MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Tannerella forsythia ATCC 43037 chromosome

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016610	TTCATA	2	12	48474	48485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016610	AAATCA	2	12	64392	64403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016610	TGTTGG	2	12	113965	113976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016610	CTATTT	2	12	121364	121375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016610	CAGCGC	2	12	179562	179573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016610	TATTCT	2	12	180074	180085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016610	AAAGCC	2	12	228786	228797	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016610	TGAAGT	2	12	231590	231601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016610	GCAAAA	2	12	278616	278627	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016610	AGCAAC	2	12	294451	294462	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016610	AGAAAA	2	12	309510	309521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016610	TTTAAT	2	12	348936	348947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016610	TAAATA	2	12	364161	364172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016610	ACAGCA	2	12	375487	375498	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016610	CCTCAC	2	12	379663	379674	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016610	ATGGCA	2	12	380625	380636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016610	AAAAGT	2	12	387181	387192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016610	TAAATA	2	12	391999	392010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016610	GCATAA	2	12	427943	427954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016610	TAAAAT	2	12	510254	510265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016610	TTATTT	2	12	522450	522461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016610	GCCTTC	2	12	540258	540269	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016610	AGAAAA	2	12	555273	555284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016610	TTCCTC	2	12	569152	569163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016610	CTTTTC	2	12	625482	625493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016610	TTTTCC	2	12	625769	625780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016610	TTTTCC	2	12	629018	629029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016610	AAATAT	2	12	655666	655677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016610	TTGTTT	2	12	657932	657943	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016610	ATTGAA	2	12	680165	680176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016610	TCGCTT	2	12	688258	688269	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016610	ACATCT	2	12	727722	727733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016610	TATTTT	2	12	731482	731493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016610	AGCATT	2	12	750104	750115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016610	CAGATT	2	12	804252	804263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016610	AAAAAG	2	12	804699	804710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016610	TTTACA	2	12	806405	806416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016610	AAAATC	2	12	829612	829623	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016610	GTTTCT	2	12	862738	862749	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016610	AGGCAG	2	12	911959	911970	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016610	GAGGAA	2	12	915278	915289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016610	AAAATA	2	12	919148	919159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016610	AGCGAA	2	12	920913	920924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016610	AACACA	2	12	959758	959769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016610	GTATCC	2	12	967753	967764	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016610	GAACCG	2	12	969099	969110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016610	ACAGGA	2	12	1037726	1037737	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016610	TAAAAA	2	12	1045217	1045228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016610	ATGAAT	2	12	1058353	1058364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016610	TGCTTC	2	12	1066870	1066881	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016610	CTTTTT	2	12	1075447	1075458	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016610	TTAGAA	2	12	1105144	1105155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016610	ATTTTA	2	12	1105419	1105430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016610	GCAACA	2	12	1107345	1107356	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016610	ACATTC	2	12	1114152	1114163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016610	AAATAT	2	12	1118568	1118579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016610	TACAAC	2	12	1146656	1146667	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016610	ATCTAT	2	12	1176298	1176309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016610	ATATGA	2	12	1176330	1176341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016610	CGTATT	2	12	1208138	1208149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016610	GATTGA	2	12	1238938	1238949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016610	TTTTTG	2	12	1263789	1263800	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016610	TTCCTC	2	12	1268385	1268396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016610	TTTCAG	2	12	1294478	1294489	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016610	GAAAAT	2	12	1295113	1295124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016610	GGTTCA	2	12	1298775	1298786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016610	TCCGCT	2	12	1302707	1302718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016610	GAATGA	2	12	1346885	1346896	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016610	TCCGGC	2	12	1371808	1371819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016610	GAAAAA	2	12	1447657	1447668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016610	CCAAAC	2	12	1451983	1451994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016610	TTGCAT	2	12	1525545	1525556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016610	TTGCAT	2	12	1528914	1528925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016610	AAGGAT	2	12	1552025	1552036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016610	TTAAAT	2	12	1571759	1571770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016610	CGTCTT	2	12	1578431	1578442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016610	CGGAAA	2	12	1586517	1586528	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016610	TAAAAA	2	12	1586720	1586731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016610	GATTTT	2	12	1586840	1586851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016610	TATGAT	2	12	1624303	1624314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016610	CTCATT	2	12	1646505	1646516	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016610	AGGAAG	2	12	1650434	1650445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016610	GAGCAA	2	12	1700070	1700081	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016610	ATTCAC	2	12	1739506	1739517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016610	ATAAGG	2	12	1758903	1758914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016610	AACCGA	2	12	1759291	1759302	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016610	AATATT	2	12	1759913	1759924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016610	AATGAT	2	12	1759928	1759939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016610	ATTTTT	2	12	1812028	1812039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016610	TGAGAA	2	12	1820349	1820360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016610	AAATTC	2	12	1838702	1838713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016610	AGCGAA	2	12	1850417	1850428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016610	AATCAA	2	12	1906932	1906943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016610	TCCCCC	2	12	1929824	1929835	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_016610	AGGAAA	2	12	1930021	1930032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016610	AAATAT	2	12	1986961	1986972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016610	GTCTTG	2	12	1986975	1986986	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016610	ATCGAA	2	12	2000561	2000572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016610	TCAAGG	2	12	2032000	2032011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016610	TTCGCT	2	12	2040001	2040012	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016610	GCTATC	2	12	2096229	2096240	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016610	TAAATG	2	12	2100375	2100386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016610	TTTTTA	2	12	2101677	2101688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016610	GTTTTG	2	12	2115873	2115884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016610	TGAAAG	2	12	2132393	2132404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016610	GCTTTT	2	12	2139889	2139900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016610	AAACGA	2	12	2197932	2197943	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016610	AGAAAA	2	12	2197996	2198007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016610	TGCGTT	2	12	2335047	2335058	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016610	TTGATA	2	12	2388850	2388861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016610	AAATTT	2	12	2401351	2401362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016610	AATTTA	2	12	2468471	2468482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016610	AATTGA	2	12	2511301	2511312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016610	TATTTG	2	12	2519422	2519433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016610	TATATT	2	12	2543895	2543906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016610	TAAAAA	2	12	2543914	2543925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016610	AAACTT	2	12	2553078	2553089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016610	GTGCTT	2	12	2618142	2618153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016610	TCTGCT	2	12	2618230	2618241	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016610	TACGAA	2	12	2620061	2620072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016610	ATCCTG	2	12	2620624	2620635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016610	ATGAGG	2	12	2624135	2624146	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016610	ATTGCT	2	12	2626387	2626398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016610	TAACGC	2	12	2656444	2656455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016610	TTATAT	2	12	2676519	2676530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016610	CCATAT	2	12	2683166	2683177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016610	TTCCTC	2	12	2695469	2695480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016610	GGGAGA	2	12	2699465	2699476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016610	GGAGAT	2	12	2702527	2702538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016610	TCCGTC	2	12	2712504	2712515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016610	TTTTAT	2	12	2722584	2722595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016610	AGCAGG	2	12	2733475	2733486	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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135	NC_016610	TATAAA	2	12	2821910	2821921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_016610	TAATTT	2	12	2885780	2885791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_016610	TTTAAA	2	12	2931550	2931561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016610	TCTTTT	2	12	2937966	2937977	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.