MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	AAATG	2	10	1176	1185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016619	CACAG	2	10	2150	2159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016619	TTATT	2	10	19169	19178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016619	GGGGT	2	10	23883	23892	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016619	AAGCC	2	10	24432	24441	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016619	CAGAT	2	10	41333	41342	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016619	CTACA	2	10	43170	43179	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016619	TAAAT	2	10	44581	44590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016619	TCGGC	2	10	48215	48224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016619	GCGCC	2	10	50387	50396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016619	CATCG	2	10	52559	52568	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016619	CGGCG	2	10	54879	54888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016619	CGGCG	2	10	58216	58225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016619	TGCCT	2	10	58443	58452	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016619	GTCAT	2	10	58982	58991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016619	GGACA	2	10	60093	60102	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016619	GGCGC	2	10	62612	62621	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016619	GCAAG	2	10	72299	72308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016619	CGCGG	2	10	73864	73873	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016619	GCTTG	2	10	79123	79132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016619	CCGGC	2	10	88466	88475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016619	CTCCG	2	10	98022	98031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_016619	CGCTC	2	10	106197	106206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016619	GGGTG	2	10	109292	109301	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016619	GCGCG	2	10	110445	110454	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016619	TCCTT	2	10	110891	110900	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016619	CGGCG	2	10	151865	151874	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016619	GCTCA	2	10	154847	154856	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016619	CGGGC	2	10	159925	159934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016619	TTGGG	2	10	160393	160402	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016619	AACCT	2	10	160553	160562	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016619	GCTCA	2	10	162589	162598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.