MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio furnissii NCTC 11218 chromosome 1

Total Repeats: 2329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016602	ATTGG	2	10	2078	2087	20 %	40 %	40 %	0 %	375129162
2	NC_016602	TGATC	2	10	4096	4105	20 %	40 %	20 %	20 %	375129166
3	NC_016602	CACAC	2	10	4206	4215	40 %	0 %	0 %	60 %	375129166
4	NC_016602	GCATC	2	10	9370	9379	20 %	20 %	20 %	40 %	375129174
5	NC_016602	CTCTT	2	10	10415	10424	0 %	60 %	0 %	40 %	375129175
6	NC_016602	GGTCG	2	10	10970	10979	0 %	20 %	60 %	20 %	375129175
7	NC_016602	ATTTT	2	10	11978	11987	20 %	80 %	0 %	0 %	375129176
8	NC_016602	TCAGT	2	10	12564	12573	20 %	40 %	20 %	20 %	375129177
9	NC_016602	CTGGT	2	10	12943	12952	0 %	40 %	40 %	20 %	375129177
10	NC_016602	CGGCA	2	10	16158	16167	20 %	0 %	40 %	40 %	375129179
11	NC_016602	CAGAT	2	10	17472	17481	40 %	20 %	20 %	20 %	375129181
12	NC_016602	TGGAT	2	10	17595	17604	20 %	40 %	40 %	0 %	375129181
13	NC_016602	TCGTC	2	10	21451	21460	0 %	40 %	20 %	40 %	375129183
14	NC_016602	CAAAG	2	10	24634	24643	60 %	0 %	20 %	20 %	375129185
15	NC_016602	TTGGT	2	10	24677	24686	0 %	60 %	40 %	0 %	375129185
16	NC_016602	AGGTA	2	10	24973	24982	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016602	CGATG	2	10	26828	26837	20 %	20 %	40 %	20 %	375129186
18	NC_016602	CGCAG	2	10	28530	28539	20 %	0 %	40 %	40 %	375129188
19	NC_016602	GCAAG	2	10	30536	30545	40 %	0 %	40 %	20 %	375129189
20	NC_016602	TCATC	2	10	32215	32224	20 %	40 %	0 %	40 %	375129191
21	NC_016602	CACCT	2	10	33392	33401	20 %	20 %	0 %	60 %	375129192
22	NC_016602	GATTT	2	10	34912	34921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016602	CTGCT	2	10	35665	35674	0 %	40 %	20 %	40 %	375129195
24	NC_016602	ACCAG	2	10	37796	37805	40 %	0 %	20 %	40 %	375129195
25	NC_016602	TGTGC	2	10	39777	39786	0 %	40 %	40 %	20 %	375129195
26	NC_016602	TCGCT	2	10	40983	40992	0 %	40 %	20 %	40 %	375129196
27	NC_016602	CTTCA	2	10	41311	41320	20 %	40 %	0 %	40 %	375129196
28	NC_016602	TACGT	2	10	41821	41830	20 %	40 %	20 %	20 %	375129196
29	NC_016602	TAAAA	2	10	45196	45205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016602	TCCAT	2	10	47664	47673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016602	GCGAA	2	10	50745	50754	40 %	0 %	40 %	20 %	375129205
32	NC_016602	TAAAC	2	10	52749	52758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016602	TGCTC	2	10	53281	53290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016602	GCGGA	2	10	55100	55109	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016602	GTTTC	2	10	55260	55269	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016602	GGAAT	2	10	55282	55291	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016602	CGACT	2	10	57206	57215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016602	TCGGT	2	10	57580	57589	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016602	ACTTT	2	10	61608	61617	20 %	60 %	0 %	20 %	375129209
40	NC_016602	ACCTT	2	10	61757	61766	20 %	40 %	0 %	40 %	375129210
41	NC_016602	GAAAT	2	10	61818	61827	60 %	20 %	20 %	0 %	375129210
42	NC_016602	TGTTT	2	10	62238	62247	0 %	80 %	20 %	0 %	375129211
43	NC_016602	AGCCC	2	10	62432	62441	20 %	0 %	20 %	60 %	375129211
44	NC_016602	GCGAA	2	10	62450	62459	40 %	0 %	40 %	20 %	375129211
45	NC_016602	ATGGC	2	10	63882	63891	20 %	20 %	40 %	20 %	375129212
46	NC_016602	AGTTC	2	10	64387	64396	20 %	40 %	20 %	20 %	375129212
47	NC_016602	ACGTG	2	10	65493	65502	20 %	20 %	40 %	20 %	375129213
48	NC_016602	AAAAC	2	10	66363	66372	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016602	CAGGC	2	10	66995	67004	20 %	0 %	40 %	40 %	375129215
50	NC_016602	CGATG	2	10	69010	69019	20 %	20 %	40 %	20 %	375129216
51	NC_016602	CACCC	2	10	69705	69714	20 %	0 %	0 %	80 %	375129217
52	NC_016602	CTGCG	2	10	69799	69808	0 %	20 %	40 %	40 %	375129217
53	NC_016602	GTCGA	2	10	69893	69902	20 %	20 %	40 %	20 %	375129217
54	NC_016602	CTTCA	2	10	70664	70673	20 %	40 %	0 %	40 %	375129217
55	NC_016602	TTGCT	2	10	71754	71763	0 %	60 %	20 %	20 %	375129217
56	NC_016602	GATGT	2	10	72843	72852	20 %	40 %	40 %	0 %	375129217
57	NC_016602	TGGAT	2	10	77452	77461	20 %	40 %	40 %	0 %	375129221
58	NC_016602	CGATG	2	10	79444	79453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016602	CACGT	2	10	81232	81241	20 %	20 %	20 %	40 %	375129224
60	NC_016602	TTGAT	2	10	81529	81538	20 %	60 %	20 %	0 %	375129224
61	NC_016602	GATGA	2	10	81831	81840	40 %	20 %	40 %	0 %	375129224
62	NC_016602	AAGAG	2	10	84093	84102	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016602	TCGGC	2	10	87464	87473	0 %	20 %	40 %	40 %	375129230
64	NC_016602	GTAAT	2	10	87702	87711	40 %	40 %	20 %	0 %	375129231
65	NC_016602	TTATT	2	10	88503	88512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016602	CCATT	2	10	90317	90326	20 %	40 %	0 %	40 %	375129232
67	NC_016602	TGAAC	2	10	90883	90892	40 %	20 %	20 %	20 %	375129233
68	NC_016602	CAGCT	2	10	91874	91883	20 %	20 %	20 %	40 %	375129233
69	NC_016602	TGTGG	2	10	94417	94426	0 %	40 %	60 %	0 %	375129236
70	NC_016602	TCAAA	2	10	94823	94832	60 %	20 %	0 %	20 %	375129236
71	NC_016602	GCTGG	2	10	95262	95271	0 %	20 %	60 %	20 %	375129237
72	NC_016602	TGGCA	2	10	96445	96454	20 %	20 %	40 %	20 %	375129237
73	NC_016602	AATTC	2	10	96758	96767	40 %	40 %	0 %	20 %	375129238
74	NC_016602	TGGTG	2	10	98394	98403	0 %	40 %	60 %	0 %	375129240
75	NC_016602	ATCAC	2	10	99721	99730	40 %	20 %	0 %	40 %	375129241
76	NC_016602	AGCCA	2	10	101333	101342	40 %	0 %	20 %	40 %	375129243
77	NC_016602	GCCCT	2	10	102202	102211	0 %	20 %	20 %	60 %	375129244
78	NC_016602	ACCAC	2	10	102945	102954	40 %	0 %	0 %	60 %	375129245
79	NC_016602	AGCAA	2	10	103294	103303	60 %	0 %	20 %	20 %	375129245
80	NC_016602	TGGTG	2	10	103351	103360	0 %	40 %	60 %	0 %	375129245
81	NC_016602	GAAAG	2	10	104300	104309	60 %	0 %	40 %	0 %	375129246
82	NC_016602	CCAAC	2	10	104627	104636	40 %	0 %	0 %	60 %	375129246
83	NC_016602	TGTGA	2	10	105018	105027	20 %	40 %	40 %	0 %	375129247
84	NC_016602	CGCAG	2	10	106267	106276	20 %	0 %	40 %	40 %	375129248
85	NC_016602	CACCG	2	10	106516	106525	20 %	0 %	20 %	60 %	375129248
86	NC_016602	GTTTG	2	10	106705	106714	0 %	60 %	40 %	0 %	375129248
87	NC_016602	TGGAC	2	10	107720	107729	20 %	20 %	40 %	20 %	375129250
88	NC_016602	TTGAT	2	10	108718	108727	20 %	60 %	20 %	0 %	375129251
89	NC_016602	TAACT	2	10	114880	114889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016602	ATTTA	2	10	116645	116654	40 %	60 %	0 %	0 %	375129256
91	NC_016602	AAAAG	2	10	117297	117306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016602	ACAAG	2	10	120022	120031	60 %	0 %	20 %	20 %	375129259
93	NC_016602	GGTGA	2	10	121179	121188	20 %	20 %	60 %	0 %	375129261
94	NC_016602	AGATA	2	10	121382	121391	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016602	TACTG	2	10	121868	121877	20 %	40 %	20 %	20 %	375129262
96	NC_016602	ATATA	2	10	122652	122661	60 %	40 %	0 %	0 %	375129264
97	NC_016602	GGCTA	2	10	128509	128518	20 %	20 %	40 %	20 %	375129268
98	NC_016602	TTGTA	2	10	128667	128676	20 %	60 %	20 %	0 %	375129268
99	NC_016602	CAACC	2	10	135144	135153	40 %	0 %	0 %	60 %	375129275
100	NC_016602	CAAAA	2	10	136211	136220	80 %	0 %	0 %	20 %	375129276
101	NC_016602	AATAA	2	10	137604	137613	80 %	20 %	0 %	0 %	375129277
102	NC_016602	ATAAA	2	10	137628	137637	80 %	20 %	0 %	0 %	375129277
103	NC_016602	CCAAA	2	10	139683	139692	60 %	0 %	0 %	40 %	375129279
104	NC_016602	ATTGT	2	10	141413	141422	20 %	60 %	20 %	0 %	375129279
105	NC_016602	TTTAC	2	10	143591	143600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016602	TAATC	2	10	144094	144103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016602	ACTCA	2	10	144407	144416	40 %	20 %	0 %	40 %	375129282
108	NC_016602	TACAA	2	10	144938	144947	60 %	20 %	0 %	20 %	375129283
109	NC_016602	ATCGC	2	10	145127	145136	20 %	20 %	20 %	40 %	375129283
110	NC_016602	ATGGG	2	10	146088	146097	20 %	20 %	60 %	0 %	375129284
111	NC_016602	TTGGT	2	10	147332	147341	0 %	60 %	40 %	0 %	375129284
112	NC_016602	TGCAG	2	10	147390	147399	20 %	20 %	40 %	20 %	375129284
113	NC_016602	CCATT	2	10	148789	148798	20 %	40 %	0 %	40 %	375129285
114	NC_016602	ACCCC	2	10	150237	150246	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
115	NC_016602	CAATC	2	10	150359	150368	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016602	TTGTT	2	10	151720	151729	0 %	80 %	20 %	0 %	375129288
117	NC_016602	CTTTA	2	10	152418	152427	20 %	60 %	0 %	20 %	375129288
118	NC_016602	CGCAG	2	10	158006	158015	20 %	0 %	40 %	40 %	375129293
119	NC_016602	GCGAA	2	10	161097	161106	40 %	0 %	40 %	20 %	375129297
120	NC_016602	ACCCA	2	10	162603	162612	40 %	0 %	0 %	60 %	375129299
121	NC_016602	CCAGC	2	10	166581	166590	20 %	0 %	20 %	60 %	375129302
122	NC_016602	AGAAT	2	10	167298	167307	60 %	20 %	20 %	0 %	375129303
123	NC_016602	TGCGT	2	10	167368	167377	0 %	40 %	40 %	20 %	375129303
124	NC_016602	CACCG	2	10	168428	168437	20 %	0 %	20 %	60 %	375129304
125	NC_016602	TTCAG	2	10	169048	169057	20 %	40 %	20 %	20 %	375129304
126	NC_016602	AAGTT	2	10	170574	170583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016602	GCTGC	2	10	174131	174140	0 %	20 %	40 %	40 %	375129310
128	NC_016602	AAGCA	2	10	174805	174814	60 %	0 %	20 %	20 %	375129311
129	NC_016602	ATAGA	2	10	178910	178919	60 %	20 %	20 %	0 %	375129316
130	NC_016602	AAGAA	2	10	179292	179301	80 %	0 %	20 %	0 %	375129317
131	NC_016602	CAAAC	2	10	181180	181189	60 %	0 %	0 %	40 %	375129318
132	NC_016602	TTTCT	2	10	182408	182417	0 %	80 %	0 %	20 %	375129319
133	NC_016602	CTCTT	2	10	182644	182653	0 %	60 %	0 %	40 %	375129319
134	NC_016602	GAGTG	2	10	185891	185900	20 %	20 %	60 %	0 %	375129324
135	NC_016602	GCCTT	2	10	186083	186092	0 %	40 %	20 %	40 %	375129324
136	NC_016602	TTTTA	2	10	187781	187790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016602	TCATC	2	10	188034	188043	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016602	ATCCA	2	10	190335	190344	40 %	20 %	0 %	40 %	375129329
139	NC_016602	CTATC	2	10	190601	190610	20 %	40 %	0 %	40 %	375129329
140	NC_016602	CTGGT	2	10	193750	193759	0 %	40 %	40 %	20 %	375129330
141	NC_016602	AGCTC	2	10	195973	195982	20 %	20 %	20 %	40 %	375129333
142	NC_016602	TATTG	2	10	196426	196435	20 %	60 %	20 %	0 %	375129333
143	NC_016602	CATTT	2	10	198724	198733	20 %	60 %	0 %	20 %	375129336
144	NC_016602	TCCAT	2	10	199041	199050	20 %	40 %	0 %	40 %	375129336
145	NC_016602	AATAA	2	10	200857	200866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016602	ATCGT	2	10	205437	205446	20 %	40 %	20 %	20 %	375129341
147	NC_016602	TGTTT	2	10	206144	206153	0 %	80 %	20 %	0 %	375129341
148	NC_016602	CTGCT	2	10	209610	209619	0 %	40 %	20 %	40 %	375129342
149	NC_016602	CCCTT	2	10	213235	213244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_016602	CCGAT	2	10	216731	216740	20 %	20 %	20 %	40 %	375129349
151	NC_016602	TGAAG	2	10	217415	217424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016602	CAATT	2	10	217447	217456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_016602	GGCTG	2	10	217742	217751	0 %	20 %	60 %	20 %	375129350
154	NC_016602	AACTC	2	10	220974	220983	40 %	20 %	0 %	40 %	375129353
155	NC_016602	AAGAT	2	10	222620	222629	60 %	20 %	20 %	0 %	375129356
156	NC_016602	GTTGA	2	10	222979	222988	20 %	40 %	40 %	0 %	375129356
157	NC_016602	TCTTT	2	10	223450	223459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_016602	TCATT	2	10	223524	223533	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_016602	CAAAT	2	10	225853	225862	60 %	20 %	0 %	20 %	375129359
160	NC_016602	CACGT	2	10	226311	226320	20 %	20 %	20 %	40 %	375129359
161	NC_016602	TGCGC	2	10	233367	233376	0 %	20 %	40 %	40 %	375129364
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163	NC_016602	CGCTA	2	10	238190	238199	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_016602	ACGCC	2	10	240270	240279	20 %	0 %	20 %	60 %	375129371
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170	NC_016602	CAGGT	2	10	248404	248413	20 %	20 %	40 %	20 %	375129378
171	NC_016602	GGCTT	2	10	248821	248830	0 %	40 %	40 %	20 %	375129378
172	NC_016602	GATGA	2	10	252226	252235	40 %	20 %	40 %	0 %	375129380
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174	NC_016602	GTCAT	2	10	254917	254926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_016602	CCACA	2	10	255369	255378	40 %	0 %	0 %	60 %	375129383
176	NC_016602	GAACA	2	10	256637	256646	60 %	0 %	20 %	20 %	375129384
177	NC_016602	TGGTC	2	10	257629	257638	0 %	40 %	40 %	20 %	375129384
178	NC_016602	CGACG	2	10	261426	261435	20 %	0 %	40 %	40 %	375129386
179	NC_016602	CGACC	2	10	262017	262026	20 %	0 %	20 %	60 %	375129386
180	NC_016602	GCCAC	2	10	263345	263354	20 %	0 %	20 %	60 %	375129388
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182	NC_016602	TCGCA	2	10	268121	268130	20 %	20 %	20 %	40 %	375129390
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184	NC_016602	GGTTG	2	10	269334	269343	0 %	40 %	60 %	0 %	375129392
185	NC_016602	CCCAG	2	10	269759	269768	20 %	0 %	20 %	60 %	375129392
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187	NC_016602	CCACA	2	10	271700	271709	40 %	0 %	0 %	60 %	375129393
188	NC_016602	TCGGC	2	10	272577	272586	0 %	20 %	40 %	40 %	375129394
189	NC_016602	ACCAA	2	10	272795	272804	60 %	0 %	0 %	40 %	375129394
190	NC_016602	CGTGA	2	10	273777	273786	20 %	20 %	40 %	20 %	375129394
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192	NC_016602	CGCGC	2	10	277403	277412	0 %	0 %	40 %	60 %	375129397
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197	NC_016602	GTTTC	2	10	286525	286534	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_016602	CGACT	2	10	288469	288478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
200	NC_016602	TCGGT	2	10	288843	288852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
201	NC_016602	CTATC	2	10	289894	289903	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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221	NC_016602	ACACA	2	10	315842	315851	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
222	NC_016602	GCGAT	2	10	316938	316947	20 %	20 %	40 %	20 %	375129432
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245	NC_016602	AGTAC	2	10	352555	352564	40 %	20 %	20 %	20 %	375129470
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249	NC_016602	GGTTG	2	10	358759	358768	0 %	40 %	60 %	0 %	375129473
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252	NC_016602	CATCG	2	10	359394	359403	20 %	20 %	20 %	40 %	375129474
253	NC_016602	CTAGC	2	10	362051	362060	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_016602	TCTTG	2	10	362203	362212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
255	NC_016602	AAGAA	2	10	362479	362488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_016602	GATCA	2	10	363382	363391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_016602	TTTTA	2	10	363597	363606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016602	TGAAC	2	10	365872	365881	40 %	20 %	20 %	20 %	375129481
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260	NC_016602	GAAGC	2	10	369852	369861	40 %	0 %	40 %	20 %	375129487
261	NC_016602	GTGAA	2	10	371630	371639	40 %	20 %	40 %	0 %	375129489
262	NC_016602	AACTG	2	10	371754	371763	40 %	20 %	20 %	20 %	375129489
263	NC_016602	GCGAT	2	10	373450	373459	20 %	20 %	40 %	20 %	375129491
264	NC_016602	TCGGA	2	10	376369	376378	20 %	20 %	40 %	20 %	375129493
265	NC_016602	TTGGC	2	10	377063	377072	0 %	40 %	40 %	20 %	375129494
266	NC_016602	CAAGG	2	10	378947	378956	40 %	0 %	40 %	20 %	375129496
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268	NC_016602	TGGTG	2	10	379750	379759	0 %	40 %	60 %	0 %	375129497
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398	NC_016602	CGCAG	2	10	557998	558007	20 %	0 %	40 %	40 %	375129664
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401	NC_016602	TGTCA	2	10	562452	562461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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