MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum brasilense Sp245

Total Repeats: 2980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016617	CCGTC	2	10	870	879	0 %	20 %	20 %	60 %	392380516
2	NC_016617	CCCCG	2	10	2229	2238	0 %	0 %	20 %	80 %	392380517
3	NC_016617	GCCCG	2	10	2960	2969	0 %	0 %	40 %	60 %	392380518
4	NC_016617	GGCGA	2	10	4249	4258	20 %	0 %	60 %	20 %	392380519
5	NC_016617	AGCGC	2	10	4406	4415	20 %	0 %	40 %	40 %	392380519
6	NC_016617	GGCCG	2	10	4845	4854	0 %	0 %	60 %	40 %	392380519
7	NC_016617	GCCGG	2	10	5729	5738	0 %	0 %	60 %	40 %	392380520
8	NC_016617	CTGCG	2	10	5783	5792	0 %	20 %	40 %	40 %	392380520
9	NC_016617	ATCCC	2	10	7421	7430	20 %	20 %	0 %	60 %	392380522
10	NC_016617	GCGCT	2	10	7614	7623	0 %	20 %	40 %	40 %	392380522
11	NC_016617	GGCGC	2	10	7844	7853	0 %	0 %	60 %	40 %	392380522
12	NC_016617	GCCCC	2	10	8300	8309	0 %	0 %	20 %	80 %	392380523
13	NC_016617	TCTTT	2	10	10323	10332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016617	GGCCA	2	10	11108	11117	20 %	0 %	40 %	40 %	392380526
15	NC_016617	CCACG	2	10	11473	11482	20 %	0 %	20 %	60 %	392380526
16	NC_016617	CTTTT	2	10	11608	11617	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016617	GCCGC	2	10	13533	13542	0 %	0 %	40 %	60 %	392380530
18	NC_016617	GCCCT	2	10	16949	16958	0 %	20 %	20 %	60 %	392380536
19	NC_016617	TGGGC	2	10	18875	18884	0 %	20 %	60 %	20 %	392380538
20	NC_016617	CCTGC	2	10	19250	19259	0 %	20 %	20 %	60 %	392380538
21	NC_016617	TCCGG	2	10	19709	19718	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016617	CGCGG	2	10	22380	22389	0 %	0 %	60 %	40 %	392380540
23	NC_016617	GGCGT	2	10	23760	23769	0 %	20 %	60 %	20 %	392380541
24	NC_016617	GCGCG	2	10	25817	25826	0 %	0 %	60 %	40 %	392380544
25	NC_016617	TCCTG	2	10	26839	26848	0 %	40 %	20 %	40 %	392380545
26	NC_016617	GGCGG	2	10	29912	29921	0 %	0 %	80 %	20 %	392380545
27	NC_016617	CCGGC	2	10	30470	30479	0 %	0 %	40 %	60 %	392380545
28	NC_016617	TGACC	2	10	31067	31076	20 %	20 %	20 %	40 %	392380546
29	NC_016617	CAAGG	2	10	32430	32439	40 %	0 %	40 %	20 %	392380547
30	NC_016617	GGGCG	2	10	32704	32713	0 %	0 %	80 %	20 %	392380547
31	NC_016617	GCCGC	2	10	32901	32910	0 %	0 %	40 %	60 %	392380547
32	NC_016617	CCGCG	2	10	33133	33142	0 %	0 %	40 %	60 %	392380547
33	NC_016617	GAAGA	2	10	35377	35386	60 %	0 %	40 %	0 %	392380550
34	NC_016617	GCCCT	2	10	36397	36406	0 %	20 %	20 %	60 %	392380551
35	NC_016617	TCCCC	2	10	37502	37511	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_016617	GCGCG	2	10	39922	39931	0 %	0 %	60 %	40 %	392380554
37	NC_016617	CGCGG	2	10	40571	40580	0 %	0 %	60 %	40 %	392380554
38	NC_016617	GCGCC	2	10	42589	42598	0 %	0 %	40 %	60 %	392380557
39	NC_016617	CACCG	2	10	43140	43149	20 %	0 %	20 %	60 %	392380557
40	NC_016617	CGGCG	2	10	43205	43214	0 %	0 %	60 %	40 %	392380557
41	NC_016617	GCACC	2	10	45375	45384	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_016617	GCCCG	2	10	45891	45900	0 %	0 %	40 %	60 %	392380561
43	NC_016617	GGCGG	2	10	46132	46141	0 %	0 %	80 %	20 %	392380561
44	NC_016617	GACGG	2	10	46247	46256	20 %	0 %	60 %	20 %	392380561
45	NC_016617	GGCGA	2	10	46961	46970	20 %	0 %	60 %	20 %	392380562
46	NC_016617	GGGCG	2	10	50079	50088	0 %	0 %	80 %	20 %	392380565
47	NC_016617	CGAAG	2	10	50399	50408	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016617	TTCCA	2	10	50556	50565	20 %	40 %	0 %	40 %	392380566
49	NC_016617	AGGTC	2	10	50935	50944	20 %	20 %	40 %	20 %	392380566
50	NC_016617	GCGCG	2	10	51620	51629	0 %	0 %	60 %	40 %	392380566
51	NC_016617	GCGGA	2	10	52331	52340	20 %	0 %	60 %	20 %	392380567
52	NC_016617	GCCCG	2	10	53791	53800	0 %	0 %	40 %	60 %	392380568
53	NC_016617	GGGCT	2	10	55885	55894	0 %	20 %	60 %	20 %	392380570
54	NC_016617	CGCGC	2	10	57488	57497	0 %	0 %	40 %	60 %	392380571
55	NC_016617	GCGCG	2	10	57824	57833	0 %	0 %	60 %	40 %	392380572
56	NC_016617	GTCCG	2	10	58547	58556	0 %	20 %	40 %	40 %	392380573
57	NC_016617	GGACG	2	10	59093	59102	20 %	0 %	60 %	20 %	392380573
58	NC_016617	CGCGC	2	10	59485	59494	0 %	0 %	40 %	60 %	392380574
59	NC_016617	GCCCT	2	10	62371	62380	0 %	20 %	20 %	60 %	392380576
60	NC_016617	CCTCC	2	10	63045	63054	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
61	NC_016617	CGGGC	2	10	63669	63678	0 %	0 %	60 %	40 %	392380577
62	NC_016617	CCCGC	2	10	64663	64672	0 %	0 %	20 %	80 %	392380579
63	NC_016617	ACGGC	2	10	64713	64722	20 %	0 %	40 %	40 %	392380579
64	NC_016617	GCCGG	2	10	66089	66098	0 %	0 %	60 %	40 %	392380582
65	NC_016617	GCGCC	2	10	66379	66388	0 %	0 %	40 %	60 %	392380583
66	NC_016617	GCGGA	2	10	66575	66584	20 %	0 %	60 %	20 %	392380583
67	NC_016617	CGGAC	2	10	69367	69376	20 %	0 %	40 %	40 %	392380585
68	NC_016617	GTGGC	2	10	69514	69523	0 %	20 %	60 %	20 %	392380585
69	NC_016617	CGACG	2	10	71469	71478	20 %	0 %	40 %	40 %	392380587
70	NC_016617	CTGGT	2	10	71489	71498	0 %	40 %	40 %	20 %	392380587
71	NC_016617	CGGCG	2	10	71604	71613	0 %	0 %	60 %	40 %	392380587
72	NC_016617	GGCGC	2	10	73731	73740	0 %	0 %	60 %	40 %	392380588
73	NC_016617	CGGCG	2	10	74022	74031	0 %	0 %	60 %	40 %	392380588
74	NC_016617	CGGGT	2	10	74437	74446	0 %	20 %	60 %	20 %	392380589
75	NC_016617	CGGGT	2	10	74557	74566	0 %	20 %	60 %	20 %	392380589
76	NC_016617	GACAG	2	10	76358	76367	40 %	0 %	40 %	20 %	392380590
77	NC_016617	GGACA	2	10	76813	76822	40 %	0 %	40 %	20 %	392380590
78	NC_016617	CCCGT	2	10	77109	77118	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_016617	CCCGG	2	10	78158	78167	0 %	0 %	40 %	60 %	392380592
80	NC_016617	CGCGC	2	10	79858	79867	0 %	0 %	40 %	60 %	392380592
81	NC_016617	CGGAC	2	10	80510	80519	20 %	0 %	40 %	40 %	392380592
82	NC_016617	CCCGC	2	10	81133	81142	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
83	NC_016617	TCCCC	2	10	82236	82245	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
84	NC_016617	CTGGG	2	10	82400	82409	0 %	20 %	60 %	20 %	392380595
85	NC_016617	CGGGC	2	10	86511	86520	0 %	0 %	60 %	40 %	392380602
86	NC_016617	AACTG	2	10	86699	86708	40 %	20 %	20 %	20 %	392380602
87	NC_016617	GCTGG	2	10	87146	87155	0 %	20 %	60 %	20 %	392380603
88	NC_016617	ACCGG	2	10	87189	87198	20 %	0 %	40 %	40 %	392380603
89	NC_016617	CCCTC	2	10	88425	88434	0 %	20 %	0 %	80 %	392380605
90	NC_016617	GCCGT	2	10	90258	90267	0 %	20 %	40 %	40 %	392380608
91	NC_016617	GCGAC	2	10	90417	90426	20 %	0 %	40 %	40 %	392380608
92	NC_016617	CCGCG	2	10	90497	90506	0 %	0 %	40 %	60 %	392380608
93	NC_016617	TGCTT	2	10	90641	90650	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016617	GGACG	2	10	91385	91394	20 %	0 %	60 %	20 %	392380609
95	NC_016617	GCCCA	2	10	92202	92211	20 %	0 %	20 %	60 %	392380609
96	NC_016617	CTTCA	2	10	92276	92285	20 %	40 %	0 %	40 %	392380609
97	NC_016617	CCGCC	2	10	93331	93340	0 %	0 %	20 %	80 %	392380612
98	NC_016617	GCGGA	2	10	95114	95123	20 %	0 %	60 %	20 %	392380614
99	NC_016617	AAGCG	2	10	95977	95986	40 %	0 %	40 %	20 %	392380614
100	NC_016617	GCCGC	2	10	96031	96040	0 %	0 %	40 %	60 %	392380614
101	NC_016617	GCCGA	2	10	98767	98776	20 %	0 %	40 %	40 %	392380617
102	NC_016617	GGCGC	2	10	101162	101171	0 %	0 %	60 %	40 %	392380619
103	NC_016617	AGACG	2	10	101832	101841	40 %	0 %	40 %	20 %	392380619
104	NC_016617	CGCAG	2	10	101843	101852	20 %	0 %	40 %	40 %	392380619
105	NC_016617	GGCGT	2	10	102209	102218	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016617	CCGCG	2	10	102850	102859	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_016617	CGGCG	2	10	105695	105704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016617	GCCGC	2	10	105730	105739	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_016617	CCGTG	2	10	106637	106646	0 %	20 %	40 %	40 %	392380620
110	NC_016617	GCGCG	2	10	107973	107982	0 %	0 %	60 %	40 %	392380620
111	NC_016617	GCCGG	2	10	108168	108177	0 %	0 %	60 %	40 %	392380620
112	NC_016617	GCCGC	2	10	108372	108381	0 %	0 %	40 %	60 %	392380621
113	NC_016617	CGGCC	2	10	109080	109089	0 %	0 %	40 %	60 %	392380621
114	NC_016617	GCCGG	2	10	109235	109244	0 %	0 %	60 %	40 %	392380621
115	NC_016617	CCCCG	2	10	109656	109665	0 %	0 %	20 %	80 %	392380621
116	NC_016617	TCCCC	2	10	109887	109896	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_016617	GGCGC	2	10	110267	110276	0 %	0 %	60 %	40 %	392380622
118	NC_016617	GGCGC	2	10	111699	111708	0 %	0 %	60 %	40 %	392380623
119	NC_016617	AGGTG	2	10	112054	112063	20 %	20 %	60 %	0 %	392380623
120	NC_016617	CCCGG	2	10	112574	112583	0 %	0 %	40 %	60 %	392380624
121	NC_016617	CCCGG	2	10	112776	112785	0 %	0 %	40 %	60 %	392380624
122	NC_016617	GTCCA	2	10	113570	113579	20 %	20 %	20 %	40 %	392380625
123	NC_016617	GCATC	2	10	113983	113992	20 %	20 %	20 %	40 %	392380625
124	NC_016617	GCTGC	2	10	114313	114322	0 %	20 %	40 %	40 %	392380626
125	NC_016617	CCCGG	2	10	114698	114707	0 %	0 %	40 %	60 %	392380626
126	NC_016617	GCTGG	2	10	115055	115064	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016617	GCCGG	2	10	115161	115170	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016617	GCGCC	2	10	115175	115184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_016617	GGCTG	2	10	115879	115888	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016617	CCGTC	2	10	119154	119163	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_016617	CCGTG	2	10	122183	122192	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016617	GCCCG	2	10	122422	122431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_016617	CCTGG	2	10	122648	122657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016617	CGGCG	2	10	123949	123958	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016617	CGGTC	2	10	124047	124056	0 %	20 %	40 %	40 %	392380629
136	NC_016617	GCCCC	2	10	124339	124348	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
137	NC_016617	GCGGA	2	10	128434	128443	20 %	0 %	60 %	20 %	392380636
138	NC_016617	TCCCG	2	10	128595	128604	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_016617	CGGGA	2	10	128715	128724	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016617	CCGCC	2	10	129131	129140	0 %	0 %	20 %	80 %	392380637
141	NC_016617	GCCCG	2	10	132118	132127	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_016617	CCGGC	2	10	133325	133334	0 %	0 %	40 %	60 %	392380643
143	NC_016617	AGGGG	2	10	133652	133661	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016617	CCGCG	2	10	134748	134757	0 %	0 %	40 %	60 %	392380645
145	NC_016617	TCCCC	2	10	135157	135166	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
146	NC_016617	GCTAG	2	10	137070	137079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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150	NC_016617	CCGCT	2	10	140641	140650	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
151	NC_016617	CGGCC	2	10	140774	140783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_016617	CTCGC	2	10	141865	141874	0 %	20 %	20 %	60 %	392380652
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165	NC_016617	GACCC	2	10	158187	158196	20 %	0 %	20 %	60 %	392380673
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175	NC_016617	GCGCC	2	10	168837	168846	0 %	0 %	40 %	60 %	392380682
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182	NC_016617	CCCCT	2	10	181305	181314	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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270	NC_016617	CCGGC	2	10	282289	282298	0 %	0 %	40 %	60 %	392380801
271	NC_016617	CCCCG	2	10	284010	284019	0 %	0 %	20 %	80 %	392380803
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