MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016621	ATTTT	2	10	6712	6721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016621	TTAAT	2	10	23709	23718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016621	TTTAA	2	10	29732	29741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016621	AAAAT	2	10	30000	30009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016621	AAATT	2	10	35602	35611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016621	TCTTT	2	10	35689	35698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016621	TATTT	2	10	50428	50437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016621	ATTTA	2	10	61817	61826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016621	AATTC	2	10	64944	64953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016621	ATTTT	2	10	64966	64975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016621	TCATA	4	20	65191	65210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016621	TATAC	2	10	68961	68970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016621	ATGTT	2	10	74424	74433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016621	ATAGT	2	10	78999	79008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016621	TAGAA	2	10	92064	92073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016621	ATTTT	2	10	107261	107270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016621	ATTTA	2	10	110970	110979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016621	TTTTA	2	10	111235	111244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016621	AGTGG	2	10	111277	111286	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016621	AATTA	2	10	111389	111398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016621	TTTAT	2	10	122149	122158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016621	ATTTA	2	10	122233	122242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016621	GAATA	2	10	126648	126657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016621	AATAA	2	10	130676	130685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016621	ATATT	2	10	144108	144117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016621	ATTAT	2	10	159624	159633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016621	TAAAA	2	10	161348	161357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016621	TAAAA	2	10	191762	191771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016621	ATAGA	2	10	198163	198172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016621	TAATA	2	10	218730	218739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016621	ATTTT	2	10	224652	224661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016621	TAATA	2	10	236699	236708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016621	TATAT	2	10	242885	242894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016621	TATAA	2	10	251840	251849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016621	TTATT	2	10	255310	255319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016621	TAAAA	2	10	264752	264761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016621	TATAA	2	10	265793	265802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016621	TAAAA	2	10	272595	272604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016621	AATTA	2	10	279195	279204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016621	GAAAA	2	10	281528	281537	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016621	TATAT	2	10	284384	284393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016621	TAAAA	2	10	288189	288198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016621	TAAAA	2	10	325538	325547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016621	GTATA	2	10	325673	325682	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016621	TAAAT	2	10	325696	325705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016621	TCTAT	2	10	346648	346657	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016621	TTTCG	2	10	354224	354233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016621	TATTT	2	10	358925	358934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016621	ATTTA	2	10	378283	378292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016621	ATTTT	2	10	378535	378544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016621	GAATA	2	10	405680	405689	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016621	TAATA	2	10	405722	405731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016621	CTGTA	2	10	415964	415973	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016621	TATTT	2	10	433879	433888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016621	CAATT	2	10	439258	439267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016621	TTATA	2	10	441190	441199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016621	TAAAA	2	10	447609	447618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016621	TAAAA	2	10	447713	447722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016621	AAAAT	2	10	448619	448628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016621	TAATA	2	10	459794	459803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016621	ATTTT	2	10	478714	478723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016621	ATTAT	2	10	501059	501068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016621	TTTTC	2	10	520171	520180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016621	ATTTT	2	10	527527	527536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016621	TAAAA	2	10	527567	527576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016621	GTATT	2	10	527803	527812	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016621	AAAAT	2	10	527828	527837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016621	TATAT	2	10	527980	527989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016621	GTTTT	2	10	532541	532550	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016621	AAATT	2	10	541914	541923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016621	ATTAT	2	10	541957	541966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016621	AAAAT	2	10	542053	542062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016621	AGAAC	2	10	553147	553156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016621	ATTTT	2	10	553165	553174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016621	AGTAA	2	10	558131	558140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016621	TAATA	2	10	558147	558156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016621	GAAAA	2	10	589167	589176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016621	TAAAA	2	10	589249	589258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016621	CATAA	2	10	597645	597654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016621	ATTAT	2	10	597655	597664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016621	AATTG	2	10	597712	597721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016621	TAAAA	2	10	598373	598382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016621	TAAAT	2	10	602489	602498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016621	TCATA	2	10	605708	605717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.