MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Tannerella forsythia ATCC 43037 chromosome

Total Repeats: 42949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016610	AGA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016610	TTG	2	6	273	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016610	AGA	2	6	296	301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016610	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016610	AAT	2	6	488	493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016610	ATT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016610	ATT	2	6	573	578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253815
8	NC_016610	TTC	2	6	813	818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253815
9	NC_016610	CTC	2	6	860	865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253815
10	NC_016610	CGC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253815
11	NC_016610	TTC	2	6	973	978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253815
12	NC_016610	CAA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253815
13	NC_016610	AAC	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253815
14	NC_016610	GTT	2	6	1056	1061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253815
15	NC_016610	TAT	2	6	1148	1153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253815
16	NC_016610	TGG	2	6	1274	1279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375253815
17	NC_016610	GCA	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253815
18	NC_016610	CAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253815
19	NC_016610	AAC	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253815
20	NC_016610	TAA	2	6	1476	1481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375253815
21	NC_016610	TTA	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253815
22	NC_016610	ACA	2	6	1604	1609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253815
23	NC_016610	GAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253815
24	NC_016610	GGA	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375253815
25	NC_016610	GTT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253815
26	NC_016610	CCG	2	6	2033	2038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253816
27	NC_016610	AGC	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253816
28	NC_016610	CCA	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375253816
29	NC_016610	TAA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375253816
30	NC_016610	CCA	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375253816
31	NC_016610	TAG	2	6	2368	2373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375253816
32	NC_016610	CTT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253816
33	NC_016610	ATC	2	6	2472	2477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253816
34	NC_016610	GCA	3	9	2522	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253816
35	NC_016610	GTC	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253816
36	NC_016610	ATC	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253816
37	NC_016610	TTG	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253816
38	NC_016610	CCG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253816
39	NC_016610	TTC	2	6	2712	2717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253816
40	NC_016610	CTT	3	9	2768	2776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253816
41	NC_016610	AAG	2	6	2814	2819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253816
42	NC_016610	TCG	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253816
43	NC_016610	CGA	2	6	2962	2967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253816
44	NC_016610	CGT	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253816
45	NC_016610	ATC	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253816
46	NC_016610	CAG	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253816
47	NC_016610	AAC	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253816
48	NC_016610	ATA	2	6	3465	3470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375253816
49	NC_016610	TTG	2	6	3702	3707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253816
50	NC_016610	CGC	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253816
51	NC_016610	AAC	2	6	3919	3924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253816
52	NC_016610	GAC	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253816
53	NC_016610	ACA	3	9	4277	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253816
54	NC_016610	CAA	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253816
55	NC_016610	AAC	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253816
56	NC_016610	TTC	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016610	TTC	2	6	4397	4402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016610	CAA	2	6	4576	4581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016610	TCC	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016610	ATA	2	6	4782	4787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375253817
61	NC_016610	ACG	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253817
62	NC_016610	TTA	2	6	4816	4821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253817
63	NC_016610	CTT	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253817
64	NC_016610	CTG	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253817
65	NC_016610	CTT	2	6	4976	4981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253817
66	NC_016610	CGC	2	6	5009	5014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253817
67	NC_016610	ATT	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016610	GTT	2	6	5285	5290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016610	TTG	2	6	5388	5393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253818
70	NC_016610	TGC	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253818
71	NC_016610	ACA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253818
72	NC_016610	ATG	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375253818
73	NC_016610	TCT	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253818
74	NC_016610	CAT	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253818
75	NC_016610	CGC	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253818
76	NC_016610	GGC	2	6	6170	6175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375253818
77	NC_016610	CTG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253818
78	NC_016610	AGA	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
79	NC_016610	ACA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253818
80	NC_016610	AGC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253818
81	NC_016610	AAG	2	6	6400	6405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
82	NC_016610	AGC	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253818
83	NC_016610	GAA	2	6	6543	6548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
84	NC_016610	TTA	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253818
85	NC_016610	GAA	2	6	6645	6650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
86	NC_016610	ATG	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375253818
87	NC_016610	CGC	2	6	6818	6823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253818
88	NC_016610	CGG	2	6	6965	6970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375253818
89	NC_016610	CGA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253818
90	NC_016610	GTT	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253818
91	NC_016610	ATC	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253818
92	NC_016610	AAG	2	6	7123	7128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
93	NC_016610	AAG	2	6	7138	7143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
94	NC_016610	ACG	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253818
95	NC_016610	TGT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253818
96	NC_016610	TCC	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253818
97	NC_016610	GAA	2	6	7586	7591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
98	NC_016610	ATC	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253818
99	NC_016610	GTT	2	6	7737	7742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253818
100	NC_016610	AGC	2	6	7744	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253818
101	NC_016610	TTC	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253818
102	NC_016610	AGC	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253818
103	NC_016610	CTG	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253818
104	NC_016610	TGG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375253818
105	NC_016610	GGC	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375253818
106	NC_016610	GCC	2	6	8086	8091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253818
107	NC_016610	AGA	3	9	8338	8346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253818
108	NC_016610	AGA	2	6	8557	8562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253819
109	NC_016610	ATT	3	9	8609	8617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016610	AAT	2	6	8646	8651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016610	TGA	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016610	CTG	2	6	8837	8842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253820
113	NC_016610	GGA	2	6	8843	8848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375253820
114	NC_016610	ATC	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253820
115	NC_016610	GAT	2	6	9037	9042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375253820
116	NC_016610	AGC	2	6	9127	9132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253820
117	NC_016610	ACG	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253820
118	NC_016610	AAC	2	6	9387	9392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375253820
119	NC_016610	GCA	2	6	9412	9417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253820
120	NC_016610	ATC	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253820
121	NC_016610	CGG	2	6	9716	9721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375253821
122	NC_016610	GCA	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253821
123	NC_016610	GCT	2	6	10197	10202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253821
124	NC_016610	TCC	2	6	10330	10335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253821
125	NC_016610	TCG	2	6	10463	10468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253821
126	NC_016610	GAA	2	6	10512	10517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253821
127	NC_016610	AAG	2	6	10667	10672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253821
128	NC_016610	TCG	2	6	10697	10702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253821
129	NC_016610	AGC	2	6	10736	10741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253821
130	NC_016610	GAA	2	6	10753	10758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253821
131	NC_016610	TCC	2	6	10786	10791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253821
132	NC_016610	CCG	2	6	10850	10855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253821
133	NC_016610	TGT	2	6	10865	10870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253821
134	NC_016610	CCT	2	6	10934	10939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253821
135	NC_016610	ATA	2	6	10943	10948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375253821
136	NC_016610	CGT	2	6	10953	10958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253821
137	NC_016610	GAT	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016610	CCG	2	6	11043	11048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375253822
139	NC_016610	TCA	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253822
140	NC_016610	TTC	2	6	11169	11174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253822
141	NC_016610	ATC	2	6	11175	11180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253822
142	NC_016610	CGA	2	6	11441	11446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253822
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144	NC_016610	CTA	2	6	11631	11636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253822
145	NC_016610	CTT	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253822
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147	NC_016610	TTC	2	6	12174	12179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253822
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150	NC_016610	TAA	2	6	12264	12269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016610	CCT	2	6	12319	12324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_016610	TCC	2	6	12515	12520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253823
153	NC_016610	ACG	2	6	12526	12531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253823
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219	NC_016610	AGA	2	6	18725	18730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_016610	GAA	3	9	21324	21332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253829
256	NC_016610	AGG	2	6	21338	21343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375253829
257	NC_016610	AAG	2	6	21350	21355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253829
258	NC_016610	TGA	2	6	21431	21436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375253829
259	NC_016610	CGA	2	6	21477	21482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253829
260	NC_016610	TGC	2	6	21530	21535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253829
261	NC_016610	CTT	2	6	21735	21740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253829
262	NC_016610	ATC	2	6	21885	21890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253829
263	NC_016610	ACG	2	6	21925	21930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253829
264	NC_016610	TTC	2	6	22037	22042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_016610	ACA	2	6	22050	22055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_016610	TTC	2	6	22078	22083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253830
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270	NC_016610	CTT	2	6	22416	22421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253830
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283	NC_016610	ATG	2	6	23336	23341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016610	AGA	2	6	23435	23440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253831
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286	NC_016610	ATT	2	6	23591	23596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253831
287	NC_016610	GAA	2	6	23619	23624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253831
288	NC_016610	TTC	2	6	23663	23668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253831
289	NC_016610	TGC	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253831
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292	NC_016610	ATT	2	6	24094	24099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253832
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295	NC_016610	CTG	2	6	24372	24377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253832
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363	NC_016610	TCT	2	6	30049	30054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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365	NC_016610	ATT	2	6	30104	30109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
366	NC_016610	GAA	2	6	30333	30338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
367	NC_016610	AGA	2	6	30342	30347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
368	NC_016610	CTT	2	6	30406	30411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
369	NC_016610	GGT	2	6	30474	30479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375253837
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371	NC_016610	TCG	2	6	30814	30819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253837
372	NC_016610	GAA	2	6	30843	30848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375253837
373	NC_016610	AGA	2	6	30968	30973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
374	NC_016610	AAT	2	6	31032	31037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_016610	TGA	2	6	31110	31115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
376	NC_016610	CCG	2	6	31121	31126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
377	NC_016610	TAT	3	9	31181	31189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_016610	ATG	2	6	31199	31204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
379	NC_016610	TGC	2	6	31231	31236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
380	NC_016610	GCA	2	6	31340	31345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253838
381	NC_016610	GGA	2	6	31352	31357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375253838
382	NC_016610	GGC	2	6	31439	31444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375253838
383	NC_016610	TTG	2	6	31640	31645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253838
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462	NC_016610	TCT	3	9	37111	37119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253841
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464	NC_016610	ATT	2	6	37278	37283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_016610	ATA	2	6	39441	39446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375253843
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489	NC_016610	CCA	2	6	39709	39714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375253843
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491	NC_016610	TGT	2	6	39764	39769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375253843
492	NC_016610	TCC	2	6	39774	39779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375253843
493	NC_016610	TAT	2	6	39821	39826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375253843
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496	NC_016610	CGT	2	6	40029	40034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375253843
497	NC_016610	ACG	2	6	40683	40688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375253843
498	NC_016610	TCT	2	6	40708	40713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375253843
499	NC_016610	TCA	2	6	40975	40980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375253843
500	NC_016610	GAT	2	6	40998	41003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375253843

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