MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p4

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016596	TCAAA	2	10	4450	4459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016596	CCATC	2	10	13648	13657	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016596	CGCGG	2	10	14745	14754	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016596	CGGGA	2	10	15942	15951	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016596	TTCGG	2	10	20442	20451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016596	AGGGG	2	10	21982	21991	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016596	GCCGG	2	10	22525	22534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016596	TCCCC	2	10	33667	33676	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_016596	AGCCG	2	10	53082	53091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016596	CAGGC	2	10	53093	53102	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016596	AGGGG	2	10	59844	59853	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016596	AGGGA	2	10	59882	59891	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016596	AAGTT	2	10	69305	69314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016596	ACGGC	2	10	71315	71324	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016596	TCCCG	2	10	83345	83354	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016596	TGGGG	2	10	90632	90641	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016596	AGGGC	2	10	91968	91977	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016596	TCCCC	2	10	102120	102129	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_016596	GCGCG	2	10	105533	105542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016596	CGCGG	2	10	105629	105638	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016596	AAAAT	2	10	105678	105687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016596	CCCGG	2	10	111370	111379	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_016596	TCCCC	2	10	112251	112260	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_016596	AGGGG	2	10	121337	121346	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016596	AGGGG	2	10	126596	126605	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016596	CCCTG	2	10	126630	126639	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_016596	CCGGT	2	10	130488	130497	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016596	AGGGG	2	10	131053	131062	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016596	CGCGG	2	10	131542	131551	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016596	ACGGG	2	10	132496	132505	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016596	GCGCC	2	10	148764	148773	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016596	CGCGA	2	10	158203	158212	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016596	TCCGA	2	10	158237	158246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016596	CGCCT	2	10	168904	168913	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_016596	CGTCA	2	10	183189	183198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016596	CGGGC	2	10	192897	192906	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016596	CTTTT	2	10	194932	194941	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016596	TTCGG	2	10	199501	199510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016596	GGAGA	2	10	230645	230654	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016596	GCCGT	2	10	235013	235022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016596	TGCGG	2	10	235078	235087	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016596	GCCGC	2	10	235126	235135	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_016596	TTTTA	2	10	246554	246563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016596	GGGGT	2	10	254686	254695	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016596	GGGGA	2	10	260937	260946	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016596	GGCCG	2	10	263700	263709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016596	TCCCG	2	10	268952	268961	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_016596	CGAGA	2	10	269074	269083	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016596	CGGTC	2	10	272250	272259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016596	TCGCT	2	10	272575	272584	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016596	CGGCG	2	10	279369	279378	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016596	GACCG	2	10	293332	293341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016596	GTCGG	2	10	300874	300883	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016596	CCGTC	2	10	303283	303292	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_016596	CGAAA	2	10	310703	310712	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016596	TCGCC	2	10	327463	327472	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_016596	CGGCG	2	10	327828	327837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016596	ACCGC	2	10	328725	328734	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016596	TCCGC	2	10	330630	330639	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_016596	CACGG	2	10	330858	330867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016596	GAACC	2	10	354567	354576	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016596	CCCCA	2	10	356350	356359	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
63	NC_016596	GCCCC	2	10	356367	356376	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_016596	GTTTC	2	10	362838	362847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016596	ATGAG	2	10	362862	362871	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016596	GTCGC	2	10	381370	381379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016596	GACGT	2	10	381423	381432	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016596	CCGAA	2	10	403752	403761	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016596	CGGAC	2	10	409611	409620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016596	CCAAA	2	10	412384	412393	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016596	TCCCC	2	10	422374	422383	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_016596	ACCGC	2	10	432146	432155	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_016596	CGCCC	2	10	434736	434745	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_016596	CGGGG	2	10	443452	443461	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016596	TCCCC	2	10	444653	444662	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
76	NC_016596	TCCCC	2	10	467618	467627	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
77	NC_016596	CCTCG	2	10	470742	470751	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_016596	ACGCG	2	10	475456	475465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016596	GCCGG	2	10	478874	478883	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016596	TGCGC	2	10	501813	501822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016596	CCGAA	2	10	504346	504355	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016596	AGGGG	2	10	517366	517375	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016596	CGCGC	2	10	525279	525288	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_016596	GGACG	2	10	528693	528702	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016596	TCCAG	2	10	529145	529154	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016596	CCCGA	2	10	530159	530168	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_016596	CCGAA	2	10	530295	530304	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016596	CCCTC	2	10	533056	533065	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_016596	TTGGA	2	10	535757	535766	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016596	TCCCC	2	10	535950	535959	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_016596	CGTGA	2	10	542117	542126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016596	GCCGG	2	10	553495	553504	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016596	GCTCG	2	10	555785	555794	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016596	GCGGA	2	10	555880	555889	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016596	AGACC	2	10	588671	588680	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016596	CCCCT	2	10	588753	588762	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
97	NC_016596	AACCG	2	10	593015	593024	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016596	CGGGC	2	10	603719	603728	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016596	AGGGG	2	10	606333	606342	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016596	CGCGA	2	10	607290	607299	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016596	AGGGG	2	10	613484	613493	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016596	GACCA	2	10	621673	621682	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016596	CGTTT	2	10	624524	624533	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016596	ACCCT	2	10	627734	627743	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_016596	CTATG	2	10	628803	628812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016596	CCCGC	2	10	629137	629146	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
107	NC_016596	GGTTC	2	10	640396	640405	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016596	AGGAA	2	10	658285	658294	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016596	CCCCT	2	10	660600	660609	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
110	NC_016596	TGGGG	2	10	660627	660636	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016596	ACGGG	2	10	663318	663327	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016596	AGGGG	2	10	668823	668832	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016596	CGTAC	2	10	681720	681729	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016596	GGCGT	2	10	684293	684302	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016596	CGGCG	2	10	685005	685014	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016596	GGCCC	2	10	685299	685308	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_016596	CCGAT	2	10	686330	686339	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016596	TGCCG	2	10	690166	690175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.