MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	AAATG	2	10	1176	1185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016619	CACAG	2	10	2150	2159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016619	TGGGT	2	10	2643	2652	0 %	40 %	60 %	0 %	392384563
4	NC_016619	CCGTC	2	10	3583	3592	0 %	20 %	20 %	60 %	392384564
5	NC_016619	CCGCC	2	10	3797	3806	0 %	0 %	20 %	80 %	392384564
6	NC_016619	GCCCG	2	10	6273	6282	0 %	0 %	40 %	60 %	392384565
7	NC_016619	CGCGC	2	10	8047	8056	0 %	0 %	40 %	60 %	392384567
8	NC_016619	GCCCC	2	10	9188	9197	0 %	0 %	20 %	80 %	392384567
9	NC_016619	CGGCG	2	10	10012	10021	0 %	0 %	60 %	40 %	392384568
10	NC_016619	CCGGA	2	10	11704	11713	20 %	0 %	40 %	40 %	392384570
11	NC_016619	CGGGC	2	10	12170	12179	0 %	0 %	60 %	40 %	392384570
12	NC_016619	TCGCC	2	10	15188	15197	0 %	20 %	20 %	60 %	392384572
13	NC_016619	CGGCG	2	10	15699	15708	0 %	0 %	60 %	40 %	392384572
14	NC_016619	GCGAG	2	10	16276	16285	20 %	0 %	60 %	20 %	392384573
15	NC_016619	AGGGC	2	10	16633	16642	20 %	0 %	60 %	20 %	392384573
16	NC_016619	GCCGC	2	10	17647	17656	0 %	0 %	40 %	60 %	392384573
17	NC_016619	GGCCC	2	10	18257	18266	0 %	0 %	40 %	60 %	392384573
18	NC_016619	TTATT	2	10	19169	19178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016619	GCAAC	2	10	21818	21827	40 %	0 %	20 %	40 %	392384577
20	NC_016619	GCACG	2	10	22357	22366	20 %	0 %	40 %	40 %	392384577
21	NC_016619	CGTGA	2	10	22463	22472	20 %	20 %	40 %	20 %	392384577
22	NC_016619	CGGGA	2	10	22638	22647	20 %	0 %	60 %	20 %	392384577
23	NC_016619	GGGGT	2	10	23883	23892	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016619	AAGCC	2	10	24432	24441	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016619	GTTCC	2	10	24473	24482	0 %	40 %	20 %	40 %	392384579
26	NC_016619	CCGAT	2	10	24554	24563	20 %	20 %	20 %	40 %	392384579
27	NC_016619	GCGCC	2	10	24762	24771	0 %	0 %	40 %	60 %	392384579
28	NC_016619	CCGGT	2	10	27420	27429	0 %	20 %	40 %	40 %	392384582
29	NC_016619	TTCGG	2	10	28015	28024	0 %	40 %	40 %	20 %	392384583
30	NC_016619	GCTTC	2	10	32118	32127	0 %	40 %	20 %	40 %	392384585
31	NC_016619	ACCGC	2	10	32662	32671	20 %	0 %	20 %	60 %	392384585
32	NC_016619	CGGTG	2	10	34197	34206	0 %	20 %	60 %	20 %	392384587
33	NC_016619	GGAAA	2	10	35402	35411	60 %	0 %	40 %	0 %	392384588
34	NC_016619	CGAAA	2	10	36111	36120	60 %	0 %	20 %	20 %	392384588
35	NC_016619	TGCCG	2	10	38384	38393	0 %	20 %	40 %	40 %	392384592
36	NC_016619	GGCGT	2	10	38518	38527	0 %	20 %	60 %	20 %	392384592
37	NC_016619	CGTAG	2	10	40204	40213	20 %	20 %	40 %	20 %	392384594
38	NC_016619	GGCGA	2	10	40214	40223	20 %	0 %	60 %	20 %	392384594
39	NC_016619	CGGCA	2	10	40430	40439	20 %	0 %	40 %	40 %	392384594
40	NC_016619	CAGAT	2	10	41333	41342	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016619	CTACA	2	10	43170	43179	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016619	TAAAT	2	10	44581	44590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016619	TCGCC	2	10	46835	46844	0 %	20 %	20 %	60 %	392384601
44	NC_016619	TCGGC	2	10	48215	48224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016619	GCGCC	2	10	50387	50396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016619	CATCG	2	10	52559	52568	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016619	GCCCG	2	10	53447	53456	0 %	0 %	40 %	60 %	392384606
48	NC_016619	TCCCT	2	10	54051	54060	0 %	40 %	0 %	60 %	392384608
49	NC_016619	ACCGC	2	10	54732	54741	20 %	0 %	20 %	60 %	392384610
50	NC_016619	CGGCG	2	10	54879	54888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016619	GTCCG	2	10	55681	55690	0 %	20 %	40 %	40 %	392384612
52	NC_016619	AGCCG	2	10	57304	57313	20 %	0 %	40 %	40 %	392384614
53	NC_016619	CGGCG	2	10	58216	58225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016619	TGCCT	2	10	58443	58452	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016619	GTCAT	2	10	58982	58991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016619	GGACA	2	10	60093	60102	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016619	CCGCG	2	10	60488	60497	0 %	0 %	40 %	60 %	392384617
58	NC_016619	GCACG	2	10	60966	60975	20 %	0 %	40 %	40 %	392384617
59	NC_016619	GGCGC	2	10	62612	62621	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016619	CCTCC	2	10	63064	63073	0 %	20 %	0 %	80 %	392384619
61	NC_016619	CCGTT	2	10	64519	64528	0 %	40 %	20 %	40 %	392384620
62	NC_016619	CACGC	2	10	65522	65531	20 %	0 %	20 %	60 %	392384620
63	NC_016619	ACCGT	2	10	67245	67254	20 %	20 %	20 %	40 %	392384621
64	NC_016619	GCAAG	2	10	72299	72308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016619	AAGCC	2	10	72783	72792	40 %	0 %	20 %	40 %	392384626
66	NC_016619	CGCGG	2	10	73864	73873	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016619	GCCGC	2	10	75410	75419	0 %	0 %	40 %	60 %	392384630
68	NC_016619	TGACC	2	10	77063	77072	20 %	20 %	20 %	40 %	392384632
69	NC_016619	TCCGA	2	10	77271	77280	20 %	20 %	20 %	40 %	392384632
70	NC_016619	TCATG	2	10	77285	77294	20 %	40 %	20 %	20 %	392384632
71	NC_016619	CCGGC	2	10	77298	77307	0 %	0 %	40 %	60 %	392384632
72	NC_016619	GGCCG	2	10	77544	77553	0 %	0 %	60 %	40 %	392384633
73	NC_016619	GCTTG	2	10	79123	79132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016619	TCGGC	2	10	80102	80111	0 %	20 %	40 %	40 %	392384634
75	NC_016619	ACCGC	2	10	81495	81504	20 %	0 %	20 %	60 %	392384635
76	NC_016619	TCGCC	2	10	81922	81931	0 %	20 %	20 %	60 %	392384635
77	NC_016619	TGCGG	2	10	82169	82178	0 %	20 %	60 %	20 %	392384635
78	NC_016619	GGGCA	2	10	83360	83369	20 %	0 %	60 %	20 %	392384635
79	NC_016619	GGCCG	2	10	83657	83666	0 %	0 %	60 %	40 %	392384635
80	NC_016619	CGAGC	2	10	85763	85772	20 %	0 %	40 %	40 %	392384635
81	NC_016619	GGCCG	2	10	87716	87725	0 %	0 %	60 %	40 %	392384635
82	NC_016619	GCGCC	2	10	87787	87796	0 %	0 %	40 %	60 %	392384635
83	NC_016619	CCGGC	2	10	88466	88475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_016619	ACCGG	2	10	89756	89765	20 %	0 %	40 %	40 %	392384636
85	NC_016619	CGGGG	2	10	89874	89883	0 %	0 %	80 %	20 %	392384636
86	NC_016619	CCTCG	2	10	89885	89894	0 %	20 %	20 %	60 %	392384636
87	NC_016619	GGTGT	2	10	91379	91388	0 %	40 %	60 %	0 %	392384638
88	NC_016619	TGCCG	2	10	91779	91788	0 %	20 %	40 %	40 %	392384639
89	NC_016619	GGCGT	2	10	91913	91922	0 %	20 %	60 %	20 %	392384639
90	NC_016619	CTTGG	2	10	93488	93497	0 %	40 %	40 %	20 %	392384642
91	NC_016619	GTCGC	2	10	94483	94492	0 %	20 %	40 %	40 %	392384643
92	NC_016619	GTGCG	2	10	95079	95088	0 %	20 %	60 %	20 %	392384643
93	NC_016619	CGCTG	2	10	96802	96811	0 %	20 %	40 %	40 %	392384645
94	NC_016619	GCTTT	2	10	97686	97695	0 %	60 %	20 %	20 %	392384645
95	NC_016619	GTGCG	2	10	97860	97869	0 %	20 %	60 %	20 %	392384645
96	NC_016619	CGCAG	2	10	97894	97903	20 %	0 %	40 %	40 %	392384645
97	NC_016619	CCCAG	2	10	97960	97969	20 %	0 %	20 %	60 %	392384645
98	NC_016619	CTCCG	2	10	98022	98031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_016619	CGGCG	2	10	98978	98987	0 %	0 %	60 %	40 %	392384646
100	NC_016619	GGCAA	2	10	99504	99513	40 %	0 %	40 %	20 %	392384646
101	NC_016619	CGAAC	2	10	100304	100313	40 %	0 %	20 %	40 %	392384648
102	NC_016619	TCGGT	2	10	100504	100513	0 %	40 %	40 %	20 %	392384648
103	NC_016619	CGGCC	2	10	102138	102147	0 %	0 %	40 %	60 %	392384650
104	NC_016619	CCGCG	2	10	102941	102950	0 %	0 %	40 %	60 %	392384650
105	NC_016619	TGACA	2	10	103223	103232	40 %	20 %	20 %	20 %	392384650
106	NC_016619	GCTTT	2	10	103808	103817	0 %	60 %	20 %	20 %	392384651
107	NC_016619	CGCTC	2	10	106197	106206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_016619	GGGTG	2	10	109292	109301	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016619	CCGGC	2	10	109879	109888	0 %	0 %	40 %	60 %	392384657
110	NC_016619	GCGCG	2	10	110445	110454	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016619	TCCTT	2	10	110891	110900	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016619	GTCCG	2	10	111593	111602	0 %	20 %	40 %	40 %	392384660
113	NC_016619	GACCT	2	10	114084	114093	20 %	20 %	20 %	40 %	392384662
114	NC_016619	TGACA	2	10	114166	114175	40 %	20 %	20 %	20 %	392384662
115	NC_016619	CGGCC	2	10	114987	114996	0 %	0 %	40 %	60 %	392384663
116	NC_016619	CCGGC	2	10	116268	116277	0 %	0 %	40 %	60 %	392384665
117	NC_016619	GGACG	2	10	117732	117741	20 %	0 %	60 %	20 %	392384667
118	NC_016619	TGGCC	2	10	118035	118044	0 %	20 %	40 %	40 %	392384668
119	NC_016619	GCCCC	2	10	122073	122082	0 %	0 %	20 %	80 %	392384671
120	NC_016619	CGCCC	2	10	124097	124106	0 %	0 %	20 %	80 %	392384672
121	NC_016619	GCATC	2	10	125767	125776	20 %	20 %	20 %	40 %	392384675
122	NC_016619	CTGCC	2	10	127013	127022	0 %	20 %	20 %	60 %	392384676
123	NC_016619	CCGAC	2	10	129869	129878	20 %	0 %	20 %	60 %	392384678
124	NC_016619	TGCTC	2	10	131965	131974	0 %	40 %	20 %	40 %	392384679
125	NC_016619	CCGCA	2	10	132354	132363	20 %	0 %	20 %	60 %	392384679
126	NC_016619	GGCGA	2	10	133491	133500	20 %	0 %	60 %	20 %	392384682
127	NC_016619	GTCCC	2	10	137663	137672	0 %	20 %	20 %	60 %	392384683
128	NC_016619	GCGTC	2	10	137971	137980	0 %	20 %	40 %	40 %	392384684
129	NC_016619	GCCGG	2	10	138266	138275	0 %	0 %	60 %	40 %	392384684
130	NC_016619	CGGCG	2	10	139715	139724	0 %	0 %	60 %	40 %	392384686
131	NC_016619	GTGCC	2	10	140126	140135	0 %	20 %	40 %	40 %	392384686
132	NC_016619	GCCGT	2	10	140208	140217	0 %	20 %	40 %	40 %	392384686
133	NC_016619	CCGTC	2	10	140434	140443	0 %	20 %	20 %	60 %	392384686
134	NC_016619	GCGCC	2	10	140528	140537	0 %	0 %	40 %	60 %	392384686
135	NC_016619	CCGTT	2	10	145198	145207	0 %	40 %	20 %	40 %	392384686
136	NC_016619	CCGGT	2	10	145442	145451	0 %	20 %	40 %	40 %	392384687
137	NC_016619	CCGCG	2	10	146438	146447	0 %	0 %	40 %	60 %	392384687
138	NC_016619	CCGGG	2	10	146597	146606	0 %	0 %	60 %	40 %	392384687
139	NC_016619	GCCGT	2	10	146739	146748	0 %	20 %	40 %	40 %	392384688
140	NC_016619	CCCGA	2	10	147303	147312	20 %	0 %	20 %	60 %	392384688
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148	NC_016619	TGCCG	2	10	152570	152579	0 %	20 %	40 %	40 %	392384692
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152	NC_016619	CGTTG	2	10	156723	156732	0 %	40 %	40 %	20 %	392384700
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156	NC_016619	TTGGG	2	10	160393	160402	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_016619	GCTCA	2	10	162589	162598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_016619	CGGCG	2	10	163385	163394	0 %	0 %	60 %	40 %	392384704
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175	NC_016619	TCGAA	2	10	183239	183248	40 %	20 %	20 %	20 %	392384717
176	NC_016619	GGGCA	2	10	187854	187863	20 %	0 %	60 %	20 %	392384719
177	NC_016619	GTATC	2	10	188271	188280	20 %	40 %	20 %	20 %	392384719
178	NC_016619	CGATC	2	10	190064	190073	20 %	20 %	20 %	40 %	392384719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.