MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Dechlorosoma suillum PS chromosome

Total Repeats: 78831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016616	CAG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486702
2	NC_016616	GCA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486702
3	NC_016616	TGC	2	6	309	314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486702
4	NC_016616	GCC	2	6	364	369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
5	NC_016616	GGT	2	6	418	423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486702
6	NC_016616	GCA	2	6	432	437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486702
7	NC_016616	GCG	2	6	442	447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
8	NC_016616	TTG	2	6	536	541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	372486702
9	NC_016616	GCC	2	6	590	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
10	NC_016616	CGT	3	9	615	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486702
11	NC_016616	CGG	3	9	780	788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
12	NC_016616	CGC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
13	NC_016616	CAG	2	6	898	903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486702
14	NC_016616	GAT	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486702
15	NC_016616	GCC	2	6	1010	1015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
16	NC_016616	GCA	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486702
17	NC_016616	ATC	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486702
18	NC_016616	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
19	NC_016616	GGC	2	6	1210	1215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
20	NC_016616	GGC	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
21	NC_016616	GCG	2	6	1251	1256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
22	NC_016616	CGC	2	6	1290	1295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
23	NC_016616	CCG	2	6	1341	1346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
24	NC_016616	GCC	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
25	NC_016616	CGG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
26	NC_016616	CGG	2	6	1500	1505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
27	NC_016616	GGC	2	6	1510	1515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
28	NC_016616	GCC	2	6	1574	1579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
29	NC_016616	GGC	2	6	1603	1608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
30	NC_016616	GCA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486702
31	NC_016616	CCA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486702
32	NC_016616	GCG	2	6	1760	1765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
33	NC_016616	GGC	3	9	1774	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
34	NC_016616	GCC	2	6	1852	1857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486702
35	NC_016616	CTC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486702
36	NC_016616	GGC	3	9	1879	1887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
37	NC_016616	CGG	2	6	1906	1911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486702
38	NC_016616	AGG	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016616	CCG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016616	CTC	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486703
41	NC_016616	CAG	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486703
42	NC_016616	GCA	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486703
43	NC_016616	CCA	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486704
44	NC_016616	GCA	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486704
45	NC_016616	TGC	3	9	2471	2479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486704
46	NC_016616	GCC	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486704
47	NC_016616	CAG	2	6	2599	2604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486704
48	NC_016616	CCG	2	6	2712	2717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486704
49	NC_016616	TCT	2	6	2973	2978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486704
50	NC_016616	CTG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486704
51	NC_016616	GAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486704
52	NC_016616	GCC	2	6	3200	3205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486704
53	NC_016616	CGA	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486704
54	NC_016616	GGC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486704
55	NC_016616	GGC	2	6	3250	3255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486704
56	NC_016616	CAG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486704
57	NC_016616	GGC	2	6	3274	3279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486704
58	NC_016616	CGA	2	6	3285	3290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486704
59	NC_016616	GCC	2	6	3427	3432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486704
60	NC_016616	TGG	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486704
61	NC_016616	GAA	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486704
62	NC_016616	GCC	3	9	3506	3514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486704
63	NC_016616	GGC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486704
64	NC_016616	CTT	2	6	3613	3618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486704
65	NC_016616	GAG	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486704
66	NC_016616	CGG	2	6	3685	3690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486704
67	NC_016616	GAG	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486704
68	NC_016616	CCA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486704
69	NC_016616	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486704
70	NC_016616	GCC	2	6	3832	3837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486705
71	NC_016616	AAC	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486705
72	NC_016616	CGG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486705
73	NC_016616	TGG	2	6	3890	3895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486705
74	NC_016616	GAA	2	6	3993	3998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486705
75	NC_016616	CGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486705
76	NC_016616	CCG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486705
77	NC_016616	GCC	3	9	4120	4128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486705
78	NC_016616	CCA	2	6	4148	4153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486705
79	NC_016616	CCG	2	6	4196	4201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486705
80	NC_016616	CTG	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486705
81	NC_016616	CGG	2	6	4290	4295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486705
82	NC_016616	TCC	2	6	4324	4329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016616	CCG	2	6	4367	4372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486706
84	NC_016616	GCC	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486706
85	NC_016616	GGC	2	6	4398	4403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486706
86	NC_016616	CCT	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486706
87	NC_016616	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486706
88	NC_016616	CGC	2	6	4454	4459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486706
89	NC_016616	GCC	2	6	4482	4487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486706
90	NC_016616	ACC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486706
91	NC_016616	CAG	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486706
92	NC_016616	ATC	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486706
93	NC_016616	GCC	2	6	4560	4565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486706
94	NC_016616	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486706
95	NC_016616	TCG	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486706
96	NC_016616	GCC	2	6	4668	4673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486706
97	NC_016616	CGG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486706
98	NC_016616	CGG	2	6	4808	4813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486706
99	NC_016616	GCG	2	6	4816	4821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486706
100	NC_016616	GAA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016616	GCA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486707
102	NC_016616	CAA	2	6	4946	4951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486707
103	NC_016616	GCC	2	6	4955	4960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486707
104	NC_016616	ACA	2	6	5107	5112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486707
105	NC_016616	CGA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486707
106	NC_016616	GTC	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486707
107	NC_016616	CAT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486708
108	NC_016616	CGT	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486708
109	NC_016616	ACT	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016616	GTT	2	6	5604	5609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016616	GCC	2	6	5639	5644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016616	AGA	2	6	5801	5806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486709
113	NC_016616	GCC	2	6	5820	5825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486709
114	NC_016616	TGC	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486709
115	NC_016616	ACG	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486709
116	NC_016616	CGC	2	6	5991	5996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486709
117	NC_016616	GTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	372486709
118	NC_016616	GGA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486709
119	NC_016616	TCG	2	6	6113	6118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
120	NC_016616	TCA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486710
121	NC_016616	CTG	3	9	6160	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
122	NC_016616	TGG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486710
123	NC_016616	CCG	3	9	6188	6196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486710
124	NC_016616	AAC	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486710
125	NC_016616	GCG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486710
126	NC_016616	CGA	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486710
127	NC_016616	GCG	2	6	6281	6286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486710
128	NC_016616	GTC	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
129	NC_016616	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486710
130	NC_016616	TGG	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486710
131	NC_016616	TTC	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486710
132	NC_016616	GTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486710
133	NC_016616	GCC	2	6	6551	6556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486710
134	NC_016616	GCC	2	6	6674	6679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486710
135	NC_016616	AAC	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486710
136	NC_016616	GCT	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
137	NC_016616	GTG	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486710
138	NC_016616	CTG	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
139	NC_016616	AGC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486710
140	NC_016616	CGA	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486710
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149	NC_016616	GGC	2	6	7218	7223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486710
150	NC_016616	TCA	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486710
151	NC_016616	CGA	2	6	7272	7277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486710
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153	NC_016616	AGA	3	9	7316	7324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486710
154	NC_016616	GAG	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486710
155	NC_016616	TCG	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
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158	NC_016616	AGC	2	6	7583	7588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486710
159	NC_016616	CTG	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
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163	NC_016616	CTG	2	6	7795	7800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486710
164	NC_016616	ACA	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486710
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171	NC_016616	CAT	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486710
172	NC_016616	GTG	2	6	8047	8052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486710
173	NC_016616	AAG	2	6	8092	8097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486710
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175	NC_016616	CGA	2	6	8217	8222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486710
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231	NC_016616	CAT	2	6	10734	10739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_016616	CTG	2	6	11516	11521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486713
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254	NC_016616	CTG	3	9	11678	11686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486713
255	NC_016616	GGC	2	6	11687	11692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486713
256	NC_016616	CTG	2	6	11729	11734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486713
257	NC_016616	ACG	2	6	11788	11793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486714
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259	NC_016616	GCG	3	9	11872	11880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486714
260	NC_016616	GAA	2	6	11922	11927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486714
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262	NC_016616	CCG	2	6	11996	12001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486714
263	NC_016616	CGC	2	6	12042	12047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486714
264	NC_016616	GGC	2	6	12048	12053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486714
265	NC_016616	GGC	2	6	12060	12065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486714
266	NC_016616	CGC	2	6	12083	12088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486714
267	NC_016616	GGC	2	6	12093	12098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486714
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289	NC_016616	GAG	2	6	13499	13504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016616	CCA	2	6	13507	13512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486716
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297	NC_016616	CTG	2	6	13722	13727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486716
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500	NC_016616	CCG	2	6	22172	22177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486725

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