MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p3

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016595	CGCCA	2	10	20224	20233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016595	GCATT	2	10	24981	24990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016595	GGCGG	2	10	35626	35635	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016595	GGCGC	2	10	50988	50997	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016595	GGGCT	2	10	51322	51331	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016595	GCGCC	2	10	51582	51591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_016595	GGGGA	2	10	65929	65938	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016595	CGGTT	2	10	66028	66037	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016595	GGCGA	2	10	73117	73126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016595	GCGCG	2	10	77596	77605	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016595	GGGGT	2	10	77637	77646	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016595	TGCGG	2	10	81484	81493	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016595	TCCCC	2	10	95636	95645	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_016595	GCCCC	2	10	96932	96941	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016595	GTGCC	2	10	115149	115158	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016595	GGCCG	2	10	147028	147037	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016595	GGCGC	2	10	159637	159646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016595	GCTTT	2	10	159719	159728	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016595	CCGTT	2	10	161551	161560	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016595	CCCGG	2	10	185187	185196	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_016595	CAAAA	2	10	186252	186261	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016595	CCCGG	2	10	201836	201845	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_016595	ACGCC	2	10	218758	218767	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016595	CGCTG	2	10	226705	226714	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016595	CCGGC	2	10	228832	228841	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_016595	CTCGC	2	10	230155	230164	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_016595	CGGCA	2	10	242774	242783	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016595	TCCCC	2	10	248107	248116	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_016595	TATAT	3	15	256186	256200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016595	AACCC	2	10	306136	306145	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016595	CCGGC	2	10	307104	307113	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016595	TCGGC	2	10	311629	311638	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016595	CGCGG	2	10	315600	315609	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016595	AGCGC	2	10	357555	357564	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016595	GCAAA	2	10	398947	398956	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016595	CGGGG	2	10	423471	423480	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016595	CCCCG	2	10	423504	423513	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_016595	CCCCT	2	10	430532	430541	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_016595	GGCCG	2	10	432286	432295	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016595	GCGCG	2	10	433384	433393	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016595	GCCGC	2	10	440414	440423	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_016595	GTCCC	2	10	467479	467488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_016595	CGGGG	2	10	467656	467665	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016595	CCGGC	2	10	470061	470070	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_016595	CGTCC	2	10	474405	474414	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016595	ACGGG	2	10	475581	475590	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016595	GCCGC	2	10	481406	481415	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_016595	GAACG	2	10	481416	481425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016595	TTTGG	2	10	486001	486010	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016595	CCCCA	2	10	492260	492269	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_016595	ACGGA	2	10	502606	502615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016595	GCGCC	2	10	503452	503461	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016595	GAAGG	2	10	504213	504222	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016595	TCCCC	2	10	514287	514296	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_016595	GGCGG	2	10	523326	523335	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016595	CCGTC	2	10	524591	524600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_016595	CCGGC	2	10	525333	525342	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016595	CGGTG	2	10	525406	525415	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016595	GCGGG	2	10	526791	526800	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016595	GCGCC	2	10	531945	531954	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_016595	CCAGC	2	10	542375	542384	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_016595	CTTCC	2	10	542522	542531	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_016595	TCAAT	2	10	577677	577686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016595	CGGAG	2	10	577759	577768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016595	CCTCC	2	10	593393	593402	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_016595	GCCGG	2	10	595451	595460	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016595	CGGGC	2	10	643916	643925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016595	GGCCC	2	10	666678	666687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_016595	ATGCA	2	10	667547	667556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016595	TGCGG	2	10	667710	667719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016595	AATGA	2	10	672233	672242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016595	CCAAA	2	10	675176	675185	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016595	CCCTT	2	10	679742	679751	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_016595	TCACG	2	10	688433	688442	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016595	GCCCG	2	10	694512	694521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_016595	GCAAC	2	10	694554	694563	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016595	CGAAC	2	10	698665	698674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016595	TCCCC	2	10	702008	702017	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NC_016595	CCCGC	2	10	707042	707051	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
80	NC_016595	TCCCA	2	10	711326	711335	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_016595	TCCCC	2	10	714479	714488	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_016595	GCCGG	2	10	726991	727000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016595	GCCGG	2	10	727645	727654	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016595	CGGGC	2	10	728338	728347	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016595	TCCCC	2	10	728388	728397	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
86	NC_016595	AAGCG	2	10	728449	728458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016595	CCGCC	2	10	728548	728557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
88	NC_016595	GCCGC	2	10	737185	737194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_016595	CCCGC	2	10	744123	744132	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
90	NC_016595	CGAGC	2	10	744144	744153	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016595	TTTCA	2	10	758526	758535	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016595	CCCCA	2	10	758872	758881	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
93	NC_016595	GGCAG	2	10	770622	770631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016595	TGCCT	2	10	771567	771576	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016595	CGTCC	2	10	776867	776876	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.