MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED02

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016600	GAC	2	6	1728	1733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016600	CCG	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016600	ACG	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016600	CCT	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016600	GAA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016600	GGT	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016600	CGC	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016600	TCG	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016600	GGT	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016600	CAG	2	6	3058	3063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016600	TCG	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016600	CGT	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016600	GCG	2	6	3232	3237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016600	CGC	2	6	3258	3263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016600	ACG	3	9	3344	3352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016600	TTC	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016600	GCT	3	9	3719	3727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016600	ACG	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016600	GTG	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016600	GTT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016600	GCG	2	6	6308	6313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016600	TGG	2	6	6758	6763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016600	GCG	2	6	6795	6800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016600	CGC	2	6	6813	6818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016600	TCG	2	6	9812	9817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016600	GCC	2	6	9843	9848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016600	CGA	2	6	9852	9857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016600	GCA	2	6	10822	10827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016600	GCG	3	9	10849	10857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016600	CCG	2	6	10870	10875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016600	CGG	2	6	10926	10931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016600	ACG	2	6	12403	12408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016600	AGC	2	6	12421	12426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016600	GCC	2	6	12524	12529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016600	CTG	2	6	12563	12568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016600	CCG	2	6	12609	12614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016600	GGC	2	6	12629	12634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016600	GGT	3	9	12706	12714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016600	GTC	2	6	12747	12752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016600	ACG	2	6	13002	13007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016600	GGC	2	6	13039	13044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016600	CCG	2	6	13046	13051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016600	GCA	2	6	13065	13070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016600	CGC	2	6	13204	13209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016600	GGC	3	9	13210	13218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016600	CGT	2	6	13239	13244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016600	GCA	2	6	13399	13404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016600	GAT	2	6	13515	13520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016600	TCC	2	6	13531	13536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016600	GAC	2	6	13566	13571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016600	TCT	2	6	13645	13650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016600	GCC	2	6	13676	13681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016600	CCG	2	6	18215	18220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016600	GCT	2	6	19824	19829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016600	GAA	2	6	21774	21779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016600	CAG	2	6	23182	23187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016600	GCT	2	6	23258	23263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016600	AGC	2	6	23357	23362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016600	CGT	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016600	GGC	2	6	24574	24579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016600	CGC	2	6	24621	24626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016600	GAC	2	6	24627	24632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016600	GCT	2	6	24633	24638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016600	GCT	2	6	24705	24710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016600	TCG	2	6	29156	29161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016600	GAT	2	6	29193	29198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016600	CCG	2	6	29253	29258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016600	TGC	2	6	29385	29390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016600	TCG	2	6	29439	29444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016600	TTC	2	6	29447	29452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016600	GAT	2	6	29476	29481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016600	CGA	2	6	29484	29489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016600	CCG	2	6	29553	29558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016600	GCC	2	6	29580	29585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016600	GCC	2	6	29624	29629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016600	CGG	2	6	29641	29646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016600	CTC	2	6	29720	29725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016600	TCG	2	6	29766	29771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016600	CAT	2	6	30507	30512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016600	GCC	2	6	30534	30539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016600	GGC	2	6	31684	31689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016600	CAT	2	6	31855	31860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016600	TGG	2	6	31894	31899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016600	CGC	2	6	31937	31942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016600	CAC	2	6	32005	32010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016600	ACT	2	6	32075	32080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016600	TGC	2	6	32099	32104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016600	CGG	2	6	32111	32116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016600	GCT	2	6	32145	32150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016600	CCG	2	6	32183	32188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016600	TCC	2	6	33497	33502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016600	TCG	2	6	36623	36628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016600	GCC	2	6	36629	36634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016600	CGG	2	6	36743	36748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016600	GGA	2	6	36765	36770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016600	TCG	2	6	36776	36781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016600	GGT	2	6	36913	36918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016600	ACC	2	6	37061	37066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016600	TTC	2	6	39986	39991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016600	CCG	2	6	41771	41776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016600	GCG	2	6	41810	41815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016600	GAG	2	6	41861	41866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016600	AGC	2	6	42843	42848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016600	TCC	3	9	42868	42876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016600	CGG	2	6	43162	43167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016600	CTA	2	6	43246	43251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016600	CGT	2	6	43272	43277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016600	GGC	2	6	43308	43313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016600	CCT	2	6	43317	43322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016600	CGG	2	6	43407	43412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016600	GCG	3	9	45296	45304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016600	GGC	2	6	45378	45383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016600	GCT	3	9	45406	45414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016600	CGC	2	6	45437	45442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016600	AGT	2	6	45486	45491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016600	TCG	2	6	45529	45534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016600	GGC	2	6	45539	45544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.