MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dechlorosoma suillum PS chromosome

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016616	GGGGAA	2	12	1925	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016616	GGCGCC	2	12	13971	13982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016616	ATAAAA	2	12	46982	46993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016616	GCGAAA	2	12	83073	83084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016616	CGTTTT	2	12	131106	131117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016616	CGGGGC	2	12	142240	142251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016616	GCTTGA	2	12	147187	147198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016616	CCGGCC	2	12	247022	247033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016616	TCGCCT	2	12	247393	247404	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016616	CTGCCC	2	12	254220	254231	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016616	CGGGGG	2	12	258718	258729	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016616	CCACTC	2	12	267732	267743	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016616	ACCGGG	2	12	283130	283141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016616	CACCGG	2	12	334395	334406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016616	CCGGCG	2	12	368976	368987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016616	GGCCCC	2	12	401554	401565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016616	GCGGAA	2	12	438068	438079	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016616	CCGCCT	2	12	507401	507412	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016616	TTCACG	2	12	516918	516929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016616	AAAAAG	2	12	529104	529115	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016616	TGACGC	2	12	529143	529154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016616	CAAAAA	2	12	531345	531356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016616	AAAAGG	2	12	596375	596386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016616	GGCAGG	2	12	668960	668971	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016616	GCCGAT	2	12	669028	669039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016616	GCCGAC	2	12	679519	679530	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016616	TTGGGG	2	12	710273	710284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016616	CCCTCG	2	12	767620	767631	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016616	CCAGGC	2	12	768212	768223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016616	GAATTT	2	12	771842	771853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016616	TCCCTG	2	12	775864	775875	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016616	ACTCTG	2	12	800774	800785	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016616	TCCCGC	2	12	807066	807077	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016616	TGAAAG	2	12	808084	808095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016616	CGGCAT	2	12	808831	808842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016616	CATTTT	2	12	842724	842735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016616	TGTTCC	2	12	845272	845283	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016616	TTCCCA	2	12	852549	852560	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016616	GCCATG	2	12	867486	867497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016616	AGTGGA	2	12	885713	885724	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016616	GGCAGC	2	12	895915	895926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016616	GGAACG	2	12	902644	902655	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016616	CCTGAC	2	12	922806	922817	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016616	CAGGGC	2	12	948948	948959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016616	CCGGGG	2	12	980537	980548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016616	GCGGGG	2	12	987507	987518	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016616	CGTTGA	2	12	1034296	1034307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016616	CGGCCG	2	12	1082364	1082375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016616	GCTGCC	2	12	1175502	1175513	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016616	GGGCTG	2	12	1175633	1175644	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016616	GTATTG	2	12	1194469	1194480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016616	CGCAAG	2	12	1195253	1195264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016616	TCCCCA	2	12	1248994	1249005	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016616	CCCCGG	2	12	1282942	1282953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016616	CAGGCC	2	12	1311970	1311981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016616	CGATCC	2	12	1314897	1314908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016616	TTCCCA	2	12	1323847	1323858	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016616	AGAAAA	2	12	1365987	1365998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016616	TAGGTG	2	12	1393416	1393427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016616	CAGGAG	2	12	1395144	1395155	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016616	ACAAAC	2	12	1395550	1395561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016616	GGATCA	2	12	1408886	1408897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016616	GGGGCC	2	12	1444068	1444079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016616	CCCCGG	2	12	1476037	1476048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016616	TGAACA	2	12	1547195	1547206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016616	CGGTTC	2	12	1549135	1549146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016616	GCCGAG	2	12	1644875	1644886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016616	CCCCGG	2	12	1660831	1660842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016616	CCGGCG	2	12	1687845	1687856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016616	TGGCGA	2	12	1695039	1695050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016616	GTTGGG	2	12	1710814	1710825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016616	CGGGAA	2	12	1747342	1747353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016616	GCTGCC	2	12	1754020	1754031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016616	CGCCGG	2	12	1775184	1775195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016616	GCCCAT	2	12	1775326	1775337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016616	AGCCGG	2	12	1788439	1788450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016616	GGGAAA	2	12	1839171	1839182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016616	GCTAAA	2	12	1888226	1888237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016616	TAGGTG	2	12	1901246	1901257	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016616	CAGGAG	2	12	1902974	1902985	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016616	ACAAAC	2	12	1903380	1903391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016616	CGGTGC	2	12	1913084	1913095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016616	CCGTTT	2	12	1934787	1934798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016616	TGGGGT	2	12	1952113	1952124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016616	GTCCCC	2	12	1955388	1955399	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016616	TGCCGT	2	12	1955457	1955468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016616	CGGGCG	2	12	1993998	1994009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016616	CCCAAC	2	12	2000184	2000195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016616	ATCTTG	2	12	2003154	2003165	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016616	GGCGCG	2	12	2034818	2034829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016616	CGTAGT	2	12	2034862	2034873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016616	AGGTGG	2	12	2042825	2042836	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016616	CTTTTT	2	12	2139065	2139076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016616	GGTCGG	2	12	2150424	2150435	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016616	ACCCCA	2	12	2190022	2190033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016616	TTCTCC	2	12	2191702	2191713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016616	CCGGGG	2	12	2207117	2207128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016616	GCCAGC	2	12	2226624	2226635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016616	GCCCCG	2	12	2301080	2301091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016616	TGCCTA	2	12	2313546	2313557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016616	TGCCGG	2	12	2313558	2313569	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016616	TTGACG	2	12	2323297	2323308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016616	CTTTTT	2	12	2360862	2360873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016616	GGCCGG	2	12	2367194	2367205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016616	CCGGCT	2	12	2467745	2467756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016616	ACCCCA	2	12	2508141	2508152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016616	AAACGG	2	12	2589808	2589819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016616	TGCAGT	2	12	2591916	2591927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016616	TAAGCT	2	12	2644198	2644209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016616	CCGGTG	2	12	2663584	2663595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016616	TGCTCG	2	12	2665912	2665923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016616	CAGCGG	2	12	2666366	2666377	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016616	CTATAA	2	12	2718642	2718653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016616	AGATCC	2	12	2756449	2756460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016616	TCGATC	2	12	2777983	2777994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016616	CTTTTC	2	12	2856936	2856947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016616	ACCGGG	2	12	2860687	2860698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016616	GTTCCA	2	12	2870024	2870035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016616	AGAAAA	2	12	2871059	2871070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016616	CGCCGG	2	12	2937332	2937343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016616	CGGACG	2	12	2937910	2937921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016616	CCCGTT	2	12	2990783	2990794	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016616	CGTTGA	2	12	3008548	3008559	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016616	GCGAAA	2	12	3028828	3028839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016616	TTTATT	2	12	3034728	3034739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016616	CCAGCA	2	12	3195431	3195442	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016616	GCCGGC	2	12	3195640	3195651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016616	ACCGCC	2	12	3246486	3246497	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016616	CTTTCG	2	12	3266372	3266383	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016616	GCGAGG	2	12	3306841	3306852	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016616	CTGCCG	2	12	3320182	3320193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016616	GAAAAA	2	12	3381877	3381888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016616	CGGGCC	2	12	3399271	3399282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016616	ACCCGC	2	12	3464039	3464050	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016616	AGCCCC	2	12	3474760	3474771	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016616	GCCGGC	2	12	3540151	3540162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016616	CAAAGC	2	12	3592403	3592414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016616	CGAGAG	2	12	3609375	3609386	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_016616	CGGCAG	2	12	3621343	3621354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016616	CGCGGC	2	12	3624156	3624167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016616	AGTTTG	2	12	3657775	3657786	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016616	CAGGGC	2	12	3672216	3672227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016616	ACTCTT	2	12	3722082	3722093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.