MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio furnissii NCTC 11218 chromosome 1

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016602	ATTTCA	2	12	56299	56310	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016602	GTATCC	2	12	127729	127740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016602	AAAATA	2	12	131424	131435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016602	AAAAGG	2	12	166992	167003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016602	TACGAA	2	12	204270	204281	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016602	GTTTTT	2	12	223705	223716	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016602	CATTTA	2	12	225319	225330	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016602	GAGTAG	2	12	234709	234720	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016602	TTTTTC	2	12	242278	242289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016602	GAATCC	2	12	272037	272048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016602	CTTTTT	2	12	283614	283625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016602	ATTTCA	2	12	287562	287573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016602	TGAAAT	2	12	391518	391529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016602	TTTGTT	2	12	425749	425760	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016602	CGCAGT	2	12	439003	439014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016602	GACAAA	2	12	439516	439527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016602	ATCAAA	2	12	479868	479879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016602	ATTTAT	2	12	482525	482536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016602	TTTTAA	2	12	495800	495811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016602	TGAAAT	2	12	512015	512026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016602	GTAATA	2	12	546839	546850	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016602	CCTGAT	2	12	601053	601064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016602	CGCGCT	2	12	620711	620722	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016602	AGCGCT	2	12	630526	630537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016602	GCAAGC	2	12	634120	634131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016602	TTGAAG	2	12	714048	714059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016602	CAAAAA	2	12	723774	723785	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016602	ACCAAT	2	12	788714	788725	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016602	ATCAAC	2	12	799193	799204	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016602	TGAAAT	2	12	814480	814491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016602	GATCAC	2	12	837848	837859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016602	CAATCA	2	12	858035	858046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016602	TCAATT	2	12	946637	946648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016602	ATTGCG	2	12	963617	963628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016602	GGAAAA	2	12	980662	980673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016602	TAAATT	2	12	1034495	1034506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016602	TAGTGT	2	12	1058911	1058922	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016602	TGAAAT	2	12	1065265	1065276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016602	CTTTTC	2	12	1105606	1105617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016602	CTTTTT	2	12	1149728	1149739	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016602	TAATAG	2	12	1165881	1165892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016602	GCATTT	2	12	1167458	1167469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016602	TTTTTG	2	12	1172309	1172320	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016602	TTTTGA	2	12	1185062	1185073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016602	CTTTTT	2	12	1358420	1358431	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016602	CTTTTT	2	12	1372351	1372362	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016602	TGAAAG	2	12	1374075	1374086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016602	GGAAGG	2	12	1430695	1430706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016602	TCTCAT	2	12	1472789	1472800	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016602	TTGGGT	2	12	1486452	1486463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016602	CTAAGA	2	12	1568741	1568752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016602	CAAGTG	2	12	1702069	1702080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016602	TTTTAG	2	12	1705153	1705164	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016602	ATATTC	2	12	1758303	1758314	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016602	GGTTTG	2	12	1761436	1761447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016602	AAAATG	2	12	1776483	1776494	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016602	ACAAAA	2	12	1845402	1845413	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016602	AGGGGG	2	12	1856624	1856635	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016602	TATTTT	2	12	1891627	1891638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016602	GGGAAA	2	12	1970113	1970124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016602	AATCAT	2	12	1982935	1982946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016602	TTACTT	2	12	1987582	1987593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016602	CCGAGA	2	12	2037143	2037154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016602	TTTCAG	2	12	2082809	2082820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016602	CAAGAC	2	12	2112743	2112754	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016602	ATTCGC	2	12	2133911	2133922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016602	GCGTGA	2	12	2137876	2137887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016602	CATGGT	4	24	2137907	2137930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016602	TGCTCC	2	12	2189166	2189177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016602	TGGTTA	2	12	2231338	2231349	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016602	GGCTTC	2	12	2274644	2274655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016602	CATCGC	2	12	2372550	2372561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016602	CCGCAG	2	12	2379863	2379874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016602	ATCAAA	2	12	2414569	2414580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016602	AAGTGA	2	12	2424683	2424694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016602	CATCGC	2	12	2452759	2452770	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016602	GATCAA	2	12	2459647	2459658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016602	TGATTA	2	12	2507520	2507531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016602	CCCTAC	2	12	2594265	2594276	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016602	GCTATT	2	12	2621595	2621606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016602	AAAAAG	2	12	2628388	2628399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016602	TAAAAA	2	12	2660237	2660248	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016602	CTGCGG	2	12	2684057	2684068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016602	TTCTCT	2	12	2694981	2694992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016602	CAAACA	2	12	2707753	2707764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016602	TTATTT	2	12	2728642	2728653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016602	ATCAGT	2	12	2734118	2734129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016602	GCGGTT	2	12	2734169	2734180	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016602	ACTTTG	2	12	2811321	2811332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016602	TATTGA	2	12	2838358	2838369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016602	ACAAAA	2	12	2860962	2860973	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016602	CGATAA	2	12	2860998	2861009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016602	ACAAAA	2	12	2875437	2875448	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016602	TCCTTG	2	12	2891979	2891990	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016602	CAAAAC	2	12	2913702	2913713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016602	GTTTTT	2	12	2996635	2996646	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016602	TCACCA	2	12	3042493	3042504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016602	GATGGA	2	12	3042746	3042757	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016602	ACAAAA	2	12	3106183	3106194	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016602	TCGCTT	2	12	3122634	3122645	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016602	TCCTCA	2	12	3152988	3152999	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016602	ATCTGC	2	12	3155429	3155440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016602	ACTTTG	2	12	3165601	3165612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016602	TAAAAA	2	12	3170084	3170095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016602	TCAGCG	2	12	3270485	3270496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016602	GAAGGG	2	12	3270853	3270864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016602	ATTTCA	2	12	3272171	3272182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.