MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteriovorax marinus SJ

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016620	TTTTG	2	10	44348	44357	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016620	TATAA	2	10	46285	46294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016620	CTTAT	2	10	50481	50490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016620	TTCAA	2	10	51547	51556	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016620	CTACA	2	10	55410	55419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016620	TGAAA	2	10	55504	55513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016620	ATACC	2	10	84725	84734	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016620	AAAGT	2	10	101331	101340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016620	ACAAT	2	10	108451	108460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016620	AAGTT	2	10	128777	128786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016620	TATTT	2	10	167134	167143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016620	TTTTA	2	10	169693	169702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016620	ATATA	2	10	188219	188228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016620	AATTT	2	10	233581	233590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016620	TCGTG	2	10	234734	234743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016620	TAAAA	2	10	235438	235447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016620	CCGTA	2	10	237135	237144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016620	GAGAA	2	10	237162	237171	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016620	AGAGG	2	10	237388	237397	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016620	TCGGG	2	10	237749	237758	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016620	AAGAT	2	10	238311	238320	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016620	TATTT	2	10	238422	238431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016620	GTTTT	2	10	238450	238459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016620	ATCCC	2	10	238588	238597	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016620	TTTCA	2	10	253513	253522	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016620	TTTTC	2	10	268774	268783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016620	AATAG	2	10	268793	268802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016620	TAGGT	2	10	291207	291216	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016620	CTATT	2	10	298683	298692	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016620	TTCTA	2	10	329581	329590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016620	TAGGA	2	10	329633	329642	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016620	TATTT	2	10	330348	330357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016620	GGAGA	2	10	343454	343463	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016620	CTGTG	2	10	351422	351431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016620	ATTTT	2	10	418504	418513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016620	ACTCT	2	10	448634	448643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016620	TTAAA	2	10	460672	460681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016620	AGTAA	2	10	489117	489126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016620	GGGGA	2	10	501578	501587	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016620	ATTAA	2	10	506040	506049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016620	CTTAT	2	10	523835	523844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016620	AAAAT	2	10	535837	535846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016620	TTTGA	2	10	539868	539877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016620	TTAAT	2	10	554514	554523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016620	AGCTT	2	10	607934	607943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016620	CAAAT	2	10	610370	610379	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016620	TACAA	2	10	640434	640443	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016620	ATTTT	2	10	661598	661607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016620	AATAA	2	10	671778	671787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016620	TAAGT	2	10	674126	674135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016620	ATTGG	2	10	674479	674488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016620	CTTTT	2	10	677511	677520	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016620	AGGAT	2	10	695038	695047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016620	ATTAG	2	10	700931	700940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016620	GAGAG	2	10	753077	753086	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016620	TTAAT	2	10	762983	762992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016620	GTCTT	2	10	763148	763157	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016620	TAATT	2	10	770591	770600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016620	TTTCT	2	10	781940	781949	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016620	GAATT	2	10	793973	793982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016620	AATCA	2	10	802422	802431	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016620	TTTAA	2	10	802699	802708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016620	ATGTA	2	10	809906	809915	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016620	GAATT	2	10	829836	829845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016620	TTGAT	2	10	831916	831925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016620	CTATA	2	10	839427	839436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016620	AAAAC	2	10	860563	860572	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016620	TCAAT	2	10	860870	860879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016620	AATAT	2	10	862563	862572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016620	TTTTG	2	10	923874	923883	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016620	AATTT	2	10	927169	927178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016620	GGTAA	2	10	960420	960429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016620	TTCAA	2	10	960918	960927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016620	AAGGT	2	10	1027006	1027015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016620	TTTAA	2	10	1034825	1034834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016620	ATAGA	2	10	1036754	1036763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016620	TAAAT	2	10	1040686	1040695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016620	ATTTA	2	10	1049109	1049118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016620	TATGA	2	10	1054663	1054672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016620	AATAT	2	10	1056850	1056859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016620	TCCTT	2	10	1059640	1059649	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016620	AATTT	2	10	1064593	1064602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016620	ATAAA	2	10	1071895	1071904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016620	AGAGA	2	10	1081000	1081009	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016620	TAGTA	2	10	1098354	1098363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016620	TTTAA	2	10	1104687	1104696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016620	ATTTA	2	10	1134260	1134269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016620	TTTAT	2	10	1158042	1158051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016620	TTATA	2	10	1195211	1195220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016620	AAAGA	2	10	1205891	1205900	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016620	GAAAG	2	10	1205938	1205947	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016620	TAATT	2	10	1212142	1212151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016620	TAAAT	2	10	1213374	1213383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016620	TAGAA	2	10	1382987	1382996	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016620	TTACT	2	10	1425417	1425426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016620	CGTTG	2	10	1427381	1427390	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016620	TTCCC	2	10	1427509	1427518	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_016620	CTTAA	2	10	1432296	1432305	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016620	TATTT	2	10	1432459	1432468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016620	ATTAG	2	10	1432842	1432851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016620	CTTTT	2	10	1487693	1487702	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016620	AGTCC	2	10	1492914	1492923	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016620	CTATT	2	10	1509610	1509619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016620	TTTTC	2	10	1524293	1524302	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016620	TAATT	2	10	1532672	1532681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016620	GAGTA	2	10	1532756	1532765	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016620	TATAC	2	10	1544378	1544387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016620	GGTGC	2	10	1564123	1564132	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016620	TCCTC	2	10	1564504	1564513	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_016620	ATTAC	2	10	1569664	1569673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016620	CTTCT	2	10	1580824	1580833	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016620	TTCTA	2	10	1616481	1616490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016620	GAGGC	2	10	1633627	1633636	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016620	TTTTA	2	10	1640160	1640169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016620	ATAAA	2	10	1667805	1667814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016620	TATAT	2	10	1687285	1687294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016620	CCTTA	2	10	1718215	1718224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016620	AAGAA	2	10	1747987	1747996	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016620	AACTT	2	10	1808596	1808605	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016620	ATTAA	2	10	1814009	1814018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016620	AATGA	2	10	1834981	1834990	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016620	ATAAC	2	10	1835449	1835458	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016620	AAAGT	2	10	1871979	1871988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016620	AACTA	2	10	1877848	1877857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016620	CTCTT	2	10	1885124	1885133	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016620	TAGAA	2	10	1887900	1887909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016620	GGGAT	2	10	1888600	1888609	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016620	CAAAA	2	10	1888737	1888746	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016620	TAAAA	2	10	1888764	1888773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016620	ATCTT	2	10	1888877	1888886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016620	CCCGA	2	10	1889439	1889448	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_016620	CCTCT	2	10	1889800	1889809	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_016620	TTCTC	2	10	1890026	1890035	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016620	TACGG	2	10	1890053	1890062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016620	ATTTT	2	10	1891744	1891753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016620	CACGA	2	10	1892414	1892423	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016620	AAATT	2	10	1893567	1893576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016620	GAAAT	2	10	1925912	1925921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016620	AATCT	2	10	1950967	1950976	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016620	CTAAA	2	10	1962527	1962536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016620	TGGCA	2	10	1962664	1962673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016620	ATTAT	2	10	1970494	1970503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016620	TCTCT	2	10	1995196	1995205	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016620	AGAAT	2	10	1995276	1995285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016620	AATCA	2	10	2011926	2011935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_016620	ATTAA	2	10	3373036	3373045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_016620	TACAA	2	10	3375766	3375775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
236	NC_016620	GGCTG	2	10	3390248	3390257	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.