MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED02

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016601	ATGCGA	2	12	453	464	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016601	TGCCGG	2	12	2768	2779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375129107
3	NC_016601	CCGGTC	2	12	2854	2865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375129107
4	NC_016601	GCTGGT	2	12	3006	3017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375129107
5	NC_016601	TGCTGG	2	12	3566	3577	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375129107
6	NC_016601	GCCCGA	2	12	3875	3886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375129108
7	NC_016601	GTCGGT	2	12	3917	3928	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375129108
8	NC_016601	CGGCCT	2	12	7287	7298	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375129111
9	NC_016601	TCGACG	2	12	8134	8145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375129112
10	NC_016601	GTTCGA	2	12	9427	9438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375129113
11	NC_016601	CCGCGG	2	12	13523	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
12	NC_016601	GCCCGG	2	12	16692	16703	0 %	0 %	50 %	50 %	375129119
13	NC_016601	GCGGCC	2	12	16860	16871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016601	CGCGGT	2	12	17777	17788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375129121
15	NC_016601	GCCGCG	2	12	18767	18778	0 %	0 %	50 %	50 %	375129122
16	NC_016601	AGCGGC	2	12	20096	20107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375129123
17	NC_016601	GGCGCC	2	12	21660	21671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016601	CAGCGT	2	12	26483	26494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375129125
19	NC_016601	TCGACA	2	12	27474	27485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375129126
20	NC_016601	GTGACG	3	18	33725	33742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375129130
21	NC_016601	CCGATT	2	12	33944	33955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375129130
22	NC_016601	TCGCCC	2	12	38611	38622	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	375129135
23	NC_016601	CGTCGC	2	12	38987	38998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375129135
24	NC_016601	CGACGC	2	12	43984	43995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375129137
25	NC_016601	CCGGCC	2	12	44867	44878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129137
26	NC_016601	GCCCGG	2	12	46099	46110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016601	CCGCGG	2	12	46619	46630	0 %	0 %	50 %	50 %	375129139
28	NC_016601	TTGGGC	2	12	49274	49285	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016601	ATAAAA	2	12	49355	49366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016601	GCCGCA	2	12	49451	49462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375129141
31	NC_016601	CCCGCA	2	12	49837	49848	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	375129141
32	NC_016601	AGGCCG	2	12	49933	49944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375129141
33	NC_016601	CGCCAC	2	12	50459	50470	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	375129141
34	NC_016601	CGCCCG	2	12	50498	50509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129141
35	NC_016601	TCGGCC	2	12	55859	55870	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016601	CGGGCT	2	12	56785	56796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016601	TGGGGC	2	12	57329	57340	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016601	ACCCTG	3	18	60891	60908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	375129153
39	NC_016601	GACGCC	2	12	60951	60962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375129153
40	NC_016601	CGCCCA	2	12	62526	62537	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	375129157
41	NC_016601	ATGGCC	2	12	62542	62553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375129157
42	NC_016601	ATGACC	2	12	63112	63123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375129157
43	NC_016601	CGGCGA	2	12	64638	64649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375129158
44	NC_016601	AGGCGC	2	12	65373	65384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375129158
45	NC_016601	GAGCGC	2	12	66231	66242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375129159

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.