MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p3

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016595	G	6	6	2185	2190	0 %	0 %	100 %	0 %	392378907
2	NC_016595	G	6	6	3803	3808	0 %	0 %	100 %	0 %	392378909
3	NC_016595	C	6	6	4408	4413	0 %	0 %	0 %	100 %	392378909
4	NC_016595	T	6	6	7426	7431	0 %	100 %	0 %	0 %	392378910
5	NC_016595	C	6	6	8664	8669	0 %	0 %	0 %	100 %	392378911
6	NC_016595	A	6	6	10913	10918	100 %	0 %	0 %	0 %	392378912
7	NC_016595	A	6	6	14376	14381	100 %	0 %	0 %	0 %	392378914
8	NC_016595	G	6	6	15032	15037	0 %	0 %	100 %	0 %	392378916
9	NC_016595	T	6	6	15962	15967	0 %	100 %	0 %	0 %	392378917
10	NC_016595	G	6	6	16415	16420	0 %	0 %	100 %	0 %	392378917
11	NC_016595	G	6	6	20758	20763	0 %	0 %	100 %	0 %	392378924
12	NC_016595	T	6	6	23018	23023	0 %	100 %	0 %	0 %	392378927
13	NC_016595	G	6	6	23891	23896	0 %	0 %	100 %	0 %	392378928
14	NC_016595	G	6	6	28191	28196	0 %	0 %	100 %	0 %	392378935
15	NC_016595	C	6	6	28578	28583	0 %	0 %	0 %	100 %	392378935
16	NC_016595	G	6	6	28809	28814	0 %	0 %	100 %	0 %	392378935
17	NC_016595	T	6	6	29437	29442	0 %	100 %	0 %	0 %	392378936
18	NC_016595	G	6	6	31461	31466	0 %	0 %	100 %	0 %	392378941
19	NC_016595	T	6	6	40904	40909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016595	G	6	6	48632	48637	0 %	0 %	100 %	0 %	392378960
21	NC_016595	G	6	6	55606	55611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016595	T	6	6	57181	57186	0 %	100 %	0 %	0 %	392378970
23	NC_016595	C	6	6	58655	58660	0 %	0 %	0 %	100 %	392378971
24	NC_016595	C	6	6	60563	60568	0 %	0 %	0 %	100 %	392378972
25	NC_016595	C	6	6	60700	60705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_016595	C	6	6	64498	64503	0 %	0 %	0 %	100 %	392378976
27	NC_016595	T	6	6	65078	65083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016595	G	7	7	72584	72590	0 %	0 %	100 %	0 %	392378985
29	NC_016595	C	6	6	73030	73035	0 %	0 %	0 %	100 %	392378985
30	NC_016595	A	6	6	73281	73286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016595	C	6	6	74157	74162	0 %	0 %	0 %	100 %	392378986
32	NC_016595	G	6	6	82875	82880	0 %	0 %	100 %	0 %	392378995
33	NC_016595	G	6	6	86317	86322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016595	G	6	6	93744	93749	0 %	0 %	100 %	0 %	392379006
35	NC_016595	G	6	6	96534	96539	0 %	0 %	100 %	0 %	392379008
36	NC_016595	C	6	6	97931	97936	0 %	0 %	0 %	100 %	392379009
37	NC_016595	T	6	6	98845	98850	0 %	100 %	0 %	0 %	392379011
38	NC_016595	G	6	6	100822	100827	0 %	0 %	100 %	0 %	392379015
39	NC_016595	G	6	6	101353	101358	0 %	0 %	100 %	0 %	392379016
40	NC_016595	G	6	6	105272	105277	0 %	0 %	100 %	0 %	392379019
41	NC_016595	T	7	7	115192	115198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016595	G	6	6	115199	115204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016595	G	6	6	116594	116599	0 %	0 %	100 %	0 %	392379028
44	NC_016595	C	6	6	116834	116839	0 %	0 %	0 %	100 %	392379028
45	NC_016595	G	6	6	117498	117503	0 %	0 %	100 %	0 %	392379029
46	NC_016595	G	6	6	120795	120800	0 %	0 %	100 %	0 %	392379032
47	NC_016595	G	6	6	123284	123289	0 %	0 %	100 %	0 %	392379035
48	NC_016595	A	8	8	127107	127114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016595	C	6	6	128719	128724	0 %	0 %	0 %	100 %	392379037
50	NC_016595	G	6	6	145201	145206	0 %	0 %	100 %	0 %	392379055
51	NC_016595	C	8	8	147557	147564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_016595	G	6	6	147739	147744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016595	C	6	6	148725	148730	0 %	0 %	0 %	100 %	392379057
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55	NC_016595	G	6	6	156225	156230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_016595	G	6	6	185179	185184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016595	A	6	6	186232	186237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016595	A	6	6	186258	186263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016595	C	6	6	186279	186284	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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82	NC_016595	G	6	6	213611	213616	0 %	0 %	100 %	0 %	392379124
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87	NC_016595	G	6	6	230216	230221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016595	C	6	6	230920	230925	0 %	0 %	0 %	100 %	392379143
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90	NC_016595	G	6	6	236456	236461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016595	T	7	7	241369	241375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016595	G	6	6	245475	245480	0 %	0 %	100 %	0 %	392379160
93	NC_016595	G	6	6	247215	247220	0 %	0 %	100 %	0 %	392379163
94	NC_016595	A	7	7	247610	247616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_016595	G	7	7	256443	256449	0 %	0 %	100 %	0 %	392379174
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104	NC_016595	C	7	7	272839	272845	0 %	0 %	0 %	100 %	392379188
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106	NC_016595	G	6	6	276767	276772	0 %	0 %	100 %	0 %	392379192
107	NC_016595	C	7	7	279241	279247	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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109	NC_016595	G	6	6	283930	283935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016595	G	6	6	292131	292136	0 %	0 %	100 %	0 %	392379202
111	NC_016595	T	6	6	294702	294707	0 %	100 %	0 %	0 %	392379208
112	NC_016595	C	6	6	295500	295505	0 %	0 %	0 %	100 %	392379208
113	NC_016595	C	6	6	296094	296099	0 %	0 %	0 %	100 %	392379209
114	NC_016595	A	6	6	298199	298204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016595	G	6	6	298283	298288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016595	C	6	6	301938	301943	0 %	0 %	0 %	100 %	392379214
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119	NC_016595	G	6	6	316523	316528	0 %	0 %	100 %	0 %	392379229
120	NC_016595	C	6	6	321884	321889	0 %	0 %	0 %	100 %	392379236
121	NC_016595	G	6	6	322366	322371	0 %	0 %	100 %	0 %	392379237
122	NC_016595	N	100	100	324584	324683	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016595	C	6	6	327032	327037	0 %	0 %	0 %	100 %	392379241
124	NC_016595	T	6	6	327391	327396	0 %	100 %	0 %	0 %	392379241
125	NC_016595	N	100	100	327417	327516	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016595	C	6	6	330111	330116	0 %	0 %	0 %	100 %	392379244
127	NC_016595	C	6	6	330767	330772	0 %	0 %	0 %	100 %	392379244
128	NC_016595	C	6	6	335837	335842	0 %	0 %	0 %	100 %	392379244
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139	NC_016595	A	6	6	373249	373254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.