MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 13549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016623	TAC	2	6	26	31	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016623	GTG	2	6	41	46	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016623	ACC	2	6	123	128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016623	TGG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293520
5	NC_016623	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293520
6	NC_016623	TGA	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016623	TCA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016623	CGT	2	6	541	546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293521
9	NC_016623	AGG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016623	GGC	2	6	786	791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016623	GCA	3	9	861	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016623	TGG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016623	CGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016623	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016623	GCA	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
16	NC_016623	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
17	NC_016623	GTG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
18	NC_016623	GTG	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
19	NC_016623	CTG	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
20	NC_016623	CGA	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
21	NC_016623	TCA	3	9	1481	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
22	NC_016623	CTT	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293522
23	NC_016623	GAA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293522
24	NC_016623	GCG	2	6	1686	1691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
25	NC_016623	TGA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293522
26	NC_016623	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
27	NC_016623	GAG	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293522
28	NC_016623	GGT	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
29	NC_016623	CTG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
30	NC_016623	GCG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
31	NC_016623	CGG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
32	NC_016623	TCG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
33	NC_016623	CCG	2	6	2079	2084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
34	NC_016623	CTG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
35	NC_016623	CGA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
36	NC_016623	GCC	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
37	NC_016623	CTG	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
38	NC_016623	GGT	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
39	NC_016623	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
40	NC_016623	TCG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
41	NC_016623	GCG	3	9	2292	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
42	NC_016623	CTG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
43	NC_016623	CTG	3	9	2386	2394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
44	NC_016623	CGG	2	6	2405	2410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
45	NC_016623	GCC	2	6	2462	2467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
46	NC_016623	TCA	3	9	2513	2521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
47	NC_016623	TCG	3	9	2528	2536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
48	NC_016623	GGC	3	9	2571	2579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
49	NC_016623	GAT	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293522
50	NC_016623	ATC	3	9	2644	2652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
51	NC_016623	CTG	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
52	NC_016623	GCT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
53	NC_016623	CGG	2	6	2750	2755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
54	NC_016623	GGC	3	9	2778	2786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
55	NC_016623	CAA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374293522
56	NC_016623	GCG	2	6	2815	2820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
57	NC_016623	CAG	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
58	NC_016623	CGG	2	6	2970	2975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
59	NC_016623	GCT	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
60	NC_016623	CGC	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016623	AGG	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293523
62	NC_016623	CTG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293523
63	NC_016623	GTG	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293523
64	NC_016623	GCG	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293523
65	NC_016623	CAT	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293523
66	NC_016623	GTC	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293523
67	NC_016623	GCT	3	9	3526	3534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293523
68	NC_016623	CAC	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293524
69	NC_016623	CGG	2	6	3649	3654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293524
70	NC_016623	CCG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293524
71	NC_016623	TCC	2	6	3783	3788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293524
72	NC_016623	TTC	2	6	3800	3805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293524
73	NC_016623	TCG	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293524
74	NC_016623	CTG	2	6	3849	3854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293524
75	NC_016623	GCG	3	9	3912	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293524
76	NC_016623	CAG	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293524
77	NC_016623	TCC	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293524
78	NC_016623	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293524
79	NC_016623	TGG	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293524
80	NC_016623	CAG	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293524
81	NC_016623	CAG	2	6	4267	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293525
82	NC_016623	TCG	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
83	NC_016623	TCT	2	6	4326	4331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293525
84	NC_016623	GAT	2	6	4366	4371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293525
85	NC_016623	GGC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293525
86	NC_016623	TCG	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
87	NC_016623	GCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293525
88	NC_016623	CAC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293525
89	NC_016623	CGC	2	6	4532	4537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293525
90	NC_016623	AGC	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293525
91	NC_016623	TCC	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293525
92	NC_016623	CGT	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
93	NC_016623	TCG	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
94	NC_016623	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293526
95	NC_016623	CAG	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
96	NC_016623	CGG	2	6	4903	4908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
97	NC_016623	CCT	3	9	4924	4932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
98	NC_016623	AGG	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293526
99	NC_016623	TCG	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
100	NC_016623	CGG	2	6	5101	5106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
101	NC_016623	CGG	2	6	5136	5141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
102	NC_016623	GAG	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293526
103	NC_016623	ATG	3	9	5148	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293526
104	NC_016623	CAG	2	6	5189	5194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
105	NC_016623	CAT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293526
106	NC_016623	CAG	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
107	NC_016623	CCG	2	6	5293	5298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
108	NC_016623	TCG	3	9	5361	5369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
109	NC_016623	CGG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
110	NC_016623	GCG	2	6	5591	5596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
111	NC_016623	GTG	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293526
112	NC_016623	GGC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
113	NC_016623	CCG	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
114	NC_016623	GGC	2	6	5786	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
115	NC_016623	CAC	2	6	5828	5833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293526
116	NC_016623	CTT	2	6	5888	5893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293526
117	NC_016623	CAG	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
118	NC_016623	TCT	2	6	6046	6051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293526
119	NC_016623	GCA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
120	NC_016623	CTC	3	9	6092	6100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
121	NC_016623	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
122	NC_016623	CTC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
123	NC_016623	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
124	NC_016623	GCC	3	9	6377	6385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
125	NC_016623	CAC	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293526
126	NC_016623	GTC	2	6	6425	6430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
127	NC_016623	GGC	3	9	6455	6463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
128	NC_016623	CCG	2	6	6469	6474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
129	NC_016623	CGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
130	NC_016623	CGT	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
131	NC_016623	CGC	2	6	6572	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
132	NC_016623	CTC	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
133	NC_016623	CCT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
134	NC_016623	GTG	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293526
135	NC_016623	CAG	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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145	NC_016623	CCG	2	6	7148	7153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
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147	NC_016623	GTC	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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153	NC_016623	TCC	2	6	7533	7538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
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165	NC_016623	CGG	2	6	8038	8043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
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173	NC_016623	CAG	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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177	NC_016623	TCG	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_016623	CTT	2	6	18690	18695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293536
384	NC_016623	CGG	2	6	18728	18733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293536
385	NC_016623	TCC	2	6	18797	18802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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492	NC_016623	TCA	2	6	23357	23362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293542
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497	NC_016623	GAA	2	6	23532	23537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293542
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500	NC_016623	CAG	2	6	23562	23567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293542

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