MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016617	GCAAGC	2	12	6008	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016617	CCGCCA	2	12	12036	12047	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016617	GCGGCC	2	12	81106	81117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016617	GATGCT	2	12	86056	86067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016617	CTGCGC	2	12	104231	104242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016617	GGGCTG	2	12	104351	104362	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016617	GAGGTG	2	12	123516	123527	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016617	CACCCT	2	12	124474	124485	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016617	GAGGGT	2	12	128636	128647	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016617	GCGGGG	2	12	137025	137036	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016617	GAGGGT	2	12	189289	189300	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016617	ACCAGC	2	12	191116	191127	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016617	AATGGC	2	12	194998	195009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016617	AACCCT	2	12	255581	255592	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016617	GCTCCC	2	12	272838	272849	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016617	CGGATG	2	12	302938	302949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016617	CTTTTT	2	12	321890	321901	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016617	GGGCCG	2	12	428708	428719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016617	GCCCGC	2	12	440168	440179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016617	TTGCCG	2	12	461629	461640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016617	CGTTTC	2	12	471927	471938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016617	CCCGGC	2	12	502882	502893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016617	GGGAGA	2	12	530967	530978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016617	TCCGGC	2	12	550931	550942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016617	TCTCCC	2	12	551645	551656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016617	GTCGGG	2	12	551898	551909	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016617	CGACGC	2	12	552117	552128	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016617	TTCCGC	2	12	552172	552183	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016617	CAGCGC	2	12	552208	552219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016617	CCTTTT	2	12	559596	559607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016617	GCACGG	2	12	596533	596544	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016617	GGCGAC	2	12	615334	615345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016617	AGCTGG	2	12	648908	648919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016617	AGGACA	2	12	648986	648997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016617	GGCGGT	2	12	650786	650797	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016617	TCTCCT	2	12	677273	677284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016617	GGCCGG	2	12	677601	677612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016617	CTCGTT	2	12	677776	677787	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016617	GGGCCG	2	12	685729	685740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016617	CAGGCC	3	18	685812	685829	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016617	CAGCCG	2	12	792159	792170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016617	CCGCCA	2	12	792656	792667	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016617	GTTTCC	2	12	796484	796495	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016617	GTTTTT	2	12	848315	848326	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016617	GGCGCG	2	12	853470	853481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016617	GGGGAG	2	12	853965	853976	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016617	AGCGCA	2	12	889230	889241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016617	AGGGTG	2	12	891855	891866	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016617	GGGGGA	2	12	893453	893464	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016617	TGCGCT	2	12	898760	898771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016617	GCAAGG	2	12	912688	912699	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016617	CACGCC	2	12	952652	952663	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016617	GACGAT	2	12	1054209	1054220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016617	CCTGAA	2	12	1078656	1078667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016617	AACCCT	2	12	1144326	1144337	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016617	CACGCC	2	12	1149395	1149406	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016617	GCGGAG	2	12	1159581	1159592	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016617	CGGCAT	2	12	1160087	1160098	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016617	TTCACC	2	12	1160271	1160282	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016617	CGAGGC	2	12	1160666	1160677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016617	TTTGAT	2	12	1173450	1173461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016617	TTCGAA	2	12	1189295	1189306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016617	GGTGCC	2	12	1196899	1196910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016617	CACCCT	2	12	1201509	1201520	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016617	CAGGTT	2	12	1204634	1204645	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016617	CTCCTG	2	12	1204706	1204717	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016617	AGGGTG	2	12	1217116	1217127	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016617	CACCCC	2	12	1224563	1224574	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_016617	CGCGGG	2	12	1228626	1228637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016617	CAGCGT	2	12	1230533	1230544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016617	TGGATG	2	12	1236544	1236555	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016617	CGCTCC	2	12	1236600	1236611	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016617	CAAACA	2	12	1240951	1240962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016617	ACCTCC	2	12	1242662	1242673	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016617	CTGGTC	2	12	1249329	1249340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016617	CCAGCA	2	12	1264504	1264515	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016617	GGAAAC	2	12	1269860	1269871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016617	AAGGGG	2	12	1278634	1278645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016617	AGGGTG	2	12	1314883	1314894	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016617	CTCGAC	2	12	1318019	1318030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016617	GGGCCG	2	12	1327932	1327943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016617	CCCGTT	2	12	1327957	1327968	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016617	GCCGCG	2	12	1332445	1332456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016617	TGCCGA	2	12	1332603	1332614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016617	CGGTGT	2	12	1353083	1353094	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016617	TTGGCG	2	12	1353346	1353357	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016617	GCGCGG	2	12	1355326	1355337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016617	CAGCAC	2	12	1355728	1355739	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016617	AGCCCG	2	12	1379005	1379016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016617	CGAGGC	2	12	1381471	1381482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016617	TCCCCC	2	12	1382779	1382790	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_016617	CGACGC	2	12	1410680	1410691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016617	GGTGGC	2	12	1421614	1421625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016617	CGGTGG	2	12	1421670	1421681	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016617	GGGGCT	2	12	1422061	1422072	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016617	CGCTGG	2	12	1438202	1438213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016617	TCACCC	2	12	1471081	1471092	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_016617	AAAAGG	2	12	1474363	1474374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016617	GTCCCT	2	12	1533604	1533615	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016617	GTCGCC	2	12	1545103	1545114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016617	GAACAT	2	12	1545326	1545337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016617	CGCTGG	2	12	1579010	1579021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016617	GTTCCG	2	12	1581869	1581880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016617	GCAGTT	2	12	1587242	1587253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016617	TACGGG	2	12	1587551	1587562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016617	ACCCTC	2	12	1615541	1615552	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016617	ACCGAC	2	12	1620413	1620424	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016617	GACACC	2	12	1620869	1620880	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016617	AGCGAG	2	12	1621502	1621513	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016617	GCGGAG	2	12	1621850	1621861	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016617	CGGCCT	2	12	1622467	1622478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016617	TCCCGC	2	12	1622582	1622593	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016617	GGGCTG	2	12	1622616	1622627	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016617	TCACCA	2	12	1623798	1623809	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016617	CCGTTC	2	12	1634762	1634773	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016617	ACCCTC	2	12	1677400	1677411	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016617	GGGAGA	2	12	1677447	1677458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016617	GTCGGC	2	12	1683613	1683624	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016617	GTCGAG	2	12	1684183	1684194	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016617	GATGTG	2	12	1691425	1691436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016617	GTTTTT	2	12	1695643	1695654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016617	ACGCAC	2	12	1706601	1706612	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016617	TTTGTT	2	12	1708020	1708031	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016617	CGCCGG	2	12	1741422	1741433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016617	GTCGTG	2	12	1787565	1787576	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016617	GCTCCA	2	12	1793153	1793164	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016617	CGGTCG	2	12	1793637	1793648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016617	GCTGGG	3	18	1802197	1802214	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016617	CCTGCT	2	12	1802581	1802592	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016617	GGGGGT	2	12	1802638	1802649	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016617	GGAGAG	2	12	1806376	1806387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016617	GACTTT	2	12	1810185	1810196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_016617	GCCGAA	2	12	1827888	1827899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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135	NC_016617	CGCACC	2	12	1861954	1861965	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016617	CCCCGA	2	12	1883787	1883798	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016617	CTGTCC	2	12	1886875	1886886	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016617	CTTCGC	2	12	1904668	1904679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016617	GCTGTC	2	12	1905007	1905018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016617	GGCAAG	2	12	1905933	1905944	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_016617	GCCCCG	2	12	1906227	1906238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016617	GCGCAA	2	12	1906348	1906359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016617	ACGCCG	2	12	1940407	1940418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016617	TATTTT	2	12	1946622	1946633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_016617	ACCCTC	2	12	1971385	1971396	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_016617	GGGTTG	2	12	1987719	1987730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016617	GGAAAA	2	12	2011484	2011495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016617	GGGCAT	2	12	2016674	2016685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_016617	GCCGGG	2	12	2029897	2029908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_016617	ATGCCC	2	12	2037204	2037215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_016617	GGCTCG	2	12	2048134	2048145	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_016617	GCGTCT	2	12	2080033	2080044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_016617	GGATCG	2	12	2082058	2082069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_016617	TCGGCC	2	12	2119369	2119380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_016617	CCGGCC	2	12	2119660	2119671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_016617	TCCGGT	2	12	2120154	2120165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_016617	GTTTAC	2	12	2128172	2128183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_016617	AGGTCG	2	12	2158800	2158811	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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164	NC_016617	GCGCCC	2	12	2180425	2180436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_016617	CCCCGG	2	12	2191226	2191237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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220	NC_016617	CGGTCG	2	12	2934399	2934410	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
221	NC_016617	GGAATC	2	12	2971913	2971924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
222	NC_016617	GGGCCG	2	12	2972397	2972408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.