MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016607	TACA	2	8	157	164	50 %	25 %	0 %	25 %	381184518
2	NC_016607	AAAG	2	8	221	228	75 %	0 %	25 %	0 %	381184518
3	NC_016607	ATTT	2	8	508	515	25 %	75 %	0 %	0 %	381184518
4	NC_016607	TGGC	2	8	1178	1185	0 %	25 %	50 %	25 %	381184518
5	NC_016607	AATG	2	8	1230	1237	50 %	25 %	25 %	0 %	381184518
6	NC_016607	AACC	2	8	1404	1411	50 %	0 %	0 %	50 %	381184518
7	NC_016607	CCAG	2	8	1813	1820	25 %	0 %	25 %	50 %	381184519
8	NC_016607	TGTC	2	8	2208	2215	0 %	50 %	25 %	25 %	381184519
9	NC_016607	TAAA	2	8	2345	2352	75 %	25 %	0 %	0 %	381184520
10	NC_016607	AAGT	2	8	3020	3027	50 %	25 %	25 %	0 %	381184520
11	NC_016607	TTCA	2	8	3511	3518	25 %	50 %	0 %	25 %	381184520
12	NC_016607	TAAA	2	8	5054	5061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016607	GATA	2	8	5271	5278	50 %	25 %	25 %	0 %	381184522
14	NC_016607	GTTG	2	8	6035	6042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016607	AAAG	2	8	6110	6117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016607	AGAA	2	8	6345	6352	75 %	0 %	25 %	0 %	381184525
17	NC_016607	AGAA	2	8	6428	6435	75 %	0 %	25 %	0 %	381184525
18	NC_016607	TCAA	2	8	6695	6702	50 %	25 %	0 %	25 %	381184525
19	NC_016607	CAGT	2	8	6719	6726	25 %	25 %	25 %	25 %	381184525
20	NC_016607	CAAT	2	8	6920	6927	50 %	25 %	0 %	25 %	381184525
21	NC_016607	TTAA	2	8	7075	7082	50 %	50 %	0 %	0 %	381184525
22	NC_016607	TAAA	2	8	7166	7173	75 %	25 %	0 %	0 %	381184525
23	NC_016607	AATT	2	8	7247	7254	50 %	50 %	0 %	0 %	381184525
24	NC_016607	AATC	2	8	8808	8815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016607	GCAG	2	8	9834	9841	25 %	0 %	50 %	25 %	381184526
26	NC_016607	TATT	2	8	10497	10504	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
27	NC_016607	TATT	2	8	10626	10633	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
28	NC_016607	TATT	2	8	10755	10762	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
29	NC_016607	TATT	2	8	10884	10891	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
30	NC_016607	TATT	2	8	11013	11020	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
31	NC_016607	TATT	2	8	11142	11149	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
32	NC_016607	TATT	2	8	11271	11278	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
33	NC_016607	TATT	2	8	11400	11407	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
34	NC_016607	TATT	2	8	11598	11605	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
35	NC_016607	TATT	2	8	11724	11731	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
36	NC_016607	TTTG	2	8	11870	11877	0 %	75 %	25 %	0 %	381184526
37	NC_016607	CTTG	2	8	13310	13317	0 %	50 %	25 %	25 %	381184526
38	NC_016607	TTTA	2	8	13411	13418	25 %	75 %	0 %	0 %	381184526
39	NC_016607	GAAA	2	8	13835	13842	75 %	0 %	25 %	0 %	381184526
40	NC_016607	GTTG	2	8	14513	14520	0 %	50 %	50 %	0 %	381184526
41	NC_016607	TACT	2	8	14757	14764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016607	ATGA	2	8	14887	14894	50 %	25 %	25 %	0 %	381184527
43	NC_016607	ACTT	2	8	15379	15386	25 %	50 %	0 %	25 %	381184527
44	NC_016607	TTGA	2	8	15880	15887	25 %	50 %	25 %	0 %	381184527
45	NC_016607	AGTT	2	8	16062	16069	25 %	50 %	25 %	0 %	381184527
46	NC_016607	CGAC	2	8	16440	16447	25 %	0 %	25 %	50 %	381184528
47	NC_016607	CCTG	2	8	16594	16601	0 %	25 %	25 %	50 %	381184528
48	NC_016607	AGCC	2	8	16819	16826	25 %	0 %	25 %	50 %	381184528
49	NC_016607	CAAT	2	8	16968	16975	50 %	25 %	0 %	25 %	381184528
50	NC_016607	TCCT	2	8	18470	18477	0 %	50 %	0 %	50 %	381184529
51	NC_016607	TGGT	2	8	18549	18556	0 %	50 %	50 %	0 %	381184529
52	NC_016607	TAAG	2	8	19430	19437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016607	ACGC	2	8	19970	19977	25 %	0 %	25 %	50 %	381184530
54	NC_016607	TTTA	2	8	20318	20325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016607	TGAA	2	8	20442	20449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016607	ATTA	2	8	20570	20577	50 %	50 %	0 %	0 %	381184531
57	NC_016607	GACT	2	8	21154	21161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016607	TGTA	2	8	21178	21185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016607	TGAT	2	8	21482	21489	25 %	50 %	25 %	0 %	381184532
60	NC_016607	ATTC	2	8	21780	21787	25 %	50 %	0 %	25 %	381184533
61	NC_016607	ATTT	2	8	22612	22619	25 %	75 %	0 %	0 %	381184533
62	NC_016607	CATA	2	8	22754	22761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016607	ATTT	2	8	22771	22778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016607	ATGT	2	8	22787	22794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016607	CCAA	2	8	22876	22883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.