MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p6

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016597	GCACG	2	10	1024	1033	20 %	0 %	40 %	40 %	392380388
2	NC_016597	GGCTG	2	10	1824	1833	0 %	20 %	60 %	20 %	392380388
3	NC_016597	ACGGC	2	10	3593	3602	20 %	0 %	40 %	40 %	392380389
4	NC_016597	CCGGC	2	10	4182	4191	0 %	0 %	40 %	60 %	392380389
5	NC_016597	CCGCG	2	10	6304	6313	0 %	0 %	40 %	60 %	392380390
6	NC_016597	TCGGC	2	10	7432	7441	0 %	20 %	40 %	40 %	392380392
7	NC_016597	GCCCG	2	10	10297	10306	0 %	0 %	40 %	60 %	392380395
8	NC_016597	CGGAC	2	10	10827	10836	20 %	0 %	40 %	40 %	392380395
9	NC_016597	ACCGC	2	10	11067	11076	20 %	0 %	20 %	60 %	392380395
10	NC_016597	CGCGG	2	10	11714	11723	0 %	0 %	60 %	40 %	392380396
11	NC_016597	CAGCG	2	10	12486	12495	20 %	0 %	40 %	40 %	392380396
12	NC_016597	ACCGG	2	10	14931	14940	20 %	0 %	40 %	40 %	392380398
13	NC_016597	CGGAC	2	10	16781	16790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016597	GCGCG	2	10	18341	18350	0 %	0 %	60 %	40 %	392380400
15	NC_016597	CACAC	2	10	19146	19155	40 %	0 %	0 %	60 %	392380400
16	NC_016597	CCGGC	2	10	20081	20090	0 %	0 %	40 %	60 %	392380400
17	NC_016597	AGCAC	2	10	20671	20680	40 %	0 %	20 %	40 %	392380401
18	NC_016597	GCTGG	2	10	23320	23329	0 %	20 %	60 %	20 %	392380403
19	NC_016597	TGCCG	2	10	28159	28168	0 %	20 %	40 %	40 %	392380407
20	NC_016597	CGGCG	2	10	31123	31132	0 %	0 %	60 %	40 %	392380410
21	NC_016597	GGAAG	2	10	31402	31411	40 %	0 %	60 %	0 %	392380411
22	NC_016597	GCGCG	2	10	31441	31450	0 %	0 %	60 %	40 %	392380411
23	NC_016597	CCAGG	2	10	31801	31810	20 %	0 %	40 %	40 %	392380411
24	NC_016597	GACCC	2	10	32178	32187	20 %	0 %	20 %	60 %	392380411
25	NC_016597	ATCCG	2	10	32253	32262	20 %	20 %	20 %	40 %	392380411
26	NC_016597	GTCGC	2	10	32896	32905	0 %	20 %	40 %	40 %	392380412
27	NC_016597	AGGAA	2	10	34335	34344	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016597	TCGCC	2	10	34792	34801	0 %	20 %	20 %	60 %	392380413
29	NC_016597	GGCGT	2	10	34929	34938	0 %	20 %	60 %	20 %	392380413
30	NC_016597	CTGCG	2	10	36922	36931	0 %	20 %	40 %	40 %	392380414
31	NC_016597	GCGGG	2	10	39117	39126	0 %	0 %	80 %	20 %	392380415
32	NC_016597	CCGTC	2	10	39415	39424	0 %	20 %	20 %	60 %	392380416
33	NC_016597	CGGTG	2	10	40736	40745	0 %	20 %	60 %	20 %	392380417
34	NC_016597	CGCGC	2	10	44247	44256	0 %	0 %	40 %	60 %	392380418
35	NC_016597	CAGGG	2	10	44322	44331	20 %	0 %	60 %	20 %	392380418
36	NC_016597	GCGCC	2	10	45359	45368	0 %	0 %	40 %	60 %	392380418
37	NC_016597	CGGCT	2	10	48141	48150	0 %	20 %	40 %	40 %	392380420
38	NC_016597	GCCTG	2	10	48527	48536	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016597	CGCGG	2	10	49598	49607	0 %	0 %	60 %	40 %	392380421
40	NC_016597	CCGCG	2	10	50154	50163	0 %	0 %	40 %	60 %	392380422
41	NC_016597	TGTCC	2	10	57313	57322	0 %	40 %	20 %	40 %	392380428
42	NC_016597	GGAAA	2	10	57673	57682	60 %	0 %	40 %	0 %	392380429
43	NC_016597	CCGGC	2	10	57938	57947	0 %	0 %	40 %	60 %	392380429
44	NC_016597	AAAGG	2	10	57992	58001	60 %	0 %	40 %	0 %	392380429
45	NC_016597	CGGCG	2	10	62409	62418	0 %	0 %	60 %	40 %	392380432
46	NC_016597	GCGTC	2	10	62730	62739	0 %	20 %	40 %	40 %	392380432
47	NC_016597	CCCGC	2	10	64294	64303	0 %	0 %	20 %	80 %	392380433
48	NC_016597	CCCGG	2	10	65321	65330	0 %	0 %	40 %	60 %	392380435
49	NC_016597	GCGGT	2	10	66030	66039	0 %	20 %	60 %	20 %	392380435
50	NC_016597	GGCCC	2	10	66123	66132	0 %	0 %	40 %	60 %	392380435
51	NC_016597	ATCGG	2	10	66174	66183	20 %	20 %	40 %	20 %	392380435
52	NC_016597	CGGCG	2	10	68121	68130	0 %	0 %	60 %	40 %	392380436
53	NC_016597	CGGTG	2	10	68778	68787	0 %	20 %	60 %	20 %	392380436
54	NC_016597	CGCGG	2	10	69792	69801	0 %	0 %	60 %	40 %	392380436
55	NC_016597	GCGAC	2	10	70166	70175	20 %	0 %	40 %	40 %	392380436
56	NC_016597	GACCA	2	10	72103	72112	40 %	0 %	20 %	40 %	392380438
57	NC_016597	CCGGG	2	10	72218	72227	0 %	0 %	60 %	40 %	392380438
58	NC_016597	GACCA	2	10	73060	73069	40 %	0 %	20 %	40 %	392380439
59	NC_016597	CGCGG	2	10	74376	74385	0 %	0 %	60 %	40 %	392380439
60	NC_016597	CCCGG	2	10	76406	76415	0 %	0 %	40 %	60 %	392380440
61	NC_016597	GCGCG	2	10	77588	77597	0 %	0 %	60 %	40 %	392380441
62	NC_016597	CCGCG	2	10	78575	78584	0 %	0 %	40 %	60 %	392380441
63	NC_016597	GACCG	2	10	79581	79590	20 %	0 %	40 %	40 %	392380441
64	NC_016597	GGACC	2	10	80744	80753	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016597	GCCGC	2	10	80963	80972	0 %	0 %	40 %	60 %	392380442
66	NC_016597	CAGGA	2	10	83433	83442	40 %	0 %	40 %	20 %	392380445
67	NC_016597	GGCTG	2	10	84220	84229	0 %	20 %	60 %	20 %	392380445
68	NC_016597	CACCC	2	10	84849	84858	20 %	0 %	0 %	80 %	392380446
69	NC_016597	GCCAT	2	10	85008	85017	20 %	20 %	20 %	40 %	392380446
70	NC_016597	CCGCG	2	10	85179	85188	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_016597	TTTCT	2	10	85368	85377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016597	AAAAG	2	10	85419	85428	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016597	CGGGA	2	10	86329	86338	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016597	GGGCC	2	10	87530	87539	0 %	0 %	60 %	40 %	392380449
75	NC_016597	CTCGC	2	10	87564	87573	0 %	20 %	20 %	60 %	392380449
76	NC_016597	TTTGT	2	10	89662	89671	0 %	80 %	20 %	0 %	392380451
77	NC_016597	CATGG	2	10	91876	91885	20 %	20 %	40 %	20 %	392380453
78	NC_016597	TCCGG	2	10	92906	92915	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016597	CCCCG	2	10	92916	92925	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
80	NC_016597	GGTGT	2	10	94240	94249	0 %	40 %	60 %	0 %	392380455
81	NC_016597	GTCAG	2	10	96554	96563	20 %	20 %	40 %	20 %	392380457
82	NC_016597	ATCCA	2	10	96818	96827	40 %	20 %	0 %	40 %	392380457
83	NC_016597	GGGCC	2	10	97729	97738	0 %	0 %	60 %	40 %	392380458
84	NC_016597	AGATC	2	10	102705	102714	40 %	20 %	20 %	20 %	392380460
85	NC_016597	CGCGC	2	10	103321	103330	0 %	0 %	40 %	60 %	392380460
86	NC_016597	TCCAT	2	10	103878	103887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016597	GGTCA	2	10	105603	105612	20 %	20 %	40 %	20 %	392380463
88	NC_016597	GGGTT	2	10	105813	105822	0 %	40 %	60 %	0 %	392380463
89	NC_016597	TCCGG	2	10	107610	107619	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016597	TGCCG	2	10	108749	108758	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016597	TGGCG	2	10	110256	110265	0 %	20 %	60 %	20 %	392380466
92	NC_016597	CGCGC	2	10	110520	110529	0 %	0 %	40 %	60 %	392380466
93	NC_016597	GTTTC	2	10	111705	111714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016597	GCATC	2	10	111860	111869	20 %	20 %	20 %	40 %	392380468
95	NC_016597	CGCGG	2	10	115235	115244	0 %	0 %	60 %	40 %	392380469
96	NC_016597	GCCGT	2	10	115514	115523	0 %	20 %	40 %	40 %	392380469
97	NC_016597	CGTGG	2	10	116178	116187	0 %	20 %	60 %	20 %	392380469
98	NC_016597	GCGCC	2	10	116200	116209	0 %	0 %	40 %	60 %	392380469
99	NC_016597	AGGGC	2	10	116422	116431	20 %	0 %	60 %	20 %	392380469
100	NC_016597	GCGGG	2	10	117112	117121	0 %	0 %	80 %	20 %	392380470
101	NC_016597	GACCG	2	10	117442	117451	20 %	0 %	40 %	40 %	392380470
102	NC_016597	CGTCC	3	15	118511	118525	0 %	20 %	20 %	60 %	392380471
103	NC_016597	GCCGG	2	10	119231	119240	0 %	0 %	60 %	40 %	392380472
104	NC_016597	CGCGC	2	10	120956	120965	0 %	0 %	40 %	60 %	392380473
105	NC_016597	GGACG	2	10	121395	121404	20 %	0 %	60 %	20 %	392380473
106	NC_016597	CGGCC	2	10	121592	121601	0 %	0 %	40 %	60 %	392380473
107	NC_016597	TGGCC	2	10	121756	121765	0 %	20 %	40 %	40 %	392380473
108	NC_016597	GCCGG	2	10	123408	123417	0 %	0 %	60 %	40 %	392380474
109	NC_016597	GTCCA	2	10	124414	124423	20 %	20 %	20 %	40 %	392380475
110	NC_016597	GCGCC	2	10	124470	124479	0 %	0 %	40 %	60 %	392380475
111	NC_016597	CGGGG	2	10	126254	126263	0 %	0 %	80 %	20 %	392380476
112	NC_016597	TCTCG	2	10	127730	127739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016597	TTCCT	2	10	127801	127810	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016597	AGTCC	2	10	129486	129495	20 %	20 %	20 %	40 %	392380478
115	NC_016597	AGCGC	2	10	132221	132230	20 %	0 %	40 %	40 %	392380481
116	NC_016597	AGGCG	2	10	135210	135219	20 %	0 %	60 %	20 %	392380484
117	NC_016597	AGGTC	2	10	136718	136727	20 %	20 %	40 %	20 %	392380485
118	NC_016597	GGCGA	2	10	138250	138259	20 %	0 %	60 %	20 %	392380486
119	NC_016597	GGTCG	2	10	139179	139188	0 %	20 %	60 %	20 %	392380486
120	NC_016597	AGGAT	2	10	140170	140179	40 %	20 %	40 %	0 %	392380486
121	NC_016597	TGGAA	2	10	140523	140532	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016597	TCCCG	2	10	143613	143622	0 %	20 %	20 %	60 %	392380494
123	NC_016597	TCCGT	2	10	144857	144866	0 %	40 %	20 %	40 %	392380496
124	NC_016597	TGTGC	2	10	145461	145470	0 %	40 %	40 %	20 %	392380496
125	NC_016597	CCGGC	2	10	147241	147250	0 %	0 %	40 %	60 %	392380496
126	NC_016597	GCGCG	2	10	147812	147821	0 %	0 %	60 %	40 %	392380496
127	NC_016597	CGGGC	2	10	149021	149030	0 %	0 %	60 %	40 %	392380496
128	NC_016597	GGGCT	2	10	149213	149222	0 %	20 %	60 %	20 %	392380496
129	NC_016597	GCCTC	2	10	152905	152914	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_016597	GCGCC	2	10	156863	156872	0 %	0 %	40 %	60 %	392380506
131	NC_016597	GGGAC	2	10	157623	157632	20 %	0 %	60 %	20 %	392380507
132	NC_016597	GGGCA	3	15	157771	157785	20 %	0 %	60 %	20 %	392380507
133	NC_016597	GCCCA	2	10	159004	159013	20 %	0 %	20 %	60 %	392380507
134	NC_016597	CGGCC	2	10	159251	159260	0 %	0 %	40 %	60 %	392380507
135	NC_016597	GCGCC	2	10	159646	159655	0 %	0 %	40 %	60 %	392380508
136	NC_016597	TTATT	2	10	159813	159822	20 %	80 %	0 %	0 %	392380509
137	NC_016597	GGGCG	2	10	160713	160722	0 %	0 %	80 %	20 %	392380510
138	NC_016597	GCGCG	2	10	166453	166462	0 %	0 %	60 %	40 %	392380512

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.