MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p6

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016597	CCGA	2	8	1775	1782	25 %	0 %	25 %	50 %	392380388
2	NC_016597	GCCA	2	8	2017	2024	25 %	0 %	25 %	50 %	392380389
3	NC_016597	TGGC	2	8	2163	2170	0 %	25 %	50 %	25 %	392380389
4	NC_016597	GCGG	2	8	2178	2185	0 %	0 %	75 %	25 %	392380389
5	NC_016597	GGGC	2	8	2377	2384	0 %	0 %	75 %	25 %	392380389
6	NC_016597	ACGG	2	8	2711	2718	25 %	0 %	50 %	25 %	392380389
7	NC_016597	CGAC	2	8	3074	3081	25 %	0 %	25 %	50 %	392380389
8	NC_016597	GACG	2	8	3642	3649	25 %	0 %	50 %	25 %	392380389
9	NC_016597	ACGG	2	8	3832	3839	25 %	0 %	50 %	25 %	392380389
10	NC_016597	ACCG	2	8	4021	4028	25 %	0 %	25 %	50 %	392380389
11	NC_016597	TGCG	2	8	4573	4580	0 %	25 %	50 %	25 %	392380389
12	NC_016597	TCCT	2	8	5080	5087	0 %	50 %	0 %	50 %	392380390
13	NC_016597	GACA	2	8	5176	5183	50 %	0 %	25 %	25 %	392380390
14	NC_016597	TCCG	3	12	5562	5573	0 %	25 %	25 %	50 %	392380390
15	NC_016597	CGAT	2	8	6521	6528	25 %	25 %	25 %	25 %	392380390
16	NC_016597	CCGT	2	8	7252	7259	0 %	25 %	25 %	50 %	392380391
17	NC_016597	GTCG	2	8	7475	7482	0 %	25 %	50 %	25 %	392380392
18	NC_016597	ACCG	2	8	8259	8266	25 %	0 %	25 %	50 %	392380392
19	NC_016597	GCCC	2	8	8465	8472	0 %	0 %	25 %	75 %	392380392
20	NC_016597	GACC	2	8	8607	8614	25 %	0 %	25 %	50 %	392380393
21	NC_016597	GAGC	2	8	8700	8707	25 %	0 %	50 %	25 %	392380393
22	NC_016597	GGGC	2	8	9407	9414	0 %	0 %	75 %	25 %	392380393
23	NC_016597	AGCA	2	8	9480	9487	50 %	0 %	25 %	25 %	392380394
24	NC_016597	CGCC	2	8	10223	10230	0 %	0 %	25 %	75 %	392380394
25	NC_016597	CACG	2	8	10607	10614	25 %	0 %	25 %	50 %	392380395
26	NC_016597	CTCG	2	8	10623	10630	0 %	25 %	25 %	50 %	392380395
27	NC_016597	CCCG	2	8	10653	10660	0 %	0 %	25 %	75 %	392380395
28	NC_016597	GGCC	2	8	10689	10696	0 %	0 %	50 %	50 %	392380395
29	NC_016597	TGGC	2	8	10756	10763	0 %	25 %	50 %	25 %	392380395
30	NC_016597	GCTC	2	8	10863	10870	0 %	25 %	25 %	50 %	392380395
31	NC_016597	GTGC	2	8	10956	10963	0 %	25 %	50 %	25 %	392380395
32	NC_016597	CCAG	2	8	11296	11303	25 %	0 %	25 %	50 %	392380396
33	NC_016597	CTTC	2	8	11377	11384	0 %	50 %	0 %	50 %	392380396
34	NC_016597	CCGG	2	8	11634	11641	0 %	0 %	50 %	50 %	392380396
35	NC_016597	CCAG	2	8	11833	11840	25 %	0 %	25 %	50 %	392380396
36	NC_016597	GCCA	2	8	12756	12763	25 %	0 %	25 %	50 %	392380396
37	NC_016597	GGTC	2	8	13489	13496	0 %	25 %	50 %	25 %	392380397
38	NC_016597	CGTC	2	8	13732	13739	0 %	25 %	25 %	50 %	392380397
39	NC_016597	CGGC	2	8	14279	14286	0 %	0 %	50 %	50 %	392380397
40	NC_016597	GGAC	2	8	14567	14574	25 %	0 %	50 %	25 %	392380398
41	NC_016597	GACG	2	8	15234	15241	25 %	0 %	50 %	25 %	392380398
42	NC_016597	AGGA	2	8	15457	15464	50 %	0 %	50 %	0 %	392380398
43	NC_016597	CAGA	2	8	16102	16109	50 %	0 %	25 %	25 %	392380398
44	NC_016597	TCGA	2	8	16390	16397	25 %	25 %	25 %	25 %	392380398
45	NC_016597	CGGC	2	8	17717	17724	0 %	0 %	50 %	50 %	392380399
46	NC_016597	CGGC	2	8	18493	18500	0 %	0 %	50 %	50 %	392380400
47	NC_016597	CGCC	2	8	18978	18985	0 %	0 %	25 %	75 %	392380400
48	NC_016597	GCGG	2	8	19002	19009	0 %	0 %	75 %	25 %	392380400
49	NC_016597	CGCC	2	8	19871	19878	0 %	0 %	25 %	75 %	392380400
50	NC_016597	TGGA	2	8	20021	20028	25 %	25 %	50 %	0 %	392380400
51	NC_016597	CGTC	2	8	20449	20456	0 %	25 %	25 %	50 %	392380401
52	NC_016597	GCCG	2	8	20516	20523	0 %	0 %	50 %	50 %	392380401
53	NC_016597	CCGA	2	8	20973	20980	25 %	0 %	25 %	50 %	392380401
54	NC_016597	CCGC	2	8	21620	21627	0 %	0 %	25 %	75 %	392380401
55	NC_016597	CGGC	2	8	21850	21857	0 %	0 %	50 %	50 %	392380402
56	NC_016597	CCAT	2	8	22521	22528	25 %	25 %	0 %	50 %	392380402
57	NC_016597	ACCG	2	8	24297	24304	25 %	0 %	25 %	50 %	392380404
58	NC_016597	GCTG	2	8	24921	24928	0 %	25 %	50 %	25 %	392380405
59	NC_016597	CGCC	2	8	24929	24936	0 %	0 %	25 %	75 %	392380405
60	NC_016597	GGCC	2	8	25236	25243	0 %	0 %	50 %	50 %	392380405
61	NC_016597	CGAG	2	8	25350	25357	25 %	0 %	50 %	25 %	392380405
62	NC_016597	GCTC	2	8	26423	26430	0 %	25 %	25 %	50 %	392380406
63	NC_016597	CCGC	2	8	26471	26478	0 %	0 %	25 %	75 %	392380406
64	NC_016597	AGAT	2	8	27040	27047	50 %	25 %	25 %	0 %	392380406
65	NC_016597	CCGT	2	8	27055	27062	0 %	25 %	25 %	50 %	392380406
66	NC_016597	CCAG	2	8	27554	27561	25 %	0 %	25 %	50 %	392380406
67	NC_016597	GAAC	2	8	27695	27702	50 %	0 %	25 %	25 %	392380406
68	NC_016597	CCAC	2	8	28009	28016	25 %	0 %	0 %	75 %	392380407
69	NC_016597	GCTC	2	8	28437	28444	0 %	25 %	25 %	50 %	392380408
70	NC_016597	CGCC	2	8	28501	28508	0 %	0 %	25 %	75 %	392380408
71	NC_016597	CGAG	2	8	28614	28621	25 %	0 %	50 %	25 %	392380408
72	NC_016597	GGTC	2	8	28851	28858	0 %	25 %	50 %	25 %	392380408
73	NC_016597	GCGT	2	8	28868	28875	0 %	25 %	50 %	25 %	392380408
74	NC_016597	CGGG	2	8	29050	29057	0 %	0 %	75 %	25 %	392380408
75	NC_016597	CGGT	2	8	30666	30673	0 %	25 %	50 %	25 %	392380410
76	NC_016597	CAGG	2	8	30836	30843	25 %	0 %	50 %	25 %	392380410
77	NC_016597	GATC	2	8	30934	30941	25 %	25 %	25 %	25 %	392380410
78	NC_016597	GACG	2	8	31034	31041	25 %	0 %	50 %	25 %	392380410
79	NC_016597	CGGC	2	8	31531	31538	0 %	0 %	50 %	50 %	392380411
80	NC_016597	CTGC	2	8	31587	31594	0 %	25 %	25 %	50 %	392380411
81	NC_016597	GCCG	2	8	31654	31661	0 %	0 %	50 %	50 %	392380411
82	NC_016597	CCGC	2	8	31786	31793	0 %	0 %	25 %	75 %	392380411
83	NC_016597	CGGG	2	8	32592	32599	0 %	0 %	75 %	25 %	392380412
84	NC_016597	CCAC	2	8	32630	32637	25 %	0 %	0 %	75 %	392380412
85	NC_016597	CGGT	2	8	32847	32854	0 %	25 %	50 %	25 %	392380412
86	NC_016597	TTGG	2	8	32880	32887	0 %	50 %	50 %	0 %	392380412
87	NC_016597	AGGA	2	8	33025	33032	50 %	0 %	50 %	0 %	392380412
88	NC_016597	CATG	2	8	33200	33207	25 %	25 %	25 %	25 %	392380412
89	NC_016597	GGGA	2	8	33341	33348	25 %	0 %	75 %	0 %	392380412
90	NC_016597	AGGC	2	8	33577	33584	25 %	0 %	50 %	25 %	392380412
91	NC_016597	GCCG	2	8	33729	33736	0 %	0 %	50 %	50 %	392380412
92	NC_016597	TCCA	2	8	34484	34491	25 %	25 %	0 %	50 %	392380413
93	NC_016597	GGTC	2	8	34606	34613	0 %	25 %	50 %	25 %	392380413
94	NC_016597	ATCG	2	8	34733	34740	25 %	25 %	25 %	25 %	392380413
95	NC_016597	GTCG	2	8	35333	35340	0 %	25 %	50 %	25 %	392380413
96	NC_016597	ACGA	2	8	36522	36529	50 %	0 %	25 %	25 %	392380414
97	NC_016597	GCCG	2	8	36601	36608	0 %	0 %	50 %	50 %	392380414
98	NC_016597	AGCC	2	8	36914	36921	25 %	0 %	25 %	50 %	392380414
99	NC_016597	CACC	2	8	37050	37057	25 %	0 %	0 %	75 %	392380414
100	NC_016597	CGTC	2	8	37829	37836	0 %	25 %	25 %	50 %	392380415
101	NC_016597	GGGT	2	8	39040	39047	0 %	25 %	75 %	0 %	392380415
102	NC_016597	CGGT	2	8	39109	39116	0 %	25 %	50 %	25 %	392380415
103	NC_016597	AGGA	2	8	39525	39532	50 %	0 %	50 %	0 %	392380416
104	NC_016597	AGGT	2	8	39594	39601	25 %	25 %	50 %	0 %	392380416
105	NC_016597	TCCG	2	8	39685	39692	0 %	25 %	25 %	50 %	392380416
106	NC_016597	GAGC	2	8	40587	40594	25 %	0 %	50 %	25 %	392380417
107	NC_016597	CTGC	2	8	40818	40825	0 %	25 %	25 %	50 %	392380417
108	NC_016597	TCGG	2	8	41511	41518	0 %	25 %	50 %	25 %	392380418
109	NC_016597	GCCA	2	8	41883	41890	25 %	0 %	25 %	50 %	392380418
110	NC_016597	TGGA	2	8	42073	42080	25 %	25 %	50 %	0 %	392380418
111	NC_016597	GGGC	2	8	42687	42694	0 %	0 %	75 %	25 %	392380418
112	NC_016597	CGGC	2	8	42924	42931	0 %	0 %	50 %	50 %	392380418
113	NC_016597	CCGC	2	8	43318	43325	0 %	0 %	25 %	75 %	392380418
114	NC_016597	CGGC	2	8	43393	43400	0 %	0 %	50 %	50 %	392380418
115	NC_016597	GCCC	2	8	43401	43408	0 %	0 %	25 %	75 %	392380418
116	NC_016597	CCCG	2	8	43672	43679	0 %	0 %	25 %	75 %	392380418
117	NC_016597	ACCG	2	8	43782	43789	25 %	0 %	25 %	50 %	392380418
118	NC_016597	AGGG	2	8	43821	43828	25 %	0 %	75 %	0 %	392380418
119	NC_016597	CGGT	2	8	43839	43846	0 %	25 %	50 %	25 %	392380418
120	NC_016597	CCAG	2	8	43939	43946	25 %	0 %	25 %	50 %	392380418
121	NC_016597	CGCC	2	8	44202	44209	0 %	0 %	25 %	75 %	392380418
122	NC_016597	CGTC	2	8	44503	44510	0 %	25 %	25 %	50 %	392380418
123	NC_016597	CGGA	2	8	44514	44521	25 %	0 %	50 %	25 %	392380418
124	NC_016597	CTTC	2	8	44619	44626	0 %	50 %	0 %	50 %	392380418
125	NC_016597	CAAG	2	8	44662	44669	50 %	0 %	25 %	25 %	392380418
126	NC_016597	GCGT	2	8	45261	45268	0 %	25 %	50 %	25 %	392380418
127	NC_016597	GCCG	2	8	46067	46074	0 %	0 %	50 %	50 %	392380419
128	NC_016597	GCCG	2	8	46145	46152	0 %	0 %	50 %	50 %	392380419
129	NC_016597	GCCG	2	8	46289	46296	0 %	0 %	50 %	50 %	392380419
130	NC_016597	CTCG	2	8	46385	46392	0 %	25 %	25 %	50 %	392380419
131	NC_016597	TGCG	2	8	47556	47563	0 %	25 %	50 %	25 %	392380420
132	NC_016597	CGGC	2	8	47843	47850	0 %	0 %	50 %	50 %	392380420
133	NC_016597	GCCC	2	8	49332	49339	0 %	0 %	25 %	75 %	392380421
134	NC_016597	GGCT	2	8	50025	50032	0 %	25 %	50 %	25 %	392380421
135	NC_016597	TCCG	2	8	50237	50244	0 %	25 %	25 %	50 %	392380422
136	NC_016597	GTTC	2	8	50748	50755	0 %	50 %	25 %	25 %	392380422
137	NC_016597	GAGG	2	8	50818	50825	25 %	0 %	75 %	0 %	392380422
138	NC_016597	CCCG	2	8	50985	50992	0 %	0 %	25 %	75 %	392380422
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.