MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p3

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016595	GACG	2	8	14550	14557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016595	GCGG	2	8	25351	25358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016595	CGGC	2	8	35636	35643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016595	GCGG	2	8	39033	39040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016595	TTCT	2	8	40068	40075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016595	CGGA	2	8	47442	47449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016595	CCGT	2	8	50870	50877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016595	TCCG	2	8	51066	51073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016595	CGAG	2	8	51150	51157	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016595	CGGC	2	8	51341	51348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016595	GTGG	2	8	51391	51398	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016595	GCTG	2	8	51816	51823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016595	CGAT	2	8	53091	53098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016595	GCCG	3	12	55151	55162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016595	TGAC	2	8	55687	55694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016595	GTCA	2	8	55696	55703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016595	GTTC	2	8	57498	57505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016595	GATG	2	8	57607	57614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016595	ATGG	2	8	57667	57674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016595	GTCT	2	8	58854	58861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016595	TTCT	2	8	60706	60713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016595	GGCC	2	8	60736	60743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016595	AGCC	2	8	60746	60753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016595	TCGT	2	8	63126	63133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016595	GCCA	2	8	66040	66047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016595	GAAA	2	8	73276	73283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016595	GCTC	2	8	80299	80306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016595	CCCT	2	8	85102	85109	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_016595	CGGC	2	8	85119	85126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016595	GCCG	2	8	87381	87388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016595	AATG	2	8	90470	90477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016595	AGGG	2	8	90738	90745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016595	GGGA	2	8	95622	95629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016595	ATCA	2	8	95693	95700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016595	GGGA	2	8	101157	101164	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016595	CCTT	2	8	110650	110657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016595	CCGG	2	8	115105	115112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016595	CCGT	2	8	117052	117059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016595	CGGG	2	8	121027	121034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016595	GCCC	2	8	121061	121068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016595	CTGG	2	8	123651	123658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016595	AGGC	2	8	123667	123674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016595	CCTC	2	8	127060	127067	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_016595	GCGG	2	8	136688	136695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016595	CGGC	2	8	139548	139555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016595	AAAT	2	8	141577	141584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016595	GGCC	2	8	146886	146893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016595	CCCG	2	8	147389	147396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016595	CGGA	2	8	147574	147581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016595	CGGG	2	8	147582	147589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016595	GCCC	2	8	147634	147641	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016595	GCCG	2	8	147825	147832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016595	TCCC	2	8	148638	148645	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016595	TCCC	2	8	148673	148680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_016595	AGGG	2	8	148702	148709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016595	CGCC	2	8	154039	154046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_016595	ACAG	2	8	154759	154766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016595	GCGG	2	8	155660	155667	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016595	GTCG	2	8	156087	156094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016595	GTTG	2	8	156243	156250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016595	GCAG	2	8	156629	156636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016595	GCCG	2	8	157788	157795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016595	GTCG	2	8	162816	162823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016595	TCAA	2	8	165829	165836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016595	GCCG	2	8	169686	169693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016595	TGAG	2	8	170609	170616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016595	ACGA	2	8	176886	176893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016595	GTTC	2	8	194193	194200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016595	GCAC	2	8	196899	196906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016595	TCGC	2	8	199027	199034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016595	TGGA	2	8	199255	199262	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016595	CGGC	2	8	199407	199414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016595	CGGG	2	8	199491	199498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016595	GCGG	2	8	199614	199621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016595	GGCG	2	8	199781	199788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016595	GCCC	2	8	199974	199981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_016595	CCTT	2	8	200069	200076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016595	CGCC	2	8	200191	200198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_016595	GCTG	2	8	200276	200283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016595	CCGC	2	8	204028	204035	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_016595	GCGG	2	8	218532	218539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016595	CACC	2	8	218591	218598	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016595	CCGA	2	8	226689	226696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016595	CGGG	2	8	229490	229497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016595	GGAG	2	8	229682	229689	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016595	CGGC	2	8	229745	229752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016595	CCGG	2	8	229881	229888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016595	TCCT	2	8	230005	230012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016595	ACCA	2	8	232602	232609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016595	GCGG	2	8	238488	238495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016595	CGTC	2	8	241413	241420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016595	GGCG	2	8	241481	241488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016595	TCGG	2	8	246332	246339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016595	GCTC	2	8	247578	247585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016595	GGGA	2	8	248093	248100	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016595	CCAA	2	8	262577	262584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016595	GCTG	2	8	279164	279171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016595	GTCC	2	8	287798	287805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016595	TGGA	2	8	292523	292530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016595	AGGA	2	8	292568	292575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016595	TGGC	2	8	298072	298079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016595	ATCA	2	8	298790	298797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016595	TCAA	2	8	298887	298894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016595	GCCG	2	8	300134	300141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016595	CAAG	2	8	308588	308595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016595	CGGC	2	8	311761	311768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016595	GCCA	2	8	311777	311784	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016595	TTGA	2	8	315637	315644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016595	GGGC	2	8	319784	319791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016595	CGAA	2	8	322303	322310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016595	AGGG	2	8	322315	322322	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016595	GCCC	2	8	324340	324347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016595	GCCC	2	8	324394	324401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_016595	GCCC	2	8	324421	324428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_016595	CACC	2	8	339637	339644	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_016595	GCCG	2	8	339724	339731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016595	CTTG	2	8	350438	350445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016595	CTTC	2	8	352158	352165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016595	CGGC	2	8	356823	356830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016595	CCCG	2	8	356924	356931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_016595	CCGG	2	8	357228	357235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016595	CCGG	2	8	357479	357486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016595	CGCC	2	8	358768	358775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_016595	GGAG	2	8	386814	386821	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016595	GCGG	2	8	387717	387724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016595	CGCC	2	8	387737	387744	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_016595	CGGG	2	8	389515	389522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016595	CGGC	2	8	398972	398979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016595	TCCC	2	8	412104	412111	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016595	GGCT	2	8	416926	416933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016595	GTTC	2	8	418055	418062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016595	CCAC	2	8	419175	419182	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_016595	CCGC	2	8	423463	423470	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_016595	GCGG	2	8	423484	423491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016595	AGTC	2	8	427768	427775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016595	GCCC	2	8	432048	432055	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_016595	CGGC	2	8	432322	432329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016595	CGCC	2	8	432404	432411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_016595	CGGT	2	8	432488	432495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016595	CCGC	2	8	432922	432929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_016595	CAGC	2	8	432994	433001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016595	GCGG	2	8	433462	433469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016595	CAGC	2	8	433587	433594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016595	TCCG	2	8	439857	439864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016595	CGCC	2	8	440021	440028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_016595	CGGG	2	8	440072	440079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016595	CGGT	2	8	440115	440122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016595	TCCA	2	8	440546	440553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016595	CCCT	2	8	440753	440760	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_016595	TAGA	2	8	440790	440797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016595	GGCG	2	8	454180	454187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016595	CGTC	2	8	459957	459964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_016595	CTGG	2	8	525950	525957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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187	NC_016595	GGTC	2	8	532159	532166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_016595	CCGC	2	8	556075	556082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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231	NC_016595	GAAC	2	8	688416	688423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
232	NC_016595	CGGA	2	8	689390	689397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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264	NC_016595	CATC	2	8	778585	778592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.