MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu chromosome

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016621	AAAAAT	2	12	10115	10126	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016621	TTTAAA	2	12	17531	17542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016621	ATCTTA	2	12	24574	24585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016621	TTTAAT	2	12	37030	37041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016621	AAAAAT	2	12	62331	62342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016621	TTTTTA	2	12	107278	107289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016621	TTTTAG	2	12	110339	110350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016621	TAAAAA	2	12	110921	110932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016621	TAAAGT	2	12	144296	144307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016621	ATCACT	2	12	159164	159175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016621	ATTATG	2	12	168890	168901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016621	ATATTT	2	12	198243	198254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016621	TAAAAA	2	12	206247	206258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016621	AATAAA	2	12	206694	206705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016621	ATTTAT	2	12	209858	209869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016621	TAAATA	2	12	251740	251751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016621	AAAATA	2	12	272535	272546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016621	TAGATT	2	12	274460	274471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016621	TATTTT	2	12	304823	304834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016621	CATTAA	2	12	313445	313456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016621	TATTTT	2	12	325478	325489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016621	TTTGAA	2	12	386540	386551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016621	TAAAAA	2	12	401783	401794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016621	AGATAA	2	12	408580	408591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016621	TATTAA	2	12	495541	495552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016621	TATAAA	2	12	541808	541819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016621	ACAAAA	2	12	542111	542122	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016621	ATTTTT	2	12	558206	558217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016621	ATTTTT	2	12	579314	579325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016621	AAAATA	2	12	589343	589354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016621	ATTTTT	2	12	596342	596353	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016621	ATTTAT	2	12	596383	596394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016621	TTTAAA	2	12	597829	597840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016621	TAATTT	2	12	598383	598394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.