MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	CG	3	6	53	58	0 %	0 %	50 %	50 %	392384559
2	NC_016619	TC	3	6	963	968	0 %	50 %	0 %	50 %	392384561
3	NC_016619	GA	3	6	1233	1238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016619	CG	3	6	1989	1994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016619	GC	3	6	4387	4392	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
6	NC_016619	CG	3	6	5528	5533	0 %	0 %	50 %	50 %	392384565
7	NC_016619	GC	4	8	6072	6079	0 %	0 %	50 %	50 %	392384565
8	NC_016619	CG	3	6	6626	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016619	GC	3	6	7751	7756	0 %	0 %	50 %	50 %	392384567
10	NC_016619	CG	3	6	7818	7823	0 %	0 %	50 %	50 %	392384567
11	NC_016619	GC	3	6	8207	8212	0 %	0 %	50 %	50 %	392384567
12	NC_016619	GC	3	6	8650	8655	0 %	0 %	50 %	50 %	392384567
13	NC_016619	GC	3	6	9054	9059	0 %	0 %	50 %	50 %	392384567
14	NC_016619	CG	3	6	9157	9162	0 %	0 %	50 %	50 %	392384567
15	NC_016619	GC	3	6	9554	9559	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
16	NC_016619	GC	3	6	9572	9577	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
17	NC_016619	GC	3	6	9604	9609	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
18	NC_016619	GC	3	6	9611	9616	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
19	NC_016619	GC	3	6	9870	9875	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
20	NC_016619	CG	3	6	9930	9935	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
21	NC_016619	GC	3	6	10098	10103	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
22	NC_016619	GC	3	6	10203	10208	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
23	NC_016619	CG	3	6	10368	10373	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
24	NC_016619	CA	3	6	10487	10492	50 %	0 %	0 %	50 %	392384568
25	NC_016619	CG	3	6	11668	11673	0 %	0 %	50 %	50 %	392384570
26	NC_016619	GC	3	6	12072	12077	0 %	0 %	50 %	50 %	392384570
27	NC_016619	CG	3	6	12358	12363	0 %	0 %	50 %	50 %	392384570
28	NC_016619	CG	3	6	12539	12544	0 %	0 %	50 %	50 %	392384570
29	NC_016619	CG	3	6	13030	13035	0 %	0 %	50 %	50 %	392384570
30	NC_016619	CG	3	6	13117	13122	0 %	0 %	50 %	50 %	392384570
31	NC_016619	CG	3	6	13333	13338	0 %	0 %	50 %	50 %	392384571
32	NC_016619	GC	3	6	13385	13390	0 %	0 %	50 %	50 %	392384571
33	NC_016619	CG	3	6	13866	13871	0 %	0 %	50 %	50 %	392384571
34	NC_016619	GC	3	6	13896	13901	0 %	0 %	50 %	50 %	392384571
35	NC_016619	CG	3	6	13902	13907	0 %	0 %	50 %	50 %	392384571
36	NC_016619	GC	3	6	13953	13958	0 %	0 %	50 %	50 %	392384571
37	NC_016619	GC	3	6	14450	14455	0 %	0 %	50 %	50 %	392384572
38	NC_016619	CG	4	8	15431	15438	0 %	0 %	50 %	50 %	392384572
39	NC_016619	CG	3	6	15925	15930	0 %	0 %	50 %	50 %	392384572
40	NC_016619	GC	3	6	15967	15972	0 %	0 %	50 %	50 %	392384572
41	NC_016619	GC	3	6	16204	16209	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
42	NC_016619	GC	3	6	16292	16297	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
43	NC_016619	GC	3	6	16597	16602	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
44	NC_016619	GC	3	6	17316	17321	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
45	NC_016619	CG	3	6	17547	17552	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
46	NC_016619	GC	3	6	17798	17803	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
47	NC_016619	GT	3	6	17914	17919	0 %	50 %	50 %	0 %	392384573
48	NC_016619	GC	4	8	18096	18103	0 %	0 %	50 %	50 %	392384573
49	NC_016619	CG	3	6	18418	18423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016619	CT	3	6	19305	19310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016619	GC	3	6	20922	20927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016619	CG	3	6	21332	21337	0 %	0 %	50 %	50 %	392384577
53	NC_016619	CG	3	6	21751	21756	0 %	0 %	50 %	50 %	392384577
54	NC_016619	GC	3	6	22078	22083	0 %	0 %	50 %	50 %	392384577
55	NC_016619	CG	3	6	23187	23192	0 %	0 %	50 %	50 %	392384577
56	NC_016619	CA	3	6	23602	23607	50 %	0 %	0 %	50 %	392384577
57	NC_016619	GC	3	6	23757	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016619	CG	3	6	24995	25000	0 %	0 %	50 %	50 %	392384579
59	NC_016619	CG	3	6	25342	25347	0 %	0 %	50 %	50 %	392384580
60	NC_016619	GC	3	6	26863	26868	0 %	0 %	50 %	50 %	392384582
61	NC_016619	CG	3	6	27566	27571	0 %	0 %	50 %	50 %	392384582
62	NC_016619	CT	4	8	28723	28730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016619	CA	4	8	28955	28962	50 %	0 %	0 %	50 %	392384584
64	NC_016619	CG	3	6	29511	29516	0 %	0 %	50 %	50 %	392384584
65	NC_016619	GC	3	6	29607	29612	0 %	0 %	50 %	50 %	392384584
66	NC_016619	GC	3	6	29663	29668	0 %	0 %	50 %	50 %	392384584
67	NC_016619	CG	4	8	30165	30172	0 %	0 %	50 %	50 %	392384585
68	NC_016619	CG	3	6	30921	30926	0 %	0 %	50 %	50 %	392384585
69	NC_016619	GC	3	6	31166	31171	0 %	0 %	50 %	50 %	392384585
70	NC_016619	CG	3	6	31350	31355	0 %	0 %	50 %	50 %	392384585
71	NC_016619	CG	3	6	31880	31885	0 %	0 %	50 %	50 %	392384585
72	NC_016619	AC	3	6	31976	31981	50 %	0 %	0 %	50 %	392384585
73	NC_016619	TC	3	6	32160	32165	0 %	50 %	0 %	50 %	392384585
74	NC_016619	GC	3	6	32257	32262	0 %	0 %	50 %	50 %	392384585
75	NC_016619	CT	3	6	33005	33010	0 %	50 %	0 %	50 %	392384585
76	NC_016619	AC	3	6	33206	33211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016619	CG	3	6	33268	33273	0 %	0 %	50 %	50 %	392384586
78	NC_016619	GC	3	6	34117	34122	0 %	0 %	50 %	50 %	392384587
79	NC_016619	GA	3	6	34129	34134	50 %	0 %	50 %	0 %	392384587
80	NC_016619	CT	3	6	34264	34269	0 %	50 %	0 %	50 %	392384587
81	NC_016619	GC	3	6	34614	34619	0 %	0 %	50 %	50 %	392384587
82	NC_016619	CG	3	6	35150	35155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016619	CG	4	8	35165	35172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016619	CG	3	6	35378	35383	0 %	0 %	50 %	50 %	392384588
85	NC_016619	CG	3	6	36897	36902	0 %	0 %	50 %	50 %	392384589
86	NC_016619	GC	3	6	38624	38629	0 %	0 %	50 %	50 %	392384592
87	NC_016619	CT	3	6	39094	39099	0 %	50 %	0 %	50 %	392384593
88	NC_016619	GC	3	6	40194	40199	0 %	0 %	50 %	50 %	392384594
89	NC_016619	CG	3	6	40621	40626	0 %	0 %	50 %	50 %	392384595
90	NC_016619	CG	3	6	40816	40821	0 %	0 %	50 %	50 %	392384595
91	NC_016619	AT	4	8	41580	41587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016619	GC	3	6	42234	42239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016619	AT	3	6	43253	43258	50 %	50 %	0 %	0 %	392384596
94	NC_016619	GC	3	6	43588	43593	0 %	0 %	50 %	50 %	392384597
95	NC_016619	GC	3	6	45202	45207	0 %	0 %	50 %	50 %	392384598
96	NC_016619	CG	3	6	45625	45630	0 %	0 %	50 %	50 %	392384599
97	NC_016619	CG	3	6	46160	46165	0 %	0 %	50 %	50 %	392384600
98	NC_016619	GC	3	6	46394	46399	0 %	0 %	50 %	50 %	392384600
99	NC_016619	GC	4	8	46549	46556	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
100	NC_016619	GC	3	6	46564	46569	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
101	NC_016619	GC	3	6	46574	46579	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
102	NC_016619	GC	3	6	46744	46749	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
103	NC_016619	CG	3	6	46985	46990	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
104	NC_016619	GC	3	6	47004	47009	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
105	NC_016619	GC	3	6	47383	47388	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
106	NC_016619	GC	3	6	47422	47427	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
107	NC_016619	GC	3	6	47616	47621	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
108	NC_016619	CG	3	6	47705	47710	0 %	0 %	50 %	50 %	392384601
109	NC_016619	GA	3	6	47748	47753	50 %	0 %	50 %	0 %	392384601
110	NC_016619	GC	3	6	49186	49191	0 %	0 %	50 %	50 %	392384602
111	NC_016619	CG	3	6	51596	51601	0 %	0 %	50 %	50 %	392384604
112	NC_016619	CG	3	6	51922	51927	0 %	0 %	50 %	50 %	392384605
113	NC_016619	GC	3	6	52141	52146	0 %	0 %	50 %	50 %	392384605
114	NC_016619	CG	4	8	52217	52224	0 %	0 %	50 %	50 %	392384605
115	NC_016619	GC	3	6	52329	52334	0 %	0 %	50 %	50 %	392384605
116	NC_016619	CG	3	6	53202	53207	0 %	0 %	50 %	50 %	392384606
117	NC_016619	AG	3	6	53999	54004	50 %	0 %	50 %	0 %	392384608
118	NC_016619	AG	4	8	54110	54117	50 %	0 %	50 %	0 %	392384608
119	NC_016619	GT	3	6	54862	54867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016619	GT	3	6	57014	57019	0 %	50 %	50 %	0 %	392384613
121	NC_016619	GC	5	10	57711	57720	0 %	0 %	50 %	50 %	392384614
122	NC_016619	CG	3	6	58349	58354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016619	GC	3	6	59516	59521	0 %	0 %	50 %	50 %	392384616
124	NC_016619	TG	3	6	59802	59807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016619	GC	3	6	60060	60065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016619	GA	3	6	60334	60339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016619	GC	3	6	60387	60392	0 %	0 %	50 %	50 %	392384617
128	NC_016619	GC	3	6	60674	60679	0 %	0 %	50 %	50 %	392384617
129	NC_016619	GC	3	6	61159	61164	0 %	0 %	50 %	50 %	392384617
130	NC_016619	GC	3	6	61564	61569	0 %	0 %	50 %	50 %	392384617
131	NC_016619	CG	4	8	61609	61616	0 %	0 %	50 %	50 %	392384617
132	NC_016619	TG	3	6	62854	62859	0 %	50 %	50 %	0 %	392384619
133	NC_016619	CG	3	6	62983	62988	0 %	0 %	50 %	50 %	392384619
134	NC_016619	GC	3	6	64064	64069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016619	TA	3	6	64121	64126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016619	CG	3	6	64158	64163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016619	CG	4	8	64785	64792	0 %	0 %	50 %	50 %	392384620
138	NC_016619	CG	3	6	66087	66092	0 %	0 %	50 %	50 %	392384620
139	NC_016619	GC	3	6	66181	66186	0 %	0 %	50 %	50 %	392384620
140	NC_016619	GT	3	6	66519	66524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016619	GC	3	6	67312	67317	0 %	0 %	50 %	50 %	392384621
142	NC_016619	GC	3	6	67772	67777	0 %	0 %	50 %	50 %	392384622
143	NC_016619	CG	3	6	70252	70257	0 %	0 %	50 %	50 %	392384624
144	NC_016619	CG	3	6	70421	70426	0 %	0 %	50 %	50 %	392384624
145	NC_016619	GC	3	6	71541	71546	0 %	0 %	50 %	50 %	392384625
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.