MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium rhodesiae NBB3 chromosome

Total Repeats: 4636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016604	ACGCC	2	10	368	377	20 %	0 %	20 %	60 %	375137219
2	NC_016604	CGGAT	2	10	1364	1373	20 %	20 %	40 %	20 %	375137220
3	NC_016604	GACCG	2	10	2610	2619	20 %	0 %	40 %	40 %	375137220
4	NC_016604	GTTGC	2	10	6768	6777	0 %	40 %	40 %	20 %	375137226
5	NC_016604	CCCGG	2	10	7444	7453	0 %	0 %	40 %	60 %	375137226
6	NC_016604	AGCCG	2	10	8287	8296	20 %	0 %	40 %	40 %	375137227
7	NC_016604	ATCCG	2	10	8545	8554	20 %	20 %	20 %	40 %	375137227
8	NC_016604	CCGAT	2	10	10711	10720	20 %	20 %	20 %	40 %	375137229
9	NC_016604	CACCG	2	10	11535	11544	20 %	0 %	20 %	60 %	375137230
10	NC_016604	GAGCG	2	10	13677	13686	20 %	0 %	60 %	20 %	375137232
11	NC_016604	CGAAT	2	10	15037	15046	40 %	20 %	20 %	20 %	375137233
12	NC_016604	CGCGG	2	10	15449	15458	0 %	0 %	60 %	40 %	375137234
13	NC_016604	GCCCA	2	10	16983	16992	20 %	0 %	20 %	60 %	375137236
14	NC_016604	CCGGC	2	10	17340	17349	0 %	0 %	40 %	60 %	375137237
15	NC_016604	GGAAG	2	10	19017	19026	40 %	0 %	60 %	0 %	375137238
16	NC_016604	TGCGA	2	10	19157	19166	20 %	20 %	40 %	20 %	375137238
17	NC_016604	CCGTC	2	10	19894	19903	0 %	20 %	20 %	60 %	375137240
18	NC_016604	GCGCG	2	10	28135	28144	0 %	0 %	60 %	40 %	375137246
19	NC_016604	GAGGC	2	10	29074	29083	20 %	0 %	60 %	20 %	375137246
20	NC_016604	CGCTG	2	10	32250	32259	0 %	20 %	40 %	40 %	375137248
21	NC_016604	GGGTT	2	10	32500	32509	0 %	40 %	60 %	0 %	375137248
22	NC_016604	CGGTG	2	10	34907	34916	0 %	20 %	60 %	20 %	375137249
23	NC_016604	CCGAT	2	10	36070	36079	20 %	20 %	20 %	40 %	375137250
24	NC_016604	GGAAC	2	10	39050	39059	40 %	0 %	40 %	20 %	375137252
25	NC_016604	GAAGC	2	10	40386	40395	40 %	0 %	40 %	20 %	375137252
26	NC_016604	TCGGG	2	10	41771	41780	0 %	20 %	60 %	20 %	375137252
27	NC_016604	ATCGA	2	10	41926	41935	40 %	20 %	20 %	20 %	375137252
28	NC_016604	GCTCG	2	10	44444	44453	0 %	20 %	40 %	40 %	375137255
29	NC_016604	AGCGC	2	10	46573	46582	20 %	0 %	40 %	40 %	375137259
30	NC_016604	CGCGG	2	10	48299	48308	0 %	0 %	60 %	40 %	375137261
31	NC_016604	ACTGG	2	10	49162	49171	20 %	20 %	40 %	20 %	375137262
32	NC_016604	CGTAA	2	10	49680	49689	40 %	20 %	20 %	20 %	375137263
33	NC_016604	CCGCG	2	10	53860	53869	0 %	0 %	40 %	60 %	375137268
34	NC_016604	GCGAT	2	10	55402	55411	20 %	20 %	40 %	20 %	375137270
35	NC_016604	GCGCC	2	10	56185	56194	0 %	0 %	40 %	60 %	375137271
36	NC_016604	CGGTG	2	10	58492	58501	0 %	20 %	60 %	20 %	375137273
37	NC_016604	CGGGA	2	10	59416	59425	20 %	0 %	60 %	20 %	375137274
38	NC_016604	GTGCC	2	10	60084	60093	0 %	20 %	40 %	40 %	375137275
39	NC_016604	ACTGA	2	10	60640	60649	40 %	20 %	20 %	20 %	375137276
40	NC_016604	TCGCG	2	10	61602	61611	0 %	20 %	40 %	40 %	375137276
41	NC_016604	ACCCG	2	10	62408	62417	20 %	0 %	20 %	60 %	375137277
42	NC_016604	ACAGC	2	10	62583	62592	40 %	0 %	20 %	40 %	375137277
43	NC_016604	TCCGG	2	10	62977	62986	0 %	20 %	40 %	40 %	375137277
44	NC_016604	TCGAT	2	10	63145	63154	20 %	40 %	20 %	20 %	375137278
45	NC_016604	TCCAC	2	10	63383	63392	20 %	20 %	0 %	60 %	375137278
46	NC_016604	TCGAG	2	10	65699	65708	20 %	20 %	40 %	20 %	375137279
47	NC_016604	GCGCG	2	10	65860	65869	0 %	0 %	60 %	40 %	375137279
48	NC_016604	CGAGC	2	10	65882	65891	20 %	0 %	40 %	40 %	375137279
49	NC_016604	GCCAC	2	10	65932	65941	20 %	0 %	20 %	60 %	375137279
50	NC_016604	CCCTG	2	10	69080	69089	0 %	20 %	20 %	60 %	375137282
51	NC_016604	CCGAA	2	10	69111	69120	40 %	0 %	20 %	40 %	375137282
52	NC_016604	CGGGT	2	10	72659	72668	0 %	20 %	60 %	20 %	375137282
53	NC_016604	CCCTC	2	10	73085	73094	0 %	20 %	0 %	80 %	375137282
54	NC_016604	ATCGC	2	10	75110	75119	20 %	20 %	20 %	40 %	375137283
55	NC_016604	TGCGC	2	10	75615	75624	0 %	20 %	40 %	40 %	375137283
56	NC_016604	CACGC	2	10	76135	76144	20 %	0 %	20 %	60 %	375137284
57	NC_016604	CGATG	2	10	76491	76500	20 %	20 %	40 %	20 %	375137284
58	NC_016604	GGACC	2	10	78021	78030	20 %	0 %	40 %	40 %	375137286
59	NC_016604	GGTCA	2	10	78412	78421	20 %	20 %	40 %	20 %	375137286
60	NC_016604	CGTCC	2	10	79563	79572	0 %	20 %	20 %	60 %	375137288
61	NC_016604	GCGCG	2	10	80666	80675	0 %	0 %	60 %	40 %	375137288
62	NC_016604	CCGAT	2	10	80889	80898	20 %	20 %	20 %	40 %	375137288
63	NC_016604	CGGTC	2	10	82087	82096	0 %	20 %	40 %	40 %	375137288
64	NC_016604	GTGCA	2	10	83979	83988	20 %	20 %	40 %	20 %	375137290
65	NC_016604	CCGCG	2	10	87002	87011	0 %	0 %	40 %	60 %	375137292
66	NC_016604	CGCCC	2	10	87715	87724	0 %	0 %	20 %	80 %	375137292
67	NC_016604	TCCCC	2	10	89004	89013	0 %	20 %	0 %	80 %	375137294
68	NC_016604	CATCG	2	10	90500	90509	20 %	20 %	20 %	40 %	375137295
69	NC_016604	CGGCG	2	10	90833	90842	0 %	0 %	60 %	40 %	375137295
70	NC_016604	AGCTC	2	10	91523	91532	20 %	20 %	20 %	40 %	375137296
71	NC_016604	CAGCG	2	10	92179	92188	20 %	0 %	40 %	40 %	375137297
72	NC_016604	AGCCG	2	10	94683	94692	20 %	0 %	40 %	40 %	375137298
73	NC_016604	CGGCG	2	10	94904	94913	0 %	0 %	60 %	40 %	375137298
74	NC_016604	GCAGC	2	10	95834	95843	20 %	0 %	40 %	40 %	375137299
75	NC_016604	GCGTG	2	10	96580	96589	0 %	20 %	60 %	20 %	375137300
76	NC_016604	CCCTT	2	10	103419	103428	0 %	40 %	0 %	60 %	375137308
77	NC_016604	CGCCA	2	10	104056	104065	20 %	0 %	20 %	60 %	375137308
78	NC_016604	CGCGC	2	10	105475	105484	0 %	0 %	40 %	60 %	375137309
79	NC_016604	GGCCG	2	10	106455	106464	0 %	0 %	60 %	40 %	375137310
80	NC_016604	GCGCG	2	10	107039	107048	0 %	0 %	60 %	40 %	375137310
81	NC_016604	GCGTG	2	10	107999	108008	0 %	20 %	60 %	20 %	375137311
82	NC_016604	CAGCG	2	10	109918	109927	20 %	0 %	40 %	40 %	375137313
83	NC_016604	GTCAT	2	10	110054	110063	20 %	40 %	20 %	20 %	375137313
84	NC_016604	AGCGC	2	10	110668	110677	20 %	0 %	40 %	40 %	375137314
85	NC_016604	TCGGC	2	10	111308	111317	0 %	20 %	40 %	40 %	375137314
86	NC_016604	ACGCC	2	10	113706	113715	20 %	0 %	20 %	60 %	375137316
87	NC_016604	CGCTG	2	10	115921	115930	0 %	20 %	40 %	40 %	375137318
88	NC_016604	GCACC	2	10	117667	117676	20 %	0 %	20 %	60 %	375137320
89	NC_016604	ATCCC	2	10	118061	118070	20 %	20 %	0 %	60 %	375137320
90	NC_016604	CTGCG	2	10	118322	118331	0 %	20 %	40 %	40 %	375137321
91	NC_016604	GGGCT	2	10	118340	118349	0 %	20 %	60 %	20 %	375137321
92	NC_016604	CGGCG	2	10	118957	118966	0 %	0 %	60 %	40 %	375137321
93	NC_016604	CCCGT	2	10	119240	119249	0 %	20 %	20 %	60 %	375137321
94	NC_016604	CCGGC	2	10	119366	119375	0 %	0 %	40 %	60 %	375137322
95	NC_016604	GCTCG	2	10	121454	121463	0 %	20 %	40 %	40 %	375137325
96	NC_016604	TCACC	2	10	123292	123301	20 %	20 %	0 %	60 %	375137327
97	NC_016604	CGTTC	2	10	125740	125749	0 %	40 %	20 %	40 %	375137329
98	NC_016604	TGATC	2	10	126114	126123	20 %	40 %	20 %	20 %	375137330
99	NC_016604	GTGCG	2	10	130638	130647	0 %	20 %	60 %	20 %	375137336
100	NC_016604	CAGAC	2	10	131259	131268	40 %	0 %	20 %	40 %	375137336
101	NC_016604	GTGGA	2	10	131479	131488	20 %	20 %	60 %	0 %	375137337
102	NC_016604	ACCCG	2	10	132399	132408	20 %	0 %	20 %	60 %	375137337
103	NC_016604	GCGCC	2	10	134501	134510	0 %	0 %	40 %	60 %	375137340
104	NC_016604	CGATG	2	10	138322	138331	20 %	20 %	40 %	20 %	375137344
105	NC_016604	AGCGC	2	10	138998	139007	20 %	0 %	40 %	40 %	375137345
106	NC_016604	ATCTC	2	10	142136	142145	20 %	40 %	0 %	40 %	375137347
107	NC_016604	CGCCA	2	10	142452	142461	20 %	0 %	20 %	60 %	375137348
108	NC_016604	GCCGG	2	10	142683	142692	0 %	0 %	60 %	40 %	375137348
109	NC_016604	TGCGC	2	10	142813	142822	0 %	20 %	40 %	40 %	375137348
110	NC_016604	CGCGG	2	10	147162	147171	0 %	0 %	60 %	40 %	375137353
111	NC_016604	GCTCG	2	10	148600	148609	0 %	20 %	40 %	40 %	375137355
112	NC_016604	TCCGA	2	10	148651	148660	20 %	20 %	20 %	40 %	375137356
113	NC_016604	CCGCG	2	10	152290	152299	0 %	0 %	40 %	60 %	375137359
114	NC_016604	AGGCG	2	10	152474	152483	20 %	0 %	60 %	20 %	375137360
115	NC_016604	ATGAC	2	10	155527	155536	40 %	20 %	20 %	20 %	375137362
116	NC_016604	GCGCT	2	10	155791	155800	0 %	20 %	40 %	40 %	375137363
117	NC_016604	GAAGC	2	10	159588	159597	40 %	0 %	40 %	20 %	375137367
118	NC_016604	GACAG	2	10	159735	159744	40 %	0 %	40 %	20 %	375137368
119	NC_016604	ACCAC	2	10	159869	159878	40 %	0 %	0 %	60 %	375137368
120	NC_016604	GGGCC	2	10	159894	159903	0 %	0 %	60 %	40 %	375137368
121	NC_016604	GTTCA	2	10	160474	160483	20 %	40 %	20 %	20 %	375137368
122	NC_016604	TGCCG	2	10	160975	160984	0 %	20 %	40 %	40 %	375137369
123	NC_016604	TCTCC	2	10	161621	161630	0 %	40 %	0 %	60 %	375137370
124	NC_016604	CTGCC	2	10	162152	162161	0 %	20 %	20 %	60 %	375137370
125	NC_016604	TCGAA	2	10	162930	162939	40 %	20 %	20 %	20 %	375137371
126	NC_016604	GACTG	2	10	164323	164332	20 %	20 %	40 %	20 %	375137373
127	NC_016604	CGGAT	2	10	165160	165169	20 %	20 %	40 %	20 %	375137374
128	NC_016604	CCCAA	2	10	166131	166140	40 %	0 %	0 %	60 %	375137375
129	NC_016604	GGGCC	2	10	166733	166742	0 %	0 %	60 %	40 %	375137376
130	NC_016604	TTGGC	2	10	168241	168250	0 %	40 %	40 %	20 %	375137378
131	NC_016604	GCGCG	2	10	168934	168943	0 %	0 %	60 %	40 %	375137379
132	NC_016604	CCAGG	2	10	172216	172225	20 %	0 %	40 %	40 %	375137383
133	NC_016604	ACCGG	2	10	172232	172241	20 %	0 %	40 %	40 %	375137383
134	NC_016604	AGTCC	2	10	173724	173733	20 %	20 %	20 %	40 %	375137383
135	NC_016604	CCGCC	2	10	173806	173815	0 %	0 %	20 %	80 %	375137383
136	NC_016604	CCCGT	2	10	174236	174245	0 %	20 %	20 %	60 %	375137384
137	NC_016604	CCCGG	2	10	175364	175373	0 %	0 %	40 %	60 %	375137384
138	NC_016604	GCGCC	2	10	177079	177088	0 %	0 %	40 %	60 %	375137385
139	NC_016604	ATCCG	2	10	186685	186694	20 %	20 %	20 %	40 %	375137393
140	NC_016604	CGGAC	2	10	189971	189980	20 %	0 %	40 %	40 %	375137396
141	NC_016604	GGCCG	2	10	196508	196517	0 %	0 %	60 %	40 %	375137405
142	NC_016604	GACCG	2	10	197194	197203	20 %	0 %	40 %	40 %	375137406
143	NC_016604	CGACC	2	10	197840	197849	20 %	0 %	20 %	60 %	375137406
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149	NC_016604	GACCG	2	10	209634	209643	20 %	0 %	40 %	40 %	375137420
150	NC_016604	CAGCC	2	10	211325	211334	20 %	0 %	20 %	60 %	375137422
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152	NC_016604	TCCGT	2	10	212149	212158	0 %	40 %	20 %	40 %	375137423
153	NC_016604	AGCCG	2	10	213709	213718	20 %	0 %	40 %	40 %	375137423
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155	NC_016604	GCCCC	2	10	214483	214492	0 %	0 %	20 %	80 %	375137424
156	NC_016604	CGACG	2	10	218035	218044	20 %	0 %	40 %	40 %	375137429
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178	NC_016604	CGTGG	2	10	261135	261144	0 %	20 %	60 %	20 %	375137474
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