MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-5

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016608	ATTT	2	8	363	370	25 %	75 %	0 %	0 %	377808758
2	NC_016608	ATCA	2	8	437	444	50 %	25 %	0 %	25 %	377808758
3	NC_016608	TAAG	2	8	2051	2058	50 %	25 %	25 %	0 %	377808760
4	NC_016608	AAAG	2	8	2161	2168	75 %	0 %	25 %	0 %	377808760
5	NC_016608	AAAG	2	8	3033	3040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016608	TGAC	2	8	3045	3052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016608	AAAG	2	8	3271	3278	75 %	0 %	25 %	0 %	377808763
8	NC_016608	AGAA	2	8	3351	3358	75 %	0 %	25 %	0 %	377808763
9	NC_016608	TGGT	2	8	3584	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	377808763
10	NC_016608	GAAA	2	8	3764	3771	75 %	0 %	25 %	0 %	377808763
11	NC_016608	TTAA	2	8	3995	4002	50 %	50 %	0 %	0 %	377808763
12	NC_016608	CTCA	2	8	4060	4067	25 %	25 %	0 %	50 %	377808763
13	NC_016608	TAAA	2	8	4086	4093	75 %	25 %	0 %	0 %	377808763
14	NC_016608	AATT	2	8	4167	4174	50 %	50 %	0 %	0 %	377808763
15	NC_016608	AACA	2	8	4191	4198	75 %	0 %	0 %	25 %	377808763
16	NC_016608	AACG	2	8	4220	4227	50 %	0 %	25 %	25 %	377808763
17	NC_016608	GCAA	2	8	4642	4649	50 %	0 %	25 %	25 %	377808763
18	NC_016608	TTAT	2	8	4696	4703	25 %	75 %	0 %	0 %	377808763
19	NC_016608	AAAG	2	8	5176	5183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016608	CAAA	3	12	5200	5211	75 %	0 %	0 %	25 %	377808764
21	NC_016608	CAAG	2	8	5229	5236	50 %	0 %	25 %	25 %	377808764
22	NC_016608	GATT	2	8	5515	5522	25 %	50 %	25 %	0 %	377808764
23	NC_016608	GACC	2	8	5727	5734	25 %	0 %	25 %	50 %	377808765
24	NC_016608	GTGA	2	8	5803	5810	25 %	25 %	50 %	0 %	377808765
25	NC_016608	GCAG	2	8	6099	6106	25 %	0 %	50 %	25 %	377808765
26	NC_016608	AGGA	2	8	6139	6146	50 %	0 %	50 %	0 %	377808765
27	NC_016608	ATTT	2	8	6206	6213	25 %	75 %	0 %	0 %	377808766
28	NC_016608	AAGC	2	8	6265	6272	50 %	0 %	25 %	25 %	377808766
29	NC_016608	TATT	2	8	6345	6352	25 %	75 %	0 %	0 %	377808766
30	NC_016608	TTTA	2	8	6812	6819	25 %	75 %	0 %	0 %	377808767
31	NC_016608	GTAT	2	8	6960	6967	25 %	50 %	25 %	0 %	377808768
32	NC_016608	CCAA	2	8	7552	7559	50 %	0 %	0 %	50 %	377808769
33	NC_016608	GAAA	2	8	7560	7567	75 %	0 %	25 %	0 %	377808769
34	NC_016608	TGAT	2	8	7631	7638	25 %	50 %	25 %	0 %	377808769
35	NC_016608	CTAC	2	8	7685	7692	25 %	25 %	0 %	50 %	377808769
36	NC_016608	TTGT	2	8	9019	9026	0 %	75 %	25 %	0 %	377808769
37	NC_016608	TGAG	2	8	9630	9637	25 %	25 %	50 %	0 %	377808770
38	NC_016608	TTTG	2	8	9969	9976	0 %	75 %	25 %	0 %	377808770
39	NC_016608	GGCA	2	8	10131	10138	25 %	0 %	50 %	25 %	377808770
40	NC_016608	GAAA	2	8	10241	10248	75 %	0 %	25 %	0 %	377808770
41	NC_016608	CAAG	2	8	10530	10537	50 %	0 %	25 %	25 %	377808770
42	NC_016608	ACCC	2	8	11684	11691	25 %	0 %	0 %	75 %	377808771
43	NC_016608	CCAA	2	8	12271	12278	50 %	0 %	0 %	50 %	377808772
44	NC_016608	ATTA	2	8	13301	13308	50 %	50 %	0 %	0 %	377808774
45	NC_016608	ATTT	2	8	13338	13345	25 %	75 %	0 %	0 %	377808774
46	NC_016608	AGCA	2	8	13362	13369	50 %	0 %	25 %	25 %	377808774
47	NC_016608	GGCG	2	8	14004	14011	0 %	0 %	75 %	25 %	377808775
48	NC_016608	AGCC	2	8	14901	14908	25 %	0 %	25 %	50 %	377808775
49	NC_016608	CAGT	2	8	15331	15338	25 %	25 %	25 %	25 %	377808776
50	NC_016608	AATA	2	8	15437	15444	75 %	25 %	0 %	0 %	377808776
51	NC_016608	GATA	2	8	15499	15506	50 %	25 %	25 %	0 %	377808776
52	NC_016608	TGTT	2	8	15507	15514	0 %	75 %	25 %	0 %	377808777
53	NC_016608	TTAG	2	8	16486	16493	25 %	50 %	25 %	0 %	377808778
54	NC_016608	TGAA	2	8	16786	16793	50 %	25 %	25 %	0 %	377808778
55	NC_016608	GCCA	2	8	17710	17717	25 %	0 %	25 %	50 %	377808779
56	NC_016608	ATTA	2	8	18267	18274	50 %	50 %	0 %	0 %	377808779
57	NC_016608	ATTG	2	8	18591	18598	25 %	50 %	25 %	0 %	377808779
58	NC_016608	ATCA	2	8	18646	18653	50 %	25 %	0 %	25 %	377808779
59	NC_016608	TAAA	2	8	18713	18720	75 %	25 %	0 %	0 %	377808779
60	NC_016608	AGCA	2	8	20233	20240	50 %	0 %	25 %	25 %	377808781
61	NC_016608	CAGA	2	8	20925	20932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016608	TTTG	2	8	21094	21101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016608	TTGA	2	8	21159	21166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016608	CTTT	2	8	21865	21872	0 %	75 %	0 %	25 %	377808783
65	NC_016608	TTGT	2	8	22098	22105	0 %	75 %	25 %	0 %	377808783
66	NC_016608	GGTA	2	8	22123	22130	25 %	25 %	50 %	0 %	377808783
67	NC_016608	GTCA	2	8	22395	22402	25 %	25 %	25 %	25 %	377808783
68	NC_016608	TCGA	2	8	22751	22758	25 %	25 %	25 %	25 %	377808783
69	NC_016608	CTAA	2	8	22795	22802	50 %	25 %	0 %	25 %	377808783
70	NC_016608	GATG	2	8	23083	23090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016608	CAAC	2	8	23264	23271	50 %	0 %	0 %	50 %	377808784
72	NC_016608	CTAT	2	8	23557	23564	25 %	50 %	0 %	25 %	377808785
73	NC_016608	TGGT	2	8	23565	23572	0 %	50 %	50 %	0 %	377808785
74	NC_016608	ATTT	2	8	24041	24048	25 %	75 %	0 %	0 %	377808785
75	NC_016608	TTTA	2	8	24074	24081	25 %	75 %	0 %	0 %	377808785
76	NC_016608	TTAT	2	8	24165	24172	25 %	75 %	0 %	0 %	377808785
77	NC_016608	TTAA	2	8	24415	24422	50 %	50 %	0 %	0 %	377808785
78	NC_016608	ACTT	2	8	24694	24701	25 %	50 %	0 %	25 %	377808785
79	NC_016608	AATG	2	8	24991	24998	50 %	25 %	25 %	0 %	377808786
80	NC_016608	CTGG	2	8	25058	25065	0 %	25 %	50 %	25 %	377808786
81	NC_016608	AACT	2	8	25326	25333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016608	CTCA	2	8	25752	25759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016608	AACG	2	8	25780	25787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016608	ATTA	2	8	25836	25843	50 %	50 %	0 %	0 %	377808787
85	NC_016608	AGAA	2	8	26142	26149	75 %	0 %	25 %	0 %	377808787
86	NC_016608	TTGT	2	8	26178	26185	0 %	75 %	25 %	0 %	377808787
87	NC_016608	AACT	2	8	26405	26412	50 %	25 %	0 %	25 %	377808787
88	NC_016608	TTGG	2	8	27280	27287	0 %	50 %	50 %	0 %	377808788
89	NC_016608	TGGT	2	8	27299	27306	0 %	50 %	50 %	0 %	377808788
90	NC_016608	TCCA	2	8	29918	29925	25 %	25 %	0 %	50 %	377808788
91	NC_016608	TGCT	2	8	30628	30635	0 %	50 %	25 %	25 %	377808788
92	NC_016608	TTTC	2	8	31191	31198	0 %	75 %	0 %	25 %	377808788
93	NC_016608	ATTC	2	8	31623	31630	25 %	50 %	0 %	25 %	377808789
94	NC_016608	GACA	2	8	31706	31713	50 %	0 %	25 %	25 %	377808789
95	NC_016608	TAGG	2	8	32827	32834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016608	TTAG	2	8	33551	33558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016608	TTGA	2	8	34409	34416	25 %	50 %	25 %	0 %	377808790
98	NC_016608	TTTA	2	8	34761	34768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016608	TGAC	2	8	35164	35171	25 %	25 %	25 %	25 %	377808791
100	NC_016608	TAGC	2	8	35524	35531	25 %	25 %	25 %	25 %	377808791
101	NC_016608	TAAG	2	8	35612	35619	50 %	25 %	25 %	0 %	377808791
102	NC_016608	AAGA	2	8	35707	35714	75 %	0 %	25 %	0 %	377808792
103	NC_016608	AATT	2	8	35893	35900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016608	ATTT	2	8	35918	35925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016608	TAAT	2	8	35929	35936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016608	GGTA	2	8	35987	35994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.