MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 3189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016619	TGA	2	6	179574	179579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384716
3002	NC_016619	GCC	2	6	179605	179610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3003	NC_016619	CGA	2	6	179641	179646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3004	NC_016619	GGT	3	9	179701	179709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384716
3005	NC_016619	GCC	2	6	179731	179736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3006	NC_016619	CTT	2	6	179743	179748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392384716
3007	NC_016619	GAG	2	6	179768	179773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384716
3008	NC_016619	GAC	2	6	179774	179779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3009	NC_016619	GGA	2	6	179812	179817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384716
3010	NC_016619	CGC	2	6	179843	179848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3011	NC_016619	ACC	2	6	179898	179903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392384716
3012	NC_016619	ACG	2	6	179910	179915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3013	NC_016619	AAC	2	6	180008	180013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392384716
3014	NC_016619	GGT	2	6	180031	180036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384716
3015	NC_016619	GGT	2	6	180043	180048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384716
3016	NC_016619	GCC	2	6	180051	180056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3017	NC_016619	TCG	2	6	180072	180077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3018	NC_016619	TCA	2	6	180108	180113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384716
3019	NC_016619	CAG	2	6	180128	180133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3020	NC_016619	GCG	3	9	180163	180171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3021	NC_016619	GGA	2	6	180199	180204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384716
3022	NC_016619	GGT	2	6	180217	180222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384716
3023	NC_016619	CGA	2	6	180250	180255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3024	NC_016619	CTG	2	6	180269	180274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3025	NC_016619	CGA	2	6	180309	180314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3026	NC_016619	GGC	3	9	180354	180362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3027	NC_016619	CGG	2	6	180386	180391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3028	NC_016619	GTC	2	6	180398	180403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3029	NC_016619	TCG	2	6	180449	180454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3030	NC_016619	GGT	2	6	180598	180603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384716
3031	NC_016619	CGT	2	6	180643	180648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3032	NC_016619	GAT	2	6	180665	180670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384716
3033	NC_016619	CCT	2	6	180699	180704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392384716
3034	NC_016619	GCC	2	6	180713	180718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3035	NC_016619	TGG	2	6	180800	180805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384716
3036	NC_016619	GGC	2	6	180889	180894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3037	NC_016619	GAC	2	6	180941	180946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3038	NC_016619	GCC	2	6	180953	180958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3039	NC_016619	GGC	2	6	181007	181012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3040	NC_016619	GAC	3	9	181070	181078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3041	NC_016619	GCC	2	6	181082	181087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3042	NC_016619	TGC	2	6	181104	181109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3043	NC_016619	CGT	2	6	181111	181116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3044	NC_016619	CGG	2	6	181119	181124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3045	NC_016619	CTG	2	6	181145	181150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384716
3046	NC_016619	CGC	2	6	181294	181299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384716
3047	NC_016619	CGG	2	6	181374	181379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3048	NC_016619	CGG	3	9	181453	181461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384716
3049	NC_016619	CGA	2	6	181526	181531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3050	NC_016619	CGA	2	6	181587	181592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3051	NC_016619	ATC	2	6	181624	181629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384717
3052	NC_016619	GAA	2	6	181725	181730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392384717
3053	NC_016619	TCG	2	6	181742	181747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3054	NC_016619	GCT	2	6	181761	181766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3055	NC_016619	CGA	2	6	181779	181784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3056	NC_016619	CGA	2	6	181815	181820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3057	NC_016619	CGA	2	6	181959	181964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3058	NC_016619	CGG	2	6	181990	181995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384717
3059	NC_016619	GAG	2	6	182215	182220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384717
3060	NC_016619	CGG	3	9	182231	182239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384717
3061	NC_016619	TCG	2	6	182288	182293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3062	NC_016619	AGG	2	6	182309	182314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384717
3063	NC_016619	TCC	2	6	182321	182326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392384717
3064	NC_016619	GGC	2	6	182358	182363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384717
3065	NC_016619	GCT	2	6	182499	182504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3066	NC_016619	ATG	2	6	182578	182583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384717
3067	NC_016619	CGG	2	6	182600	182605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384717
3068	NC_016619	GAC	3	9	182646	182654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
3069	NC_016619	CCT	2	6	182664	182669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392384717
3070	NC_016619	GGA	2	6	182697	182702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384717
3071	NC_016619	GCG	2	6	182740	182745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384717
3072	NC_016619	CGA	2	6	182870	182875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3074	NC_016619	TGC	2	6	182987	182992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3079	NC_016619	CGT	2	6	183341	183346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3083	NC_016619	GGA	2	6	183612	183617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384717
3084	NC_016619	CGA	2	6	183699	183704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3090	NC_016619	GCT	2	6	184054	184059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3092	NC_016619	CGA	2	6	184155	184160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3094	NC_016619	CTG	2	6	184189	184194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384717
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3102	NC_016619	CGG	2	6	184895	184900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384717
3103	NC_016619	TCC	2	6	184919	184924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392384717
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3105	NC_016619	GAA	2	6	184957	184962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392384717
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3118	NC_016619	CTA	2	6	185985	185990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384718
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.