MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-5

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016608	AAGAAA	2	12	458	469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	377808758
2	NC_016608	AAGTTA	2	12	2889	2900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016608	CAATCA	2	12	9601	9612	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	377808770
4	NC_016608	GAGAAA	2	12	12811	12822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808773
5	NC_016608	TAAAGC	2	12	15425	15436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	377808776
6	NC_016608	GTACGA	2	12	18039	18050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377808779
7	NC_016608	TCGAAC	2	12	18464	18475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377808779
8	NC_016608	TTTTGA	2	12	18915	18926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	377808779
9	NC_016608	GTTATC	2	12	19603	19614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377808781
10	NC_016608	TAAGTC	2	12	21741	21752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377808783
11	NC_016608	TGTACT	2	12	21936	21947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377808783
12	NC_016608	AACGGT	2	12	23634	23645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377808785
13	NC_016608	TAATTA	2	12	31243	31254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016608	GATTTT	2	12	31794	31805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	377808789
15	NC_016608	ATCAAT	2	12	33523	33534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.