MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu chromosome

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016621	TGAACA	2	12	1870	1881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374290094
2	NC_016621	TTATAT	2	12	1989	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290095
3	NC_016621	CATATC	2	12	2015	2026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290095
4	NC_016621	TATAAA	2	12	2787	2798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290096
5	NC_016621	TTTTGT	2	12	4974	4985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374290097
6	NC_016621	CTATTT	2	12	5627	5638	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374290098
7	NC_016621	ATTTTT	2	12	8550	8561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290100
8	NC_016621	TAAAAA	2	12	10547	10558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290101
9	NC_016621	ATTTCT	2	12	13313	13324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374290103
10	NC_016621	AGAAAT	2	12	18641	18652	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290106
11	NC_016621	ATCCAA	2	12	19379	19390	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374290107
12	NC_016621	TAAAAA	2	12	23881	23892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290111
13	NC_016621	ATTTAG	2	12	28771	28782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374290116
14	NC_016621	TGGAAT	2	12	28844	28855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374290116
15	NC_016621	AAATAT	2	12	29561	29572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290117
16	NC_016621	AAAAAT	2	12	29710	29721	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290117
17	NC_016621	TAAAAA	2	12	30280	30291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290119
18	NC_016621	AAAATT	2	12	32863	32874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290122
19	NC_016621	GAAAGG	2	12	36915	36926	50 %	0 %	50 %	0 %	374290126
20	NC_016621	ATATGG	2	12	38149	38160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374290128
21	NC_016621	AGAACG	2	12	39348	39359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374290130
22	NC_016621	AATATA	2	12	39395	39406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290130
23	NC_016621	GGATTT	2	12	40210	40221	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374290130
24	NC_016621	GAAAAC	2	12	40898	40909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374290130
25	NC_016621	ATATTT	2	12	43418	43429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290133
26	NC_016621	ATTTTT	2	12	45360	45371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290135
27	NC_016621	TTGGAT	2	12	46133	46144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374290135
28	NC_016621	TATTTT	2	12	46653	46664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290135
29	NC_016621	TCTGAA	2	12	48027	48038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374290136
30	NC_016621	ATTTCT	2	12	49940	49951	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374290139
31	NC_016621	GGAGAA	2	12	50704	50715	50 %	0 %	50 %	0 %	374290140
32	NC_016621	AAAGAA	2	12	52242	52253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374290141
33	NC_016621	AAAAGA	2	12	52256	52267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374290141
34	NC_016621	ATTTAT	2	12	57658	57669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290145
35	NC_016621	ATCTAT	2	12	58095	58106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374290146
36	NC_016621	TATAGA	2	12	58395	58406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290146
37	NC_016621	ACAATA	2	12	59897	59908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374290147
38	NC_016621	TAATTC	2	12	61038	61049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374290148
39	NC_016621	CATAAA	2	12	62441	62452	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374290149
40	NC_016621	AATTTA	2	12	63465	63476	50 %	50 %	0 %	0 %	374290150
41	NC_016621	TTTCAA	2	12	63831	63842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374290150
42	NC_016621	ATTATA	2	12	66033	66044	50 %	50 %	0 %	0 %	374290151
43	NC_016621	TATAGA	2	12	67008	67019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290151
44	NC_016621	ATTTTT	3	18	68144	68161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290152
45	NC_016621	CATTAA	2	12	71328	71339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374290155
46	NC_016621	CTATTC	2	12	71732	71743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374290155
47	NC_016621	ATTTTA	2	12	72715	72726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290157
48	NC_016621	ATTAAT	2	12	75428	75439	50 %	50 %	0 %	0 %	374290159
49	NC_016621	AAATTA	2	12	75612	75623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290159
50	NC_016621	TTTTGG	2	12	75637	75648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290159
51	NC_016621	CCAAAA	2	12	77858	77869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374290163
52	NC_016621	TAGAAA	2	12	82410	82421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290168
53	NC_016621	AAATAA	2	12	82656	82667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290168
54	NC_016621	TATAGA	2	12	83137	83148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290168
55	NC_016621	AATTAA	2	12	83727	83738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290168
56	NC_016621	TAATGA	2	12	86574	86585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290171
57	NC_016621	TATTTT	2	12	88641	88652	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290172
58	NC_016621	TTCTTT	2	12	88737	88748	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290172
59	NC_016621	AAATAT	2	12	90569	90580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290174
60	NC_016621	GAAATA	2	12	92604	92615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290175
61	NC_016621	TTTCTT	2	12	95111	95122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290177
62	NC_016621	AAATTT	2	12	96020	96031	50 %	50 %	0 %	0 %	374290178
63	NC_016621	GTACCT	2	12	96602	96613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374290178
64	NC_016621	ATTAAA	2	12	99301	99312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290181
65	NC_016621	AGATTC	2	12	102251	102262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374290184
66	NC_016621	GAAAAA	2	12	103677	103688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374290185
67	NC_016621	TTTTAG	2	12	103775	103786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374290185
68	NC_016621	TTGAGA	2	12	104782	104793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374290186
69	NC_016621	TCCAGT	2	12	107003	107014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374290188
70	NC_016621	TAAAGT	2	12	109559	109570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290191
71	NC_016621	TTTCTT	2	12	109828	109839	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290191
72	NC_016621	TCTTTT	2	12	112282	112293	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290193
73	NC_016621	TCCTAT	2	12	114414	114425	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374290194
74	NC_016621	AATCCA	2	12	115111	115122	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374290195
75	NC_016621	TGTTCA	2	12	115390	115401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374290195
76	NC_016621	TAAAGA	2	12	115770	115781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290195
77	NC_016621	ACGTAT	2	12	116019	116030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374290195
78	NC_016621	TTTCTT	2	12	116465	116476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290196
79	NC_016621	AATTTT	2	12	116566	116577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290196
80	NC_016621	AATATT	2	12	116820	116831	50 %	50 %	0 %	0 %	374290196
81	NC_016621	TTTATT	2	12	116869	116880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290196
82	NC_016621	ATTCTA	2	12	118237	118248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374290198
83	NC_016621	TTTCTC	2	12	118669	118680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290198
84	NC_016621	AATTTT	2	12	119467	119478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290199
85	NC_016621	ATAGGT	2	12	119536	119547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374290199
86	NC_016621	TTGGAA	2	12	120049	120060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374290199
87	NC_016621	TATTTT	2	12	120155	120166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290199
88	NC_016621	ATTTTT	2	12	120657	120668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290199
89	NC_016621	TTTTTA	2	12	120757	120768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290199
90	NC_016621	TCTAAA	2	12	124426	124437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374290201
91	NC_016621	TTTCTA	2	12	124454	124465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374290201
92	NC_016621	TAAAAT	2	12	125519	125530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290202
93	NC_016621	AATCAA	2	12	125994	126005	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374290203
94	NC_016621	TTTTCT	2	12	126939	126950	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290204
95	NC_016621	TTATGG	2	12	130407	130418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374290206
96	NC_016621	TGCAAG	2	12	131525	131536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374290207
97	NC_016621	TTTTCT	2	12	131586	131597	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290207
98	NC_016621	TATTCT	2	12	132215	132226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374290208
99	NC_016621	TTTTCT	2	12	134479	134490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290211
100	NC_016621	TCATAT	2	12	135336	135347	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374290212
101	NC_016621	TATCCA	2	12	136416	136427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290213
102	NC_016621	ATAGAA	2	12	136843	136854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290213
103	NC_016621	TTTTAA	2	12	137695	137706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290214
104	NC_016621	TTTATT	2	12	139827	139838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290215
105	NC_016621	GGATGA	2	12	144453	144464	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374290220
106	NC_016621	TTTTCT	2	12	148137	148148	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290222
107	NC_016621	TATAAA	2	12	149019	149030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290223
108	NC_016621	ATTAAA	2	12	149046	149057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290223
109	NC_016621	TTTTAT	2	12	149327	149338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374290223
110	NC_016621	CTTTTT	2	12	150028	150039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374290224
111	NC_016621	ATTTTA	2	12	153375	153386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290226
112	NC_016621	GGATTT	2	12	156177	156188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374290229
113	NC_016621	AATAAA	2	12	157472	157483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290230
114	NC_016621	TGGTAA	2	12	159431	159442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374290232
115	NC_016621	TAGATT	2	12	160124	160135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374290234
116	NC_016621	AAATGT	2	12	160686	160697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290234
117	NC_016621	AAAATA	2	12	164957	164968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290236
118	NC_016621	AATGAA	2	12	165106	165117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290236
119	NC_016621	TATTCC	2	12	165219	165230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374290236
120	NC_016621	GAAAAA	2	12	165364	165375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374290236
121	NC_016621	AATTAG	2	12	171016	171027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374290241
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.