MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED02

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016601	GC	3	6	1071	1076	0 %	0 %	50 %	50 %	375129106
2	NC_016601	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	375129106
3	NC_016601	CG	3	6	3426	3431	0 %	0 %	50 %	50 %	375129107
4	NC_016601	CG	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	375129108
5	NC_016601	CG	3	6	5955	5960	0 %	0 %	50 %	50 %	375129109
6	NC_016601	GC	3	6	6008	6013	0 %	0 %	50 %	50 %	375129109
7	NC_016601	TC	3	6	6459	6464	0 %	50 %	0 %	50 %	375129110
8	NC_016601	CG	3	6	6674	6679	0 %	0 %	50 %	50 %	375129110
9	NC_016601	GC	4	8	7861	7868	0 %	0 %	50 %	50 %	375129112
10	NC_016601	GC	3	6	8198	8203	0 %	0 %	50 %	50 %	375129112
11	NC_016601	CG	3	6	8662	8667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016601	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016601	CG	3	6	9646	9651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016601	CG	3	6	10172	10177	0 %	0 %	50 %	50 %	375129114
15	NC_016601	GC	3	6	10288	10293	0 %	0 %	50 %	50 %	375129114
16	NC_016601	CG	3	6	10831	10836	0 %	0 %	50 %	50 %	375129115
17	NC_016601	CG	3	6	11224	11229	0 %	0 %	50 %	50 %	375129115
18	NC_016601	CG	3	6	12002	12007	0 %	0 %	50 %	50 %	375129116
19	NC_016601	GC	3	6	12241	12246	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
20	NC_016601	CG	3	6	12258	12263	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
21	NC_016601	CA	3	6	12315	12320	50 %	0 %	0 %	50 %	375129117
22	NC_016601	CG	3	6	12465	12470	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
23	NC_016601	CG	3	6	12633	12638	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
24	NC_016601	CT	3	6	12955	12960	0 %	50 %	0 %	50 %	375129117
25	NC_016601	CG	4	8	12998	13005	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
26	NC_016601	CA	4	8	13025	13032	50 %	0 %	0 %	50 %	375129117
27	NC_016601	CG	3	6	13193	13198	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
28	NC_016601	GC	3	6	13203	13208	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
29	NC_016601	CG	3	6	13397	13402	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
30	NC_016601	GC	3	6	13767	13772	0 %	0 %	50 %	50 %	375129117
31	NC_016601	GC	3	6	14790	14795	0 %	0 %	50 %	50 %	375129118
32	NC_016601	AG	3	6	16044	16049	50 %	0 %	50 %	0 %	375129119
33	NC_016601	GA	3	6	16111	16116	50 %	0 %	50 %	0 %	375129119
34	NC_016601	AG	3	6	16554	16559	50 %	0 %	50 %	0 %	375129119
35	NC_016601	CA	3	6	16812	16817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016601	GC	3	6	17083	17088	0 %	0 %	50 %	50 %	375129120
37	NC_016601	AC	3	6	17090	17095	50 %	0 %	0 %	50 %	375129120
38	NC_016601	CG	3	6	17726	17731	0 %	0 %	50 %	50 %	375129121
39	NC_016601	GC	3	6	18051	18056	0 %	0 %	50 %	50 %	375129121
40	NC_016601	GC	3	6	18584	18589	0 %	0 %	50 %	50 %	375129122
41	NC_016601	GC	3	6	18810	18815	0 %	0 %	50 %	50 %	375129122
42	NC_016601	CG	3	6	18987	18992	0 %	0 %	50 %	50 %	375129122
43	NC_016601	CG	3	6	19152	19157	0 %	0 %	50 %	50 %	375129122
44	NC_016601	CA	3	6	19300	19305	50 %	0 %	0 %	50 %	375129122
45	NC_016601	GC	3	6	21191	21196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016601	GC	3	6	21913	21918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016601	CT	3	6	22532	22537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016601	CT	3	6	22811	22816	0 %	50 %	0 %	50 %	375129124
49	NC_016601	GC	3	6	23079	23084	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124
50	NC_016601	GC	3	6	23475	23480	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124
51	NC_016601	GC	3	6	23494	23499	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124
52	NC_016601	GC	3	6	23826	23831	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124
53	NC_016601	TG	3	6	23962	23967	0 %	50 %	50 %	0 %	375129124
54	NC_016601	CG	3	6	24147	24152	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124
55	NC_016601	GA	4	8	24178	24185	50 %	0 %	50 %	0 %	375129124
56	NC_016601	CG	3	6	24546	24551	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124
57	NC_016601	AC	3	6	25377	25382	50 %	0 %	0 %	50 %	375129124
58	NC_016601	AC	3	6	26580	26585	50 %	0 %	0 %	50 %	375129125
59	NC_016601	TC	3	6	27072	27077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016601	GC	3	6	27535	27540	0 %	0 %	50 %	50 %	375129126
61	NC_016601	GA	3	6	28088	28093	50 %	0 %	50 %	0 %	375129126
62	NC_016601	CA	3	6	28197	28202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016601	CG	3	6	29675	29680	0 %	0 %	50 %	50 %	375129129
64	NC_016601	CG	3	6	29825	29830	0 %	0 %	50 %	50 %	375129129
65	NC_016601	TG	3	6	30694	30699	0 %	50 %	50 %	0 %	375129129
66	NC_016601	GC	3	6	31822	31827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016601	GC	4	8	32100	32107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016601	AT	3	6	33049	33054	50 %	50 %	0 %	0 %	375129130
69	NC_016601	CT	3	6	33077	33082	0 %	50 %	0 %	50 %	375129130
70	NC_016601	AG	3	6	33985	33990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016601	GC	3	6	35884	35889	0 %	0 %	50 %	50 %	375129133
72	NC_016601	CG	3	6	36343	36348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016601	GC	4	8	36866	36873	0 %	0 %	50 %	50 %	375129134
74	NC_016601	CT	3	6	37386	37391	0 %	50 %	0 %	50 %	375129134
75	NC_016601	GT	3	6	37794	37799	0 %	50 %	50 %	0 %	375129134
76	NC_016601	GC	3	6	38286	38291	0 %	0 %	50 %	50 %	375129135
77	NC_016601	CG	3	6	38917	38922	0 %	0 %	50 %	50 %	375129135
78	NC_016601	CG	3	6	39242	39247	0 %	0 %	50 %	50 %	375129135
79	NC_016601	TG	3	6	42095	42100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016601	CG	3	6	42655	42660	0 %	0 %	50 %	50 %	375129136
81	NC_016601	GC	3	6	42716	42721	0 %	0 %	50 %	50 %	375129136
82	NC_016601	TC	3	6	42849	42854	0 %	50 %	0 %	50 %	375129136
83	NC_016601	CG	3	6	43174	43179	0 %	0 %	50 %	50 %	375129136
84	NC_016601	CG	3	6	43227	43232	0 %	0 %	50 %	50 %	375129136
85	NC_016601	GT	3	6	44070	44075	0 %	50 %	50 %	0 %	375129137
86	NC_016601	GC	3	6	44527	44532	0 %	0 %	50 %	50 %	375129137
87	NC_016601	CG	3	6	45054	45059	0 %	0 %	50 %	50 %	375129138
88	NC_016601	AC	3	6	45382	45387	50 %	0 %	0 %	50 %	375129138
89	NC_016601	AG	3	6	45961	45966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016601	CA	3	6	46219	46224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016601	GA	3	6	46474	46479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016601	GC	3	6	47496	47501	0 %	0 %	50 %	50 %	375129139
93	NC_016601	AG	3	6	47741	47746	50 %	0 %	50 %	0 %	375129139
94	NC_016601	GC	3	6	48172	48177	0 %	0 %	50 %	50 %	375129140
95	NC_016601	GC	3	6	49904	49909	0 %	0 %	50 %	50 %	375129141
96	NC_016601	CG	3	6	50159	50164	0 %	0 %	50 %	50 %	375129141
97	NC_016601	GC	3	6	50373	50378	0 %	0 %	50 %	50 %	375129141
98	NC_016601	GC	3	6	50683	50688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016601	GC	3	6	51133	51138	0 %	0 %	50 %	50 %	375129142
100	NC_016601	TG	3	6	51537	51542	0 %	50 %	50 %	0 %	375129142
101	NC_016601	AG	3	6	51951	51956	50 %	0 %	50 %	0 %	375129142
102	NC_016601	GC	3	6	52096	52101	0 %	0 %	50 %	50 %	375129143
103	NC_016601	CG	3	6	53361	53366	0 %	0 %	50 %	50 %	375129144
104	NC_016601	AC	3	6	54680	54685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016601	CT	3	6	54687	54692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016601	GC	3	6	54930	54935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016601	CT	4	8	54946	54953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016601	AG	3	6	55075	55080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016601	CG	3	6	55473	55478	0 %	0 %	50 %	50 %	375129146
110	NC_016601	GC	4	8	55638	55645	0 %	0 %	50 %	50 %	375129146
111	NC_016601	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016601	CG	3	6	56353	56358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016601	TG	3	6	56807	56812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016601	CG	4	8	57288	57295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016601	GC	4	8	57555	57562	0 %	0 %	50 %	50 %	375129148
116	NC_016601	CG	3	6	58782	58787	0 %	0 %	50 %	50 %	375129150
117	NC_016601	CG	3	6	59015	59020	0 %	0 %	50 %	50 %	375129150
118	NC_016601	CG	3	6	59142	59147	0 %	0 %	50 %	50 %	375129150
119	NC_016601	AG	3	6	59409	59414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016601	CA	3	6	59477	59482	50 %	0 %	0 %	50 %	375129151
121	NC_016601	GC	3	6	59973	59978	0 %	0 %	50 %	50 %	375129152
122	NC_016601	CG	3	6	61309	61314	0 %	0 %	50 %	50 %	375129154
123	NC_016601	GC	3	6	61707	61712	0 %	0 %	50 %	50 %	375129155
124	NC_016601	GC	3	6	62520	62525	0 %	0 %	50 %	50 %	375129157
125	NC_016601	GC	3	6	62715	62720	0 %	0 %	50 %	50 %	375129157
126	NC_016601	CG	3	6	62746	62751	0 %	0 %	50 %	50 %	375129157
127	NC_016601	CT	3	6	63078	63083	0 %	50 %	0 %	50 %	375129157
128	NC_016601	GA	3	6	63149	63154	50 %	0 %	50 %	0 %	375129157
129	NC_016601	CG	4	8	63708	63715	0 %	0 %	50 %	50 %	375129158
130	NC_016601	GC	3	6	64059	64064	0 %	0 %	50 %	50 %	375129158
131	NC_016601	GC	3	6	65361	65366	0 %	0 %	50 %	50 %	375129158
132	NC_016601	AG	3	6	65806	65811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016601	GC	3	6	66079	66084	0 %	0 %	50 %	50 %	375129159

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.