	445032	445039	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
177	NC_016623	GGAG	2	8	459361	459368	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016623	TTTG	2	8	472423	472430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_016623	CGGA	2	8	472447	472454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_016623	GAGG	2	8	482980	482987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016623	CGCC	2	8	485120	485127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
188	NC_016623	CCCT	2	8	485131	485138	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
189	NC_016623	GGCC	2	8	485221	485228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
190	NC_016623	GGGA	2	8	485237	485244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
191	NC_016623	CCCT	2	8	487131	487138	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
192	NC_016623	ATCC	2	8	491479	491486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_016623	ATCG	2	8	497434	497441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
194	NC_016623	GCCG	2	8	499094	499101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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197	NC_016623	GCCG	2	8	505295	505302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
198	NC_016623	TCGT	2	8	506298	506305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_016623	GGGA	2	8	506349	506356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_016623	GCCG	2	8	509336	509343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
203	NC_016623	GGTT	2	8	515587	515594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
204	NC_016623	GCCG	2	8	529879	529886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.