MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio sp. EJY3 chromosome 2

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016614	ATCATG	2	12	450	461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016614	AATATC	2	12	57351	57362	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016614	TGAAAC	2	12	57407	57418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016614	AATAAA	2	12	68901	68912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016614	TACAAT	2	12	72753	72764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016614	TGAAAT	2	12	92241	92252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016614	TGCAAA	2	12	102360	102371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016614	AATTAA	2	12	109803	109814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016614	TTCCTG	2	12	121142	121153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016614	TGCAAT	2	12	135426	135437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016614	ATGCTG	2	12	313324	313335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016614	ATAAGT	2	12	317288	317299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016614	TATTCT	2	12	355913	355924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016614	TATATT	2	12	392390	392401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016614	GTTATA	2	12	392505	392516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016614	GATGAA	2	12	414438	414449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016614	CACTGA	2	12	443465	443476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016614	TGTTTT	2	12	450506	450517	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016614	GAACAG	2	12	464254	464265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016614	TAAGAG	2	12	472327	472338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016614	TATTGA	2	12	481989	482000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016614	ATATGG	2	12	506368	506379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016614	AGTTGG	2	12	506395	506406	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016614	GTTAAG	2	12	519276	519287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016614	AAAAGG	2	12	519320	519331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016614	CAACTT	2	12	576177	576188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016614	ATTCAA	2	12	600192	600203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016614	CGTTAA	2	12	610110	610121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016614	TTTAAT	2	12	667651	667662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016614	TTTTAC	2	12	679906	679917	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016614	AAAGCT	2	12	707136	707147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016614	GAATGC	2	12	721108	721119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016614	GTTTTT	2	12	761531	761542	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016614	GCTTGT	2	12	785672	785683	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016614	AAAAGT	2	12	817480	817491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016614	TACTCG	2	12	862943	862954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016614	TGACTA	2	12	887346	887357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016614	GAAAAT	2	12	906168	906179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016614	TGTTTT	2	12	908557	908568	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016614	GTTATC	2	12	924515	924526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016614	GAAATA	2	12	928402	928413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016614	AACGAA	2	12	952166	952177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016614	AAGGGA	2	12	958403	958414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016614	CAAATT	2	12	982164	982175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016614	TTCCCC	2	12	991843	991854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016614	ATTGTA	2	12	995162	995173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016614	TTAATG	2	12	995244	995255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016614	GAATCA	2	12	1033823	1033834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016614	TGTAGT	2	12	1046142	1046153	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016614	TTTATA	2	12	1050833	1050844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016614	ATATTT	2	12	1051282	1051293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016614	AGCTTG	2	12	1052029	1052040	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016614	AATACA	2	12	1116974	1116985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016614	CAAAAC	2	12	1121627	1121638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016614	TATTTA	2	12	1128630	1128641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016614	GCTTAC	2	12	1137440	1137451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016614	TAGAGA	2	12	1147082	1147093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016614	TATTTA	2	12	1166835	1166846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016614	ACTTTT	3	18	1172002	1172019	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016614	AATCAT	2	12	1177932	1177943	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016614	ACAAAT	5	30	1178536	1178565	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016614	TTAAAT	2	12	1198987	1198998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016614	CTTTTT	2	12	1250849	1250860	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016614	CTTTTT	2	12	1282795	1282806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016614	AATTGA	2	12	1385296	1385307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016614	CAAAAA	2	12	1387095	1387106	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016614	TTTACT	2	12	1435821	1435832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016614	TGATGT	2	12	1473629	1473640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016614	ATATTT	2	12	1483817	1483828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016614	CTTTCA	2	12	1501996	1502007	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016614	AAATCT	2	12	1519401	1519412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016614	AAATAA	2	12	1528496	1528507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016614	CAGTGA	2	12	1551809	1551820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016614	CGATGT	2	12	1554631	1554642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016614	TTAATT	2	12	1557525	1557536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016614	TAAGAA	2	12	1571377	1571388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016614	AATAAA	3	18	1596443	1596460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016614	GTCGTA	2	12	1611627	1611638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016614	TATGCA	2	12	1634866	1634877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016614	ATAAGT	2	12	1643006	1643017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016614	AAAAAT	2	12	1652907	1652918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016614	CTGATT	2	12	1678351	1678362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016614	AACGAA	2	12	1715745	1715756	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016614	GTTTTA	2	12	1735471	1735482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016614	ATAAGG	2	12	1760179	1760190	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016614	CACAAA	2	12	1794668	1794679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016614	AAACTA	2	12	1802334	1802345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016614	TCACAC	2	12	1819152	1819163	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016614	AGCCAA	2	12	1849330	1849341	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016614	TCCCAG	2	12	1851366	1851377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016614	TAAAAT	2	12	1852430	1852441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016614	TCAATT	2	12	1883401	1883412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016614	CAAAAA	2	12	1905979	1905990	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016614	AAAAAC	2	12	1936225	1936236	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016614	TCAAAC	2	12	1938937	1938948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016614	AATTTT	2	12	1951044	1951055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016614	AAAGAT	2	12	1952896	1952907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016614	AATTAA	2	12	1966893	1966904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.