MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016623	G	6	6	4142	4147	0 %	0 %	100 %	0 %	374293524
2	NC_016623	G	6	6	4783	4788	0 %	0 %	100 %	0 %	374293526
3	NC_016623	G	6	6	26698	26703	0 %	0 %	100 %	0 %	374293545
4	NC_016623	A	6	6	30270	30275	100 %	0 %	0 %	0 %	374293548
5	NC_016623	A	7	7	30462	30468	100 %	0 %	0 %	0 %	374293548
6	NC_016623	C	6	6	31290	31295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_016623	G	6	6	32456	32461	0 %	0 %	100 %	0 %	374293550
8	NC_016623	C	6	6	33546	33551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_016623	G	6	6	33631	33636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016623	C	6	6	33674	33679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_016623	G	7	7	33699	33705	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016623	C	6	6	35160	35165	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_016623	G	6	6	38157	38162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016623	C	6	6	42636	42641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_016623	A	6	6	46586	46591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016623	C	6	6	50551	50556	0 %	0 %	0 %	100 %	374293564
17	NC_016623	G	6	6	50918	50923	0 %	0 %	100 %	0 %	374293564
18	NC_016623	C	6	6	53041	53046	0 %	0 %	0 %	100 %	374293566
19	NC_016623	C	6	6	54247	54252	0 %	0 %	0 %	100 %	374293566
20	NC_016623	T	6	6	55253	55258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016623	C	7	7	57796	57802	0 %	0 %	0 %	100 %	374293570
22	NC_016623	C	7	7	57861	57867	0 %	0 %	0 %	100 %	374293571
23	NC_016623	G	6	6	65745	65750	0 %	0 %	100 %	0 %	374293579
24	NC_016623	G	6	6	66044	66049	0 %	0 %	100 %	0 %	374293579
25	NC_016623	C	6	6	69317	69322	0 %	0 %	0 %	100 %	374293581
26	NC_016623	C	6	6	69701	69706	0 %	0 %	0 %	100 %	374293581
27	NC_016623	G	7	7	71312	71318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016623	T	6	6	71678	71683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016623	G	6	6	79787	79792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016623	T	6	6	81483	81488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016623	G	6	6	84154	84159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016623	G	6	6	90416	90421	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016623	G	7	7	91615	91621	0 %	0 %	100 %	0 %	374293603
34	NC_016623	G	6	6	95281	95286	0 %	0 %	100 %	0 %	374293606
35	NC_016623	T	6	6	98654	98659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016623	C	8	8	102177	102184	0 %	0 %	0 %	100 %	374293609
37	NC_016623	A	6	6	104568	104573	100 %	0 %	0 %	0 %	374293611
38	NC_016623	G	7	7	105167	105173	0 %	0 %	100 %	0 %	374293612
39	NC_016623	C	6	6	110661	110666	0 %	0 %	0 %	100 %	374293618
40	NC_016623	G	6	6	113844	113849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016623	G	6	6	114080	114085	0 %	0 %	100 %	0 %	374293622
42	NC_016623	T	6	6	118070	118075	0 %	100 %	0 %	0 %	374293623
43	NC_016623	C	6	6	120571	120576	0 %	0 %	0 %	100 %	374293626
44	NC_016623	G	6	6	124849	124854	0 %	0 %	100 %	0 %	374293631
45	NC_016623	C	6	6	129554	129559	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_016623	A	6	6	134212	134217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016623	C	7	7	139703	139709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_016623	T	7	7	146026	146032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016623	G	6	6	150967	150972	0 %	0 %	100 %	0 %	374293653
50	NC_016623	G	6	6	152991	152996	0 %	0 %	100 %	0 %	374293655
51	NC_016623	C	6	6	153002	153007	0 %	0 %	0 %	100 %	374293655
52	NC_016623	C	6	6	157567	157572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_016623	G	6	6	158437	158442	0 %	0 %	100 %	0 %	374293663
54	NC_016623	A	8	8	164828	164835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016623	G	6	6	169006	169011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016623	G	6	6	169700	169705	0 %	0 %	100 %	0 %	374293675
57	NC_016623	C	6	6	184570	184575	0 %	0 %	0 %	100 %	374293683
58	NC_016623	G	6	6	188948	188953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016623	C	6	6	192342	192347	0 %	0 %	0 %	100 %	374293692
60	NC_016623	A	6	6	193752	193757	100 %	0 %	0 %	0 %	374293694
61	NC_016623	C	7	7	198156	198162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_016623	G	7	7	198164	198170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016623	C	6	6	198225	198230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_016623	T	6	6	208385	208390	0 %	100 %	0 %	0 %	374293708
65	NC_016623	T	6	6	212672	212677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016623	C	6	6	217124	217129	0 %	0 %	0 %	100 %	374293713
67	NC_016623	C	6	6	219480	219485	0 %	0 %	0 %	100 %	374293716
68	NC_016623	G	6	6	222625	222630	0 %	0 %	100 %	0 %	374293719
69	NC_016623	T	6	6	225320	225325	0 %	100 %	0 %	0 %	374293721
70	NC_016623	G	6	6	228178	228183	0 %	0 %	100 %	0 %	374293725
71	NC_016623	C	6	6	230250	230255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_016623	G	7	7	231627	231633	0 %	0 %	100 %	0 %	374293729
73	NC_016623	G	6	6	235029	235034	0 %	0 %	100 %	0 %	374293732
74	NC_016623	C	6	6	246298	246303	0 %	0 %	0 %	100 %	374293743
75	NC_016623	C	6	6	253309	253314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_016623	C	6	6	256763	256768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_016623	C	6	6	258894	258899	0 %	0 %	0 %	100 %	374293754
78	NC_016623	C	6	6	260252	260257	0 %	0 %	0 %	100 %	374293756
79	NC_016623	T	7	7	261461	261467	0 %	100 %	0 %	0 %	374293758
80	NC_016623	A	6	6	262232	262237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016623	T	6	6	262482	262487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016623	A	7	7	262597	262603	100 %	0 %	0 %	0 %	374293759
83	NC_016623	C	6	6	263767	263772	0 %	0 %	0 %	100 %	374293760
84	NC_016623	G	6	6	267964	267969	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016623	C	8	8	267985	267992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_016623	A	6	6	269334	269339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016623	G	6	6	282443	282448	0 %	0 %	100 %	0 %	374293776
88	NC_016623	C	6	6	288869	288874	0 %	0 %	0 %	100 %	374293781
89	NC_016623	C	7	7	288881	288887	0 %	0 %	0 %	100 %	374293781
90	NC_016623	G	6	6	289733	289738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016623	A	6	6	296195	296200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016623	G	6	6	296255	296260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016623	A	6	6	300813	300818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016623	G	6	6	302151	302156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016623	A	6	6	302195	302200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016623	T	7	7	302346	302352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016623	G	6	6	306113	306118	0 %	0 %	100 %	0 %	374293793
98	NC_016623	G	6	6	317509	317514	0 %	0 %	100 %	0 %	374293793
99	NC_016623	G	6	6	323838	323843	0 %	0 %	100 %	0 %	374293794
100	NC_016623	C	6	6	336363	336368	0 %	0 %	0 %	100 %	374293802
101	NC_016623	C	6	6	339535	339540	0 %	0 %	0 %	100 %	374293804
102	NC_016623	T	6	6	341100	341105	0 %	100 %	0 %	0 %	374293807
103	NC_016623	T	6	6	352646	352651	0 %	100 %	0 %	0 %	374293817
104	NC_016623	G	8	8	355166	355173	0 %	0 %	100 %	0 %	374293821
105	NC_016623	T	6	6	355883	355888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016623	T	7	7	356118	356124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016623	C	6	6	358090	358095	0 %	0 %	0 %	100 %	374293824
108	NC_016623	C	6	6	358741	358746	0 %	0 %	0 %	100 %	374293824
109	NC_016623	T	6	6	359657	359662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016623	C	6	6	362917	362922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_016623	G	8	8	363998	364005	0 %	0 %	100 %	0 %	374293827
112	NC_016623	C	6	6	364220	364225	0 %	0 %	0 %	100 %	374293828
113	NC_016623	G	6	6	381855	381860	0 %	0 %	100 %	0 %	374293843
114	NC_016623	C	6	6	389402	389407	0 %	0 %	0 %	100 %	374293848
115	NC_016623	C	6	6	395219	395224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_016623	G	6	6	406901	406906	0 %	0 %	100 %	0 %	374293860
117	NC_016623	T	7	7	410725	410731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016623	C	6	6	410894	410899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_016623	T	6	6	412177	412182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016623	T	6	6	412288	412293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016623	G	6	6	418868	418873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016623	T	6	6	418880	418885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016623	A	6	6	419828	419833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016623	C	6	6	420637	420642	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_016623	T	6	6	425103	425108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016623	A	6	6	427438	427443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016623	C	6	6	432939	432944	0 %	0 %	0 %	100 %	374293881
128	NC_016623	G	6	6	439087	439092	0 %	0 %	100 %	0 %	374293886
129	NC_016623	G	6	6	439711	439716	0 %	0 %	100 %	0 %	374293886
130	NC_016623	T	6	6	440655	440660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016623	A	7	7	441605	441611	100 %	0 %	0 %	0 %	374293889
132	NC_016623	C	6	6	443638	443643	0 %	0 %	0 %	100 %	374293891
133	NC_016623	T	6	6	443677	443682	0 %	100 %	0 %	0 %	374293891
134	NC_016623	C	6	6	443925	443930	0 %	0 %	0 %	100 %	374293891
135	NC_016623	C	6	6	445019	445024	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_016623	G	6	6	445292	445297	0 %	0 %	100 %	0 %	374293894
137	NC_016623	G	7	7	445936	445942	0 %	0 %	100 %	0 %	374293894
138	NC_016623	G	6	6	448721	448726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016623	C	6	6	450146	450151	0 %	0 %	0 %	100 %	374293895
140	NC_016623	C	6	6	453085	453090	0 %	0 %	0 %	100 %	374293898
141	NC_016623	G	6	6	454151	454156	0 %	0 %	100 %	0 %	374293899
142	NC_016623	G	6	6	455080	455085	0 %	0 %	100 %	0 %	374293900
143	NC_016623	G	6	6	459431	459436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016623	C	6	6	464897	464902	0 %	0 %	0 %	100 %	374293907
145	NC_016623	G	7	7	469596	469602	0 %	0 %	100 %	0 %	374293910
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.