MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	GA	3	6	1233	1238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016619	CG	3	6	1989	1994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016619	CG	3	6	6626	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016619	CG	3	6	18418	18423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016619	CT	3	6	19305	19310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016619	GC	3	6	20922	20927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016619	GC	3	6	23757	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016619	CT	4	8	28723	28730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016619	AC	3	6	33206	33211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016619	CG	3	6	35150	35155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016619	CG	4	8	35165	35172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016619	AT	4	8	41580	41587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016619	GC	3	6	42234	42239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016619	GT	3	6	54862	54867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016619	CG	3	6	58349	58354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016619	TG	3	6	59802	59807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016619	GC	3	6	60060	60065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016619	GA	3	6	60334	60339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016619	GC	3	6	64064	64069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016619	TA	3	6	64121	64126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016619	CG	3	6	64158	64163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016619	GT	3	6	66519	66524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016619	AG	3	6	75363	75368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016619	CA	3	6	75660	75665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016619	CG	3	6	95723	95728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016619	CA	3	6	101210	101215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016619	AT	3	6	104476	104481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016619	AT	3	6	104510	104515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016619	CG	3	6	106299	106304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016619	CG	3	6	110768	110773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016619	GC	4	8	118667	118674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016619	CG	3	6	118702	118707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016619	GC	3	6	118846	118851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016619	GC	4	8	119215	119222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016619	CT	3	6	134787	134792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016619	GC	3	6	135800	135805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016619	GC	3	6	136862	136867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016619	CG	3	6	136869	136874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016619	TC	3	6	138391	138396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016619	GC	3	6	151681	151686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016619	GC	3	6	153084	153089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016619	GC	3	6	154884	154889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016619	GC	3	6	158792	158797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016619	GC	3	6	158824	158829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016619	CG	3	6	162711	162716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016619	CG	3	6	165862	165867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016619	GC	3	6	168024	168029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016619	GT	3	6	185649	185654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016619	CG	3	6	186204	186209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016619	TC	3	6	191184	191189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016619	CG	3	6	191290	191295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016619	CG	4	8	191471	191478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016619	GT	3	6	191743	191748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.