MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio sp. EJY3 chromosome 1

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016613	CAAAAA	2	12	3286	3297	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016613	TGAAAT	2	12	38613	38624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016613	TAATAC	2	12	40982	40993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016613	ATCAGA	2	12	119106	119117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016613	CTGAAC	3	18	129755	129772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016613	AATTTA	2	12	237613	237624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016613	CAAATT	2	12	244291	244302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016613	TCCTTG	2	12	322016	322027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016613	TTCTAA	2	12	348248	348259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016613	TTACAA	2	12	368693	368704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016613	CAAAAA	2	12	373511	373522	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016613	ATCTGT	2	12	385958	385969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016613	TTAAAT	2	12	390968	390979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016613	TGGTAT	2	12	396027	396038	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016613	TGACGT	2	12	444414	444425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016613	TTTTTA	2	12	533317	533328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016613	CTAAAT	2	12	534458	534469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016613	TGAAAT	2	12	580309	580320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016613	TATTAG	2	12	603074	603085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016613	GAATAC	2	12	605308	605319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016613	GAGAAC	2	12	605382	605393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016613	AATCAT	2	12	616762	616773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016613	TGACAG	2	12	649382	649393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016613	ATTTTT	2	12	650827	650838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016613	GATTTT	2	12	654683	654694	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016613	TTTTAA	2	12	654714	654725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016613	AGCGGC	2	12	683039	683050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016613	CTTCTG	2	12	696878	696889	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016613	ATTTTG	2	12	707143	707154	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016613	AAATTT	2	12	746990	747001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016613	CAGAAA	2	12	769044	769055	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016613	GAGATG	2	12	800909	800920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016613	GTATTC	2	12	826935	826946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016613	TAAAAA	2	12	854759	854770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016613	GATAAA	2	12	880279	880290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016613	AATGGA	2	12	885695	885706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016613	TAAGTT	2	12	910773	910784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016613	TAAAAA	2	12	947722	947733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016613	TACCAG	2	12	980887	980898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016613	GTTAAA	2	12	1006488	1006499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016613	CTTTTG	2	12	1040825	1040836	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016613	ATCGCA	2	12	1072769	1072780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016613	TAAAAC	2	12	1083557	1083568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016613	TAACTA	2	12	1091825	1091836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016613	GCCAAA	2	12	1105626	1105637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016613	TTGAGT	2	12	1110602	1110613	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016613	AGAGCA	2	12	1126380	1126391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016613	TTGTTA	2	12	1241630	1241641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016613	AGTTAA	2	12	1245301	1245312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016613	CAAATG	2	12	1277311	1277322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016613	TTTTAA	2	12	1296144	1296155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016613	TTGTTA	2	12	1312773	1312784	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016613	GTTTTT	2	12	1352978	1352989	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016613	CAGGGG	2	12	1368273	1368284	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016613	AAATAT	2	12	1379819	1379830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016613	GAGTGG	2	12	1424742	1424753	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016613	AGGGCG	2	12	1454788	1454799	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016613	TTTACA	2	12	1455169	1455180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016613	TGAAAA	2	12	1471944	1471955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016613	TGAAAA	2	12	1471966	1471977	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016613	AAACAA	2	12	1474315	1474326	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016613	GTGATG	2	12	1498362	1498373	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016613	TACTTT	2	12	1498640	1498651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016613	TCGTTA	2	12	1576508	1576519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016613	ATTGAA	2	12	1589481	1589492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016613	ATATTA	2	12	1625763	1625774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016613	TTTAAA	2	12	1642503	1642514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016613	TGAAAT	2	12	1649519	1649530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016613	AATGAA	2	12	1681115	1681126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016613	GTTACG	2	12	1717326	1717337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016613	CTGCCG	2	12	1718314	1718325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016613	AGGACC	2	12	1718417	1718428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016613	AGCCGG	2	12	1719781	1719792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016613	CCTGCC	2	12	1720996	1721007	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016613	GCATAC	2	12	1777129	1777140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016613	AACAGA	2	12	1800825	1800836	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016613	ATATTT	2	12	1805102	1805113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016613	GTATAT	2	12	1812749	1812760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016613	CGAAAT	2	12	1857445	1857456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016613	TGCTTC	2	12	1874014	1874025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016613	GGTTTG	2	12	1898468	1898479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016613	AAATTT	2	12	1919055	1919066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016613	TTTTAT	2	12	1934490	1934501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016613	ACATCA	2	12	1960610	1960621	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016613	TTGAAG	2	12	1974183	1974194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016613	TAAGTG	2	12	1999225	1999236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016613	CTATGA	2	12	2012142	2012153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016613	ATTTGT	2	12	2043381	2043392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016613	GTTTGT	2	12	2051425	2051436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016613	TTATGG	2	12	2056018	2056029	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016613	CAAAAT	2	12	2060220	2060231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016613	ACCATT	2	12	2061069	2061080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016613	GGATAA	2	12	2088752	2088763	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016613	CTTAAT	3	18	2092040	2092057	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016613	TGATTT	2	12	2103663	2103674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016613	TATTCT	2	12	2117135	2117146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016613	ATATAC	2	12	2117267	2117278	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016613	AATAAA	2	12	2117877	2117888	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016613	AAAATA	2	12	2135444	2135455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016613	GAAAAA	2	12	2156397	2156408	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016613	TTTTGG	2	12	2175317	2175328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016613	TTTCCA	2	12	2185191	2185202	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016613	AAAAAG	2	12	2193208	2193219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016613	TATTTT	2	12	2259271	2259282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016613	GAATAA	2	12	2340332	2340343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016613	AATAAC	2	12	2356375	2356386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016613	ATAAAA	2	12	2388199	2388210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016613	AACTCA	2	12	2406658	2406669	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016613	TGTTTG	2	12	2462741	2462752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016613	AACTAA	2	12	2468669	2468680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016613	TTTTAA	2	12	2503506	2503517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016613	AAAAAC	2	12	2532107	2532118	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016613	ATGAGG	2	12	2552315	2552326	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016613	TTGAGC	2	12	2599934	2599945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016613	ATTACA	2	12	2652923	2652934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016613	TGACCA	2	12	2657442	2657453	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016613	CAATCA	2	12	2695232	2695243	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016613	AGCAAG	2	12	2703255	2703266	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016613	TTCTTT	2	12	2768783	2768794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016613	TACCGT	2	12	2785018	2785029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016613	ATTAAT	2	12	2815067	2815078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016613	TATCAA	2	12	2828676	2828687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016613	ATAAAA	2	12	2832669	2832680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016613	CAGAAA	2	12	2854572	2854583	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016613	TTGTTT	2	12	2858695	2858706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016613	AATTTT	2	12	2863299	2863310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_016613	ATTTCA	2	12	3018477	3018488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_016613	AAAAAG	2	12	3065370	3065381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.