MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Dechlorosoma suillum PS chromosome

Total Repeats: 2297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016616	TCTGC	2	10	1557	1566	0 %	40 %	20 %	40 %	372486702
2	NC_016616	GGCGA	2	10	2735	2744	20 %	0 %	60 %	20 %	372486704
3	NC_016616	GCGCC	2	10	3731	3740	0 %	0 %	40 %	60 %	372486704
4	NC_016616	CTGCG	2	10	8652	8661	0 %	20 %	40 %	40 %	372486711
5	NC_016616	TGGTG	2	10	10201	10210	0 %	40 %	60 %	0 %	372486712
6	NC_016616	GCCCT	2	10	11102	11111	0 %	20 %	20 %	60 %	372486713
7	NC_016616	GCCAG	2	10	14177	14186	20 %	0 %	40 %	40 %	372486717
8	NC_016616	CGTGC	2	10	14361	14370	0 %	20 %	40 %	40 %	372486717
9	NC_016616	AACGG	2	10	15282	15291	40 %	0 %	40 %	20 %	372486718
10	NC_016616	TGGCG	2	10	18877	18886	0 %	20 %	60 %	20 %	372486721
11	NC_016616	GACGG	2	10	19042	19051	20 %	0 %	60 %	20 %	372486721
12	NC_016616	CCGGG	2	10	19924	19933	0 %	0 %	60 %	40 %	372486723
13	NC_016616	CTGGC	2	10	21745	21754	0 %	20 %	40 %	40 %	372486724
14	NC_016616	GCAGG	2	10	23666	23675	20 %	0 %	60 %	20 %	372486726
15	NC_016616	CGCTG	2	10	24082	24091	0 %	20 %	40 %	40 %	372486727
16	NC_016616	CGGCC	2	10	25957	25966	0 %	0 %	40 %	60 %	372486729
17	NC_016616	GGCCC	2	10	28792	28801	0 %	0 %	40 %	60 %	372486733
18	NC_016616	GGCGC	2	10	29401	29410	0 %	0 %	60 %	40 %	372486734
19	NC_016616	CGGGC	2	10	29462	29471	0 %	0 %	60 %	40 %	372486734
20	NC_016616	CCTGG	2	10	29890	29899	0 %	20 %	40 %	40 %	372486734
21	NC_016616	GCGGG	2	10	30675	30684	0 %	0 %	80 %	20 %	372486735
22	NC_016616	GCCGG	2	10	32800	32809	0 %	0 %	60 %	40 %	372486736
23	NC_016616	AGCCG	2	10	33676	33685	20 %	0 %	40 %	40 %	372486738
24	NC_016616	GTCCC	2	10	34580	34589	0 %	20 %	20 %	60 %	372486738
25	NC_016616	GCCGG	2	10	37453	37462	0 %	0 %	60 %	40 %	372486741
26	NC_016616	GGGCC	2	10	38637	38646	0 %	0 %	60 %	40 %	372486742
27	NC_016616	GCCGG	2	10	38699	38708	0 %	0 %	60 %	40 %	372486742
28	NC_016616	CGGCG	2	10	41310	41319	0 %	0 %	60 %	40 %	372486746
29	NC_016616	CAGGC	2	10	41480	41489	20 %	0 %	40 %	40 %	372486746
30	NC_016616	GTGGC	2	10	43779	43788	0 %	20 %	60 %	20 %	372486748
31	NC_016616	GGGAC	2	10	44450	44459	20 %	0 %	60 %	20 %	372486748
32	NC_016616	GCGCA	2	10	45096	45105	20 %	0 %	40 %	40 %	372486749
33	NC_016616	GTTCA	2	10	47985	47994	20 %	40 %	20 %	20 %	372486751
34	NC_016616	CCTGG	2	10	48333	48342	0 %	20 %	40 %	40 %	372486752
35	NC_016616	CCCTC	2	10	53388	53397	0 %	20 %	0 %	80 %	372486757
36	NC_016616	ACAGC	2	10	53564	53573	40 %	0 %	20 %	40 %	372486757
37	NC_016616	TGCCG	2	10	56768	56777	0 %	20 %	40 %	40 %	372486760
38	NC_016616	CCAGT	2	10	57282	57291	20 %	20 %	20 %	40 %	372486761
39	NC_016616	AGCAG	2	10	58498	58507	40 %	0 %	40 %	20 %	372486762
40	NC_016616	GCCAT	2	10	59822	59831	20 %	20 %	20 %	40 %	372486764
41	NC_016616	AGACG	2	10	61080	61089	40 %	0 %	40 %	20 %	372486765
42	NC_016616	ACCCA	2	10	61889	61898	40 %	0 %	0 %	60 %	372486765
43	NC_016616	CGTAC	2	10	68261	68270	20 %	20 %	20 %	40 %	372486771
44	NC_016616	AGATC	2	10	71442	71451	40 %	20 %	20 %	20 %	372486774
45	NC_016616	GTCCG	2	10	75451	75460	0 %	20 %	40 %	40 %	372486778
46	NC_016616	GTCCA	2	10	78001	78010	20 %	20 %	20 %	40 %	372486780
47	NC_016616	GCTTC	2	10	79911	79920	0 %	40 %	20 %	40 %	372486782
48	NC_016616	CGGAG	2	10	80184	80193	20 %	0 %	60 %	20 %	372486782
49	NC_016616	TTTCA	2	10	81129	81138	20 %	60 %	0 %	20 %	372486783
50	NC_016616	GACCA	2	10	84010	84019	40 %	0 %	20 %	40 %	372486785
51	NC_016616	GGCCG	2	10	89335	89344	0 %	0 %	60 %	40 %	372486789
52	NC_016616	GACCA	2	10	96195	96204	40 %	0 %	20 %	40 %	372486795
53	NC_016616	GAGCC	2	10	97749	97758	20 %	0 %	40 %	40 %	372486796
54	NC_016616	AAATC	2	10	99274	99283	60 %	20 %	0 %	20 %	372486799
55	NC_016616	CCACC	2	10	100047	100056	20 %	0 %	0 %	80 %	372486800
56	NC_016616	CGGGG	2	10	101376	101385	0 %	0 %	80 %	20 %	372486801
57	NC_016616	CGGCG	2	10	103406	103415	0 %	0 %	60 %	40 %	372486804
58	NC_016616	ACCGG	2	10	104043	104052	20 %	0 %	40 %	40 %	372486804
59	NC_016616	GGCCC	2	10	110253	110262	0 %	0 %	40 %	60 %	372486810
60	NC_016616	CAAGG	2	10	110395	110404	40 %	0 %	40 %	20 %	372486810
61	NC_016616	CGCCC	2	10	112025	112034	0 %	0 %	20 %	80 %	372486812
62	NC_016616	GCGCC	2	10	115036	115045	0 %	0 %	40 %	60 %	372486816
63	NC_016616	CCCGG	2	10	115408	115417	0 %	0 %	40 %	60 %	372486816
64	NC_016616	GCCGC	2	10	115535	115544	0 %	0 %	40 %	60 %	372486816
65	NC_016616	GCCAG	2	10	117616	117625	20 %	0 %	40 %	40 %	372486818
66	NC_016616	CCGCA	2	10	120022	120031	20 %	0 %	20 %	60 %	372486820
67	NC_016616	CGGCG	2	10	121453	121462	0 %	0 %	60 %	40 %	372486822
68	NC_016616	GGATG	2	10	122182	122191	20 %	20 %	60 %	0 %	372486823
69	NC_016616	GCTGC	2	10	122497	122506	0 %	20 %	40 %	40 %	372486823
70	NC_016616	CGATG	2	10	122590	122599	20 %	20 %	40 %	20 %	372486823
71	NC_016616	GCAGC	2	10	123933	123942	20 %	0 %	40 %	40 %	372486825
72	NC_016616	GCCCT	2	10	125380	125389	0 %	20 %	20 %	60 %	372486826
73	NC_016616	CTGGA	2	10	126710	126719	20 %	20 %	40 %	20 %	372486827
74	NC_016616	CCGCA	2	10	128066	128075	20 %	0 %	20 %	60 %	372486828
75	NC_016616	TGGCC	2	10	128663	128672	0 %	20 %	40 %	40 %	372486829
76	NC_016616	GCTGG	2	10	132828	132837	0 %	20 %	60 %	20 %	372486830
77	NC_016616	TCGCC	2	10	133654	133663	0 %	20 %	20 %	60 %	372486831
78	NC_016616	GCGCC	2	10	134009	134018	0 %	0 %	40 %	60 %	372486831
79	NC_016616	CGCAA	2	10	136032	136041	40 %	0 %	20 %	40 %	372486833
80	NC_016616	GCATC	2	10	136190	136199	20 %	20 %	20 %	40 %	372486833
81	NC_016616	CATGC	2	10	136266	136275	20 %	20 %	20 %	40 %	372486833
82	NC_016616	TGCTC	2	10	137354	137363	0 %	40 %	20 %	40 %	372486834
83	NC_016616	GCCCC	2	10	139167	139176	0 %	0 %	20 %	80 %	372486835
84	NC_016616	CAGAC	2	10	142892	142901	40 %	0 %	20 %	40 %	372486839
85	NC_016616	TGTGG	2	10	143208	143217	0 %	40 %	60 %	0 %	372486839
86	NC_016616	AACCA	2	10	144644	144653	60 %	0 %	0 %	40 %	372486840
87	NC_016616	ACGGC	2	10	145656	145665	20 %	0 %	40 %	40 %	372486841
88	NC_016616	GTCCG	2	10	146226	146235	0 %	20 %	40 %	40 %	372486841
89	NC_016616	CATGA	2	10	146880	146889	40 %	20 %	20 %	20 %	372486842
90	NC_016616	GCTTT	2	10	155064	155073	0 %	60 %	20 %	20 %	372486848
91	NC_016616	CAAGC	2	10	159667	159676	40 %	0 %	20 %	40 %	372486850
92	NC_016616	ATTCC	2	10	159840	159849	20 %	40 %	0 %	40 %	372486850
93	NC_016616	AAAGA	2	10	160869	160878	80 %	0 %	20 %	0 %	372486852
94	NC_016616	AACTC	2	10	161686	161695	40 %	20 %	0 %	40 %	372486853
95	NC_016616	TTGTC	2	10	162384	162393	0 %	60 %	20 %	20 %	372486854
96	NC_016616	ATGAA	2	10	163568	163577	60 %	20 %	20 %	0 %	372486856
97	NC_016616	ATGAA	2	10	163661	163670	60 %	20 %	20 %	0 %	372486856
98	NC_016616	TCAAG	2	10	164686	164695	40 %	20 %	20 %	20 %	372486857
99	NC_016616	ACCCA	2	10	165149	165158	40 %	0 %	0 %	60 %	372486857
100	NC_016616	TCGGC	2	10	169368	169377	0 %	20 %	40 %	40 %	372486862
101	NC_016616	CGGAT	2	10	171213	171222	20 %	20 %	40 %	20 %	372486863
102	NC_016616	CCGGG	2	10	172583	172592	0 %	0 %	60 %	40 %	372486864
103	NC_016616	GAGAA	2	10	175716	175725	60 %	0 %	40 %	0 %	372486868
104	NC_016616	CGGCG	2	10	176310	176319	0 %	0 %	60 %	40 %	372486869
105	NC_016616	GGCCG	2	10	176413	176422	0 %	0 %	60 %	40 %	372486869
106	NC_016616	GGCGC	2	10	179528	179537	0 %	0 %	60 %	40 %	372486871
107	NC_016616	ATCGC	2	10	182719	182728	20 %	20 %	20 %	40 %	372486876
108	NC_016616	CACCG	2	10	185769	185778	20 %	0 %	20 %	60 %	372486881
109	NC_016616	TGCCT	2	10	188032	188041	0 %	40 %	20 %	40 %	372486882
110	NC_016616	CCCTC	2	10	189719	189728	0 %	20 %	0 %	80 %	372486884
111	NC_016616	CGCGC	2	10	190858	190867	0 %	0 %	40 %	60 %	372486887
112	NC_016616	CCGCA	2	10	191443	191452	20 %	0 %	20 %	60 %	372486888
113	NC_016616	CAGCT	2	10	194035	194044	20 %	20 %	20 %	40 %	372486890
114	NC_016616	CGACC	2	10	198163	198172	20 %	0 %	20 %	60 %	372486892
115	NC_016616	ACCCC	2	10	201065	201074	20 %	0 %	0 %	80 %	372486897
116	NC_016616	GCCTG	2	10	204877	204886	0 %	20 %	40 %	40 %	372486901
117	NC_016616	TCATC	2	10	207031	207040	20 %	40 %	0 %	40 %	372486904
118	NC_016616	GCTGT	2	10	209631	209640	0 %	40 %	40 %	20 %	372486904
119	NC_016616	GGACT	2	10	211842	211851	20 %	20 %	40 %	20 %	372486906
120	NC_016616	CGCCT	2	10	214364	214373	0 %	20 %	20 %	60 %	372486909
121	NC_016616	CCTGG	2	10	214417	214426	0 %	20 %	40 %	40 %	372486909
122	NC_016616	CGCTC	2	10	215054	215063	0 %	20 %	20 %	60 %	372486910
123	NC_016616	GCCAG	2	10	221759	221768	20 %	0 %	40 %	40 %	372486920
124	NC_016616	AGGGC	2	10	222128	222137	20 %	0 %	60 %	20 %	372486920
125	NC_016616	GGCGT	2	10	224363	224372	0 %	20 %	60 %	20 %	372486922
126	NC_016616	CGGCC	2	10	225449	225458	0 %	0 %	40 %	60 %	372486923
127	NC_016616	CTGGC	2	10	228801	228810	0 %	20 %	40 %	40 %	372486926
128	NC_016616	GCCAG	2	10	232729	232738	20 %	0 %	40 %	40 %	372486930
129	NC_016616	AGGCC	2	10	232985	232994	20 %	0 %	40 %	40 %	372486930
130	NC_016616	TGGCC	2	10	238049	238058	0 %	20 %	40 %	40 %	372486935
131	NC_016616	GGCCG	2	10	238062	238071	0 %	0 %	60 %	40 %	372486935
132	NC_016616	CACGG	2	10	238089	238098	20 %	0 %	40 %	40 %	372486935
133	NC_016616	GCCCG	2	10	238468	238477	0 %	0 %	40 %	60 %	372486935
134	NC_016616	GGGCC	2	10	239879	239888	0 %	0 %	60 %	40 %	372486936
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149	NC_016616	CCTGG	2	10	272006	272015	0 %	20 %	40 %	40 %	372486964
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151	NC_016616	GGCCG	2	10	274619	274628	0 %	0 %	60 %	40 %	372486966
152	NC_016616	GCGCC	2	10	274714	274723	0 %	0 %	40 %	60 %	372486966
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177	NC_016616	TGGGC	2	10	316635	316644	0 %	20 %	60 %	20 %	372487008
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250	NC_016616	GCGGG	2	10	423401	423410	0 %	0 %	80 %	20 %	372487111
251	NC_016616	ACGGC	2	10	425924	425933	20 %	0 %	40 %	40 %	372487112
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254	NC_016616	GGCCT	2	10	427902	427911	0 %	20 %	40 %	40 %	372487114
255	NC_016616	CCCGG	2	10	428297	428306	0 %	0 %	40 %	60 %	372487114
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257	NC_016616	CGCCT	2	10	429831	429840	0 %	20 %	20 %	60 %	372487114
258	NC_016616	CTGGC	2	10	430334	430343	0 %	20 %	40 %	40 %	372487115
259	NC_016616	CCCTG	2	10	432517	432526	0 %	20 %	20 %	60 %	372487117
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261	NC_016616	GCCGC	2	10	435070	435079	0 %	0 %	40 %	60 %	372487119
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