MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B

Total Repeats: 2200

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016622	TGCCG	2	10	2735314	2735323	0 %	20 %	40 %	40 %	374293260
2002	NC_016622	CCCGA	2	10	2735914	2735923	20 %	0 %	20 %	60 %	374293261
2003	NC_016622	CCCCG	2	10	2736309	2736318	0 %	0 %	20 %	80 %	374293261
2004	NC_016622	ACGCC	2	10	2737663	2737672	20 %	0 %	20 %	60 %	374293262
2005	NC_016622	GGGCT	2	10	2739099	2739108	0 %	20 %	60 %	20 %	374293262
2006	NC_016622	CCGGA	2	10	2740124	2740133	20 %	0 %	40 %	40 %	374293263
2007	NC_016622	CATTC	2	10	2741255	2741264	20 %	40 %	0 %	40 %	374293264
2008	NC_016622	GTCCC	2	10	2742329	2742338	0 %	20 %	20 %	60 %	374293265
2009	NC_016622	TCCGA	2	10	2742772	2742781	20 %	20 %	20 %	40 %	374293265
2010	NC_016622	GGAGT	2	10	2743367	2743376	20 %	20 %	60 %	0 %	374293266
2011	NC_016622	CCGCC	2	10	2745736	2745745	0 %	0 %	20 %	80 %	374293268
2012	NC_016622	GGCCG	2	10	2745914	2745923	0 %	0 %	60 %	40 %	374293268
2013	NC_016622	GCCGC	2	10	2746009	2746018	0 %	0 %	40 %	60 %	374293268
2014	NC_016622	ACTCC	2	10	2746278	2746287	20 %	20 %	0 %	60 %	374293269
2015	NC_016622	CCGGC	2	10	2746606	2746615	0 %	0 %	40 %	60 %	374293269
2016	NC_016622	TCCCC	2	10	2746970	2746979	0 %	20 %	0 %	80 %	374293269
2017	NC_016622	CGGCG	2	10	2747485	2747494	0 %	0 %	60 %	40 %	374293270
2018	NC_016622	CGCTC	2	10	2750153	2750162	0 %	20 %	20 %	60 %	374293274
2019	NC_016622	GCCGG	2	10	2750843	2750852	0 %	0 %	60 %	40 %	374293275
2020	NC_016622	CGCGC	2	10	2753751	2753760	0 %	0 %	40 %	60 %	374293279
2021	NC_016622	ATCGG	2	10	2754393	2754402	20 %	20 %	40 %	20 %	374293279
2022	NC_016622	CGCCA	2	10	2755435	2755444	20 %	0 %	20 %	60 %	374293280
2023	NC_016622	GCCAG	2	10	2757467	2757476	20 %	0 %	40 %	40 %	374293283
2024	NC_016622	CCTCC	2	10	2757975	2757984	0 %	20 %	0 %	80 %	374293283
2025	NC_016622	CACCG	2	10	2763759	2763768	20 %	0 %	20 %	60 %	374293286
2026	NC_016622	CGGTC	2	10	2763932	2763941	0 %	20 %	40 %	40 %	374293286
2027	NC_016622	CGCTG	2	10	2768579	2768588	0 %	20 %	40 %	40 %	374293288
2028	NC_016622	GCGCC	2	10	2769248	2769257	0 %	0 %	40 %	60 %	374293289
2029	NC_016622	GCGCC	2	10	2769334	2769343	0 %	0 %	40 %	60 %	374293289
2030	NC_016622	CCGGC	2	10	2769453	2769462	0 %	0 %	40 %	60 %	374293289
2031	NC_016622	CGCGG	2	10	2769697	2769706	0 %	0 %	60 %	40 %	374293289
2032	NC_016622	GCGCG	2	10	2772892	2772901	0 %	0 %	60 %	40 %	374293292
2033	NC_016622	GCGCC	2	10	2780125	2780134	0 %	0 %	40 %	60 %	374293301
2034	NC_016622	GCCGT	2	10	2782259	2782268	0 %	20 %	40 %	40 %	374293302
2035	NC_016622	CGCGG	2	10	2782910	2782919	0 %	0 %	60 %	40 %	374293303
2036	NC_016622	CCGCC	2	10	2784029	2784038	0 %	0 %	20 %	80 %	374293303
2037	NC_016622	GGACA	2	10	2784093	2784102	40 %	0 %	40 %	20 %	374293303
2038	NC_016622	CGGGG	2	10	2784126	2784135	0 %	0 %	80 %	20 %	374293303
2039	NC_016622	CGGAC	2	10	2785089	2785098	20 %	0 %	40 %	40 %	374293304
2040	NC_016622	GGCCG	2	10	2785188	2785197	0 %	0 %	60 %	40 %	374293305
2041	NC_016622	GGCGG	2	10	2786006	2786015	0 %	0 %	80 %	20 %	374293305
2042	NC_016622	TCCGC	2	10	2787250	2787259	0 %	20 %	20 %	60 %	374293306
2043	NC_016622	GGGCC	2	10	2787770	2787779	0 %	0 %	60 %	40 %	374293306
2044	NC_016622	GCTGG	2	10	2789809	2789818	0 %	20 %	60 %	20 %	374293309
2045	NC_016622	CGACG	2	10	2790022	2790031	20 %	0 %	40 %	40 %	374293309
2046	NC_016622	GCGGA	2	10	2790889	2790898	20 %	0 %	60 %	20 %	374293310
2047	NC_016622	CCGCG	2	10	2793911	2793920	0 %	0 %	40 %	60 %	374293313
2048	NC_016622	GACCG	2	10	2794607	2794616	20 %	0 %	40 %	40 %	374293313
2049	NC_016622	CCTGG	2	10	2795224	2795233	0 %	20 %	40 %	40 %	374293314
2050	NC_016622	GCCCG	2	10	2799369	2799378	0 %	0 %	40 %	60 %	374293316
2051	NC_016622	AGCCG	2	10	2799388	2799397	20 %	0 %	40 %	40 %	374293316
2052	NC_016622	AGCGG	2	10	2799427	2799436	20 %	0 %	60 %	20 %	374293316
2053	NC_016622	GCGAG	2	10	2799584	2799593	20 %	0 %	60 %	20 %	374293316
2054	NC_016622	CGCGG	2	10	2800750	2800759	0 %	0 %	60 %	40 %	374293319
2055	NC_016622	TGGGA	2	10	2801705	2801714	20 %	20 %	60 %	0 %	374293321
2056	NC_016622	GCCGC	2	10	2801985	2801994	0 %	0 %	40 %	60 %	374293322
2057	NC_016622	CGGAG	2	10	2802514	2802523	20 %	0 %	60 %	20 %	374293323
2058	NC_016622	GCGCC	2	10	2804326	2804335	0 %	0 %	40 %	60 %	374293325
2059	NC_016622	GGCGG	2	10	2805784	2805793	0 %	0 %	80 %	20 %	374293328
2060	NC_016622	GCCCG	2	10	2806087	2806096	0 %	0 %	40 %	60 %	374293329
2061	NC_016622	CAGCG	2	10	2806226	2806235	20 %	0 %	40 %	40 %	374293329
2062	NC_016622	CCGCA	2	10	2808547	2808556	20 %	0 %	20 %	60 %	374293331
2063	NC_016622	CTTCG	2	10	2809085	2809094	0 %	40 %	20 %	40 %	374293332
2064	NC_016622	CGGTG	2	10	2809147	2809156	0 %	20 %	60 %	20 %	374293332
2065	NC_016622	CGCGT	2	10	2809551	2809560	0 %	20 %	40 %	40 %	374293333
2066	NC_016622	CCACA	2	10	2811859	2811868	40 %	0 %	0 %	60 %	374293334
2067	NC_016622	CACCC	2	10	2813096	2813105	20 %	0 %	0 %	80 %	374293335
2068	NC_016622	CCGCC	2	10	2814725	2814734	0 %	0 %	20 %	80 %	374293336
2069	NC_016622	CGGGC	2	10	2814809	2814818	0 %	0 %	60 %	40 %	374293336
2070	NC_016622	TCGGC	2	10	2815915	2815924	0 %	20 %	40 %	40 %	374293338
2071	NC_016622	CCACG	2	10	2816024	2816033	20 %	0 %	20 %	60 %	374293338
2072	NC_016622	GATCG	2	10	2816768	2816777	20 %	20 %	40 %	20 %	374293338
2073	NC_016622	TCCTC	2	10	2817068	2817077	0 %	40 %	0 %	60 %	374293339
2074	NC_016622	GACCG	2	10	2821250	2821259	20 %	0 %	40 %	40 %	374293343
2075	NC_016622	TTTTC	2	10	2824972	2824981	0 %	80 %	0 %	20 %	374293346
2076	NC_016622	GCCCG	2	10	2825094	2825103	0 %	0 %	40 %	60 %	374293346
2077	NC_016622	GGCGC	2	10	2826148	2826157	0 %	0 %	60 %	40 %	374293347
2078	NC_016622	AGGAC	2	10	2829972	2829981	40 %	0 %	40 %	20 %	374293350
2079	NC_016622	GGGCC	2	10	2831029	2831038	0 %	0 %	60 %	40 %	374293351
2080	NC_016622	CATCG	2	10	2832857	2832866	20 %	20 %	20 %	40 %	374293352
2081	NC_016622	CCGCG	2	10	2833603	2833612	0 %	0 %	40 %	60 %	374293353
2082	NC_016622	CGACA	2	10	2834364	2834373	40 %	0 %	20 %	40 %	374293354
2083	NC_016622	TCACC	2	10	2835217	2835226	20 %	20 %	0 %	60 %	374293356
2084	NC_016622	CCGGA	2	10	2835419	2835428	20 %	0 %	40 %	40 %	374293356
2085	NC_016622	CATGG	2	10	2835834	2835843	20 %	20 %	40 %	20 %	374293356
2086	NC_016622	GCCTT	2	10	2837194	2837203	0 %	40 %	20 %	40 %	374293356
2087	NC_016622	GCCGG	2	10	2837421	2837430	0 %	0 %	60 %	40 %	374293356
2088	NC_016622	TGTGC	2	10	2837925	2837934	0 %	40 %	40 %	20 %	374293357
2089	NC_016622	CCGGC	2	10	2838851	2838860	0 %	0 %	40 %	60 %	374293358
2090	NC_016622	CGGGC	2	10	2839278	2839287	0 %	0 %	60 %	40 %	374293359
2091	NC_016622	CCGAT	2	10	2840077	2840086	20 %	20 %	20 %	40 %	374293359
2092	NC_016622	CGGCG	2	10	2840631	2840640	0 %	0 %	60 %	40 %	374293360
2093	NC_016622	CGCTG	2	10	2840661	2840670	0 %	20 %	40 %	40 %	374293360
2094	NC_016622	GCGCG	2	10	2841590	2841599	0 %	0 %	60 %	40 %	374293361
2095	NC_016622	TCGCC	2	10	2841821	2841830	0 %	20 %	20 %	60 %	374293361
2096	NC_016622	ATCGC	2	10	2843395	2843404	20 %	20 %	20 %	40 %	374293364
2097	NC_016622	CAGCG	2	10	2843697	2843706	20 %	0 %	40 %	40 %	374293364
2098	NC_016622	CAGCC	2	10	2845659	2845668	20 %	0 %	20 %	60 %	374293365
2099	NC_016622	GCACG	2	10	2846588	2846597	20 %	0 %	40 %	40 %	374293365
2100	NC_016622	GGGCA	2	10	2848939	2848948	20 %	0 %	60 %	20 %	374293368
2101	NC_016622	GGGAA	2	10	2849482	2849491	40 %	0 %	60 %	0 %	374293368
2102	NC_016622	CGGCG	2	10	2850093	2850102	0 %	0 %	60 %	40 %	374293369
2103	NC_016622	GGGCA	2	10	2852819	2852828	20 %	0 %	60 %	20 %	374293373
2104	NC_016622	GGGCA	2	10	2853308	2853317	20 %	0 %	60 %	20 %	374293373
2105	NC_016622	AGGGG	2	10	2855697	2855706	20 %	0 %	80 %	0 %	374293376
2106	NC_016622	CGATC	2	10	2856288	2856297	20 %	20 %	20 %	40 %	374293376
2107	NC_016622	GGCGC	2	10	2857663	2857672	0 %	0 %	60 %	40 %	374293377
2108	NC_016622	CGCAG	2	10	2860163	2860172	20 %	0 %	40 %	40 %	374293380
2109	NC_016622	GCCCG	2	10	2860738	2860747	0 %	0 %	40 %	60 %	374293381
2110	NC_016622	GGGGA	2	10	2866083	2866092	20 %	0 %	80 %	0 %	374293387
2111	NC_016622	GAAGG	2	10	2866246	2866255	40 %	0 %	60 %	0 %	374293387
2112	NC_016622	GGGCT	2	10	2868175	2868184	0 %	20 %	60 %	20 %	374293389
2113	NC_016622	GCCCG	2	10	2870577	2870586	0 %	0 %	40 %	60 %	374293392
2114	NC_016622	GGGCC	2	10	2872036	2872045	0 %	0 %	60 %	40 %	374293396
2115	NC_016622	GGGGA	2	10	2872358	2872367	20 %	0 %	80 %	0 %	374293396
2116	NC_016622	GCAGC	2	10	2874438	2874447	20 %	0 %	40 %	40 %	374293398
2117	NC_016622	CAGGA	2	10	2875906	2875915	40 %	0 %	40 %	20 %	374293400
2118	NC_016622	AGCCC	2	10	2877558	2877567	20 %	0 %	20 %	60 %	374293401
2119	NC_016622	CGCTC	2	10	2881260	2881269	0 %	20 %	20 %	60 %	374293407
2120	NC_016622	CCGAC	2	10	2882804	2882813	20 %	0 %	20 %	60 %	374293408
2121	NC_016622	CGCGC	2	10	2885700	2885709	0 %	0 %	40 %	60 %	374293412
2122	NC_016622	GCGAT	2	10	2886026	2886035	20 %	20 %	40 %	20 %	374293413
2123	NC_016622	TGGCG	2	10	2887794	2887803	0 %	20 %	60 %	20 %	374293415
2124	NC_016622	CCAGC	2	10	2889603	2889612	20 %	0 %	20 %	60 %	374293416
2125	NC_016622	CGAGG	2	10	2890920	2890929	20 %	0 %	60 %	20 %	374293417
2126	NC_016622	GCCGG	2	10	2892118	2892127	0 %	0 %	60 %	40 %	374293418
2127	NC_016622	GGGCA	2	10	2893494	2893503	20 %	0 %	60 %	20 %	374293420
2128	NC_016622	GCCGC	2	10	2894386	2894395	0 %	0 %	40 %	60 %	374293421
2129	NC_016622	GTCCG	2	10	2894442	2894451	0 %	20 %	40 %	40 %	374293421
2130	NC_016622	CGCGG	2	10	2894928	2894937	0 %	0 %	60 %	40 %	374293421
2131	NC_016622	ATCGG	2	10	2895523	2895532	20 %	20 %	40 %	20 %	374293422
2132	NC_016622	GACGC	2	10	2895671	2895680	20 %	0 %	40 %	40 %	374293422
2133	NC_016622	GGCGC	2	10	2896990	2896999	0 %	0 %	60 %	40 %	374293423
2134	NC_016622	GCCGG	2	10	2897598	2897607	0 %	0 %	60 %	40 %	374293423
2135	NC_016622	TTCGC	2	10	2901181	2901190	0 %	40 %	20 %	40 %	374293427
2136	NC_016622	CCCGG	2	10	2903979	2903988	0 %	0 %	40 %	60 %	374293431
2137	NC_016622	GCCGC	2	10	2904280	2904289	0 %	0 %	40 %	60 %	374293431
2138	NC_016622	CCCGG	2	10	2906006	2906015	0 %	0 %	40 %	60 %	374293433
2139	NC_016622	CGGGG	2	10	2906384	2906393	0 %	0 %	80 %	20 %	374293434
2140	NC_016622	AGCGC	2	10	2907925	2907934	20 %	0 %	40 %	40 %	374293434
2141	NC_016622	GGTGC	2	10	2908236	2908245	0 %	20 %	60 %	20 %	374293434
2142	NC_016622	GCCGG	2	10	2909250	2909259	0 %	0 %	60 %	40 %	374293435
2143	NC_016622	CGCAG	2	10	2909582	2909591	20 %	0 %	40 %	40 %	374293436
2144	NC_016622	CGGCG	2	10	2910892	2910901	0 %	0 %	60 %	40 %	374293439
2145	NC_016622	CGCGG	2	10	2911347	2911356	0 %	0 %	60 %	40 %	374293439
2146	NC_016622	GGTCG	2	10	2911534	2911543	0 %	20 %	60 %	20 %	374293439
2147	NC_016622	GCGAG	2	10	2911578	2911587	20 %	0 %	60 %	20 %	374293439
2148	NC_016622	GGGGC	2	10	2911646	2911655	0 %	0 %	80 %	20 %	374293439
2149	NC_016622	AGCGC	2	10	2912178	2912187	20 %	0 %	40 %	40 %	374293440
2150	NC_016622	GCGGG	2	10	2912220	2912229	0 %	0 %	80 %	20 %	374293440
2151	NC_016622	GTCGC	2	10	2914106	2914115	0 %	20 %	40 %	40 %	374293442
2152	NC_016622	CGACG	2	10	2916801	2916810	20 %	0 %	40 %	40 %	374293446
2153	NC_016622	GCGCT	2	10	2916916	2916925	0 %	20 %	40 %	40 %	374293446
2154	NC_016622	TGCGG	2	10	2918960	2918969	0 %	20 %	60 %	20 %	374293448
2155	NC_016622	GCGCA	2	10	2922019	2922028	20 %	0 %	40 %	40 %	374293452
2156	NC_016622	GCGCG	2	10	2924922	2924931	0 %	0 %	60 %	40 %	374293454
2157	NC_016622	TCGCC	2	10	2928317	2928326	0 %	20 %	20 %	60 %	374293459
2158	NC_016622	CAGGA	2	10	2928580	2928589	40 %	0 %	40 %	20 %	374293459
2159	NC_016622	AGACC	2	10	2929181	2929190	40 %	0 %	20 %	40 %	374293460
2160	NC_016622	GCCGC	2	10	2931496	2931505	0 %	0 %	40 %	60 %	374293463
2161	NC_016622	GGCGC	2	10	2931655	2931664	0 %	0 %	60 %	40 %	374293463
2162	NC_016622	GCACC	2	10	2934760	2934769	20 %	0 %	20 %	60 %	374293466
2163	NC_016622	AAGGA	2	10	2935113	2935122	60 %	0 %	40 %	0 %	374293466
2164	NC_016622	GCGCC	2	10	2937675	2937684	0 %	0 %	40 %	60 %	374293470
2165	NC_016622	AAGGC	2	10	2938346	2938355	40 %	0 %	40 %	20 %	374293470
2166	NC_016622	CACCG	2	10	2938435	2938444	20 %	0 %	20 %	60 %	374293470
2167	NC_016622	TTTGT	2	10	2940180	2940189	0 %	80 %	20 %	0 %	374293473
2168	NC_016622	GCGCG	2	10	2940558	2940567	0 %	0 %	60 %	40 %	374293473
2169	NC_016622	AGGGG	2	10	2940760	2940769	20 %	0 %	80 %	0 %	374293473
2170	NC_016622	TCCGC	2	10	2943566	2943575	0 %	20 %	20 %	60 %	374293477
2171	NC_016622	CTTCG	2	10	2944281	2944290	0 %	40 %	20 %	40 %	374293477
2172	NC_016622	GACCG	2	10	2944344	2944353	20 %	0 %	40 %	40 %	374293477
2173	NC_016622	GAGGC	2	10	2951710	2951719	20 %	0 %	60 %	20 %	374293478
2174	NC_016622	GACCG	2	10	2952360	2952369	20 %	0 %	40 %	40 %	374293478
2175	NC_016622	GTGCT	2	10	2952717	2952726	0 %	40 %	40 %	20 %	374293478
2176	NC_016622	CGCGG	2	10	2956704	2956713	0 %	0 %	60 %	40 %	374293482
2177	NC_016622	TCCGC	2	10	2957148	2957157	0 %	20 %	20 %	60 %	374293482
2178	NC_016622	GCGCG	2	10	2959365	2959374	0 %	0 %	60 %	40 %	374293483
2179	NC_016622	CGCGC	2	10	2959755	2959764	0 %	0 %	40 %	60 %	374293483
2180	NC_016622	AGGCG	2	10	2962212	2962221	20 %	0 %	60 %	20 %	374293485
2181	NC_016622	CCTTA	2	10	2964797	2964806	20 %	40 %	0 %	40 %	374293487
2182	NC_016622	GGCCG	2	10	2965118	2965127	0 %	0 %	60 %	40 %	374293487
2183	NC_016622	GCCGC	2	10	2965521	2965530	0 %	0 %	40 %	60 %	374293487
2184	NC_016622	CGAGG	2	10	2967976	2967985	20 %	0 %	60 %	20 %	374293489
2185	NC_016622	ACGCC	2	10	2968140	2968149	20 %	0 %	20 %	60 %	374293489
2186	NC_016622	CGGTT	2	10	2969173	2969182	0 %	40 %	40 %	20 %	374293489
2187	NC_016622	TCGGA	2	10	2969634	2969643	20 %	20 %	40 %	20 %	374293489
2188	NC_016622	GAATT	3	15	2970194	2970208	40 %	40 %	20 %	0 %	374293490
2189	NC_016622	CCGGC	2	10	2971183	2971192	0 %	0 %	40 %	60 %	374293492
2190	NC_016622	TCGTC	2	10	2972946	2972955	0 %	40 %	20 %	40 %	374293492
2191	NC_016622	CGCGC	2	10	2974924	2974933	0 %	0 %	40 %	60 %	374293494
2192	NC_016622	GGGCA	2	10	2975225	2975234	20 %	0 %	60 %	20 %	374293494
2193	NC_016622	CGCGC	2	10	2975568	2975577	0 %	0 %	40 %	60 %	374293494
2194	NC_016622	GCGCG	2	10	2979209	2979218	0 %	0 %	60 %	40 %	374293498
2195	NC_016622	TGACC	2	10	2979325	2979334	20 %	20 %	20 %	40 %	374293498
2196	NC_016622	GCCCG	2	10	2979374	2979383	0 %	0 %	40 %	60 %	374293498
2197	NC_016622	TTGGC	2	10	2980949	2980958	0 %	40 %	40 %	20 %	374293500
2198	NC_016622	GCCAG	2	10	2983891	2983900	20 %	0 %	40 %	40 %	374293503
2199	NC_016622	CCGAT	2	10	2985229	2985238	20 %	20 %	20 %	40 %	374293504
2200	NC_016622	GCTGG	2	10	2987030	2987039	0 %	20 %	60 %	20 %	374293506

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.