MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	TGGGT	2	10	2643	2652	0 %	40 %	60 %	0 %	392384563
2	NC_016619	CCGTC	2	10	3583	3592	0 %	20 %	20 %	60 %	392384564
3	NC_016619	CCGCC	2	10	3797	3806	0 %	0 %	20 %	80 %	392384564
4	NC_016619	GCCCG	2	10	6273	6282	0 %	0 %	40 %	60 %	392384565
5	NC_016619	CGCGC	2	10	8047	8056	0 %	0 %	40 %	60 %	392384567
6	NC_016619	GCCCC	2	10	9188	9197	0 %	0 %	20 %	80 %	392384567
7	NC_016619	CGGCG	2	10	10012	10021	0 %	0 %	60 %	40 %	392384568
8	NC_016619	CCGGA	2	10	11704	11713	20 %	0 %	40 %	40 %	392384570
9	NC_016619	CGGGC	2	10	12170	12179	0 %	0 %	60 %	40 %	392384570
10	NC_016619	TCGCC	2	10	15188	15197	0 %	20 %	20 %	60 %	392384572
11	NC_016619	CGGCG	2	10	15699	15708	0 %	0 %	60 %	40 %	392384572
12	NC_016619	GCGAG	2	10	16276	16285	20 %	0 %	60 %	20 %	392384573
13	NC_016619	AGGGC	2	10	16633	16642	20 %	0 %	60 %	20 %	392384573
14	NC_016619	GCCGC	2	10	17647	17656	0 %	0 %	40 %	60 %	392384573
15	NC_016619	GGCCC	2	10	18257	18266	0 %	0 %	40 %	60 %	392384573
16	NC_016619	GCAAC	2	10	21818	21827	40 %	0 %	20 %	40 %	392384577
17	NC_016619	GCACG	2	10	22357	22366	20 %	0 %	40 %	40 %	392384577
18	NC_016619	CGTGA	2	10	22463	22472	20 %	20 %	40 %	20 %	392384577
19	NC_016619	CGGGA	2	10	22638	22647	20 %	0 %	60 %	20 %	392384577
20	NC_016619	GTTCC	2	10	24473	24482	0 %	40 %	20 %	40 %	392384579
21	NC_016619	CCGAT	2	10	24554	24563	20 %	20 %	20 %	40 %	392384579
22	NC_016619	GCGCC	2	10	24762	24771	0 %	0 %	40 %	60 %	392384579
23	NC_016619	CCGGT	2	10	27420	27429	0 %	20 %	40 %	40 %	392384582
24	NC_016619	TTCGG	2	10	28015	28024	0 %	40 %	40 %	20 %	392384583
25	NC_016619	GCTTC	2	10	32118	32127	0 %	40 %	20 %	40 %	392384585
26	NC_016619	ACCGC	2	10	32662	32671	20 %	0 %	20 %	60 %	392384585
27	NC_016619	CGGTG	2	10	34197	34206	0 %	20 %	60 %	20 %	392384587
28	NC_016619	GGAAA	2	10	35402	35411	60 %	0 %	40 %	0 %	392384588
29	NC_016619	CGAAA	2	10	36111	36120	60 %	0 %	20 %	20 %	392384588
30	NC_016619	TGCCG	2	10	38384	38393	0 %	20 %	40 %	40 %	392384592
31	NC_016619	GGCGT	2	10	38518	38527	0 %	20 %	60 %	20 %	392384592
32	NC_016619	CGTAG	2	10	40204	40213	20 %	20 %	40 %	20 %	392384594
33	NC_016619	GGCGA	2	10	40214	40223	20 %	0 %	60 %	20 %	392384594
34	NC_016619	CGGCA	2	10	40430	40439	20 %	0 %	40 %	40 %	392384594
35	NC_016619	TCGCC	2	10	46835	46844	0 %	20 %	20 %	60 %	392384601
36	NC_016619	GCCCG	2	10	53447	53456	0 %	0 %	40 %	60 %	392384606
37	NC_016619	TCCCT	2	10	54051	54060	0 %	40 %	0 %	60 %	392384608
38	NC_016619	ACCGC	2	10	54732	54741	20 %	0 %	20 %	60 %	392384610
39	NC_016619	GTCCG	2	10	55681	55690	0 %	20 %	40 %	40 %	392384612
40	NC_016619	AGCCG	2	10	57304	57313	20 %	0 %	40 %	40 %	392384614
41	NC_016619	CCGCG	2	10	60488	60497	0 %	0 %	40 %	60 %	392384617
42	NC_016619	GCACG	2	10	60966	60975	20 %	0 %	40 %	40 %	392384617
43	NC_016619	CCTCC	2	10	63064	63073	0 %	20 %	0 %	80 %	392384619
44	NC_016619	CCGTT	2	10	64519	64528	0 %	40 %	20 %	40 %	392384620
45	NC_016619	CACGC	2	10	65522	65531	20 %	0 %	20 %	60 %	392384620
46	NC_016619	ACCGT	2	10	67245	67254	20 %	20 %	20 %	40 %	392384621
47	NC_016619	AAGCC	2	10	72783	72792	40 %	0 %	20 %	40 %	392384626
48	NC_016619	GCCGC	2	10	75410	75419	0 %	0 %	40 %	60 %	392384630
49	NC_016619	TGACC	2	10	77063	77072	20 %	20 %	20 %	40 %	392384632
50	NC_016619	TCCGA	2	10	77271	77280	20 %	20 %	20 %	40 %	392384632
51	NC_016619	TCATG	2	10	77285	77294	20 %	40 %	20 %	20 %	392384632
52	NC_016619	CCGGC	2	10	77298	77307	0 %	0 %	40 %	60 %	392384632
53	NC_016619	GGCCG	2	10	77544	77553	0 %	0 %	60 %	40 %	392384633
54	NC_016619	TCGGC	2	10	80102	80111	0 %	20 %	40 %	40 %	392384634
55	NC_016619	ACCGC	2	10	81495	81504	20 %	0 %	20 %	60 %	392384635
56	NC_016619	TCGCC	2	10	81922	81931	0 %	20 %	20 %	60 %	392384635
57	NC_016619	TGCGG	2	10	82169	82178	0 %	20 %	60 %	20 %	392384635
58	NC_016619	GGGCA	2	10	83360	83369	20 %	0 %	60 %	20 %	392384635
59	NC_016619	GGCCG	2	10	83657	83666	0 %	0 %	60 %	40 %	392384635
60	NC_016619	CGAGC	2	10	85763	85772	20 %	0 %	40 %	40 %	392384635
61	NC_016619	GGCCG	2	10	87716	87725	0 %	0 %	60 %	40 %	392384635
62	NC_016619	GCGCC	2	10	87787	87796	0 %	0 %	40 %	60 %	392384635
63	NC_016619	ACCGG	2	10	89756	89765	20 %	0 %	40 %	40 %	392384636
64	NC_016619	CGGGG	2	10	89874	89883	0 %	0 %	80 %	20 %	392384636
65	NC_016619	CCTCG	2	10	89885	89894	0 %	20 %	20 %	60 %	392384636
66	NC_016619	GGTGT	2	10	91379	91388	0 %	40 %	60 %	0 %	392384638
67	NC_016619	TGCCG	2	10	91779	91788	0 %	20 %	40 %	40 %	392384639
68	NC_016619	GGCGT	2	10	91913	91922	0 %	20 %	60 %	20 %	392384639
69	NC_016619	CTTGG	2	10	93488	93497	0 %	40 %	40 %	20 %	392384642
70	NC_016619	GTCGC	2	10	94483	94492	0 %	20 %	40 %	40 %	392384643
71	NC_016619	GTGCG	2	10	95079	95088	0 %	20 %	60 %	20 %	392384643
72	NC_016619	CGCTG	2	10	96802	96811	0 %	20 %	40 %	40 %	392384645
73	NC_016619	GCTTT	2	10	97686	97695	0 %	60 %	20 %	20 %	392384645
74	NC_016619	GTGCG	2	10	97860	97869	0 %	20 %	60 %	20 %	392384645
75	NC_016619	CGCAG	2	10	97894	97903	20 %	0 %	40 %	40 %	392384645
76	NC_016619	CCCAG	2	10	97960	97969	20 %	0 %	20 %	60 %	392384645
77	NC_016619	CGGCG	2	10	98978	98987	0 %	0 %	60 %	40 %	392384646
78	NC_016619	GGCAA	2	10	99504	99513	40 %	0 %	40 %	20 %	392384646
79	NC_016619	CGAAC	2	10	100304	100313	40 %	0 %	20 %	40 %	392384648
80	NC_016619	TCGGT	2	10	100504	100513	0 %	40 %	40 %	20 %	392384648
81	NC_016619	CGGCC	2	10	102138	102147	0 %	0 %	40 %	60 %	392384650
82	NC_016619	CCGCG	2	10	102941	102950	0 %	0 %	40 %	60 %	392384650
83	NC_016619	TGACA	2	10	103223	103232	40 %	20 %	20 %	20 %	392384650
84	NC_016619	GCTTT	2	10	103808	103817	0 %	60 %	20 %	20 %	392384651
85	NC_016619	CCGGC	2	10	109879	109888	0 %	0 %	40 %	60 %	392384657
86	NC_016619	GTCCG	2	10	111593	111602	0 %	20 %	40 %	40 %	392384660
87	NC_016619	GACCT	2	10	114084	114093	20 %	20 %	20 %	40 %	392384662
88	NC_016619	TGACA	2	10	114166	114175	40 %	20 %	20 %	20 %	392384662
89	NC_016619	CGGCC	2	10	114987	114996	0 %	0 %	40 %	60 %	392384663
90	NC_016619	CCGGC	2	10	116268	116277	0 %	0 %	40 %	60 %	392384665
91	NC_016619	GGACG	2	10	117732	117741	20 %	0 %	60 %	20 %	392384667
92	NC_016619	TGGCC	2	10	118035	118044	0 %	20 %	40 %	40 %	392384668
93	NC_016619	GCCCC	2	10	122073	122082	0 %	0 %	20 %	80 %	392384671
94	NC_016619	CGCCC	2	10	124097	124106	0 %	0 %	20 %	80 %	392384672
95	NC_016619	GCATC	2	10	125767	125776	20 %	20 %	20 %	40 %	392384675
96	NC_016619	CTGCC	2	10	127013	127022	0 %	20 %	20 %	60 %	392384676
97	NC_016619	CCGAC	2	10	129869	129878	20 %	0 %	20 %	60 %	392384678
98	NC_016619	TGCTC	2	10	131965	131974	0 %	40 %	20 %	40 %	392384679
99	NC_016619	CCGCA	2	10	132354	132363	20 %	0 %	20 %	60 %	392384679
100	NC_016619	GGCGA	2	10	133491	133500	20 %	0 %	60 %	20 %	392384682
101	NC_016619	GTCCC	2	10	137663	137672	0 %	20 %	20 %	60 %	392384683
102	NC_016619	GCGTC	2	10	137971	137980	0 %	20 %	40 %	40 %	392384684
103	NC_016619	GCCGG	2	10	138266	138275	0 %	0 %	60 %	40 %	392384684
104	NC_016619	CGGCG	2	10	139715	139724	0 %	0 %	60 %	40 %	392384686
105	NC_016619	GTGCC	2	10	140126	140135	0 %	20 %	40 %	40 %	392384686
106	NC_016619	GCCGT	2	10	140208	140217	0 %	20 %	40 %	40 %	392384686
107	NC_016619	CCGTC	2	10	140434	140443	0 %	20 %	20 %	60 %	392384686
108	NC_016619	GCGCC	2	10	140528	140537	0 %	0 %	40 %	60 %	392384686
109	NC_016619	CCGTT	2	10	145198	145207	0 %	40 %	20 %	40 %	392384686
110	NC_016619	CCGGT	2	10	145442	145451	0 %	20 %	40 %	40 %	392384687
111	NC_016619	CCGCG	2	10	146438	146447	0 %	0 %	40 %	60 %	392384687
112	NC_016619	CCGGG	2	10	146597	146606	0 %	0 %	60 %	40 %	392384687
113	NC_016619	GCCGT	2	10	146739	146748	0 %	20 %	40 %	40 %	392384688
114	NC_016619	CCCGA	2	10	147303	147312	20 %	0 %	20 %	60 %	392384688
115	NC_016619	GCAAC	2	10	147488	147497	40 %	0 %	20 %	40 %	392384688
116	NC_016619	GACGC	2	10	148198	148207	20 %	0 %	40 %	40 %	392384688
117	NC_016619	GGAGC	2	10	150041	150050	20 %	0 %	60 %	20 %	392384690
118	NC_016619	CCGGA	2	10	150233	150242	20 %	0 %	40 %	40 %	392384690
119	NC_016619	CGGCC	2	10	151071	151080	0 %	0 %	40 %	60 %	392384690
120	NC_016619	GTCCG	2	10	151096	151105	0 %	20 %	40 %	40 %	392384690
121	NC_016619	TGCCG	2	10	152570	152579	0 %	20 %	40 %	40 %	392384692
122	NC_016619	GGCGT	2	10	152704	152713	0 %	20 %	60 %	20 %	392384692
123	NC_016619	GCCAC	2	10	155925	155934	20 %	0 %	20 %	60 %	392384698
124	NC_016619	CGTTG	2	10	156723	156732	0 %	40 %	40 %	20 %	392384700
125	NC_016619	GCCGT	2	10	157252	157261	0 %	20 %	40 %	40 %	392384700
126	NC_016619	TCGGG	2	10	157301	157310	0 %	20 %	60 %	20 %	392384700
127	NC_016619	GGCGC	2	10	161176	161185	0 %	0 %	60 %	40 %	392384703
128	NC_016619	GGAGG	2	10	161635	161644	20 %	0 %	80 %	0 %	392384703
129	NC_016619	CGGCG	2	10	163385	163394	0 %	0 %	60 %	40 %	392384704
130	NC_016619	CGCGA	2	10	163965	163974	20 %	0 %	40 %	40 %	392384704
131	NC_016619	GGGCG	2	10	164522	164531	0 %	0 %	80 %	20 %	392384705
132	NC_016619	GCCGA	2	10	164673	164682	20 %	0 %	40 %	40 %	392384705
133	NC_016619	GTCGC	2	10	164771	164780	0 %	20 %	40 %	40 %	392384705
134	NC_016619	CCTGT	2	10	172706	172715	0 %	40 %	20 %	40 %	392384713
135	NC_016619	GGAAG	2	10	174403	174412	40 %	0 %	60 %	0 %	392384714
136	NC_016619	CAGCG	2	10	174777	174786	20 %	0 %	40 %	40 %	392384714
137	NC_016619	CAGGG	2	10	175206	175215	20 %	0 %	60 %	20 %	392384714
138	NC_016619	GAGGC	2	10	175838	175847	20 %	0 %	60 %	20 %	392384715
139	NC_016619	GGGGC	2	10	176012	176021	0 %	0 %	80 %	20 %	392384715
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141	NC_016619	CGTGC	2	10	181868	181877	0 %	20 %	40 %	40 %	392384717
142	NC_016619	TCGTC	2	10	182372	182381	0 %	40 %	20 %	40 %	392384717
143	NC_016619	TCGAA	2	10	183239	183248	40 %	20 %	20 %	20 %	392384717
144	NC_016619	GGGCA	2	10	187854	187863	20 %	0 %	60 %	20 %	392384719
145	NC_016619	GTATC	2	10	188271	188280	20 %	40 %	20 %	20 %	392384719
146	NC_016619	CGATC	2	10	190064	190073	20 %	20 %	20 %	40 %	392384719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.