MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B

Total Repeats: 2698

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016622	GGCGG	2	10	2786006	2786015	0 %	0 %	80 %	20 %	374293305
2502	NC_016622	CCCAT	2	10	2786056	2786065	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2503	NC_016622	TCCGC	2	10	2787250	2787259	0 %	20 %	20 %	60 %	374293306
2504	NC_016622	GGGCC	2	10	2787770	2787779	0 %	0 %	60 %	40 %	374293306
2505	NC_016622	ACCCG	2	10	2788476	2788485	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2506	NC_016622	GCTGG	2	10	2789809	2789818	0 %	20 %	60 %	20 %	374293309
2507	NC_016622	CGACG	2	10	2790022	2790031	20 %	0 %	40 %	40 %	374293309
2508	NC_016622	AACGG	2	10	2790310	2790319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2509	NC_016622	GCGGA	2	10	2790889	2790898	20 %	0 %	60 %	20 %	374293310
2510	NC_016622	AACGG	2	10	2793571	2793580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2511	NC_016622	CCGCG	2	10	2793911	2793920	0 %	0 %	40 %	60 %	374293313
2512	NC_016622	GACCG	2	10	2794607	2794616	20 %	0 %	40 %	40 %	374293313
2513	NC_016622	CGGCG	2	10	2795151	2795160	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2514	NC_016622	CCTGG	2	10	2795224	2795233	0 %	20 %	40 %	40 %	374293314
2515	NC_016622	GCCCG	2	10	2799369	2799378	0 %	0 %	40 %	60 %	374293316
2516	NC_016622	AGCCG	2	10	2799388	2799397	20 %	0 %	40 %	40 %	374293316
2517	NC_016622	AGCGG	2	10	2799427	2799436	20 %	0 %	60 %	20 %	374293316
2518	NC_016622	GCGAG	2	10	2799584	2799593	20 %	0 %	60 %	20 %	374293316
2519	NC_016622	TCCCA	2	10	2799901	2799910	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2520	NC_016622	CGCGG	2	10	2800750	2800759	0 %	0 %	60 %	40 %	374293319
2521	NC_016622	TGGGA	2	10	2801705	2801714	20 %	20 %	60 %	0 %	374293321
2522	NC_016622	GCCGC	2	10	2801985	2801994	0 %	0 %	40 %	60 %	374293322
2523	NC_016622	CGGAG	2	10	2802514	2802523	20 %	0 %	60 %	20 %	374293323
2524	NC_016622	GCGCC	2	10	2804326	2804335	0 %	0 %	40 %	60 %	374293325
2525	NC_016622	GGCGG	2	10	2805784	2805793	0 %	0 %	80 %	20 %	374293328
2526	NC_016622	GCCCG	2	10	2806087	2806096	0 %	0 %	40 %	60 %	374293329
2527	NC_016622	CAGCG	2	10	2806226	2806235	20 %	0 %	40 %	40 %	374293329
2528	NC_016622	CCGCA	2	10	2808547	2808556	20 %	0 %	20 %	60 %	374293331
2529	NC_016622	CTTCG	2	10	2809085	2809094	0 %	40 %	20 %	40 %	374293332
2530	NC_016622	CGGTG	2	10	2809147	2809156	0 %	20 %	60 %	20 %	374293332
2531	NC_016622	CGCGT	2	10	2809551	2809560	0 %	20 %	40 %	40 %	374293333
2532	NC_016622	CCACA	2	10	2811859	2811868	40 %	0 %	0 %	60 %	374293334
2533	NC_016622	CACCC	2	10	2813096	2813105	20 %	0 %	0 %	80 %	374293335
2534	NC_016622	CCGCC	2	10	2814725	2814734	0 %	0 %	20 %	80 %	374293336
2535	NC_016622	CGGGC	2	10	2814809	2814818	0 %	0 %	60 %	40 %	374293336
2536	NC_016622	TCGGC	2	10	2815915	2815924	0 %	20 %	40 %	40 %	374293338
2537	NC_016622	CCACG	2	10	2816024	2816033	20 %	0 %	20 %	60 %	374293338
2538	NC_016622	GATCG	2	10	2816768	2816777	20 %	20 %	40 %	20 %	374293338
2539	NC_016622	TCCTC	2	10	2817068	2817077	0 %	40 %	0 %	60 %	374293339
2540	NC_016622	GACCG	2	10	2821250	2821259	20 %	0 %	40 %	40 %	374293343
2541	NC_016622	TGCAG	2	10	2821429	2821438	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2542	NC_016622	GCATC	2	10	2824924	2824933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2543	NC_016622	TTTTC	2	10	2824972	2824981	0 %	80 %	0 %	20 %	374293346
2544	NC_016622	GCCCG	2	10	2825094	2825103	0 %	0 %	40 %	60 %	374293346
2545	NC_016622	GGGGA	2	10	2825770	2825779	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016622	GGCGC	2	10	2826148	2826157	0 %	0 %	60 %	40 %	374293347
2547	NC_016622	AGGAC	2	10	2829972	2829981	40 %	0 %	40 %	20 %	374293350
2548	NC_016622	GGGCC	2	10	2831029	2831038	0 %	0 %	60 %	40 %	374293351
2549	NC_016622	CATCG	2	10	2832857	2832866	20 %	20 %	20 %	40 %	374293352
2550	NC_016622	CCGCG	2	10	2833603	2833612	0 %	0 %	40 %	60 %	374293353
2551	NC_016622	CGACA	2	10	2834364	2834373	40 %	0 %	20 %	40 %	374293354
2552	NC_016622	TCACC	2	10	2835217	2835226	20 %	20 %	0 %	60 %	374293356
2553	NC_016622	CCGGA	2	10	2835419	2835428	20 %	0 %	40 %	40 %	374293356
2554	NC_016622	CATGG	2	10	2835834	2835843	20 %	20 %	40 %	20 %	374293356
2555	NC_016622	GCCTT	2	10	2837194	2837203	0 %	40 %	20 %	40 %	374293356
2556	NC_016622	GCCGG	2	10	2837421	2837430	0 %	0 %	60 %	40 %	374293356
2557	NC_016622	TGTGC	2	10	2837925	2837934	0 %	40 %	40 %	20 %	374293357
2558	NC_016622	CCGGC	2	10	2838851	2838860	0 %	0 %	40 %	60 %	374293358
2559	NC_016622	CGGGC	2	10	2839278	2839287	0 %	0 %	60 %	40 %	374293359
2560	NC_016622	CCGAT	2	10	2840077	2840086	20 %	20 %	20 %	40 %	374293359
2561	NC_016622	CGGCG	2	10	2840631	2840640	0 %	0 %	60 %	40 %	374293360
2562	NC_016622	CGCTG	2	10	2840661	2840670	0 %	20 %	40 %	40 %	374293360
2563	NC_016622	GCGCG	2	10	2841590	2841599	0 %	0 %	60 %	40 %	374293361
2564	NC_016622	TCGCC	2	10	2841821	2841830	0 %	20 %	20 %	60 %	374293361
2565	NC_016622	ATCGC	2	10	2843395	2843404	20 %	20 %	20 %	40 %	374293364
2566	NC_016622	CAGCG	2	10	2843697	2843706	20 %	0 %	40 %	40 %	374293364
2567	NC_016622	GTGGG	2	10	2845321	2845330	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016622	CAGCC	2	10	2845659	2845668	20 %	0 %	20 %	60 %	374293365
2569	NC_016622	GCACG	2	10	2846588	2846597	20 %	0 %	40 %	40 %	374293365
2570	NC_016622	GGGCA	2	10	2848939	2848948	20 %	0 %	60 %	20 %	374293368
2571	NC_016622	GGGAA	2	10	2849482	2849491	40 %	0 %	60 %	0 %	374293368
2572	NC_016622	CGGCG	2	10	2850093	2850102	0 %	0 %	60 %	40 %	374293369
2573	NC_016622	CCCCA	2	10	2851167	2851176	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2574	NC_016622	GGGCA	2	10	2852819	2852828	20 %	0 %	60 %	20 %	374293373
2575	NC_016622	GGGCA	2	10	2853308	2853317	20 %	0 %	60 %	20 %	374293373
2576	NC_016622	AGGGG	2	10	2855697	2855706	20 %	0 %	80 %	0 %	374293376
2577	NC_016622	CGATC	2	10	2856288	2856297	20 %	20 %	20 %	40 %	374293376
2578	NC_016622	GGCGC	2	10	2857663	2857672	0 %	0 %	60 %	40 %	374293377
2579	NC_016622	CCGAT	2	10	2858238	2858247	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2580	NC_016622	CGCAG	2	10	2860163	2860172	20 %	0 %	40 %	40 %	374293380
2581	NC_016622	CAGGG	2	10	2860434	2860443	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2582	NC_016622	GCCCG	2	10	2860738	2860747	0 %	0 %	40 %	60 %	374293381
2583	NC_016622	GGGGA	2	10	2866083	2866092	20 %	0 %	80 %	0 %	374293387
2584	NC_016622	GAAGG	2	10	2866246	2866255	40 %	0 %	60 %	0 %	374293387
2585	NC_016622	GGGCT	2	10	2868175	2868184	0 %	20 %	60 %	20 %	374293389
2586	NC_016622	GCCCG	2	10	2870577	2870586	0 %	0 %	40 %	60 %	374293392
2587	NC_016622	CCCCA	2	10	2871403	2871412	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2588	NC_016622	GGGCC	2	10	2872036	2872045	0 %	0 %	60 %	40 %	374293396
2589	NC_016622	GGGGA	2	10	2872358	2872367	20 %	0 %	80 %	0 %	374293396
2590	NC_016622	GGAAA	2	10	2872567	2872576	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_016622	AAAAG	2	10	2872641	2872650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_016622	GCAGC	2	10	2874438	2874447	20 %	0 %	40 %	40 %	374293398
2593	NC_016622	CAGGA	2	10	2875906	2875915	40 %	0 %	40 %	20 %	374293400
2594	NC_016622	AGCCC	2	10	2877558	2877567	20 %	0 %	20 %	60 %	374293401
2595	NC_016622	TCCCG	2	10	2878817	2878826	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2596	NC_016622	TGGGG	2	10	2879755	2879764	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_016622	CGCTC	2	10	2881260	2881269	0 %	20 %	20 %	60 %	374293407
2598	NC_016622	CCGAC	2	10	2882804	2882813	20 %	0 %	20 %	60 %	374293408
2599	NC_016622	CGCGC	2	10	2885700	2885709	0 %	0 %	40 %	60 %	374293412
2600	NC_016622	GCGAT	2	10	2886026	2886035	20 %	20 %	40 %	20 %	374293413
2601	NC_016622	GCCCG	2	10	2886514	2886523	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2602	NC_016622	TGGCG	2	10	2887794	2887803	0 %	20 %	60 %	20 %	374293415
2603	NC_016622	CCAGC	2	10	2889603	2889612	20 %	0 %	20 %	60 %	374293416
2604	NC_016622	CGAGG	2	10	2890920	2890929	20 %	0 %	60 %	20 %	374293417
2605	NC_016622	GCCGG	2	10	2892118	2892127	0 %	0 %	60 %	40 %	374293418
2606	NC_016622	GGGCA	2	10	2893494	2893503	20 %	0 %	60 %	20 %	374293420
2607	NC_016622	GCCGC	2	10	2894386	2894395	0 %	0 %	40 %	60 %	374293421
2608	NC_016622	GTCCG	2	10	2894442	2894451	0 %	20 %	40 %	40 %	374293421
2609	NC_016622	CGCGG	2	10	2894928	2894937	0 %	0 %	60 %	40 %	374293421
2610	NC_016622	ATCGG	2	10	2895523	2895532	20 %	20 %	40 %	20 %	374293422
2611	NC_016622	GACGC	2	10	2895671	2895680	20 %	0 %	40 %	40 %	374293422
2612	NC_016622	GGCGC	2	10	2896990	2896999	0 %	0 %	60 %	40 %	374293423
2613	NC_016622	GCCGG	2	10	2897598	2897607	0 %	0 %	60 %	40 %	374293423
2614	NC_016622	TTCGC	2	10	2901181	2901190	0 %	40 %	20 %	40 %	374293427
2615	NC_016622	GCCGG	2	10	2902980	2902989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2616	NC_016622	CCCGG	2	10	2903979	2903988	0 %	0 %	40 %	60 %	374293431
2617	NC_016622	GCCGC	2	10	2904280	2904289	0 %	0 %	40 %	60 %	374293431
2618	NC_016622	CCCGG	2	10	2906006	2906015	0 %	0 %	40 %	60 %	374293433
2619	NC_016622	CCAGG	2	10	2906190	2906199	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2620	NC_016622	CGGGG	2	10	2906384	2906393	0 %	0 %	80 %	20 %	374293434
2621	NC_016622	AGCGC	2	10	2907925	2907934	20 %	0 %	40 %	40 %	374293434
2622	NC_016622	GGTGC	2	10	2908236	2908245	0 %	20 %	60 %	20 %	374293434
2623	NC_016622	GCCGG	2	10	2909250	2909259	0 %	0 %	60 %	40 %	374293435
2624	NC_016622	CGCAG	2	10	2909582	2909591	20 %	0 %	40 %	40 %	374293436
2625	NC_016622	CGGCG	2	10	2910892	2910901	0 %	0 %	60 %	40 %	374293439
2626	NC_016622	CGCGG	2	10	2911347	2911356	0 %	0 %	60 %	40 %	374293439
2627	NC_016622	GGTCG	2	10	2911534	2911543	0 %	20 %	60 %	20 %	374293439
2628	NC_016622	GCGAG	2	10	2911578	2911587	20 %	0 %	60 %	20 %	374293439
2629	NC_016622	GGGGC	2	10	2911646	2911655	0 %	0 %	80 %	20 %	374293439
2630	NC_016622	AGCGC	2	10	2912178	2912187	20 %	0 %	40 %	40 %	374293440
2631	NC_016622	GCGGG	2	10	2912220	2912229	0 %	0 %	80 %	20 %	374293440
2632	NC_016622	GTCGC	2	10	2914106	2914115	0 %	20 %	40 %	40 %	374293442
2633	NC_016622	CGACG	2	10	2916801	2916810	20 %	0 %	40 %	40 %	374293446
2634	NC_016622	GCGCT	2	10	2916916	2916925	0 %	20 %	40 %	40 %	374293446
2635	NC_016622	TGCGG	2	10	2918960	2918969	0 %	20 %	60 %	20 %	374293448
2636	NC_016622	GCGCA	2	10	2922019	2922028	20 %	0 %	40 %	40 %	374293452
2637	NC_016622	GCGCG	2	10	2924922	2924931	0 %	0 %	60 %	40 %	374293454
2638	NC_016622	TCGCC	2	10	2928317	2928326	0 %	20 %	20 %	60 %	374293459
2639	NC_016622	CAGGA	2	10	2928580	2928589	40 %	0 %	40 %	20 %	374293459
2640	NC_016622	AGACC	2	10	2929181	2929190	40 %	0 %	20 %	40 %	374293460
2641	NC_016622	GCCGC	2	10	2931496	2931505	0 %	0 %	40 %	60 %	374293463
2642	NC_016622	GGCGC	2	10	2931655	2931664	0 %	0 %	60 %	40 %	374293463
2643	NC_016622	GCACC	2	10	2934760	2934769	20 %	0 %	20 %	60 %	374293466
2644	NC_016622	AAGGA	2	10	2935113	2935122	60 %	0 %	40 %	0 %	374293466
2645	NC_016622	GCGCG	2	10	2935158	2935167	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2646	NC_016622	GTTCG	2	10	2936151	2936160	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2647	NC_016622	CGGTC	2	10	2936201	2936210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2648	NC_016622	GCGCC	2	10	2937675	2937684	0 %	0 %	40 %	60 %	374293470
2649	NC_016622	AAGGC	2	10	2938346	2938355	40 %	0 %	40 %	20 %	374293470
2650	NC_016622	CACCG	2	10	2938435	2938444	20 %	0 %	20 %	60 %	374293470
2651	NC_016622	AGCGC	2	10	2939071	2939080	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2652	NC_016622	TTTGT	2	10	2940180	2940189	0 %	80 %	20 %	0 %	374293473
2653	NC_016622	GCGCG	2	10	2940558	2940567	0 %	0 %	60 %	40 %	374293473
2654	NC_016622	AGGGG	2	10	2940760	2940769	20 %	0 %	80 %	0 %	374293473
2655	NC_016622	CCGAC	2	10	2942877	2942886	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2656	NC_016622	TCCGC	2	10	2943566	2943575	0 %	20 %	20 %	60 %	374293477
2657	NC_016622	CTTCG	2	10	2944281	2944290	0 %	40 %	20 %	40 %	374293477
2658	NC_016622	GACCG	2	10	2944344	2944353	20 %	0 %	40 %	40 %	374293477
2659	NC_016622	TTCGG	2	10	2945405	2945414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2660	NC_016622	TCGTG	2	10	2946299	2946308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2661	NC_016622	CGGAT	2	10	2947706	2947715	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2662	NC_016622	AATCA	2	10	2948139	2948148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2663	NC_016622	AGAGG	2	10	2949088	2949097	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_016622	TTGAA	2	10	2949106	2949115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_016622	CCTCA	2	10	2950192	2950201	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2666	NC_016622	ATCCC	2	10	2950288	2950297	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2667	NC_016622	GAGGC	2	10	2951710	2951719	20 %	0 %	60 %	20 %	374293478
2668	NC_016622	GACCG	2	10	2952360	2952369	20 %	0 %	40 %	40 %	374293478
2669	NC_016622	GTGCT	2	10	2952717	2952726	0 %	40 %	40 %	20 %	374293478
2670	NC_016622	CGCGG	2	10	2956704	2956713	0 %	0 %	60 %	40 %	374293482
2671	NC_016622	TCCGC	2	10	2957148	2957157	0 %	20 %	20 %	60 %	374293482
2672	NC_016622	GCGCG	2	10	2959365	2959374	0 %	0 %	60 %	40 %	374293483
2673	NC_016622	CGCGC	2	10	2959755	2959764	0 %	0 %	40 %	60 %	374293483
2674	NC_016622	AGGCG	2	10	2962212	2962221	20 %	0 %	60 %	20 %	374293485
2675	NC_016622	TTTGT	2	10	2963755	2963764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2676	NC_016622	CCTTA	2	10	2964797	2964806	20 %	40 %	0 %	40 %	374293487
2677	NC_016622	GGCCG	2	10	2965118	2965127	0 %	0 %	60 %	40 %	374293487
2678	NC_016622	GCCGC	2	10	2965521	2965530	0 %	0 %	40 %	60 %	374293487
2679	NC_016622	CGAGG	2	10	2967976	2967985	20 %	0 %	60 %	20 %	374293489
2680	NC_016622	ACGCC	2	10	2968140	2968149	20 %	0 %	20 %	60 %	374293489
2681	NC_016622	CGGTT	2	10	2969173	2969182	0 %	40 %	40 %	20 %	374293489
2682	NC_016622	TCGGA	2	10	2969634	2969643	20 %	20 %	40 %	20 %	374293489
2683	NC_016622	GGGGC	2	10	2969760	2969769	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2684	NC_016622	GAATT	3	15	2970194	2970208	40 %	40 %	20 %	0 %	374293490
2685	NC_016622	CCGGC	2	10	2971183	2971192	0 %	0 %	40 %	60 %	374293492
2686	NC_016622	TCGTC	2	10	2972946	2972955	0 %	40 %	20 %	40 %	374293492
2687	NC_016622	CGCGC	2	10	2974924	2974933	0 %	0 %	40 %	60 %	374293494
2688	NC_016622	GGGCA	2	10	2975225	2975234	20 %	0 %	60 %	20 %	374293494
2689	NC_016622	CGCGC	2	10	2975568	2975577	0 %	0 %	40 %	60 %	374293494
2690	NC_016622	CCGGA	2	10	2976644	2976653	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2691	NC_016622	CGGCC	2	10	2976666	2976675	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2692	NC_016622	GCGCG	2	10	2979209	2979218	0 %	0 %	60 %	40 %	374293498
2693	NC_016622	TGACC	2	10	2979325	2979334	20 %	20 %	20 %	40 %	374293498
2694	NC_016622	GCCCG	2	10	2979374	2979383	0 %	0 %	40 %	60 %	374293498
2695	NC_016622	TTGGC	2	10	2980949	2980958	0 %	40 %	40 %	20 %	374293500
2696	NC_016622	GCCAG	2	10	2983891	2983900	20 %	0 %	40 %	40 %	374293503
2697	NC_016622	CCGAT	2	10	2985229	2985238	20 %	20 %	20 %	40 %	374293504
2698	NC_016622	GCTGG	2	10	2987030	2987039	0 %	20 %	60 %	20 %	374293506

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.