MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium rhodesiae NBB3 chromosome

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016604	AAACGC	2	12	13238	13249	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016604	GTGCGT	2	12	21782	21793	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016604	CGAGGT	2	12	64742	64753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016604	TTCGTA	2	12	93366	93377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016604	CACCGC	2	12	157554	157565	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016604	GCGGTG	2	12	177320	177331	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016604	CGAGCG	2	12	221332	221343	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016604	CCCAAC	2	12	325032	325043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016604	CGTCGC	2	12	325852	325863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016604	TCTGCG	2	12	465299	465310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016604	GCCCGA	2	12	510694	510705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016604	TCATGG	2	12	527121	527132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016604	CCGCGG	2	12	537475	537486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016604	CTGACG	2	12	644744	644755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016604	CCGAAT	2	12	658186	658197	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016604	GCCTCC	2	12	663827	663838	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016604	GACCGC	2	12	664649	664660	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016604	GACGCA	2	12	686441	686452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016604	CGACAG	2	12	723326	723337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016604	GGCAGG	2	12	796959	796970	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016604	CGAATC	2	12	873812	873823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016604	TGGCAG	2	12	893492	893503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016604	GCGTAC	2	12	961360	961371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016604	ATTGGA	2	12	993872	993883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016604	GCCGGA	2	12	1132730	1132741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016604	ACGCGG	2	12	1229225	1229236	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016604	TCGTCA	2	12	1289906	1289917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016604	TCGAAC	2	12	1292797	1292808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016604	GGCGCT	2	12	1523088	1523099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016604	TAGCGT	2	12	1554106	1554117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016604	GCCGCG	2	12	1751912	1751923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016604	CGGATC	2	12	1793745	1793756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016604	TACACC	2	12	1815107	1815118	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016604	CACCGT	2	12	1850114	1850125	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016604	GCAACG	2	12	1965692	1965703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016604	CCGCCA	2	12	2012049	2012060	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016604	CCGCCA	2	12	2035381	2035392	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016604	CAGCAT	2	12	2177065	2177076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016604	CGCCGT	2	12	2275665	2275676	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016604	GGGCGG	2	12	2407618	2407629	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016604	CTTGGC	2	12	2407947	2407958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016604	TGCGCC	2	12	2544787	2544798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016604	GCCAGG	2	12	2554587	2554598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016604	CGCCAC	2	12	2744762	2744773	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016604	ACCGCA	2	12	2755793	2755804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016604	CCGTCG	3	18	2758802	2758819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016604	ATCTGC	2	12	2766491	2766502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016604	ATCTGA	2	12	2768466	2768477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016604	GTTGGC	2	12	2768512	2768523	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016604	CGACGG	2	12	2781057	2781068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016604	CCGAAC	2	12	2784991	2785002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016604	CTACGG	2	12	2785591	2785602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016604	ATGTGC	2	12	2801862	2801873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016604	CGCGGG	2	12	2814137	2814148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016604	TGCCGC	2	12	2814415	2814426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016604	CGGCAC	2	12	2815397	2815408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016604	CCGAAC	2	12	2827119	2827130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016604	CGTGAA	2	12	2828541	2828552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016604	GTGGCC	2	12	2854887	2854898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016604	GGCGCC	2	12	2909866	2909877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016604	TGGAAT	2	12	2918389	2918400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016604	CAGCCG	2	12	2918668	2918679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016604	TCGCGG	2	12	2919310	2919321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016604	ACCGTC	2	12	2919745	2919756	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016604	CAACAC	2	12	2930675	2930686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016604	CGTCCT	2	12	2944404	2944415	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016604	TCGACA	2	12	2960782	2960793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016604	CGGTAT	2	12	2961136	2961147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016604	CTATGG	2	12	2962589	2962600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016604	TGGGTT	2	12	2966218	2966229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016604	CGTGGA	2	12	2971407	2971418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016604	AGACCG	2	12	2981859	2981870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016604	GACAAG	2	12	2982219	2982230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016604	CAACAC	2	12	2988627	2988638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016604	TGTCGG	2	12	2990180	2990191	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016604	ACATCG	2	12	2996568	2996579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016604	GTCGGC	3	18	3013178	3013195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016604	ACCCGA	2	12	3016204	3016215	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016604	GACTGC	2	12	3037939	3037950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016604	GCCGAC	2	12	3063108	3063119	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016604	CCGCAC	2	12	3069628	3069639	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016604	AACGCA	2	12	3083115	3083126	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016604	CGACAC	2	12	3090703	3090714	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016604	AACCCA	2	12	3103572	3103583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016604	CGGCTG	2	12	3127823	3127834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016604	TCGGAA	2	12	3220832	3220843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016604	GGACAG	2	12	3228016	3228027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016604	CCTTGT	2	12	3230469	3230480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016604	CGGTCT	2	12	3230830	3230841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016604	GGTGCG	2	12	3238926	3238937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016604	GATCCG	2	12	3239813	3239824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016604	TCGATC	2	12	3240126	3240137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016604	GTTGCG	2	12	3240446	3240457	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016604	TCGCGA	2	12	3320712	3320723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016604	AGCTGA	2	12	3346571	3346582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016604	CTCGAG	2	12	3349472	3349483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016604	CGAGGT	2	12	3349492	3349503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016604	CAGGCA	2	12	3429236	3429247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016604	CCCGCC	2	12	3516811	3516822	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_016604	CAGGTC	2	12	3558419	3558430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016604	CCACTC	2	12	3589708	3589719	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016604	CGTTGA	2	12	3616257	3616268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016604	GTACCG	2	12	3889209	3889220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016604	CACCGA	2	12	4254700	4254711	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016604	ACCTCG	2	12	4255941	4255952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016604	GCCGAC	2	12	4309876	4309887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016604	GATCAC	2	12	4376208	4376219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016604	GTTGGA	2	12	4399219	4399230	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016604	CATCGG	2	12	4408510	4408521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016604	AGGGTG	2	12	4575617	4575628	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016604	GCGCTG	2	12	4575676	4575687	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016604	TCGCCG	2	12	4576559	4576570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016604	CCGAGC	2	12	4576763	4576774	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016604	CGGTCG	2	12	4577849	4577860	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016604	GCGTTG	2	12	4578775	4578786	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016604	GGCTGC	2	12	4605785	4605796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016604	TGCCGA	2	12	4611388	4611399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016604	GAGGCC	2	12	4616996	4617007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016604	TCCCAC	2	12	4664041	4664052	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016604	GTCGAC	2	12	4930117	4930128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016604	GCCAGC	2	12	5072318	5072329	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016604	CGCTCA	2	12	5117248	5117259	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016604	GTGTCG	2	12	5122096	5122107	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016604	TAGCTT	2	12	5563414	5563425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016604	GGCTCA	2	12	5586411	5586422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016604	TCGCGA	2	12	5597571	5597582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016604	CCGAAA	2	12	5654390	5654401	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016604	TCACCA	2	12	5669777	5669788	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016604	GAAGCC	2	12	5670510	5670521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016604	TGTGGC	2	12	5719351	5719362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016604	TCCTTC	2	12	5767034	5767045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016604	GATGTC	2	12	5841016	5841027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_016604	CGCCAA	2	12	5853375	5853386	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016604	CGACAG	2	12	6066210	6066221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016604	AACCGG	2	12	6158399	6158410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016604	GCCCCG	2	12	6161695	6161706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016604	ATTCGC	2	12	6194099	6194110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016604	ACCGAT	2	12	6204344	6204355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016604	ACGGCG	2	12	6294134	6294145	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016604	GCCAAT	2	12	6308725	6308736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016604	GCGGTC	2	12	6385372	6385383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016604	GATCAA	2	12	6390343	6390354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.