MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Niastella koreensis GR20-10 chromosome

Total Repeats: 109811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016609	ATA	2	6	186	191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143367
2	NC_016609	TTG	2	6	199	204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143367
3	NC_016609	AAG	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143367
4	NC_016609	TCA	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143367
5	NC_016609	ATC	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143367
6	NC_016609	GAC	2	6	867	872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143367
7	NC_016609	CTT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143367
8	NC_016609	ACC	2	6	928	933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375143367
9	NC_016609	ACC	2	6	974	979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375143367
10	NC_016609	GTT	2	6	1007	1012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143367
11	NC_016609	GAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143367
12	NC_016609	AGT	2	6	1124	1129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143367
13	NC_016609	ATT	2	6	1190	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143367
14	NC_016609	TCC	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375143367
15	NC_016609	AGC	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143367
16	NC_016609	GGT	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143367
17	NC_016609	GCC	2	6	1566	1571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375143367
18	NC_016609	ATC	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143368
19	NC_016609	ATG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143369
20	NC_016609	CTC	2	6	3625	3630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375143369
21	NC_016609	TTC	2	6	3674	3679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143369
22	NC_016609	ATT	2	6	3775	3780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143369
23	NC_016609	ATA	3	9	4054	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143370
24	NC_016609	ACA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375143370
25	NC_016609	GTG	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143370
26	NC_016609	CCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375143370
27	NC_016609	TAA	4	12	4523	4534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143370
28	NC_016609	GGC	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375143370
29	NC_016609	TTC	2	6	4614	4619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143370
30	NC_016609	CTA	2	6	4672	4677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143370
31	NC_016609	ATT	2	6	4714	4719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143370
32	NC_016609	CTA	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143370
33	NC_016609	GGT	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143370
34	NC_016609	ATT	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143370
35	NC_016609	AGC	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143370
36	NC_016609	ATT	2	6	4922	4927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143370
37	NC_016609	GAA	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143370
38	NC_016609	GCG	2	6	4968	4973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375143370
39	NC_016609	CAC	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375143370
40	NC_016609	TGC	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143370
41	NC_016609	CAC	2	6	5189	5194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375143370
42	NC_016609	CAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375143370
43	NC_016609	TAT	3	9	5220	5228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143370
44	NC_016609	AAG	3	9	5436	5444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143370
45	NC_016609	ATG	3	9	5476	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143370
46	NC_016609	ATG	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143370
47	NC_016609	AAG	2	6	5656	5661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143370
48	NC_016609	GAT	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143370
49	NC_016609	GAC	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143370
50	NC_016609	AGT	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143370
51	NC_016609	ATA	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143370
52	NC_016609	GCT	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143370
53	NC_016609	TAA	3	9	6176	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143370
54	NC_016609	AGA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143370
55	NC_016609	AGA	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143370
56	NC_016609	ATT	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143371
57	NC_016609	ATT	2	6	6636	6641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143371
58	NC_016609	GAA	2	6	6680	6685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143371
59	NC_016609	GAT	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143371
60	NC_016609	TAA	2	6	6750	6755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143371
61	NC_016609	TTC	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143372
62	NC_016609	TTG	2	6	7111	7116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143372
63	NC_016609	TGA	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143372
64	NC_016609	GCT	2	6	7131	7136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143372
65	NC_016609	AGA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143372
66	NC_016609	GTG	3	9	7231	7239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143372
67	NC_016609	AAT	2	6	7254	7259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143372
68	NC_016609	TTG	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143373
69	NC_016609	CAT	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143373
70	NC_016609	CAT	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143373
71	NC_016609	TAA	3	9	7558	7566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143373
72	NC_016609	TGC	2	6	7697	7702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143374
73	NC_016609	TTG	2	6	7796	7801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143374
74	NC_016609	CTG	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143374
75	NC_016609	TAA	2	6	7974	7979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143374
76	NC_016609	CTT	2	6	8034	8039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143374
77	NC_016609	TTA	2	6	8414	8419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143375
78	NC_016609	TTA	3	9	8446	8454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143375
79	NC_016609	ATA	3	9	8619	8627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143375
80	NC_016609	TCT	2	6	8723	8728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143375
81	NC_016609	TAA	2	6	8788	8793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143375
82	NC_016609	TGT	2	6	8894	8899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143375
83	NC_016609	TGC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143375
84	NC_016609	GTT	2	6	9075	9080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143375
85	NC_016609	TTG	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143375
86	NC_016609	TAT	2	6	9096	9101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143375
87	NC_016609	TAC	2	6	9211	9216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143375
88	NC_016609	AAT	2	6	9349	9354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143376
89	NC_016609	CTG	2	6	9454	9459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143376
90	NC_016609	TTG	2	6	9462	9467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143376
91	NC_016609	GCC	2	6	9948	9953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375143377
92	NC_016609	ACC	2	6	9954	9959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375143377
93	NC_016609	GGA	2	6	10022	10027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375143377
94	NC_016609	AAG	2	6	10093	10098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143377
95	NC_016609	TAT	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143377
96	NC_016609	GAA	2	6	10113	10118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143377
97	NC_016609	TGG	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143377
98	NC_016609	GTT	2	6	10242	10247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143377
99	NC_016609	GAA	3	9	10269	10277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143377
100	NC_016609	AGA	3	9	10355	10363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375143377
101	NC_016609	GCA	2	6	10711	10716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143378
102	NC_016609	TTA	2	6	10718	10723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143378
103	NC_016609	AAC	2	6	10787	10792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375143378
104	NC_016609	TGA	2	6	10813	10818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143378
105	NC_016609	TGT	2	6	10938	10943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143378
106	NC_016609	GCT	2	6	11024	11029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143378
107	NC_016609	ATA	3	9	11139	11147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143378
108	NC_016609	CAG	2	6	11161	11166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143378
109	NC_016609	CTG	2	6	11214	11219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143378
110	NC_016609	TTA	2	6	11251	11256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143378
111	NC_016609	TAT	2	6	11329	11334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143378
112	NC_016609	TGT	2	6	11344	11349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143378
113	NC_016609	ATA	2	6	11382	11387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143378
114	NC_016609	ATT	2	6	11391	11396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143378
115	NC_016609	GTA	2	6	11400	11405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143378
116	NC_016609	ATG	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375143378
117	NC_016609	CCA	2	6	11496	11501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375143378
118	NC_016609	GGT	2	6	11522	11527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143378
119	NC_016609	TGT	2	6	11533	11538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143378
120	NC_016609	TGC	2	6	11596	11601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143378
121	NC_016609	TTG	2	6	11616	11621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375143378
122	NC_016609	ATT	2	6	11791	11796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143378
123	NC_016609	ATA	2	6	11854	11859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143379
124	NC_016609	TGG	3	9	11869	11877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375143379
125	NC_016609	CAT	2	6	11886	11891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143379
126	NC_016609	ATT	2	6	11911	11916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375143379
127	NC_016609	GAC	2	6	11922	11927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143379
128	NC_016609	GGC	2	6	12013	12018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375143379
129	NC_016609	TCT	2	6	12114	12119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375143379
130	NC_016609	TAA	2	6	12128	12133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143379
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250	NC_016609	GCG	2	6	21609	21614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375143392
251	NC_016609	AAT	2	6	21902	21907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375143393
252	NC_016609	ACG	2	6	22140	22145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375143393
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255	NC_016609	CTG	2	6	22376	22381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375143393
256	NC_016609	TAC	2	6	22450	22455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375143393
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