MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	CCGA	2	8	9	16	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016619	AGAA	2	8	1209	1216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016619	CCTT	2	8	2923	2930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016619	AAAG	2	8	6613	6620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016619	GGAA	2	8	6675	6682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016619	AAAG	2	8	18405	18412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016619	GGAA	2	8	18467	18474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016619	ATGG	2	8	19267	19274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016619	ACGA	2	8	20911	20918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016619	CAGT	2	8	24334	24341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016619	TCGG	2	8	24359	24366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016619	CGGA	2	8	34822	34829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016619	CTGG	2	8	34843	34850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016619	GTGC	2	8	34948	34955	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016619	GCCC	2	8	35183	35190	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016619	TTCG	2	8	36386	36393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016619	TCGT	2	8	36425	36432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016619	GCCA	2	8	38339	38346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016619	GAAG	2	8	40018	40025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016619	GGCG	2	8	41122	41129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016619	GAAA	2	8	41251	41258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016619	GAAT	2	8	41344	41351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016619	CAGC	2	8	41497	41504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016619	GGCA	2	8	41843	41850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016619	TCAA	2	8	41933	41940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016619	GGCG	2	8	42270	42277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016619	CATA	2	8	42424	42431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016619	ATTG	2	8	42457	42464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016619	TCAT	2	8	42749	42756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016619	ATGC	2	8	42820	42827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016619	TTTA	2	8	43391	43398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016619	AATA	2	8	43470	43477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016619	CTGT	2	8	43770	43777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016619	CTCA	2	8	44960	44967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016619	CTTG	2	8	48562	48569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016619	GCCG	2	8	48680	48687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016619	CTTG	2	8	48930	48937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016619	CGGC	2	8	52867	52874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016619	CGGC	2	8	57129	57136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016619	CCGG	3	12	57190	57201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016619	GCCT	2	8	58148	58155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016619	TCCT	2	8	58301	58308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016619	GTCC	2	8	58845	58852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016619	CAGC	2	8	59207	59214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016619	CGCC	2	8	59978	59985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_016619	GCAT	2	8	68938	68945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016619	TCCT	2	8	70616	70623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016619	CCCT	2	8	70748	70755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016619	TCCA	2	8	70815	70822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016619	CGAT	2	8	70854	70861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016619	GGCG	2	8	71302	71309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016619	TCCT	2	8	74245	74252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016619	AGGA	2	8	79184	79191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016619	GCGG	2	8	79276	79283	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016619	GCCC	2	8	81142	81149	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_016619	CCGA	2	8	88275	88282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016619	ATCG	2	8	88420	88427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016619	TCAT	2	8	88647	88654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016619	GTCA	2	8	90961	90968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016619	GCCA	2	8	91734	91741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016619	CTCA	2	8	92855	92862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016619	GGCG	2	8	95176	95183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016619	GCCC	2	8	95205	95212	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_016619	GCCG	2	8	95713	95720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016619	CGGC	2	8	95747	95754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016619	CGGG	2	8	99760	99767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016619	ATGA	2	8	101252	101259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016619	GCCA	2	8	104800	104807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016619	GGAA	2	8	108696	108703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016619	GACC	2	8	108849	108856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016619	GAAA	2	8	108996	109003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016619	CGAC	2	8	110937	110944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016619	AGGA	2	8	110945	110952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016619	CGGT	2	8	112319	112326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016619	CCTC	2	8	113349	113356	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_016619	CGCC	2	8	113396	113403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_016619	CAGA	2	8	113516	113523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016619	CGAC	2	8	118966	118973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016619	CGGC	2	8	121348	121355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016619	TTGA	2	8	134973	134980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016619	AGGA	2	8	135238	135245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016619	CGAT	2	8	135357	135364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016619	GCGT	2	8	136017	136024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016619	CTCC	2	8	136135	136142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_016619	TCGC	2	8	136337	136344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016619	CCTC	2	8	136377	136384	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_016619	GCCA	2	8	136649	136656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016619	CTGC	2	8	151627	151634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016619	CCAC	2	8	151731	151738	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_016619	TGGC	2	8	151760	151767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016619	GCCA	2	8	152525	152532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016619	ACGA	2	8	153105	153112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016619	AAGC	2	8	153895	153902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016619	GCCG	2	8	158837	158844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016619	GGTT	2	8	159401	159408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016619	GGCG	2	8	159818	159825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016619	CTCC	2	8	160240	160247	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_016619	GGCG	2	8	160270	160277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016619	CATC	2	8	160289	160296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016619	GGCG	2	8	160302	160309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016619	CGTG	2	8	160344	160351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016619	GTGG	2	8	162304	162311	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016619	GCCC	2	8	162508	162515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_016619	CGAG	2	8	162578	162585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016619	ATGG	2	8	162694	162701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016619	CGCC	2	8	163009	163016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_016619	GCCG	2	8	165876	165883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016619	TGCC	2	8	166920	166927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016619	CGAC	2	8	168360	168367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016619	ATCT	2	8	175554	175561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016619	GCTT	2	8	191373	191380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016619	CCAG	2	8	191814	191821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.