MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio sp. EJY3 chromosome 1

Total Repeats: 973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016613	CTTTCT	2	12	3722	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375264035
2	NC_016613	CTCGTC	2	12	9837	9848	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	375264042
3	NC_016613	CACTGG	2	12	13972	13983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264045
4	NC_016613	AGTGAA	2	12	15400	15411	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375264046
5	NC_016613	TAGCAG	2	12	19330	19341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264049
6	NC_016613	CCATTA	2	12	20208	20219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375264050
7	NC_016613	CGATGA	2	12	23861	23872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264052
8	NC_016613	TGCGAC	2	12	26848	26859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264057
9	NC_016613	GTCGTT	2	12	41081	41092	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375264064
10	NC_016613	CGATAC	2	12	43385	43396	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264066
11	NC_016613	CTTTGT	2	12	44198	44209	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264066
12	NC_016613	GTTACG	2	12	47304	47315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264067
13	NC_016613	ATACCA	2	12	48892	48903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375264069
14	NC_016613	CAGCGT	2	12	54678	54689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264073
15	NC_016613	CGTTCG	2	12	55971	55982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375264074
16	NC_016613	TCGGAG	2	12	56964	56975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375264075
17	NC_016613	TTTCCT	2	12	57659	57670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375264075
18	NC_016613	CATCAC	2	12	61363	61374	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	375264079
19	NC_016613	CAGGCG	2	12	64628	64639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375264081
20	NC_016613	CAGAGT	2	12	67352	67363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264084
21	NC_016613	ATGAAC	2	12	75738	75749	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375264092
22	NC_016613	CTTAAA	2	12	78523	78534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	375264095
23	NC_016613	ATCTGA	2	12	81943	81954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264096
24	NC_016613	GTTACG	2	12	82665	82676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264098
25	NC_016613	AGTAGC	2	12	84375	84386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264100
26	NC_016613	TGCTGA	2	12	86467	86478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264102
27	NC_016613	TCGTCA	2	12	89384	89395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264105
28	NC_016613	TCGCTG	2	12	96987	96998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375264113
29	NC_016613	AGACCG	2	12	97435	97446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375264113
30	NC_016613	CAATCA	2	12	101761	101772	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375264116
31	NC_016613	GCCTGA	2	12	101880	101891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264116
32	NC_016613	GTTACC	2	12	104595	104606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264118
33	NC_016613	ACAATG	2	12	112368	112379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375264127
34	NC_016613	AGGTAA	2	12	114868	114879	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375264129
35	NC_016613	CGTTAT	2	12	121280	121291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264135
36	NC_016613	TTCGTA	2	12	122695	122706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264136
37	NC_016613	AGTCCG	2	12	127905	127916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264139
38	NC_016613	CTCTGG	2	12	130788	130799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375264141
39	NC_016613	ATCCGT	2	12	133485	133496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264142
40	NC_016613	GATTAA	2	12	136868	136879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375264147
41	NC_016613	AGAATT	2	12	139279	139290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375264148
42	NC_016613	TGAATC	2	12	147177	147188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264154
43	NC_016613	AATACC	2	12	149032	149043	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375264156
44	NC_016613	GTGTTT	2	12	149624	149635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375264157
45	NC_016613	GCTCAG	2	12	152607	152618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264161
46	NC_016613	GTAATA	2	12	156704	156715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375264166
47	NC_016613	CTTTGG	2	12	161608	161619	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375264171
48	NC_016613	TCACCG	2	12	162001	162012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	375264171
49	NC_016613	TAAGCT	2	12	168514	168525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264177
50	NC_016613	CTTTGT	2	12	172541	172552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264179
51	NC_016613	TTCCTG	2	12	177490	177501	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375264185
52	NC_016613	ACACCA	2	12	180354	180365	50 %	0 %	0 %	50 %	375264188
53	NC_016613	CCAGCG	2	12	180933	180944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375264188
54	NC_016613	ATCGCG	2	12	181991	182002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264188
55	NC_016613	TTCCTC	2	12	183930	183941	0 %	50 %	0 %	50 %	375264189
56	NC_016613	GATATT	2	12	183942	183953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375264189
57	NC_016613	GTATTG	2	12	185477	185488	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375264190
58	NC_016613	ACGCCC	2	12	186152	186163	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	375264191
59	NC_016613	CAACGT	2	12	188798	188809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264193
60	NC_016613	TGAAGA	2	12	194044	194055	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375264197
61	NC_016613	AGCGAG	2	12	198809	198820	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375264203
62	NC_016613	GAAGTC	2	12	202407	202418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264208
63	NC_016613	TAATGG	2	12	214538	214549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375264220
64	NC_016613	AGCAGA	3	18	221485	221502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375264226
65	NC_016613	TGTTTA	2	12	231707	231718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375264234
66	NC_016613	TGATAT	2	12	233459	233470	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375264236
67	NC_016613	TAGCTA	2	12	234638	234649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264237
68	NC_016613	ATGGTG	2	12	252415	252426	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	375264250
69	NC_016613	TCTTTT	2	12	260252	260263	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	375264257
70	NC_016613	GGTTTT	2	12	260410	260421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375264257
71	NC_016613	TTTATG	2	12	261724	261735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375264258
72	NC_016613	AATGCA	2	12	266634	266645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375264262
73	NC_016613	TGGGTA	2	12	267005	267016	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	375264262
74	NC_016613	TTGCAG	2	12	269938	269949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264265
75	NC_016613	CAGAAG	2	12	270502	270513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375264265
76	NC_016613	TTTGAC	2	12	278625	278636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264274
77	NC_016613	ATCTTC	2	12	282401	282412	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	375264279
78	NC_016613	GCTTGA	2	12	284624	284635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264281
79	NC_016613	CCACTT	2	12	284697	284708	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	375264281
80	NC_016613	CATCCA	2	12	287011	287022	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	375264283
81	NC_016613	CGTATC	2	12	289684	289695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264285
82	NC_016613	TGAAGT	2	12	291396	291407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375264288
83	NC_016613	AAAGGT	2	12	297272	297283	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375264301
84	NC_016613	GTCCAG	2	12	301133	301144	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264309
85	NC_016613	CGTGGT	2	12	302377	302388	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375264311
86	NC_016613	CAAAAG	2	12	303067	303078	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375264312
87	NC_016613	TGATAT	2	12	313330	313341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375264322
88	NC_016613	TTTGAT	2	12	322982	322993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375264332
89	NC_016613	TGGTTA	2	12	325405	325416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375264334
90	NC_016613	ATATTA	2	12	328895	328906	50 %	50 %	0 %	0 %	375264335
91	NC_016613	TTTGAC	2	12	336076	336087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264342
92	NC_016613	TCAACG	2	12	337379	337390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264343
93	NC_016613	GCTGCA	2	12	338936	338947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264345
94	NC_016613	CCATTT	2	12	342936	342947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	375264347
95	NC_016613	GCCCTT	2	12	343532	343543	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	375264348
96	NC_016613	GGTATC	2	12	348394	348405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264354
97	NC_016613	TAGCGA	2	12	350490	350501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264357
98	NC_016613	CAGCAT	2	12	352485	352496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264360
99	NC_016613	TGCTTC	2	12	353963	353974	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375264361
100	NC_016613	ATCGAC	2	12	355999	356010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264362
101	NC_016613	CTTCTG	2	12	359996	360007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375264366
102	NC_016613	TACCGA	2	12	360728	360739	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264366
103	NC_016613	GCCTTC	2	12	361858	361869	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	375264367
104	NC_016613	CTTCAC	2	12	362586	362597	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	375264368
105	NC_016613	AGCACT	2	12	364586	364597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264369
106	NC_016613	GTGGTT	2	12	372522	372533	0 %	50 %	50 %	0 %	375264374
107	NC_016613	GGTGAA	2	12	373182	373193	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375264375
108	NC_016613	TTCAGT	2	12	374559	374570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264376
109	NC_016613	GCGATC	2	12	375588	375599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264377
110	NC_016613	GTGGTT	2	12	377845	377856	0 %	50 %	50 %	0 %	375264378
111	NC_016613	GGTATC	2	12	378761	378772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264379
112	NC_016613	TTTGTG	2	12	378889	378900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375264379
113	NC_016613	CGTCTG	2	12	383430	383441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375264383
114	NC_016613	TCGTCT	2	12	383784	383795	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375264384
115	NC_016613	ATCGAT	2	12	386855	386866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264385
116	NC_016613	TTGCGC	2	12	388817	388828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375264386
117	NC_016613	GTTCAT	2	12	390096	390107	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264387
118	NC_016613	AGTAGG	2	12	394001	394012	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375264391
119	NC_016613	TCTTCG	2	12	397600	397611	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375264393
120	NC_016613	TCATCT	2	12	397633	397644	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	375264393
121	NC_016613	CAGTGC	2	12	404007	404018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264399
122	NC_016613	CTCGAT	2	12	404902	404913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264401
123	NC_016613	CAGTAC	2	12	414847	414858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264410
124	NC_016613	GCAGAC	2	12	417774	417785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375264412
125	NC_016613	ACTCAG	2	12	417859	417870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264412
126	NC_016613	ATGAAG	2	12	423122	423133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375264415
127	NC_016613	TAACCG	2	12	425938	425949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264419
128	NC_016613	CGATGA	2	12	427106	427117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375264419
129	NC_016613	TATCGT	2	12	428276	428287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375264420
130	NC_016613	AGCGAA	2	12	429645	429656	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375264420
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132	NC_016613	TTGAAT	2	12	434171	434182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375264424
133	NC_016613	CTGCTT	2	12	437061	437072	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375264428
134	NC_016613	TTACCG	2	12	437525	437536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264428
135	NC_016613	GTGTAC	2	12	439337	439348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375264431
136	NC_016613	TCACTT	2	12	440000	440011	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	375264432
137	NC_016613	AATTTG	2	12	440997	441008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375264433
138	NC_016613	GCAAAA	2	12	446325	446336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375264440
139	NC_016613	TTGTTC	2	12	452010	452021	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264443
140	NC_016613	GTGTTG	2	12	452498	452509	0 %	50 %	50 %	0 %	375264444
141	NC_016613	TGATGG	2	12	454629	454640	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	375264446
142	NC_016613	AACCAC	2	12	456099	456110	50 %	0 %	0 %	50 %	375264447
143	NC_016613	TTGCTT	2	12	458852	458863	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264449
144	NC_016613	AAGAGA	2	12	460595	460606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375264450
145	NC_016613	AGACAA	2	12	470083	470094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375264457
146	NC_016613	GCTAAT	2	12	472784	472795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264459
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150	NC_016613	TTTGCT	2	12	483744	483755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264467
151	NC_016613	TGCTTT	2	12	486583	486594	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264468
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153	NC_016613	TGTTTT	2	12	488733	488744	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	375264468
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156	NC_016613	AAGTTC	2	12	490562	490573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264469
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159	NC_016613	GTTGAT	2	12	498069	498080	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375264476
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179	NC_016613	TCACGT	2	12	564438	564449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264533
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200	NC_016613	GTGTTC	2	12	639026	639037	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375264595
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209	NC_016613	TCTTTT	2	12	673333	673344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	375264622
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211	NC_016613	CAATAG	2	12	676892	676903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375264626
212	NC_016613	ATGGTT	2	12	678912	678923	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375264628
213	NC_016613	CAGGTG	2	12	679665	679676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375264629
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215	NC_016613	AAGAGA	2	12	682628	682639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375264630
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217	NC_016613	GGGGCT	2	12	686290	686301	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	375264635
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219	NC_016613	GCTAAA	2	12	691852	691863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375264639
220	NC_016613	ATCGGC	2	12	692076	692087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375264639
221	NC_016613	AGCGTG	2	12	694556	694567	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375264640
222	NC_016613	CTTGTT	2	12	695335	695346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375264640
223	NC_016613	GACCAT	2	12	707548	707559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264649
224	NC_016613	GTAGGG	2	12	715669	715680	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	375264657
225	NC_016613	GCACCG	2	12	718747	718758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375264662
226	NC_016613	CATCAA	2	12	731310	731321	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375264673
227	NC_016613	TTTCTA	2	12	740672	740683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375264681
228	NC_016613	GAACAT	2	12	743122	743133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375264684
229	NC_016613	CTTTTA	2	12	751647	751658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375264691
230	NC_016613	GTATCC	2	12	752243	752254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264692
231	NC_016613	AGGCAG	2	12	752542	752553	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375264692
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233	NC_016613	AGCCAT	2	12	762906	762917	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375264701
234	NC_016613	TACCTG	2	12	765508	765519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375264704
235	NC_016613	CGATAT	2	12	773966	773977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375264709
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337	NC_016613	CGTTGC	2	12	1121617	1121628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375265013
338	NC_016613	ACGTGA	2	12	1123010	1123021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375265015
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340	NC_016613	TGAAGT	2	12	1137499	1137510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375265030
341	NC_016613	AGGGTT	2	12	1137661	1137672	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	375265030
342	NC_016613	GTTTAG	2	12	1140003	1140014	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375265032
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441	NC_016613	TGATTT	2	12	1525685	1525696	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375265387
442	NC_016613	TTCAAA	2	12	1530120	1530131	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	375265392
443	NC_016613	GACAAG	2	12	1539428	1539439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375265399
444	NC_016613	TCACTA	2	12	1547064	1547075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375265407
445	NC_016613	TGGGCT	2	12	1547163	1547174	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375265407
446	NC_016613	CTTCCT	2	12	1554582	1554593	0 %	50 %	0 %	50 %	375265415
447	NC_016613	TGCAGG	2	12	1568387	1568398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375265425
448	NC_016613	TGCTGA	2	12	1568660	1568671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375265425
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450	NC_016613	CGACTT	2	12	1571161	1571172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375265426
451	NC_016613	TTCGTG	2	12	1571612	1571623	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375265426
452	NC_016613	TCTTCG	2	12	1572044	1572055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375265427
453	NC_016613	TTCAAC	2	12	1572253	1572264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375265427
454	NC_016613	CGATGA	2	12	1580583	1580594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375265434
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457	NC_016613	TGATCG	2	12	1584637	1584648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375265437
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