MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p3

Total Repeats: 702

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016595	AGGCG	2	10	580601	580610	20 %	0 %	60 %	20 %	392379470
502	NC_016595	CGGCG	2	10	581806	581815	0 %	0 %	60 %	40 %	392379472
503	NC_016595	GCCCT	2	10	582068	582077	0 %	20 %	20 %	60 %	392379472
504	NC_016595	GCAAG	2	10	585319	585328	40 %	0 %	40 %	20 %	392379474
505	NC_016595	TGCAT	2	10	586632	586641	20 %	40 %	20 %	20 %	392379475
506	NC_016595	CGATC	2	10	588457	588466	20 %	20 %	20 %	40 %	392379478
507	NC_016595	GCGCC	2	10	589839	589848	0 %	0 %	40 %	60 %	392379478
508	NC_016595	TCTGT	2	10	590463	590472	0 %	60 %	20 %	20 %	392379480
509	NC_016595	CGGCG	2	10	590776	590785	0 %	0 %	60 %	40 %	392379480
510	NC_016595	TCCGC	2	10	593174	593183	0 %	20 %	20 %	60 %	392379482
511	NC_016595	GGCTG	2	10	593204	593213	0 %	20 %	60 %	20 %	392379482
512	NC_016595	GCCGC	2	10	593289	593298	0 %	0 %	40 %	60 %	392379482
513	NC_016595	CCTCC	2	10	593393	593402	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
514	NC_016595	ACGCA	2	10	594105	594114	40 %	0 %	20 %	40 %	392379483
515	NC_016595	GCCGG	2	10	595451	595460	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
516	NC_016595	ACGGC	2	10	595755	595764	20 %	0 %	40 %	40 %	392379486
517	NC_016595	TCCTT	2	10	595856	595865	0 %	60 %	0 %	40 %	392379487
518	NC_016595	GCACC	2	10	597018	597027	20 %	0 %	20 %	60 %	392379491
519	NC_016595	ACGCG	2	10	597806	597815	20 %	0 %	40 %	40 %	392379491
520	NC_016595	GCCGC	2	10	598612	598621	0 %	0 %	40 %	60 %	392379494
521	NC_016595	CGAGC	2	10	601230	601239	20 %	0 %	40 %	40 %	392379498
522	NC_016595	AGCCG	2	10	602570	602579	20 %	0 %	40 %	40 %	392379499
523	NC_016595	TCGCC	2	10	602604	602613	0 %	20 %	20 %	60 %	392379499
524	NC_016595	CCGCC	2	10	603311	603320	0 %	0 %	20 %	80 %	392379499
525	NC_016595	GCCCG	2	10	603795	603804	0 %	0 %	40 %	60 %	392379499
526	NC_016595	CGGCG	2	10	604341	604350	0 %	0 %	60 %	40 %	392379499
527	NC_016595	GCGCC	2	10	604364	604373	0 %	0 %	40 %	60 %	392379499
528	NC_016595	CGGCG	2	10	608073	608082	0 %	0 %	60 %	40 %	392379504
529	NC_016595	CGGCG	2	10	608199	608208	0 %	0 %	60 %	40 %	392379504
530	NC_016595	CCGGC	2	10	609454	609463	0 %	0 %	40 %	60 %	392379506
531	NC_016595	CTCAC	2	10	611217	611226	20 %	20 %	0 %	60 %	392379509
532	NC_016595	GCCCC	2	10	611355	611364	0 %	0 %	20 %	80 %	392379509
533	NC_016595	CGCGC	2	10	611506	611515	0 %	0 %	40 %	60 %	392379509
534	NC_016595	TGCTC	2	10	612261	612270	0 %	40 %	20 %	40 %	392379509
535	NC_016595	GGCGC	2	10	612390	612399	0 %	0 %	60 %	40 %	392379509
536	NC_016595	TGCCC	2	10	612579	612588	0 %	20 %	20 %	60 %	392379509
537	NC_016595	CCGGC	2	10	613025	613034	0 %	0 %	40 %	60 %	392379510
538	NC_016595	GGCCC	2	10	613792	613801	0 %	0 %	40 %	60 %	392379512
539	NC_016595	CGGCG	2	10	615964	615973	0 %	0 %	60 %	40 %	392379514
540	NC_016595	GCCTT	2	10	616398	616407	0 %	40 %	20 %	40 %	392379514
541	NC_016595	GGCCG	2	10	617576	617585	0 %	0 %	60 %	40 %	392379517
542	NC_016595	CGGAG	2	10	617908	617917	20 %	0 %	60 %	20 %	392379518
543	NC_016595	CCGGC	2	10	619186	619195	0 %	0 %	40 %	60 %	392379519
544	NC_016595	GAACC	2	10	623842	623851	40 %	0 %	20 %	40 %	392379525
545	NC_016595	CTTGG	2	10	626265	626274	0 %	40 %	40 %	20 %	392379526
546	NC_016595	GCCCG	2	10	626741	626750	0 %	0 %	40 %	60 %	392379527
547	NC_016595	GCCAA	2	10	628530	628539	40 %	0 %	20 %	40 %	392379532
548	NC_016595	CCTGC	2	10	628847	628856	0 %	20 %	20 %	60 %	392379533
549	NC_016595	GTCCG	2	10	628926	628935	0 %	20 %	40 %	40 %	392379533
550	NC_016595	GGTCC	2	10	629516	629525	0 %	20 %	40 %	40 %	392379534
551	NC_016595	GGCGT	2	10	629964	629973	0 %	20 %	60 %	20 %	392379534
552	NC_016595	CGGCG	2	10	631577	631586	0 %	0 %	60 %	40 %	392379537
553	NC_016595	CCGAA	2	10	632143	632152	40 %	0 %	20 %	40 %	392379539
554	NC_016595	CGGAG	2	10	632729	632738	20 %	0 %	60 %	20 %	392379540
555	NC_016595	GCCGG	2	10	632805	632814	0 %	0 %	60 %	40 %	392379540
556	NC_016595	CGCCC	2	10	633112	633121	0 %	0 %	20 %	80 %	392379541
557	NC_016595	GAGCA	2	10	633748	633757	40 %	0 %	40 %	20 %	392379541
558	NC_016595	CGCGT	2	10	634479	634488	0 %	20 %	40 %	40 %	392379543
559	NC_016595	CCAGC	2	10	634522	634531	20 %	0 %	20 %	60 %	392379544
560	NC_016595	CGCGG	2	10	637570	637579	0 %	0 %	60 %	40 %	392379551
561	NC_016595	CCGGG	2	10	640213	640222	0 %	0 %	60 %	40 %	392379557
562	NC_016595	TGCCC	2	10	641312	641321	0 %	20 %	20 %	60 %	392379560
563	NC_016595	CTCTC	2	10	643198	643207	0 %	40 %	0 %	60 %	392379565
564	NC_016595	CGGGC	2	10	643916	643925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
565	NC_016595	TGGCG	2	10	647724	647733	0 %	20 %	60 %	20 %	392379572
566	NC_016595	CCCCT	2	10	647845	647854	0 %	20 %	0 %	80 %	392379573
567	NC_016595	CCGCA	2	10	648568	648577	20 %	0 %	20 %	60 %	392379575
568	NC_016595	GCGCC	2	10	650343	650352	0 %	0 %	40 %	60 %	392379578
569	NC_016595	CCGCG	2	10	650559	650568	0 %	0 %	40 %	60 %	392379578
570	NC_016595	GCGCG	2	10	651863	651872	0 %	0 %	60 %	40 %	392379580
571	NC_016595	GCGCC	2	10	654089	654098	0 %	0 %	40 %	60 %	392379586
572	NC_016595	CGCAG	2	10	654680	654689	20 %	0 %	40 %	40 %	392379588
573	NC_016595	CGGGC	2	10	657968	657977	0 %	0 %	60 %	40 %	392379595
574	NC_016595	GCCCG	2	10	662337	662346	0 %	0 %	40 %	60 %	392379599
575	NC_016595	CACCG	2	10	665146	665155	20 %	0 %	20 %	60 %	392379600
576	NC_016595	ACCGG	2	10	665237	665246	20 %	0 %	40 %	40 %	392379600
577	NC_016595	CGGCC	2	10	665710	665719	0 %	0 %	40 %	60 %	392379601
578	NC_016595	CCCGC	2	10	666010	666019	0 %	0 %	20 %	80 %	392379601
579	NC_016595	CGCTG	2	10	666560	666569	0 %	20 %	40 %	40 %	392379601
580	NC_016595	GGCCC	2	10	666678	666687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
581	NC_016595	TCGCC	2	10	667045	667054	0 %	20 %	20 %	60 %	392379602
582	NC_016595	ATGCA	2	10	667547	667556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
583	NC_016595	TGCGG	2	10	667710	667719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
584	NC_016595	GGGAT	2	10	668262	668271	20 %	20 %	60 %	0 %	392379604
585	NC_016595	CTTCT	2	10	668855	668864	0 %	60 %	0 %	40 %	392379604
586	NC_016595	AATGA	2	10	672233	672242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016595	ACCGA	2	10	672588	672597	40 %	0 %	20 %	40 %	392379609
588	NC_016595	GCGCA	2	10	674029	674038	20 %	0 %	40 %	40 %	392379610
589	NC_016595	CTGCA	2	10	674714	674723	20 %	20 %	20 %	40 %	392379610
590	NC_016595	CCAAA	2	10	675176	675185	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
591	NC_016595	CCGCC	2	10	676129	676138	0 %	0 %	20 %	80 %	392379611
592	NC_016595	AGGCG	2	10	678350	678359	20 %	0 %	60 %	20 %	392379613
593	NC_016595	CCCTT	2	10	679742	679751	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
594	NC_016595	CGGCC	2	10	680129	680138	0 %	0 %	40 %	60 %	392379615
595	NC_016595	CGATC	2	10	680309	680318	20 %	20 %	20 %	40 %	392379615
596	NC_016595	CCTGC	2	10	684170	684179	0 %	20 %	20 %	60 %	392379620
597	NC_016595	CCGCG	2	10	684287	684296	0 %	0 %	40 %	60 %	392379620
598	NC_016595	GCGCC	2	10	684496	684505	0 %	0 %	40 %	60 %	392379620
599	NC_016595	CCGGC	2	10	685468	685477	0 %	0 %	40 %	60 %	392379621
600	NC_016595	GCGCT	2	10	686895	686904	0 %	20 %	40 %	40 %	392379623
601	NC_016595	TCACG	2	10	688433	688442	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
602	NC_016595	CTTCC	2	10	688707	688716	0 %	40 %	0 %	60 %	392379626
603	NC_016595	GCGCG	2	10	689024	689033	0 %	0 %	60 %	40 %	392379626
604	NC_016595	GACCA	2	10	691906	691915	40 %	0 %	20 %	40 %	392379630
605	NC_016595	GCCGC	2	10	692444	692453	0 %	0 %	40 %	60 %	392379630
606	NC_016595	GGGGC	2	10	692834	692843	0 %	0 %	80 %	20 %	392379630
607	NC_016595	CCGGC	2	10	693269	693278	0 %	0 %	40 %	60 %	392379631
608	NC_016595	TGCCC	2	10	693639	693648	0 %	20 %	20 %	60 %	392379632
609	NC_016595	CCGCA	2	10	693715	693724	20 %	0 %	20 %	60 %	392379632
610	NC_016595	CGGCG	2	10	693792	693801	0 %	0 %	60 %	40 %	392379632
611	NC_016595	GCCCG	2	10	694512	694521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
612	NC_016595	GCAAC	2	10	694554	694563	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
613	NC_016595	GCGCA	2	10	695838	695847	20 %	0 %	40 %	40 %	392379634
614	NC_016595	GCCAT	2	10	698390	698399	20 %	20 %	20 %	40 %	392379637
615	NC_016595	CGAAC	2	10	698665	698674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
616	NC_016595	TCCCC	2	10	702008	702017	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
617	NC_016595	CCATC	2	10	702796	702805	20 %	20 %	0 %	60 %	392379641
618	NC_016595	CGGCG	2	10	703644	703653	0 %	0 %	60 %	40 %	392379643
619	NC_016595	CGGCC	2	10	704285	704294	0 %	0 %	40 %	60 %	392379643
620	NC_016595	TTCCA	2	10	705539	705548	20 %	40 %	0 %	40 %	392379645
621	NC_016595	CGGCG	2	10	705806	705815	0 %	0 %	60 %	40 %	392379646
622	NC_016595	CCCGC	2	10	707042	707051	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
623	NC_016595	GGCGC	2	10	707336	707345	0 %	0 %	60 %	40 %	392379647
624	NC_016595	CCGGG	2	10	707818	707827	0 %	0 %	60 %	40 %	392379647
625	NC_016595	CCGCG	2	10	709197	709206	0 %	0 %	40 %	60 %	392379648
626	NC_016595	GACAG	2	10	711214	711223	40 %	0 %	40 %	20 %	392379651
627	NC_016595	TCCCA	2	10	711326	711335	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
628	NC_016595	CAGCG	2	10	712314	712323	20 %	0 %	40 %	40 %	392379653
629	NC_016595	CGTCC	2	10	712975	712984	0 %	20 %	20 %	60 %	392379653
630	NC_016595	TCCCC	2	10	714479	714488	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
631	NC_016595	GCTGG	2	10	716015	716024	0 %	20 %	60 %	20 %	392379656
632	NC_016595	GCCGC	2	10	716819	716828	0 %	0 %	40 %	60 %	392379657
633	NC_016595	GCGCC	3	15	717648	717662	0 %	0 %	40 %	60 %	392379658
634	NC_016595	CGCCC	2	10	718483	718492	0 %	0 %	20 %	80 %	392379659
635	NC_016595	CGGCC	2	10	719156	719165	0 %	0 %	40 %	60 %	392379659
636	NC_016595	GCCGG	2	10	721814	721823	0 %	0 %	60 %	40 %	392379662
637	NC_016595	TGGAC	2	10	722535	722544	20 %	20 %	40 %	20 %	392379663
638	NC_016595	CGGCC	2	10	722650	722659	0 %	0 %	40 %	60 %	392379663
639	NC_016595	CACCG	2	10	722798	722807	20 %	0 %	20 %	60 %	392379663
640	NC_016595	GCCGG	2	10	723032	723041	0 %	0 %	60 %	40 %	392379663
641	NC_016595	CGGCG	2	10	725155	725164	0 %	0 %	60 %	40 %	392379665
642	NC_016595	GACGA	2	10	726552	726561	40 %	0 %	40 %	20 %	392379667
643	NC_016595	CGGCG	2	10	726741	726750	0 %	0 %	60 %	40 %	392379667
644	NC_016595	GCCGG	2	10	726991	727000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
645	NC_016595	GCCGG	2	10	727645	727654	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
646	NC_016595	CGGGC	2	10	728338	728347	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
647	NC_016595	TCCCC	2	10	728388	728397	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
648	NC_016595	AAGCG	2	10	728449	728458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
649	NC_016595	CCGCC	2	10	728548	728557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
650	NC_016595	GCCCT	2	10	729214	729223	0 %	20 %	20 %	60 %	392379669
651	NC_016595	CGGCC	2	10	729777	729786	0 %	0 %	40 %	60 %	392379669
652	NC_016595	CGGCG	2	10	731108	731117	0 %	0 %	60 %	40 %	392379669
653	NC_016595	CACGC	2	10	731478	731487	20 %	0 %	20 %	60 %	392379669
654	NC_016595	CCGGT	2	10	735940	735949	0 %	20 %	40 %	40 %	392379674
655	NC_016595	GGCAC	2	10	736334	736343	20 %	0 %	40 %	40 %	392379675
656	NC_016595	GTGGC	2	10	736783	736792	0 %	20 %	60 %	20 %	392379675
657	NC_016595	GCCGC	2	10	737185	737194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
658	NC_016595	GGGCG	2	10	738156	738165	0 %	0 %	80 %	20 %	392379677
659	NC_016595	GGCCC	2	10	738601	738610	0 %	0 %	40 %	60 %	392379677
660	NC_016595	ACGGC	2	10	739960	739969	20 %	0 %	40 %	40 %	392379678
661	NC_016595	CGGCG	2	10	740141	740150	0 %	0 %	60 %	40 %	392379678
662	NC_016595	GCTGG	2	10	741500	741509	0 %	20 %	60 %	20 %	392379678
663	NC_016595	CGGTG	2	10	742124	742133	0 %	20 %	60 %	20 %	392379678
664	NC_016595	GGCCC	2	10	742524	742533	0 %	0 %	40 %	60 %	392379678
665	NC_016595	CCCGC	2	10	744123	744132	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
666	NC_016595	CGAGC	2	10	744144	744153	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
667	NC_016595	CACCG	2	10	744551	744560	20 %	0 %	20 %	60 %	392379683
668	NC_016595	GGAGC	2	10	745685	745694	20 %	0 %	60 %	20 %	392379683
669	NC_016595	CCCTG	2	10	749284	749293	0 %	20 %	20 %	60 %	392379685
670	NC_016595	ACGGC	2	10	751299	751308	20 %	0 %	40 %	40 %	392379687
671	NC_016595	GCGTC	2	10	755097	755106	0 %	20 %	40 %	40 %	392379689
672	NC_016595	GCCGG	2	10	755671	755680	0 %	0 %	60 %	40 %	392379690
673	NC_016595	GGCTG	2	10	756113	756122	0 %	20 %	60 %	20 %	392379690
674	NC_016595	CGCCA	2	10	756582	756591	20 %	0 %	20 %	60 %	392379690
675	NC_016595	TGCCC	2	10	756924	756933	0 %	20 %	20 %	60 %	392379691
676	NC_016595	CGGCG	2	10	757035	757044	0 %	0 %	60 %	40 %	392379691
677	NC_016595	GGGCC	2	10	757183	757192	0 %	0 %	60 %	40 %	392379691
678	NC_016595	GCGCT	2	10	757462	757471	0 %	20 %	40 %	40 %	392379691
679	NC_016595	GGCGC	2	10	758346	758355	0 %	0 %	60 %	40 %	392379692
680	NC_016595	CGCCA	2	10	758411	758420	20 %	0 %	20 %	60 %	392379692
681	NC_016595	TTTCA	2	10	758526	758535	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
682	NC_016595	CCCCA	2	10	758872	758881	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
683	NC_016595	GGTCG	2	10	759817	759826	0 %	20 %	60 %	20 %	392379694
684	NC_016595	GCCGG	2	10	763177	763186	0 %	0 %	60 %	40 %	392379694
685	NC_016595	CGCGG	2	10	763211	763220	0 %	0 %	60 %	40 %	392379694
686	NC_016595	GGGGC	2	10	764198	764207	0 %	0 %	80 %	20 %	392379695
687	NC_016595	CGGCC	2	10	764460	764469	0 %	0 %	40 %	60 %	392379695
688	NC_016595	CGCCC	2	10	765337	765346	0 %	0 %	20 %	80 %	392379695
689	NC_016595	ACGGC	2	10	766281	766290	20 %	0 %	40 %	40 %	392379696
690	NC_016595	GCTCC	2	10	766868	766877	0 %	20 %	20 %	60 %	392379696
691	NC_016595	GGCGC	2	10	767592	767601	0 %	0 %	60 %	40 %	392379696
692	NC_016595	GGGGA	2	10	768634	768643	20 %	0 %	80 %	0 %	392379699
693	NC_016595	TGGCG	2	10	768948	768957	0 %	20 %	60 %	20 %	392379700
694	NC_016595	GCTTC	2	10	769575	769584	0 %	40 %	20 %	40 %	392379700
695	NC_016595	GCGGA	2	10	769730	769739	20 %	0 %	60 %	20 %	392379701
696	NC_016595	GAAGG	2	10	770477	770486	40 %	0 %	60 %	0 %	392379702
697	NC_016595	GGCAG	2	10	770622	770631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
698	NC_016595	TGCCT	2	10	771567	771576	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
699	NC_016595	GCAGC	2	10	772354	772363	20 %	0 %	40 %	40 %	392379708
700	NC_016595	GCTCG	2	10	773785	773794	0 %	20 %	40 %	40 %	392379710
701	NC_016595	TCCCC	2	10	774893	774902	0 %	20 %	0 %	80 %	392379712
702	NC_016595	CGTCC	2	10	776867	776876	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

< Previous 12Next >